• 제목/요약/키워드: HpaII

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Pichia pastoris에서 생산된 인체 췌장 α-아밀레이스 동질효소의 촉매활성에 대한 염소이온의 영향 (Effect of chloride ions on the catalytic properties of human pancreatic α-amylase isozyme produced in Pichia pastoris)

  • 김민규;김영완
    • 한국식품과학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.341-346
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    • 2016
  • HPA는 식품으로 섭취되는 녹말을 분해하는데 있어서 매우 중요한 역할을 수행하는 효소이기 때문에 HPA 효소 활성의 억제는 당뇨와 비만과 같은 질환의 예방과 치료에 있어서 의미를 가진다. 따라서 HPA는 당뇨병 치료와 비만 예방을 위한 새로운 식 의약품 소재 개발을 위한 주요 타깃 효소 중 하나이며, 새로운 소재의 개발을 위해서는 HPA의 반응 메커니즘을 비롯하여 천연 기질 분해 특성에 대한 이해가 반드시 필요하다. 본 연구에서는 HPA의 동질효소 중 연구가 거의 진행되지 않은 HPA II에 대한 효소 특성화를 진행하고자 P. pastoris 시스템을 이용하여 재조합 HPA II를 생산하였으며, 녹말 분해와 관련된 효소적 특성을 분석하였다. HPA II는 10 mM NaCl까지 농도 의존적으로 효소활성이 증가하였으며, 최적 활성을 위한 pH는 0 mM NaCl 조건에서 pH 6.5이었으나 10 mM NaCl조건에서 pH 7.5로 이동하는 특성을 보였으며, 이는 HPA I을 포함하는 염소이온 의존형 아밀레이스가 나타내는 전형적인 특징이다. 염소이온 존재 시 최적 pH가 염기성 pH 영역으로 이동하는 것은 염소 이온과 효소의 결합에 의해 HPA II의 산/염기 촉매 잔기의 $pK_a$값이 커진다는 것을 의미하며, 염소이온을 첨가하였을 때 녹말에 대한 가수분해 활성의 증대 정도가 산성 pH 영역보다 염기성 pH 영역에서 두드러지게 나타났다는 점이 이를 뒷받침하였다. 반응속도론적 분석 결과에 따르면 염소이온 존재 시 효소활성의 증대는 대부분 전환수(turnover number)의 증대에 의한 것으로 나타났으며, 가용성 녹말 보다 곡류 녹말에 대한 전환수의 증대가 크게 나타났다. 염소이온은 활성의 증대뿐만 아니라 고농도의 기질 조건에서 기질에 의한 효소 활성 억제 양상을 심화시키는 것으로 나타났다. 결론적으로 HPA II의 특징은 HPA I과 거의 유사한 경향을 나타내었으며, 염소이온 첨가여부에 따른 HPA II의 가수분해활성 결과를 바탕으로 향 후 HPA에 대한 곡류 녹말 가수분해 활성 억제제 개발을 위한 연구를 추진할 계획이다.

제한효소 Sma I, Xma I, AVa I, Nae I의 DNA절단반응에 있어서 Hpa II methylation의 억제효과 (Inhibition of Sma I, Ava I, Nae I, and Xma I endonuclease activities by the methylation of DNA with Hpa II methylase)

  • 최우성;강선철;서정선;유욱준
    • 미생물학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.86-90
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    • 1986
  • The DNA methylated by Hpa II methylase was not cleaved by Sma, I, Ava I and Nae I endonucleases. This experimental data could be interpreted as strong evidences that Sma I, Ava I and Nae I methylases which yet to be isolated would methylate on the inmost cytosine nucleotide within their hexameric recognition sequences. The facts that Sma I, Ava I and Nae I endonucleases can not cleave the DNA methylated by Hpa II methylase are the valuable informations for protecting DNAs upon cleavage reactions by Sma I, Ava I and NAe I endonucleases especially for cDNA insertion experiments into vector DNAs using Sma I, Ava I and Nae I oligonucleotide linkers. In the case of Xma I endonuclease, partially cleaved DNA fragments were observed although the reaction rate was greatly decreased. This result implies that the methylation site of Xma I methylase which yet to be isolated would not be the same as that of Hpa II methylase in Xma I sequence.

