• 제목/요약/키워드: M13 DNA

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DNA-PK-null 세포주의 adriamycin 처리에 의한 G2/M 세포주기 변화 (Enhanced Sensitivity and Long-Term G2/M Arrest in Adriamycin-treated DNA-PK-null Cells are Unrelated to DNA Repair Defects)

  • 김충희;김종수;;김나리;김의용;한진
    • 생명과학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.241-247
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    • 2003
  • DNA 손상 유발을 위해 cisplatin, mitomycin 그리고 adriamycin을 농도별로 처리하여 세포독성 효과 및 세포주기 분포를 조사하였다. 이들 약제중 adriamycin의 감수성이 가장 높았으며 특히 $Ku80^{-/-}MEFs$가 현저한 세포독성 감수성 효과를 나타내었다. DNA 회복과 관련된 S phase의 분포도를 알아보기 위하여 adriamycin을 처리한 결과 DNA-$PKcs^{-/-}MEFs$$Ku80^{-/-}MEFs$ 모두에서 S phase는 대조군과 비슷하게 나타났다. 그리고 DNA$PKcs^{-/-}MEFs$에 adriamycin 처리시 6시간 경과 후 $G_2$/M phase가 증가되었으나 30시간 경과시 정상으로 회복되었다. 그러나 $Ku80^{-/-}MEFs$는 6시간 경과 이후 36시간 경과시 까지 $G_2$/M phase가 지속적으로 증가하다 결국 사멸되었다. 따라서 Ku80는 세포주기 조절 유전자의 발현을 위해 필수적인 단백질이며 Ku80의 결핍은 $G_2$M phase에서 다음 단계로의 세포주기 변화를 상실하여 사멸하게 된다. 그러므로 $Ku80^{-/-}MEFs$가 대조군과 다른 반응을 나타내는 것은 DNA 회복정도의 차이에서 오는 것이 아니라 세포주기 조절유전자 발현의 차이에서 오는 것으로 사료된다.

Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) DNA Marker를 이용한 한국 재래흑염소육 감별 (Identification of Korean Native Goat Meat using Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) DNA Markers)

  • 정의룡
    • 한국축산식품학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.301-309
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    • 2002
  • 본 연구는 AFLP-PCR 유전자 지문분석 기법을 이용하여 우리나라 고유의 동물유전자원으로서 재래흑염소의 품종 및 흑염소육 감별을 위한 품종 특이적 DNA marker를 개발하고자 수행하였다. 흑염소로부터 추출한 genomic DNA를 EcoR I/Hind III 및 Taq I/Hind III 2종류의 제한효소 조합으로 이중 절단한 후 10종류의 two selective primer조합형을 이용하여 분석한 결과 각 printer 조합형당 검출된 AFLP band의 수는 36~74개의 범위로 평균 55.5개였다. 그리고 검출된 총 555개의 band 가운데 polymorphic band의 수는 149 개로 다형성 수준은 약 26.8%로 추정되었다. 재래흑염소 품종 특이적인 AFLP marker를 탐색하고자 육용종 수입흑염소 및 4품종의 유용종 염소와 AFLP 지문양상을 비교 검토한 결과 M13/H13 primer 조합형에서 2.01과 1.26 kb의 2개 band 그리고 E35/H14 primer 조합형에서 1.65 kb의 1개 band가 재래흑염소의 품종 특이적 AFLP marker로 검출되었다. 그리고 E35/H14 primer 조합형에서 수입흑염소의 2.19, 2.03, 0.96 및 0.87 kb band, Saanen종의 2.13 kb band, Nubian종의 2.08 kb band는 각 해당 품종에만 특이적으로 출현하는 품종 특이적 band로 확인되었다. 또한, E35/H13 primer 조합형에서 재래흑염소를 특히, Saanen종과 식별이 가능한 4개의 DNA band가 확인되었다. 따라서, 본 연구에서 AFLP-PCR 기법을 이용하여 검출한 품종 특이적 DNA band들은 우리나라 재래흑염소, 수입흑염소 및 유용종 염소품종들간에 명확히 구별되어 재래종 흑염소 육과 육제품의 품종판별에 매우 유용한 DNA marker로 이용 가능할 것으로 기대된다.

