This paper describes the development a of direct multiplex reverse transcription-nested polymerase chain reaction (PCR) method, devised for simultaneous detection and typing of influenza viruses. This method combines the direct reverse transcription reaction without RNA purification with the enhancement of sensitivity and specificity of nested PCR. The method successfully detected three major human influenza viruses: influenza virus A subtype 1 (H1N1) and subtype 3 (H3N2), and influenza B virus (B). The minimum number of virus particles (pfu/ml) necessary for detection in spiked saliva samples was 200 (H1N1), 140 (H3N2), and 4.5 (B). The method's sensitivity and simplicity will be convenient for use in clinical laboratories for the detection and subtyping of influenza and possibly other RNA viruses.
In this study we aim to extensively investigate the anti-influenza virus immune responses in human pharyngeal epithelial cell line (Hep-2) and evaluate the protective role of Toll-like receptor (TLR) ligands in seasonal influenza A H1N1 (sH1N1) infections in vitro. We first investigated the expression of the TLRs and cytokines genes in resting and sH1N1 infected Hep-2 cells. Clear expressions of TLR3, TLR9, interleukin (IL)-6, tumour necrosis factor (TNF)-${\alpha}$ and interferon (IFN)-${\beta}$ were detected in resting Hep-2 cells. After sH1N1 infection, a ten-fold of TLR3 and TLR9 were elicited. Concomitant with the TLRs activation, transcriptional expression of IL-6, TNF-${\alpha}$ and IFN-${\beta}$ were significantly induced in sH1N1-infected cells. Pre-treatment of cells with poly I:C (an analog of viral double-stranded RNA) and CpG-ODN (a CpG-motif containing oligodeoxydinucleotide) resulted in a strong reduction of viral and cytokines mRNA expression. The results presented indicated the innate immune response activation in Hep-2 cells and affirm the antiviral role of Poly I:C and CpG-ODN in the protection against seasonal influenza A viruses.
Byeon, Kyeong Hyang;Kim, Jai Yong;Choi, Bo Young;Choi, Bo Youl
Health Policy and Management
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v.28
no.2
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pp.107-118
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2018
Background: The purpose of this study was to investigate the estimated proportion for influenza vaccination and to identify factors associated with influenza vaccination in Korean diabetic patients. Methods: Data from the fourth, fifth, and sixth (except for 2013) Korea National Health and Nutrition Examination Survey (n=3,726) was used. A chi-square test was performed to investigate the estimated proportion for influenza vaccination, and a multiple logistic regression analysis was used to identify the factors associated with self-reported influenza vaccination. Results: In men, 28.8% of diabetes patients 30-64 years of age, and 76.1% of elderly (over 65 years of age) diabetes patients received influenza vaccination. In women, 37.7% of diabetes patients 30-64 years of age, and 78.4% of elderly diabetes patients received influenza vaccination (p<0.0001). The determinants of influenza vaccination were marriage, hypertension (odds ratio [OR], 1.55; 95% confidence interval [CI], 1.07-2.24), residence within a mega city, unemployment (OR, 3.94; 95% CI, 1.24-12.54), and exercise via (weekly) walking for diabetic men; and hypertension (OR, 1.71; 95% CI, 1.16-2.52), chronic disease (OR, 1.81; 95% CI, 1.08-3.02), and exercise via walking (OR, 2.65; 95% CI, 1.49-4.73) for diabetic women. Conclusion: Influenza vaccination remains relatively low in young diabetic patients. It is necessary to recommend vaccination to young diabetic patients, and to devise other strategies to improve vaccination.