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우리나라 야생 차나무(Camellia sinensis L.)의 유전적 다양성 (Genetic Diversity of Wild Tea(Camellia sinensis L.) in Korea)

  • 오찬진;이솔;유한춘;채정기;한상섭
    • 한국자원식물학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.41-46
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    • 2008
  • 차나무의 분자학적 유연관계 및 유전적 다양성을 알아보기 위하여 한국에서 자생하는 차나무 집단 21개 지역 차나무에 대하여 DFR 유전자 부위를 이용하여 PCR-RFLP분석을 하였다. DFR 4+5 primer 쌍을 이용하여 증폭결과 DFR유전자의 크기는 약 1.4kb에서 PCR산물을 획득하였다. PCR산물에 제한효소 Hpa II 및 Mse I를 이용하여 RFLP분석 결과 차나무 집단간 또는 집단내 차나무간의 유전적 다양성을 보였다. Hpa II 제한효소를 이용한 RFLP 밴드패턴은 3가지 형태로 구분되었으며, 같은 차나무 집단내에서도 유전적 다양성이 나타났다. Mse I 제한효소를 이용한 밴드패턴은 6가지의 형태로 다양성을 보였으며, 웅포집단 차나무의 경우 집단 내 다양성이 2가지 형태로 나타나 같은 집단내에서의 유전적 변이는 적은 것으로 보인다. 본 연구에서 사용한 2가지의 제한효소의 결과 차나무의 집단간 또는 같은 집단내의 차나무간에서 유전적 다양성을 확인할 수 있었다.

황색포도상구균에서 테트라사이클린 내성을 나타내는 플라스미드의 동정 (Characterization of Tetracycline Resistant Plasmid in Staphylococcus aureus by Restriction Enzyme Mapping)

  • 김기현;김종명;문경호
    • 약학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.255-258
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    • 1992
  • The clinical isolate Staphylococcus aureus SA8 was resistant to tetracycline(Tc) and harboured a plasmid pKH1(24.82 kb). pKH1 was shown by curing and by transformation to specify resistance to Tc. The cleavage map of a pKH1 was determined by restricction enzyme mapping techniques. Cleavage map is given for BglII, EcoRI, HpaII, PvuII and SalI. Restriction endonuclease BamHI, BglI, BstEII, HpaI, PstI, and XhoI have no sites on this plasmid. HaeIII, XbaI, and HindIII have 5, 6, 14 sites, respectively.

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Differentiation and Detection of Phytoplasma using PCR from Diseased Plant in Korea

  • Lee, Kui-Jae
    • Plant Resources
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    • 제3권3호
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    • pp.173-178
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    • 2000
  • This test checked jujube witches'-broom disease, sumac witches'-broom disease, paulonia witches'- broom disease, and mulberry dwarf disease whether or not they were infected by phytoplasma, using universal and specific primers. Upon treatment of DNA amplified by PCR of phytoplasma with Alu I , Hpa II and Sat I restricted enzymes, distinction of phytoplasmas was possible. Particularly, phytoplasma of each host was distinguishable by treatment of Hpa II restricted enzyme. Meanwhile, analysis of restricted enzymes of jujube witches'-broom disease showed a higher infectivity of phytoplasmas of two origins. There were a lot of relations between jujube witches'-broom disease and sumac witches'-broom disease, and between paulonia witches'-broom disease and mulberry dwarf disease.

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다제내성 황색포도상구균이 가지고 있는 테트라사이클린 내성 플라스미드의 동정 (Characterization of Tetracycline Resistance Plesmid of Multidrug-resistant Staphylococcus aureus)

  • 이대운;문경호
    • 약학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.6-9
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    • 1995
  • The clinical isolate Staphylococcus aureus SA2 had four kinds of plasmids and was resistant to ampicillin, chloramphenicol, clindamycin, erythromycin, gentamicin, kanamycin, methicillin, streptomycin, tetracycline and tobramycin. Transformation experiment demonstrated that 4.44 kb plasmid(pKH6) encoded resistance to tetracycline. The cleavage map of pKH6 was determined by restriction enzyme mapping techniques. The cleavage map is given for EcoRV, HindIII, HpaI, HpaII, KpnI and Xbal. Restriction endonucleases BamHl, BglI, BGIII, BstEII, EcoRI, HaellI, PstI, PvuII, SalI, Smal, and Xhol have no site on this plasmid. The restriction map revealed extensive structural homology between pKH6 and pT181.