Ribosomal RNA와 M13 probe에 의한 clostridium thermocellum 균주들의 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)비교 (RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism) by Ribosomal RNA and M13 Probes of Clostridum thermocellum Strains)

  • 이호섭;홍수형;하지홍
    • 미생물학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.189-194
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    • 1991
  • The degree of the genetic variations among Clostridium thermocellum ATCC 27405 and the wild type strains was investigated by the mehtod of GC ratio, DNA-DNA hybridization and RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) patterns by ribosomal RNA and M13 probe. GC ratio and KNA homology values of th three isolates were approximately equal to those of ATCC type strain. The RFLP patterns by the rRNA and M13 probe showed some differences among C. thermocellum ATCC 27405, wild type strains and Clostridium thermohydrosulfuricum ATCC 33223, indicating that the two probes can be useful in subspecies- and apecies-identification.

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위암 및 결장암 조직과 그 주변의 정상조직에서 Mycoplasmas DNA의 정색 (Detection of Mycoplasmas DNA in the Cancer and the Normal Tissues from the Patients with Gastric and Colon Cancer)

  • 장명웅;신현철;박인달;김광혁
    • 생명과학회지
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    • 제17권2호통권82호
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    • pp.279-285
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    • 2007
  • 위암 환자 30명과 결장암 환자 30명의 암 조직과 그 주위의 정상 조직을 구분하고, 암 조직과 정상조직의 쌍을 찾지 못한 경우의 위암 조직 8개와 결장암 조직 10개의 각 조직에서 Mycoplasma DNA의 존재 유무를 PCR법으로 확인하고 PCR산물에서 DNA의 염기서열을 분석하여 Mycoplasma DNA 서열과 비교함으로써 Mycoplasmas를 검색한 결과 다음과 같은 결론을 얻었다. 위암 조직과 그 주위 조직 30개 중에서 Mycoplasma DNA가 검출된 것은 각각 13개(43.3%)와 18개(60%)이었으며, 결장암 조직과 그 주위 조직 30개 중에서 Mycoplasma DNA가 검출된 것은 각각 12개(40%)와 15개(50%)이었다. Mycoplasma DNA가 검출된 위암 조직에서 mycoplasma 균종의 분리빈도는 M. faucium, M. subdolum, M. salivarium, M. auris, M. hyosynoviae, M. conjunctivae의 순이었다. Mycoplasma DNA가 검출된 위암 조직 주변의 정상조직에서 mycoplasma 균종은 M. facium, M. subdolum, M. salivarium, M. auris, M. hyosynoviae, M. bovigenitalium와 M. pulmonis의 순이었다. Mycoplasma DNA가 검출된 결장암 조직에서 mycoplasma 균종의 분리 빈도는 M. faucium, M. subdolum, M. salivarium, M. auris, M. hyosynoviae), M. synoviae M. bovigenitalium, M. gallinarum, M. moatsii의 순이었다. Mycoplasma DNA가 검출된 결장암 조직 주변의 정상조직에서 mycoplasma 균종은 M. faucium, M. subdolum, M. salivarium, M. auris, M. hyosynoviae, M. bovis, M. opalescens, M. bovigenitalium, M. gallinarum와 M. moatsii의 순이었다. 이상의 결과에서 위암 및 결장암 조직 보다 암 주위의 정상 조직에서 Mycoplasma DNA의 검출율이 높았으며, 검출된 Mycoplasma 균종도 암 조직과 정상 조직에서 차이가 없었으므로 이들 암과 Mycoplasma와는 상관관계가 없는 것으로 생각된다.

해녀콩의 후기 뿌리혹에서 발현되는 4개의 cDNA 특성 (Characterization of Four cDNA Clones Expressed in Late Root Nodules of Canavalia lineata)

