The amount of inorganic ions such as $Na^+$, $K^+$, $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$, $NH_4^+$, $Cl^-$, $NO_3^-$, and $SO_4^{2-}$ in the precipitation at hongwon area were analyzed during the period of February 1991 - June 1993. Ammonium ion was analyzed using Messier and indophenol methods. Cations were determined by atomic absorption spectroscopy, and ion chromatography was used for anions. For the entire period of study, there was no particular ion which has significant]y high correlation coefficient with hydrogen ion. The correlation between $NO_3^-$, and $SO_4^{2-}$ was 0.6, which suggests that these ions may be from the same source. Most cations have high correlation with each other. In the seasonal analysis, the nitrate and sulfate ions have high correlations with the acidity in the fall and winter. The rain waters of Taeahn area showed usually high concentrations of the ions, even though the pH was much higher than that of Chongwon area. It is considered that the ions came as neutral salt in Taeahn, while $NO_x$ and $SO_x$ contributes largely to the acidity of rains in Chongwon.
Kim, Jin-Soo;Kim, Ki Hyun;Kim, Hyeon Jeong;Kim, Min Ji;Park, Sung Hwan;Lee, Hyun Ji;Heu, Min Soo
Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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v.46
no.4
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pp.351-358
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2013
A protease inhibitor from fish eggs was fractionated using chromatographic methods. The fractionation efficiency was evaluated in terms of specific inhibitory activity (SIA, U/mg), purity (fold), total inhibitory activity (TIA, U), and recovery (%). The protease inhibitor (PI) from egg extracts of skipjack tuna (ST Katsuwonus pelamis), yellowfin tuna (YT Thunnus albacares) and Alaska pollock (AP Theragra chalcogramma) was fractionated using Sephadex G-50 gel filtration and DEAE-Sepharose CL-6B anion exchange chromatography based on protein size exclusion and net charge, respectively. Fractions exhibiting strong inhibitory activity were contained in the 30-50 kDa fraction on gel filtration and in the range of 0.4-0.7 M NaCl gradient fraction on anion exchange chromatography. The respective TIA and percent recovery of the fraction obtained with gel filtration toward trypsin and $N{\alpha}$-benzoyl-L-arginine-p-nitroanilide (BAPNA) were 2,758.7 U and 29.6% for ST, 1,005.5 U and 25.6% for YT, and 1,267.5 U and 26.0% for AP. Gel filtration chromatography was more effective at fractionating PI than using ion exchange chromatography. These results suggest that fish eggs act as serine protease inhibitors and might be useful for protease inhibition in foodstuffs.
Characterization and studies of proteome are challenging because biological samples are complex, with a wide dynamic range of abundance. At present the proteins are identified by digestion into peptides, with subsequent identification of the peptides by mass spectrometry (MS). MS is a powerful technique for the purpose, but it cannot identify every peptide in such complex mixtures simultaneously. For accurate analysis and quantification it is important to separate the peptides first by chromatography into fractions of a size that MS can handle. With these less complex fractions, the probability is increased of identifying peptides of low abundance that would otherwise experience ion suppression effects due to the presence of peptides of high abundance. Enrichment for peptides with certain post-translational modifications helps to increase their detection rates as well. Electrostatic repulsion-hydrophilic interaction chromatography (ERLIC) is a mixed-mode chromatographic technique which combines the use of electrostatic repulsion and hydrophilic interaction. This review provides an overview of ERLIC and its various proteomics applications. ERLIC has been demonstrated to have good orthogonality to reverse phase liquid chromatography (RPLC), making it useful as a first dimension in multidimensional liquid chromatography (MDLC) and fractionation of digests in general. Peptides elute in order of their isoelectric points and polarity. ERLIC has also been successfully utilized for the enrichment for phosphopeptides and glycopeptides, facilitating their identification. In addition, it is promising for the study of peptide deamidation. ERLIC performs comparably well or better than established methods for these various applications, and serves as a viable and efficient workflow alternative.