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Hpall-Mspl Methylation Microarray를 이용한 비소세포폐암의 DNA Methylation Marker 발굴 (Identification of DNA Methylation Markers for NSCLC Using Hpall-Mspl Methylation Microarray)

  • 권미혜;이고은;권선중;최유진;나문준;조현민;김영진;설혜정;조영준;손지웅
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제65권6호
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    • pp.495-503
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    • 2008
  • 연구배경: 유전자의 후생적인 변화(epigenetic alteration)는 악성종양의 병인론에 있어서 유전자 변이와 동등한 위치를 점하고 있다. 특히 종양억제 유전자의 전사 촉진(promoter) 부위에 발생하는 비정상적인 메칠화(methylation)는 유전자의 발현을 침묵화(silencing)하고, 결과적으로 유전자의 기능 소실을 일으키게 된다. 저자들은 CpG island와 HpaII site를 가지고 있으며 암화 과정에 관여할 것으로 생각되는 유전자에 대하여 HpaII-MspI methylation microarray를 이용하여 새로운 종양억제 유전자를 발굴하고자 하였다. 방 법: 2005년 건양대학교 병원에서 수술한 비 소세포성 폐암 환자 10명에서 폐암조직과 상응하는 암 주변의 정상조직을 얻었으며, HpaII-MspI methylation microarray (Methyl-Scan DNA chip$^{(R)}$, Genomic tree, Inc, South Korea)를 이용하여 21개의 유전자에 대하여 DNA methylation profile을 분석하였다. 각각의 유전자에서 메칠화된 정도를 두 그룹에서 비교하였고, 정상 대조군으로 두 명의 젊고 건강한 기흉 환자에서 수술한 폐 조직에 대하여 methylation profile을 분석하였다. 결 과: 21개의 대상 유전자 중 10개의 유전자에서 폐암조직, 폐암 주변 정상 조직, 대조군에서 모두 공통적으로 과메칠화 되었고, 나머지 11개의 유전자 중 APC, AR, RAR-b, HTR1B, EPHA3, CFTR의 6개의 유전자에서 대조군에서 메칠화가 없으며, 폐암조직에서 폐암 주변 정상 조직에 비하여 더 빈번하게 과메칠화 되었다. 결 론: HTR1B, EPHA3, CFTR은 비소세포 폐암에서 후생적 변화로 발생하는 새로운 종양억제 유전자의 후보 유전자로서의 가능성이 있을 것으로 생각한다.

한우 Mitochondrial DNA D-Loop 영역의 RFLP Marker가 산유량에 미치는 영향 (Effect of RFLP Marker of the Mitochondrial DNA D-Loop Region on Milk Production in Korean Cattle)

  • 정의룡;정구용
    • 한국축산식품학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.218-225
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    • 2005
  • 본 연구는 mt DNA의 D-loop 영역을 probe로 이용한 Southern blot hybridization 분석 기법을 이용하여 한우에서 mt DNA의 RFLP를 분석하고 RFLP marker가 유생산에 미치는 영향을 분석하여 산유량 관련 DNA marker를 개발하고자 수행하였다. Mt DNA의 D-loop 영역내 404번부터 15061까지 1142 bp 크기의 염기 서열 부위를 특이적인 primer를 이용하여 PCR로 증폭하였다. Mt DNA를 HpaII, BamHI, XbaI, HinfI, EcoRI, HindII 및 RsaI 7종류의 제한효소를 이용하여 각각 절단한 후 DIG로 표지된 D-loop probe를 이용하여 검출한 결과 XbaI, RsaI, BamHI 및 HpaII 4종류의 제한효소에서 각각 RFLP 다형성이 검출되었고 EcoRI, HindIII 및 HinfI 3종류 제한효소는 변이가 존재하지 않았다. 다유 계통과 저유 계통 선발 집단간의 각 제한효소별 RFLP type의 출현빈도를 비교한 결과 BamHI 및 RsaI 제한효소에서 두 집단간의 RFLP type의 출현율에 각각 통계적 유의성(P<.05)이 인정되었다. 다유 및 저유성으로 극단의 육종가 값을 갖는 두 계통의 mt DNA D-loop영역의 염기 서열을 비교 분석한 결과 441번째 염기가 G/C, 469번째 염기는 T/C, 503번째 염기는 C/T, 569번째 염기는 G/A, 614번째 염기는 C/A그리고 644번째 염기는 C/T로 각각 염기가 치환되었고 특히, 다유 계통 개체의 677번째의 A염기가 저유 계통 개체에서는 결실되어 있다는 사실이 확인되었다. 한편, 한우 암소의 유생산에 영향을 미치는 효과를 규명하기 위하여 mt DNA RFLP 형과 송아지 이유시 체중, 생시체중 및 비유량을 측정하여 얻어진 육종가의 성적을 근거로 통계 분석한 결과 XbaI 제한효소의 RFLP type이 산유 능력 육종가와 유의적인 관련성이 확인되었다 (P<05). 즉, RFLP A type을 갖는 축군의 평균 육종가 추정치가 6.233으로 B type을 갖는 축군의 평균 육종가 추정치 0.757보다 월등히 높은 것으로 나타났다. 결론적으로 산유량과 관련성이 확인된 mt DNA RFLP type은 한우의 산유량 향상을 위한 DNA marker로 이용 가능할 것으로 기대된다.