  • 안정선
    • Journal of Plant Biology
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    • 제38권4호
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    • pp.381-388
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    • 1995
  • 해녀콩(Canavalia lineata) 뿌리혹으로부터 만들어진 cDNA library를 뿌리의 총 RNA, leghemoglobin 및 uricasell cDNA를 competitor로 사용하여 차등 혼성화반응으로 후기 뿌리혹에서 발현되며 Cno이, Cne2, Cne3, Clb2로 명명된 4개의 cDNA 클론을 얻었다. Cnod1은 벼의 cysteine proteinase를 암호화하는 유전자와 유사한데 1450nt의 전사체외 혼성화 반응을 보였으며 뿌리혹에서만 발현되고 뿌리혹 발달 후기에서 가장 높은 발현을 보였다. Cne2는 벼의 Expressed Sequence Tag의 한 종류와 유사하고 900 nt의 전사체와 혼성화 반응을 보였으며 뿌리혹에서 주로 발현되었다. Cne2는 접종 후 13일째 발현이 증폭된 후 일정하게 유지되었다. Cne2는 완두의 tonoplast 막 내재 단백질 TRG31을 암호화하는 유전자와 유사하며 뿌리에서 가장 많이 발현되었다. Cne3는 1700 nt와 1400 nt의 전사체와 혼성화반응을 보였으며 뿌리혹의 성장, 발달과 일치하는 발현 양상을 보였다. Clb2는 800 nt의 전사체와 혼성화반응을 보였으며 접종 후 8일째부터 발현이 시작되어 13일째 증폭되고 그 이후 일정한 수준을 유지하였다.

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DNA Light-strand Preferential Recognition of Human Mitochondria Transcription Termination Factor mTERF

  • Nam, Sang-Chul;Kang, Chang-Won
    • BMB Reports
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    • 제38권6호
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    • pp.690-694
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    • 2005
  • Transcription termination of the human mitochondrial genome requires specific binding to termination factor mTERF. In this study, mTERF was produced in E. coli and purified by two-step chromatography. mTERF-binding DNA sequences were isolated from a pool of randomized sequences by the repeated selection of bound sequences by gel-mobility shift assay and polymerase chain reaction. Sequencing and comparison of the 23 isolated clones revealed a 16-bp consensus sequence of 5'-GTG$\b{TGGC}$AGANCCNGG-3' in the light-strand (underlined residues were absolutely conserved), which nicely matched the genomic 13-bp terminator sequence 5'-$\b{TGGC}$AGAGCCCGG-3'. Moreover, mTERF binding assays of heteroduplex and single-stranded DNAs showed mTERF recognized the light strand in preference to the heavy strand. The preferential binding of mTERF with the light-strand may explain its distinct orientation-dependent termination activity.

Neuropeptides and Neuroactive Substance in the Bembyx mori Brain: Allatotropin Gene and Localization, Neuronal Growth by BDNF, and Apoptosis by Edysone

  • Lee, Bong-Hee
    • 한국잠사학회:학술대회논문집
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    • 한국잠사학회 2003년도 International Symposium of Silkworm/Insect Biotechnology and Annual Meeting of Korea Society of Sericultural Science
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    • pp.13-18
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    • 2003
  • Allatotropin is a 13-residue amidated neuropeptide isolated from pharate adult heads of the tobacco hornworm, Manduca serta and strongly stimulates biosynthesis of juvenile hormones in adults, but not larval, lepidopteran corpora allata. From a Bombyx mori midgut cDNA library, a cDNA that encodes a 130-amino-acid polypeptide containing M. sexta allatotropin sequence was isolated. The B. mori allatotropin cDNA consists of 1196 nucleotides. (omitted)

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상백피에 의한 MC/9 비만세포의 활성 억제 조절 연구 (Suppressive effects of Morus alba Linne Root Bark (MRAL) on activation of MC/9 mast cells)

  • 이기전;김복규;길기정
    • 대한본초학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.33-42
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    • 2013
  • Objective : Morus alba Linne Root Bark (MRAL) is a medicinal herb in Korean Medicine, known for its anti-inflammatory and anti-allergic properties. However, its mechanisms of action and the cellular targets have not yet been found and the study was developed to investigate the allergic suppressive effect of MRAL. The purpose of this study is to investigate the allergic suppressive effects of MRAL on activation of MC/9 mast cells. Methods : Cytotoxic activity of MRAL (50, 100, 200, 400 ${\mu}g/mL$) on MC/9 mast cells measured using EZ-Cytox cell viability assay kit (WST reagent). The levels of interleukin-5 (IL-5), IL-13 and IL-4, IL-5, IL-6, IL-13 mRNA expression were measured by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and real-time PCR respectively. The expression of transcription factors such as GATA-1, GATA-2, NFAT, AP-1 and NF-${\kappa}B$ p65 DNA binding activity were measured by western blot and electrophoresis mobility shift assay (EMSA). Results : Our results indicated that MRAL (50 ${\mu}g/mL$, 100 ${\mu}g/mL$) significantly inhibited PMA/Ionomycin-induced production of IL-5 and IL-13 and the expression of IL-4, IL-5, IL-6 and IL-13 mRNA in MC/9 mast cells. Moreover, MRAL (50 ${\mu}g/mL$, 100 ${\mu}g/mL$) inhibited PMA/Ionomycin-induced GATA-1, GATA-2, NFAT-1, NFAT-2, c-Fos protein expression and NF-${\kappa}B$ p65 DNA binding activity in MC/9 mast cells. Conclusions : In conclusion, we suspect the anti-allergenic activities of MRAL, may be related to the regulation of transcription factors GATA-1, GATA-2, NFAT-1, NFAT-2, c-Fos and NF-${\kappa}B$ p65 DNA binding assay causing inhibition of Th2 cytokines IL-5 and IL-13 in mast cells.