In an attempt to quantitate and qualitate residual antibiotics and antibacterial agents n meat simultaneously, we studied a gas chromatogrphy-mass spectrometry (GC/MS) analysis. For a simultaneous analysis of macrolide antibiotics such as erythromycin and tylosin in meat, the homogenization with MeOH, defatting with n-hexane, extraction with CHCl3, elution with CHCl3 : MeOH=2:1 from Sep-Pak silica cartridge, acid gydrolysis, back extraction with CHCl3, and quantitation by selected ion monitoring(SIM) mode after trimethylsilyl derivatization were performed. The recoveries of erythromycin and tylosin (CV,%) at 10 ppm fortification level were 90.59(4.89) and 45.91(0.20) , and the detection limits of those were 0.02 and 2.0 $\mu\textrm{g}$/g beef, respectively. From these results, the developed analytical method using GC/MS-SIM mode allows excellent detection and quantitation of residual macrolide antibiotics in meats, using complementary method with bio-assay.
Kim, Tae Hyun;Choi, Yong Seok;Choi, Young Hee;Kim, Yoon Gyoon
Toxicological Research
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v.29
no.3
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pp.203-209
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2013
A simple and rapid liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method was developed and validated for the quantification of ${\varepsilon}$-acetamidocaproic acid (AACA), the primary metabolite of zinc acexamate (ZAC), in rat plasma by using normetanephrine as an internal standard. Sample preparation involved protein precipitation using methanol. Separation was achieved on a Gemini-NX $C_{18}$ column ($150mm{\times}2.0mm$, i.d., 3 ${\mu}m$ particle size) using a mixture of 0.1% formic acid-water : acetonitrile (80 : 20, v/v) as the mobile phase at a flow rate of 200 ${\mu}l/min$. Quantification was performed on a triple quadrupole mass spectrometer employing electrospray ionization and operating in multiple reaction monitoring (MRM) and positive ion mode. The total chromatographic run time was 4.0 min, and the calibration curves of AACA were linear over the concentration range of 20~5000 ng/ml in rat plasma. The coefficient of variation and relative error at four QC levels were ranged from 1.0% to 5.8% and from -8.4% to 6.6%, respectively. The present method was successfully applied for estimating the pharmacokinetic parameters of AACA following intravenous or oral administration of ZAC to rats.
A Gram-positive bacterium (strain JB-13) that was isolated from soil as a producer of cyclodextrin glucanotransferase (CGTase) [EC 2.4.1.19] was identified as Panibacillus sp. JB-13. This CGTase could catalyze the transglucosylation reaction from soluble starch to L-ascorbic acid (AA). A main product formed by this enzyme with ${\alpha}-glucosidase$ was identified as $2-O-{\alpha}-D-glucopyranosyl{\;}_{L}-ascorbic$ acid (AA-2G) by the HPLC profile and the elemental analysis. CGTase was purified to homogeneity using ammonium sulfate fractionation, ion-exchange chromatography on DEAE-Seohadex A-50, and gel chromatography on Sephacryl S-200HR. The molecular weight was determined to be 66,000 by both gel chromatography and SDS-PAGE. The isoelectric point of the purified enzyme was 5.3. The optimum pH and temperature was PH 7.0 and $45^{\circ}C$ respectively. The enzyme was stable in the range of pH 6-9 and at temperatures of $75{\circ}C$ or less in the presence of 15 mM ${CaCl_2}.\;{Hg^2+},\;{Mn^+2},{Ag^+},\;and\;{Cu^2+}$ all strongly inhibited the enzyme's activity.
The present work describes the identification, purification, and characterization of bile salt hydrolase (BSH) from Bifidobacterium animalis subsp. lactis. The enzyme was purified to electrophoretic homogeneity by hydrophobic chromatography, ion-exchange chromatography and ultrafiltration. SDS-PAGE analysis of putative BSH and gel filtration revealed that the analyzed protein is presumably a tetramer composed of four monomers each of about 35 kDa. The purified enzyme was analyzed by liquid chromatography coupled to LTQ FT ICR mass spectrometry and unambiguously identified as a bile salt hydrolase from B. animalis. The isoelectric point of the studied protein was estimated to be around pH 4.9. The pH optimum of the purified BSH is between 4.7 to 6.5, and the temperature optimum is around 50oC. The BSH of B. animalis could deconjugate all tested bile salts, with clear preference for glycine-conjugated bile salts over taurine-conjugated forms. Genetic analysis of the bsh showed high similarity to the previously sequenced bsh gene from B. animalis and confirmed the usefulness of bile salt hydrolase as a genetic marker for B. animalis identification.