The PGC-II Polymorphism of the Peroxisome Proliferator-activated Receptor ${\gamma}$ Coactivator $1{\alpha}$ (PGC-$1{\alpha}$) Gene in Korean Subjects with the Metabolic Syndrome

  • Im, Sun-Ok;Kim, In-Sik;Kang, Sang-Sun;Hyun, Sung-Hee
    • 대한의생명과학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.139-145
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    • 2012
  • RFLP of PGC-$1{\alpha}$ gene of 285 Korean women was analyzed by PCR and HpaII restriction. We evaluated the correlation between PGC 1 genotypes and biochemical results, using the results of RFLP. Study subjects were divided into 3 groups: normal group (who has been average value of serum biochemical analysis), upper group (who has been higher value than average value), and low group (who have been lower value than average value). The frequencies of $H_1H_1$, $H_1H_2$, and $H_2H_2$ genotypes were 92 (32%), 85 (32%), and 108 (38%) respectively, and the ratio between $H_1$ and $H_2$ alleles was 1:1.1. There were no meaningful differences between biochemical results and PGC-$1{\alpha}$ genotypes in the normal group. But, in upper group, there was significant difference in total cholesterol (P=0.04) level. In the result of Turkey multiple comparison test, the P value of $H_1H_1$ and $H_2H_2$ was 0.059. In upper group, there were noticeable differences also in triglyceride (P=0.034) level and glucose (P=0.043) level, respectively. There were important differences between $H_1H_1$ type and $H_1H_2$ type in triglyceride (P=0.029) level and between $H_1H_2$ type and $H_2H_2$ type in glucose (P=0.040) level. This study may provide the PGC-$1{\alpha}$ genotype patterns for the amounts of lipid and glucose in the serum. $H_2$ allele (Ser482) of PGC-$1{\alpha}$ gene may be related with upper group in Korean women.

수전해용 Pt/공유가교 SPEEK-HPA 복합막/Pt-Ru MEA의 전기화학적 특성 (The Electrochemical Characteristics of MEA with Pt/Cross-Linked SPEEK-HPA Composite Membranes/Pt-Ru for Water Electrolysis)

  • 황용구;우제영;이광문;정장훈;문상봉;강안수
    • 한국수소및신에너지학회논문집
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    • 제20권3호
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    • pp.194-201
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    • 2009
  • The e1ectrocatalytic properties of heteropolyacids(HPAs) entrapped in covalently cross-linked sulfonated polyetheretherketone(CL-SPEEK/HPA) membranes have been studied for water electrolysis. The HPAs, including tungstophosphoric acid(TPA), molybdophosphoric acid(MoPA), and tungstosilicic acid(TSiA) were used as additives in the composite membranes. The MEA was prepared by a non-equilibrium impregnation-reduction(I-R) method, using reducing agent, sodium borohydride(NaBH4) and tetraamineplatinum(II) chloride(pt(NH$_3$)$_4$Cl$_2$). The electrocatalytic properties of composite membranes such as the cell voltage were in the order of magnitude CL-SPEEKlMoPA40 (wt%) > /TPA30 > /TSiA40. In the optimum cell applications for water electrolysis, the cell voltage of PtlPEM/Pt-Ru MEA with CL-SPEEKlTPA30 membrane was 1.75 V at 80$^{\circ}$C and I A/cm$^2$ and this voltage carried lower than that of 1.81 V of Nafion 117. Consequently, in regards of electrochemical and mechanical characteristics and oxidation durability, the newly developed CL-SPEEKITPA30 composite membrane exhibited a better performance than the others, but CLSPEEKlMoPA40 showed the best electrocatalytic activity (1.71 Vat 80$^{\circ}$C and 1 A/cm$^2$) among the composite membranes.