무지개송어의 간세포 초대배양에 의한 Vitellogeinin 합성 유도 (Vitellogenin Induction by Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Hepatocytes in Primary Culture)

  • 여인규
    • 한국양식학회지
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    • 제11권4호
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    • pp.557-564
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    • 1998
  • 무지개송어의 초대배양 간세포에 있어서 Vitellogenin (VTG)의 합성 유도는 전기영동적 수법에 의해 행하였다. 간세포는 7일 동안 phositively charged dish를 이용한 배양으로 단층 확산되었다. 배양 7일의 간세포 생존율은 $E_2$의 유무에 따라 각각 20.7% 및 23.6%가 감소하였으며, DNA함유량도 각각 13.7% 및 14.0%가 감소하였다. $E_2$ 첨가군과 대조군간에는 생존율과 DNA 함유량에 있어서는 유의한 차이가 나타나지 않았다. 그리고, 총 단백질에 대한 VTG의 비율은 $E_2$$10^{-6}$ M의 첨가시에 최대치를 나타내었다. 그러나, 고농도($10^{-5}$M)에서는 오히려 감소하는 경향을 나타내었다.

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HBeAg 양성 산모의 분만 직후 HBV-DNA 수치에 따른 주산기 예방조치의 결과 (The outcome of perinatal prophylaxis for HBeAg positive mothers according to the maternal HBV-DNA levels at the delivery time)

  • 정온;김종현
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제50권4호
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    • pp.348-354
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    • 2007
  • 목 적 : B형 간염 바이러스 주산기 감염은 현재 감소하고 있지만 HBeAg 양성 산모로부터 분만된 신생아의 10%는 예방조치에도 불구하고 보유자가 된다. 비록 예방조치 실패의 원인이 아직 불확실하나 산모의 분만시 HBV-DNA 수치의 중요성이 제시되고 있다. 본 연구는 산모의 분만시 HBV-DNA 수치가 주산기 예방조치 결과의 유용한 예측인자임을 확인하기 위하여 시행하였다. 방 법 : 주산기 예방조치의 결과를 이미 알고 있는 29명의 HBeAg 양성 산모를 선정하였다. 산모의 HBV-DNA 양을 측정하기 위하여 WHO International Standard For Hepatitis B Virus DNA For NAT Assay를 이용한 정량적 PCR을 시행하였다. 결 과 : 주산기 예방조치 실패군 산모의 로그 HBV-DNA 수치가 성공군 산모의 수치보다 유의하게 높았다(7.99 vs. 6.72, P=0.015). 주산기 예방조치 결과를 예측할 수 있는 산모의 HBV-DNA 수치의 기준은 $2.83{\times}10^7$ 개체/mL(100 pg/mL)로 정할 수 있었는데, 산모의 HBV-DNA 수치가 기준치 미만인 16명 중 예방조치에 실패한 경우는 없었으며(0%), 기준치 이상인 경우는 13명 중 5명(38.5%)이 실패하였다. 결 론 : 현재의 예방조치법으로는 분만시 높은 HBV-DNA 수치를 가지는 산모의 주산기 예방조치 결과는 좋지 않을 가능성이 높다. 따라서 주산기 예방조치의 실패율을 낮추기 위해서는 이러한 위험요인이 있는 경우에 보다 강력한 방법을 적용시켜야 하겠다.