Matt James;Colin Pipe;Mark Fever;Jen Field;Seungho Chae
FOCUS: LIFE SCIENCE
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no.1
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pp.6.1-6.9
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2024
The document is a white paper on Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography (HILIC) analysis method development. HILIC is a type of chromatography that uses an organic/aqueous mobile phase and a polar stationary phase. In HILIC, water is a strong solvent, and unlike in Reversed Phase Liquid Chromatography (RPLC), increasing the proportion of water in the mobile phase reduces the retention time of the analyte. The paper discusses when to consider HILIC analysis methods, the advantages of HILIC, and the challenges often encountered due to the lack of understanding of HILIC mechanisms compared to RPLC. It also provides a systematic flowchart for intelligent solutions for HILIC analysis method development, which includes a three-step approach for chromatography analysis method development. The first step involves gathering as much information as possible about the analyte (e.g., pKa, log P, log D). The second step involves analyzing the sample under different pH conditions using three HILIC columns in either isocratic or gradient mode to identify the suitable column/pH combination for the analyte. The third step involves optimizing the separation by investigating other parameters such as temperature and ionic strength, and assessing the robustness of the method. The paper emphasizes that the selection of the appropriate stationary/mobile phase combination, based on the differences between the HILIC stationary phases and the mobile phase pH, can provide high selectivity in the analysis. This step-by-step approach can help users develop an efficient analysis method.
Characterization and studies of proteome are challenging because biological samples are complex, with a wide dynamic range of abundance. At present the proteins are identified by digestion into peptides, with subsequent identification of the peptides by mass spectrometry (MS). MS is a powerful technique for the purpose, but it cannot identify every peptide in such complex mixtures simultaneously. For accurate analysis and quantification it is important to separate the peptides first by chromatography into fractions of a size that MS can handle. With these less complex fractions, the probability is increased of identifying peptides of low abundance that would otherwise experience ion suppression effects due to the presence of peptides of high abundance. Enrichment for peptides with certain post-translational modifications helps to increase their detection rates as well. Electrostatic repulsion-hydrophilic interaction chromatography (ERLIC) is a mixed-mode chromatographic technique which combines the use of electrostatic repulsion and hydrophilic interaction. This review provides an overview of ERLIC and its various proteomics applications. ERLIC has been demonstrated to have good orthogonality to reverse phase liquid chromatography (RPLC), making it useful as a first dimension in multidimensional liquid chromatography (MDLC) and fractionation of digests in general. Peptides elute in order of their isoelectric points and polarity. ERLIC has also been successfully utilized for the enrichment for phosphopeptides and glycopeptides, facilitating their identification. In addition, it is promising for the study of peptide deamidation. ERLIC performs comparably well or better than established methods for these various applications, and serves as a viable and efficient workflow alternative.
Phosphorylation and glycosylation are two of the most important and widespread post-translational modifications (PTMs) in an organism. Proteomics analysis of the PTMs has been challenged by low stoichiometry of the modified proteins and suppression effects by high abundance proteins, typically no-functional house-keeping proteins. In this study, a novel method was applied for not only isolating PTM peptides from intact peptides but also concurrently characterizing of glyco- and phosphoproteome using electrostatic repulsion hydrophilic interaction chromatography (ERLIC) packed with silica coated by crosslinked polyethyleneimine. For 2 mg tryptic digest of mouse proteome of epicardial adipose tissue with fat diet, 802 N-glycosylated peptides of 316 glycoproteins and 159 phosphorylated peptides of 75 phosphoproteins were identified using HPLC chip/quadrupole time-of-flight (Q-OF) tandem mass spectrometer.