Swine influenza is an acute respiratory disease prevalent in pig-growing areas all around the world and plays the roles of an intermediate host to be transmitted to mammals including human beings through a genetic recombination with the avian influenza virus. Recognizing that people could be contracted with swine influenza, this study set out to investigate the seroprevalence of individual and multiple infections with two subtypes (H1N1 and H3N2) of the swine influenza virus in pig farms in the Gyeongnam region according to age, area, and season, as well as to provide basic data for the prevention and control of swine influenza. Used in the study were total 904 swine sera that were not vaccinated against the influenza gathered from the pig farms in the Gyeongnam region from November, 2009 to October, 2010. HerdChek SIV (H1N1, H3N2) ELISA kit (IDEXX Laboratories, USA) was used for antibody testing against swine influenza. The test results show that 370 sera (40.9%) were infected with either H1N1 or H3N2 with 37.3% (337 sera) being contracted with H1N1, 13.1% (118 sera) with H3N2, and 9.4% (85) with both H1N1 and H3N2.
Purpose: This study was done to examine the actual state of influenza vaccination among pregnant women and factors affecting vaccination rate. Methods: Data were collected using self-report questionnaires. Participants were pregnant women who participated in a prenatal education program at an acute care hospital in 2013. Data collected from 218 pregnant women were analyzed using the SPSS 18.0 Program. Results: Only 48.6% of the pregnant women had received vaccination when the influenza was prevalent. Statistically significant factors affecting the influenza vaccination rate among pregnant women were vaccination experience in the previous year, knowledge and attitude about vaccination, and gestation period. Conclusion: Results indicate that the influenza vaccination rate among pregnant women is lower than that of elders, healthcare workers, and patients with chronic diseases, who have been considered to be the mandatory vaccination recipients. Therefore, it is necessary to develop programs and policies which provide information including safety of vaccines for pregnant women and to induce positive attitudes towards vaccination for these women, in order to ultimately improve the vaccination rate.
Kim, Jae Kyung;Jeon, Jae-Sik;Kim, Jong Wan;Rheem, Insoo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.23
no.2
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pp.267-273
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2013
Multiplex RT-PCR was used to detect respiratory viruses in 5,318 clinical samples referred to the laboratory of a tertiary teaching hospital from December 2006 to November 2010. The acquired data were analyzed with respect to types, ratio, and co-infection trends of infected respiratory viruses. Trends in respiratory viral infection according to sex, age, and period of infection were also analyzed. Of the 5,318 submitted clinical samples, 3,350 (63.0%) specimens were positive for at least one respiratory virus. The infection rates were 15.8% for human rhinovirus, 14.4% for human respiratory syncytial virus A, 9.7% for human respiratory syncytial virus B, 10.1% for human adenovirus, 5.4% for influenza A virus, 1.7% for influenza B virus, 4.7% for human metapneumovirus, 2.3% for human coronavirus OC43, 1.9% for human coronavirus 229E/NL63, 3.7% for human parainfluenza virus (HPIV)-1, 1.1% for HPIV-2, and 5.3% for HPIV-3. The co-infection analysis showed 17.1% of double infections, 1.8% of triple infections. The median age of virus-positive patients was 1.3 years old, and the 91.5% of virus-positive patients were under 10 years old. Human respiratory syncytial virus was the most common virus in children < 5 years of age and the influenza A virus was most prevalent virus in children over 5 years of age. These results help in elucidating the tendency of respiratory viral infections.
Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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2009.05a
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pp.1130-1135
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2009
Avian Influenza is an infectious desease of birds. The infection can cause a wide spectrum of symptoms in birds, ranging from mild illness to a rapidly fatal diseases which might bring a tremendous economic loss to poultry farms[1]. It can also give fatal diseases to human. Therefore it is important to surveil wildbirds that are primary transportation of avian influenza. This report showed a relationship between avian influenza and a habitat of wildbirds using system dynamics, and concluded with suggestion for surveilance.
