• 제목/요약/키워드: MALDI-TOF-TOF

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Effect of Cationization Agent Concentration on Glycan Detection Using MALDI TOF-MS

  • Kim, Inyoung;Shin, Dongwon;Paek, Jihyun;Kim, Jeongkwon
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제8권1호
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    • pp.14-17
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    • 2017
  • The effect of cationization agent concentration on glycan detection via matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) was investigated using $Na^+$ ions in the form of NaCl as the cationization agent. NaCl solution concentrations ranging from 1 mM to 1 M were investigated. Glycans from ovalbumin were mixed with the cationization agent solution and the 2,5-dihydroxybenzoic acid (2,5-DHB) matrix solution in a volume ratio of 1:1:1. The resulting mixture was loaded onto the MALDI plate. Two MALDI-TOF MS instruments (Voyager DE-STR MALDI-TOF MS and Tinkerbell RT MALDI-TOF MS) were used for detection of glycans. The best detection, in terms of the number of identified glycans, the peak intensity, and the signal-to-noise (S/N) ratio, was obtained with NaCl concentrations of 0.01-0.1 M for both MALDI-TOF MS instruments.

Analysis of Entamoeba histolytica Membrane via LC-MALDI-TOF/TOF

  • Ujang, Jorim Anak;Noordin, Rahmah;Othman, Nurulhasanah
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제10권3호
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    • pp.84-87
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    • 2019
  • Liquid chromatography mass spectrometry is widely employed in proteomics studies. One of such instruments is the Liquid Chromatography (LC)-Matrix-assisted laser desorption ionisation (MALDI)-Time of flight (TOF) or LC-MALDI-TOF/TOF. In this study, this instrument was used to identify the membrane proteins of a protozoan parasite namely Entamoeba histolytica. It causes amoebiasis in human. The E. histolytica trophozoites were cultured prior to the membrane protein extraction using the conventional method, $ProteoPrep^{(R)}$ and $ProteoExtract^{(R)}$ kits. Then, the membrane protein extracts were trypticdigested and analysed by LC-MALDI-TOF/TOF. Approximately, 194 proteins were identified and 27.8% (54) were predicted as membrane proteins having 1 to 15 transmembrane regions and signal peptides by combining all three extraction methods. Also, this study has discovered 3 unique proteins as compared to our previous study which merit further investigation.

말디토프 질량분석을 이용한 고분자의 특성분석 (Analysis of Polymer Characteristics Using Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry)

  • 강민정;성윤서;김문주;김명수;변재철
    • 공업화학
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    • 제28권3호
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    • pp.263-271
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    • 2017
  • 최근에, 질량분석기술의 폴리머 분석에의 응용은 MALDI-TOF MS 개발 이후 급속도로 발전하였다. 이 리뷰 논문은 현재까지 연구된 MALDI-TOF MS의 폴리머 특성분석에의 응용에 관한 최신 논문을 정리하였다. MALDI-TOF MS는 바이오 폴리머와, 합성 폴리머의 평균분자량 분석, 폴리머의 시퀀스 분석을 통한 구조의 해석, 모노머의 조성분석에까지 이용되고 있다. 엔드그룹의 특성과 농도를 분석하는 연구도 많이 진행되었고, 복잡한 폴리머의 분자량의 분석에는 SEC와 MALDI-TOF MS를 연결한 분석법을 추천한다. MALDI에 tandem MS를 결합한 분석기술이나, 이온 모빌리티를 응용한 질량분석기, TOF-SIMS, MALDI-TOF-Imaging 기술도 급격히 발전하고 있으며, 이의 폴리머 특성분석에의 응용은 별도의 분리기술이 필요 없어 앞으로 더 많이 이용될 것으로 생각된다. 분자량, 시퀀스, 그리고 모노머의 조성을 정확하게 계산해주는 소프트웨어와 고분자량(> 100 kDa)의 분석을 가능하게 해주는 기술이 개발된다면, 폴리머를 연구하는 과학자들에게 MALDI-TOF MS의 이용은 문제점을 해결하고, 목적하는 폴리머를 합성하는 데 중요한 수단이 될 것이다.