A simple new method was developed for the determination of betaine in Fructus Lycii using hydrophilic interaction liquid chromatography with evaporative light scattering detection (HILIC-ELSD). Good chromatographic separation and reasonable betaine retention was achieved on a Kinetex HILIC column ($2.1{\times}100mm$, $2.6{\mu}m$) packed with fused-core particle. The mobile phase consisted of (A) acetonitrile and (B) 10 mM ammonium formate (pH 3.0)/acetonitrile (90/10, v/v). It was used with gradient elution at a flow rate of 0.7 mL/min. The column temperature was set at $27.5^{\circ}C$ and the injection volume was $10{\mu}L$. The ELSD drift tube temperature was $50^{\circ}C$ and the nebulizing gas (nitrogen) pressure was 3.0 bar. Stachydrine, a zwitterionic compound, was used as an internal standard. Calibration curve over $10-250{\mu}g/mL$ showed good linearity ($R^2$ > 0.9992) and betaine in the 70% methanol extract of Fructus Lycii was well separated from other peaks. Intraand inter-day precision ranged from 1.1 to 3.0% and from 2.4 to 5.3%, respectively, while intra- and inter-day accuracy ranged from 100.0 to 107.0% and from 94.3 to 103.9%, respectively. The limit of quantification (LOQ) was $10{\mu}g/mL$ and the recoveries were in the range of 98.2-102.7%. The developed HILIC-ELSD method was successfully applied to quantitatively determine the amount of betaine in fourteen Fructus Lycii samples from different locations, demonstrating that this method is simple, rapid, and suitable for the quality control of Fructus Lycii.
Oh, Mi Hyune;Lim, Moo Song;Chai, Jeung Young;Kim, Eun Jung;Cho, Joong Hoon;Lim, Chul Joo;Choi, Sun Ok
Journal of Food Hygiene and Safety
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v.32
no.2
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pp.89-95
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2017
A rapid, sensitive analytical method for glucuronolactone in beverages was developed and validated using hydrophilic interaction liquid chromatography coupled to electrospray ionization tandem mass spectrometry (HILIC-ESI-MS/MS). To determine the optimum analytical conditions for glucuronolactone, three different kinds of HILIC columns and two mobile phases with different pH values were examined. An amide-bonded stationary phase with a pH 9 acetonitrile-rich mobile phase was the best condition in terms of column retention, ESI-MS/MS response area, and signal-to-noise ratio. After extraction, glucuronolactone was separated through the HILIC amide column and detected by negative ESI-MS/MS in selected reaction monitoring (SRM) mode. Nine energy drinks sold in Korea were spiked with glucuronolactone at a concentration of 5 ng/mL; the Monster $Energy^{TM}$ sample showed the smallest peak area and its signal-to-noise ratio was used for method validation. Good linearity was obtained in the concentration range from 20 to 1500 ng/mL with a correlation coefficient > 0.998. The developed method had a limit of detection (LOD) of 6 ng/mL and a limit of quantitation (LOQ) of 20 ng/mL. The recovery of this method at concentration of 20, 100, 500, and 1000 ng/mL was 96.3%-99.2% with relative standard deviations (RSD) of 1.6%-14.0%. A reproducibility precision assessment at concentration of 100 and 500 ng/mL was carried out among three laboratories. The recovery of that evaluation was 95.1%-102.3% with RSD of 2.7%-7.0%. An analysis of variance indicated that there was no difference between the recovery results of the three laboratories at the 5% significance level. The validated method is applicable to inspecting beverages adulterated with glucuronolactone in Korea.
A rapid, sensitive and selective hydrophilic interaction liquid chromatography-tandem mass spectrometric(HILIC-MS/MS) method for the determination of tiapride in human plasma was developed. Tiapride and internal standard, metoclopramide were extracted from human plasma with dichloromethane at basic pH and analyzed on an Atlantis HILIC silica column with the mobile phase of acetonitrile-ammonium formate (190 mM, pH 3.0) (94:6, v/v). The ana-Iytes were detected using an electrospray ionization tandem mass spectrometry in the multi-ple-reaction-monitoring mode. The standard curve was linear (r=0.999) over the concentration range of 1.00-200 ng/mL. The coefficient of variation and relative error for intra- and inter-assay at three QC levels were 6.4∼8.8% and -2.0∼3.6%, respectively. The recoveries of tiapride ranged from 96.3 to 97.4%, with that of metoclopramide (internal standard) being 94.2%. The lower limit of quantification for tiapride was 1.00 ng/mL using 1 00 $\mu$L of plasma sample.