Kim Young Sik;Lee Chong Ho;Wankat Phillip C.;Koon Yoon Mo
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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v.9
no.5
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pp.362-368
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2004
A new one-column chromatography process, analogous to a four-zone simulated moving bed (SMB), was presented. The basic principle of the process was identical to that of a four-zone SMB. The process consisted of one chromatographic column and four tanks, instead of the four columns in the four-zone SMB (1-1-1-1), and has been used for the separation of two amino acids, phenylalanine and tryptophan, using an ion exchange resin. The operating parameters for the one-column process and four-zone SMB were obtained from equilibrium theory. Computer simulations were used to compare the performances of the new one column process to that of the general four-zone SMB, using Aspen $Chromatography^{TM}$ v 11.1. The differences between the one-column and SMB processes in terms of the purities and yields of phenylalanine and tryptophan were less than 4 and about $6\%$, respectively. The lower purities of the one-column process were due to the loss of the developed concentration profiles in the column when the liquid was stored in tanks. The one-column process gave great flexibility, and would be useful for reconstructing an existing conventional chromatography process to one of a SMB.
Five samples of triglyceride compositions of sesame oil and decuticled sesame oil have been determined by a gas chromatographic analysis. A similar distribution pattern of triglycerides was found in these five sesame oils. It was noted that $C_{50},\;C_{52}\;and\;C_{54}$ were the major components in these samples. The results showed that contents of $C_{50},\;C_{52}\;and\;C_{54}$ triglyceride types in five sesame oils were within $3.0{\sim}4.5%,\;23{\sim}28%\;and\;68{\sim}74%,$ respectively.
Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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1993.04a
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pp.141-141
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1993
말징버섯 Calvatia craniformis의 culture broth 40 liter를 여과하여 얻은 균사채를 열수 추출하여 진한 갈색 건조분말(Fr. A) 13.1g을 분리하였다. Fr. A에 대하여 DEAE-cellulose ion chromatography를 시행하여 중성분획인 흰색 분말 (Fr. B) 2.50g을, 산성분획인 갈색 분말 (Fr. C) 3.50g을 각각 분리하였다. Fr. B 500mg에 대하여 Sepharose CL-4B gel filtration chromatography를 시행하여 흰색분말 Fr. D(Calvatan) 350mg을 분리하였다. Calvatan 350mg에 대하여 Con A-Sepharose 4B affinity chromatography를 적용하여 미흡착 분획인 Fr. F($\alpha$-form)와 흡착 분획인 Fr. E ($\beta$-form)로 정제하였다. 항암작용의 기전을 구명하고자 마우스에 대하여 면역학적 실험을 시행하였다. macrophage의 활성에 대한 영향을 조사하였던 바, 투여군의 활성화된 macrophage에 의해 유리되는 superoxide anion의 양은 대조군에 비해 1.4배 증가하였고 Calvatan 투여군의 용혈반 형성세포(PFC)는 대조군에 비해 3.1배 증가하였다. 화학 분석에 의해, Calvatan은 다당체 87.2%, 단백질 1.8% 및 hexosamine 1.3%로 구성되어 있었다. 따라서 항암성 분획들은 protein-bound polysaccharide임을 알 수 있었다. 또한 각 분획의 다당체를 구성하고 있는 단당류는 glucose, galactose, mannose 및 xylose 였으며 단백질 부분은 16종의 아미노산으로 구성되어 있었다. IR 스펙트럼은 3300-3400 $cm^{-1}$에서 0-H stretching frequency, 2900 $cm^{-1}$ 에서 C-H stretching frequency, 1630 $cm^{-1}$ 에서 C-0 stretching frequency. 1000-1100 $cm^{-1}$에서 C-H 및 C-0 bending frequency를 나타내는 다당체의 전형적인 특성을 보여주었다.을 보여주었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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