Park, Hyeon-Chun;Shin, Juyoun;Cho, Sung-Min;Kang, Shinseok;Chung, Yeun-Jun;Jung, Seung-Hyun
Genomics & Informatics
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v.18
no.1
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pp.5.1-5.5
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2020
Highly pathogenic avian influenza (HPAI) viruses have caused severe respiratory disease and death in poultry and human beings. Although most of the avian influenza viruses (AIVs) are of low pathogenicity and cause mild infections in birds, some subtypes including hemagglutinin H5 and H7 subtype cause HPAI. Therefore, sensitive and accurate subtyping of AIV is important to prepare and prevent for the spread of HPAI. Next-generation sequencing (NGS) can analyze the full-length sequence information of entire AIV genome at once, so this technology is becoming a more common in detecting AIVs and predicting subtypes. However, an analysis pipeline of NGS-based AIV sequencing data, including AIV subtyping, has not yet been established. Here, in order to support the pre-processing of NGS data and its interpretation, we developed a user-friendly tool, named prediction of avian influenza virus subtype (PAIVS). PAIVS has multiple functions that support the pre-processing of NGS data, reference-guided AIV subtyping, de novo assembly, variant calling and identifying the closest full-length sequences by BLAST, and provide the graphical summary to the end users.
Jung, Seungwon;Lee, Joon Hee;Kang, Jin Han;Lee, Hak Sung;Choi, Jae Won;Ma, Sang Hyuk;Lee, Jaywon
Pediatric Infection and Vaccine
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v.24
no.1
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pp.23-30
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2017
Purpose: The objective of this study was to compare the clinical characteristics of influenza A and B infections and analyze the effect of oseltamivir in hospitalized children. Methods: We investigated children under the age of 15, who were diagnosed with influenza A/H1N1, A/H3N2, or B from January to April 2014. The subjects were admitted to the Changwon Fatima Hospital and diagnosed using a rapid antigen test from nasopharyngeal swabs. The medical records of the patients were retrospectively reviewed. Results: A total of 302 pediatric patients with influenza were enrolled. Influenza B infection was the most common type (n=187, 61.9%), followed by A/H3N2 (n=100, 33.1%) and A/H1N1 (n=15, 5.0%). Compared to patients diagnosed with influenza A, patients diagnosed with influenza B were older (P=0.005), and the duration of fever was significantly longer (P=0.001). A total of 161 patients (53.3%) had been vaccinated against influenza during the season, before admission. Among the patients infected with A/H3N2 and B, the duration of fever was shorter in oseltamivir recipients compared to oseltamivir non-recipients (P=0.026 and P=0.004, respectively). Conclusions: There were significant differences between influenza A and B groups in terms of age, demographics, and clinical course. Although the effectiveness of oseltamivir on influenza differs according to the type of influenza, our data provides evidence that oseltamivir is beneficial for both A and B infections.
Kim, Minjee;Nguyen, Dinh-Van;Heo, Yoonki;Park, Ki Hoon;Paik, Hyun-Dong;Kim, Young Bong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.30
no.2
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pp.172-177
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2020
Influenza viruses cause respiratory diseases in humans and animals with high morbidity and mortality rates. Conventional anti-influenza drugs are reported to exert side effects and newly emerging viral strains tend to develop resistance to these commonly used agents. Fritillaria thunbergii (FT) is traditionally used as an expectorant for controlling airway inflammatory disorders. Here, we evaluated the therapeutic effects of FT extracts against influenza virus type A (H1N1) infection in vitro, in ovo, and in vivo. In the post-treatment assay, FT extracts showed high CC50 (7,500 ㎍/ml), indicating low toxicity, and exerted moderate antiviral effects compared to oseltamivir (SI 50.6 vs. 222) in vitro. Antiviral activity tests in ovo revealed strong inhibitory effects of both FT extract and oseltamivir against H1N1 replication in embryonated eggs. Notably, at a treatment concentration of 150 mg/kg, only half the group administered oseltamivir survived whereas the FT group showed 100% survival, clearly demonstrating the low toxicity of FT extracts. Consistent with these findings, FT-administered mice showed a higher survival rate with lower body weight reduction relative to the oseltamivir group upon treatment 24 h after viral infection. Our collective results suggest that FT extracts exert antiviral effects against influenza H1N1 virus without inducing toxicity in vitro, in ovo or in vivo, thereby supporting the potential utility of FT extract as a novel candidate therapeutic drug or supplement against influenza.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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