Applications of MALDI-TOF Mass Spectrometry in Clinical Microbiology

  • Shin, Kyeong Seob;Yum, Jonghwa
    • 대한의생명과학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.145-156
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    • 2022
  • Over the past few decades, few technologies have had a greater impact on clinical microbiology laboratories than matrix-assisted laser desorption time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). The MALDI-TOF MS is a fast, accurate, and low-cost and efficient method of microbial identification. This technology generates characteristic mass spectral fingerprints that is a unique signature for each microorganism, making it an ideal method for accurate identification at the genus and species levels of both bacterial and fastidious microorganism such as anaerobes, mycobacterium and fungi etc. In addition, MALDI-TOF MS has been successfully used in microbial subtyping and susceptibility tests such as determination of resistance genes. In this study, the authors summarized the application of MALDI-TOF MS in clinical microbiology and clinical research and explored the future of MALDI-TOF MS.

$\alpha_1$(I)및 $\alpha_2$(I)사슬 콜라겐의 질량분석법 개발 연구 (Development of mass spectrometric analysis of $\alpha_1$(I) and $\alpha_2$(I) chain Collagen)

  • 김광연;조선영;이상한;남해선;김성호
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제6권2호
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    • pp.134-143
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    • 2005
  • 포유동물에서 중요한 구조단백질인 콜라겐은 다양한 조직내 단백질 조성과 사슬간 복잡한 가교결합의 존재로 인해 그 구조가 복잡하고 다양하여, 직접적으로 분석할 적당한 방법이 없었다. 본 연구에서는 간단한 전처리만으로 다수의 생체분자 시료에 대해 정확한 분자량 측정이 가능한 매트릭스 보조 레이저 탈착/이온화 비행시간 질량분석법(MALDI-TOF MS)을 이용하여 콜라겐과 조각화된 콜라겐을 분석하고 이의 아미노산 서열을 사중극자-비행시간 직렬 질량분석법(Q-TOF MS/MS)으로 확인하여, 시료 중의 콜라겐의 종류에 대한 정보를 확인하여, MALDI-TOF 질량분석을 이용한 콜라겐 분석에서 콜라겐의 종류를 쉽게 예측할 수 있는 방법을 제시하고자 하였다. 쥐의 꼬리에서 분리한 콜라겐을 SDS-PAGE로 분리한 결과 10개의 band를 얻을 수 있었는데, 같은 시료를 MALDI-TOF MS로 확인하여 각 band의 정확한 분자량을 결정할 수 있었다. SDS-PACE상의 10개의 분리된 band에 대해 각각 tryptic digestion후 MALDI-TOF 질량분석을 수행한 결과 4개의 band에서 type I 콜라겐의 $\alpha_1$-chain내의 fragment인 Gly1056-Arg1073을 확인할 수 있었고, 5개의 band에서 type I 콜라겐의 $\alpha_2$-chain내의 fragment인 Gly985-Arg1002을 확인하였다. 잔재한 콜라겐의 가교결합으로 인해 예상되는 fragment중 둘만이 확인되었지만, 확인된 fragment를 통해 적어도 7개의 band에서는 type I콜라겐이 존재함을 확인할 수 있었다. 확인된 두 콜라겐 flagment의 아미노산 서열을 Q-TOF MS/MS로 분석한 결과 MALDI-TOF MS에서의 예측과 일치함을 확인할 수 있었으며, 이를 통해 확인된 두 fragment에 의한 peak을 지문으로 하여 MALDI-TOF MS측정시에 시료내의 type I 콜라겐의 존재를 쉽게 확인할 수 있음을 볼 수 있었다.

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Free Radical Initiated Peptide Sequencing Using MALDI-TOF/TOF Mass Spectrometry

  • Song, Insu;Lee, Jae-ung;Baek, Jaehyeon;Cha, Sangwon;Han, Sang Yun;Oh, Han Bin
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제9권2호
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    • pp.56-60
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    • 2018
  • In this study, matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) was applied to the TEMPO-assisted FRIPS for the first time. We found that 3-HPA is the optimal matrix for the analysis of p-TEMPO-Bz-Sc-peptides, which gives minimal precursor fragmentations. MALDI-TOF/TOF experiments on p-TEMPO-Bz-Sc-peptides yielded mainly $[a_n+H]^+$, $[z_n+H]^+$, and $[y_n]^+-type$ products, indicating that radical-driven peptide fragmentation occurs in MALDI-TOF/TOF-MS.

Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry의 활용 (Application of Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry)

  • 권필승
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제55권4호
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    • pp.244-252
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    • 2023
  • 검사 결과의 적시성과 정확성은 임상의가 특히 생명을 위협하는 감염이나 시력과 같은 중요한 장기 및 기능이 위험에 처한 경우, 효과적이고 표적화된 항균 요법을 결정하고 즉시 시행하는데 중요한 요소이다. 가능한 한 최단 시간 내에 정확하고 신뢰할 수 있는 결과를 얻기 위해 matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) 질량분석기기반 분석을 개선하고 최적화하기 위한 추가 연구 노력이 이루어져야 할 것이다. MALDI-TOF 질량분석기기반 세균 식별은 주로 임상 시료에서 병원체를 분리 및 정제하는 기술, 스펙트럼 라이브러리 확장 및 소프트웨어의 업그레이드에 중점을 둔다. 기술이 발전함에 따라 많은 MALDI-TOF 기반 미생물 동정 데이터베이스 및 시스템이 허가되어 임상에 사용되고 있다. 그럼에도 불구하고, 포괄적인 임상미생물의 특성화를 위해서는 MALDI-TOF 질량분석기 기반 항균제 내성 분석을 개발하는 것이 여전히 필요하다. 특정 적용 범주, 일반적인 분석물질, 주요 수행방법, 한계 및 해결점을 포함하여 임상 연구에서 MALDI-TOF의 적용이 중요하다. 임상 미생물 검사실에서 업무 활용을 위해 임상병리사들의 교육 및 훈련을 통한 전문성 확보가 필수적이며, 데이터베이스 구축과 경험을 극대화하여야 할 것이다. 향후 더 강력한 데이터베이스의 활용으로 다양한 분야에서 MALDI-TOF 질량분석기가 적용될 것으로 보인다.

Construction of an Improved Tandem Time-of-flight Mass Spectrometer for Photodissociation of Ions Generated by Matrix-assisted Laser Desorption Ionization (MALDI)

  • Moon, Jeong-Hee;Yoon, So-Hee;Kim, Myung-Soo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제26권5호
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    • pp.763-768
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    • 2005
  • An improved tandem time-of-flight (TOF) mass spectrometer for the photodissociation (PD) study of ions generated by matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI), MALDI-TOF-PD-TOF, has been designed and constructed. Recording a full spectrum with better than unit mass resolution even in low mass range has been achieved without reflectron voltage stepping which was needed in the previous version. Other aspects of the improvement, such as those in the data system which now allow 10-100 times faster spectral acquisition than with the previous instrument, are described. Rationale for the ideas which have led to the improvements is presented also.

Analysis of nonionic surfactants and silicone polymers in cosmetic products using Matrix - assisted Laser Desorption/Ionization Time-of- flight Mass Spectrometry

  • Lee, Myoung-Hee;Lee, Gae-Ho;Yoo, Jong-Shin
    • 대한화장품학회:학술대회논문집
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    • 대한화장품학회 2003년도 IFSCC Conference Proceeding Book II
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    • pp.480-507
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    • 2003
  • A rapid and efficient method for analyzing the nonionic surfactants and silicone polymers, which control the shape and characteristics of cosmetic products and give influence on product quality, has been developed using Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI- TOF IMS). The MALDI-TOF/MS could easily and effectively determine the molecular weight distribution and monomer units of nonionic surfactants. As a result, creating a library of mass spectrum data of surfactants used in cosmetic products using MALDI-TOF/MS and analyzing surfactants extracted from the products may become a useful method for detailed structural characterization of the surfactants. Furthermore, the MALDI-TOF/MS analysis was effective in obtaining the spectrum of silicone polymers from which the molecular weight distribution could be determined. The repetition units and structural data could also be obtained through molecular mass peaks. Additionally, the monomer ratio and terminal groups as properties of silicone copolymers could be determined

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돼지유래 Salmonella속 균의 동정을 위한 MALDI TOF MS 활용 (MALDI TOF MS for the identification of Salmonella spp. from swine)

  • 손준형;전우진;이영미;김선수
    • 한국동물위생학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.247-251
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    • 2016
  • Salmonella is one of the most common bacteria that causes heavy losses in swine industry and major causative pathogen of food poisoning in public health. Various methods for the identification of Salmonella such as Gram staining, agglutination test, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), polymerase chain reaction (PCR) have been used. Several studies have demonstrated that Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI TOF) Mass Spectrometry (MS) identification is an efficient and inexpensive method for the rapid and routine identification of isolated bacteria. In this study, MALDI TOF MS could provide rapid, accurate identification of Salmonella spp. from swine compared with end point PCR and real time PCR.