Background: Red ginseng polysaccharides (RGPs) have been acknowledged for their outstanding immunomodulation and anti-tumor activities. However, their studies are still limited by the complexity of their structural features, the absence of purification and enrichment methods, and the rarity of the analytical instruments that apply to the analysis of such macromolecules. Thus, this study is an attempt to establish a new mass spectrometry (MS)-based analysis procedure for RGPs. Methods: Saponin pre-excluded powder of RG (RG-SPEP, 10 mg) was treated with 200 µL of distilled water and centrifuged for 5 h at 1000 rpm and 85 ℃. Ethanol-based precipitation and centrifugation were applied to obtain RGPs from the heated extracts. Further, endo-carbohydrase treatments were performed to produce specific saccharide fragments. Solid-phase extraction (SPE) processes were implemented to purify and enrich the enzyme-treated RGPs, while matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight/time-of-flight (MALDI-TOF/TOF) MS was employed for the partial structural analysis of the obtained RGPs. Results: Utilizing cellulase, porous graphitized carbon (PGC), hydrophilic interaction chromatography (HILIC), and MALDI-TOF/TOF MS, the neutral and acidic RGPs were qualitatively analyzed. Hexn and Hexn-18 (cellulose analogs) were determined to be novel neutral RGPs. Additionally, the [Unknown + Hexn] species were also determined as new acidic RGPs. Furthermore, HexAn (H) was determined as another form of the acidic RGPs. Conclusion: Compared to the previous methods of analysis, these unprecedented applications of HILIC-SPE and MALDI-TOF/TOF MS to analyze RGPs proved to be fairly effective for fractionating and detecting neutral and acidic components. This new procedure exhibits great potential as a specific tool for searching and determining various polysaccharides in many herbal medicines.
Riboflavin is a water-soluble vitamin, which serves as a precursor to flavin mononucleotide and flavin adenine dinucleotide. This study aimed to develop a simple and rapid liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) analysis for the quantification of riboflavin in the Beagle dog plasma. This method utilized simple protein precipitation with acetonitrile and 13C4, 15N2-riboflavin was used as an internal standard (IS). For chromatographic separation, a hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) column was used with gradient elution. The mobile phase consisted of 0.1% (v/v) aqueous formic acid with 10 mM ammonium formate and acetonitrile with 0.1% (v/v) formic acid. Since riboflavin is an endogenous compound, 4% bovine serum albumin in phosphate buffered saline was used as a surrogate matrix to prepare the calibration curve. The quantification limit for riboflavin in the Beagle dog plasma was 5 ng/mL. The method was fully validated for its specificity, sensitivity, accuracy and precision, recovery, and stability according to the US FDA guidance. The developed LC-MS/MS method may be useful for the in vivo pharmacokinetic studies of riboflavin.
Hyejin Cho;Sullim Lee;Myoung-Sook Shin;Joohwan Lee;Sanghyun Lee
Korean Journal of Pharmacognosy
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v.54
no.1
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pp.38-43
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2023
A simple and accurate assay was developed for the quantitative analysis of 1-deoxynojirimycin (1-DNJ) derived from the silkworm (Bombyx mori). Normal-phase high-performance liquid chromatography coupled with an evaporative light scattering detector (HPLC-ELSD) and a hydrophilic interaction liquid chromatography column was used. Various parameters were applied to optimize the analysis method. The limits of detection and quantification of 1-DNJ were 2.97 × 10-3 and 9.00 × 10-3 mg/mL, respectively. The calibration curve showed good linearity results. The concentration range and the r2 value were 0.0625-1.0 mg/mL and 0.9997, respectively. The accuracy test demonstrated a significantly high recovery rate (89.95-103.22%). The relative standard deviation was ≤ 1.00%. Thus, a method for the accurate identification and quantitative analysis of 1-DNJ in silkworms was developed. Moreover, in this procedure, the process of derivatization of 1-DNJ, which was required in previous experiments, could be eliminated. This technique may be actively utilized for the development of pharmaceuticals and health functional foods using 1-DNJ.
Solakyildirim, Kemal;Li, Lingyun;Linhardt, Robert J.
Mass Spectrometry Letters
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v.9
no.3
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pp.67-72
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2018
Alkaline phosphatase (AP) is a membrane-bound glycoprotein that is widely distributed in the plasma membrane of cells of various organs and also found in many organisms from bacteria to humans. The complete amino acid sequence and three-dimensional structure of human placental alkaline phosphatase have been reported. Based on the literature data, AP consists of two presumptive glycosylation sites, at Asn-144 and Asn-271. However, it only contains a single occupied N-linked glycosylation site and no occupied O-linked glycosylation sites. Hydrophilic interaction chromatography (HILIC) has been primarily employed for the characterization of the glycan structures derived from glycoproteins. N-glycan structures from human placental alkaline phosphatase (PLAP) were investigated using HILIC-Orbitrap MS, and subsequent data processing and glycan assignment software. 16 structures including 10 sialylated N-glycans were identified from PLAP.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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