• 제목/요약/키워드: Genetic Differentiation

검색결과 558건 처리시간 0.037초

Tricho-dento-osseous Syndrome Mutant Dlx3 Shows Lower Transactivation Potential but Has Longer Half-life than Wild-type Dlx3

  • Cha, Ji-Hun;Ryoo, Hyun-Mo;Woo, Kyung-Mi;Kim, Gwan-Shik;Baek, Jeong-Hwa
    • International Journal of Oral Biology
    • /
    • 제32권4호
    • /
    • pp.119-125
    • /
    • 2007
  • Dlx3 is a homeodomain protein and is known to play a role in development and differentiation of many tissues. Deletion of four base pairs in DLX3 (NT3198) is causally related to tricho-dento-osseous (TDO) syndrome (OMIM #190320), a genetic disorder manifested by taurodontism, hair abnormalities, and increased bone density in the cranium. The molecular mechanisms that explain the phenotypic characteristics of TDO syndrome have not been clearly determined. In this study, we examined phenotypic characteristics of wild type DLX3(wtDlx3) and 4-BP DEL DLX3 (TDO mtDlx3) in C2C12 cells. To investigate how wtDlx3 and TDO mtDlx3 differentially regulate osteoblastic differentiation, reporter assays were performed by using luciferase reporters containing the promoters of alkaline phosphatase, bone sialoprotein or osteocalcin. Both wtDlx3 and TDO mtDlx3 enhanced significantly all the reporter activities but the effect of mtDlx3 was much weaker than that of wtDlx3. In spite of these differences in reporter activity, electrophoretic mobility shift assay showed that both wtDlx3 and TDO mtDlx3 formed similar amounts of DNA binding complexes with Dlx3 binding consensus sequence or with ALP promoter oligonucleotide bearing the Dlx3 binding core sequence. TDO mtDlx3 exhibits a longer half-life than wtDlx3 and it corresponds to PESTfind analysis result showing that potential PEST sequence was missed in carboxy terminal of TDO mtDlx3. In addition, co-immunoprecipitation demonstrated that TDO mtDlx3 binds to Msx2 more strongly than wtDlx3. Taken together, though TDO mtDlx3 acted as a weaker transcriptional activator than wtDlx3 in osteoblastic cells, there is possibility that during in vivo osteoblast differentiation TDO mtDlx3 may antagonize transcriptional repressor activity of Msx2 more effectively and for longer period than wtDlx3, resulting in enhancement of osteoblast differentiation.

생쥐 초기배아에서 c-myc Proto-Oncogene Promoter의 기능적 활성화 (Zygotic Expression of c-myc Gene in Mouse Early Embryos: Functional Role of c-myc Promoter)

  • 박기수;강해묵;심찬섭;선웅;김재만;이영기;김경진
    • 한국동물학회지
    • /
    • 제38권4호
    • /
    • pp.550-556
    • /
    • 1995
  • c-myc proto-oncogene은 여러 세포들의 분화와 형질전화에 뿐만 아니라 정상세포의 분열조절에도 관여한다고 알려져왔다. 특히 생쥐의 초기배아에서 c-myc mRNA가 발현되고 antisense c-myc oligomer의 미세주입에 의해 배발생이 억제된다는 연구결과는 c-myc이 초기배아의 발생 및 분열에 관여하는 것을 시사한다. 그러나 최근까지 초기배아에 존재하는 c-myc promoter의 기능적 활성화에 관한 연구는 미진하였다. 이를 위하여, c-myc promoter와 대장균의 lacZ 유전자를 결합시킨 두 종류의 vector(pcmyc-Gall, pcmyc-Ga12)를 만들어 수정란의 전핵에 미세주입한 후, 배 발생에 따른 c-myc promoter의 활성화를 lacZ 유전자의 산물인 $\beta$-galactosidase 에 의한 X-gal 염색으로 조사하였다. 미세주입된 초기 배아는 2세포기 배아를 포함하는 여러 발생단계에서 $\beta$-galactosidase 의 활성을 보였다. 이는 c-myc 유전자가 배아의 게놈유전자로부터 발현되며, 또한 궁극적으로 초기 배아의 발생과정에 중요한 역할을 하고 있음을 시사하고 있다.

  • PDF

포유류배양세포 동결보존에 있어 Lactamide의 효과 (Effects of Acetamide and Lactamide on the Viability of Frozen-thawed Mammalian Cells)

  • 김현;조영무;고응규;성환후
    • 생명과학회지
    • /
    • 제24권11호
    • /
    • pp.1252-1257
    • /
    • 2014
  • DMSO는 배양포유류세포 동결보존의 동결보호제로써 일반적으로 사용 되어져 왔지만, DNA 메틸화 및 히스톤의 수식에 의해 일부 세포에서는 분화를 일으키는 것으로도 알려져 있다. 동결보존시의 배양세포의 안정된 분화형질유지에는 메틸화를 일으키는 DMSO 이외의 동결보호제의 사용이 필요하다. 세포독성이 낮고, 동물정자동결보존에 효과적인 것으로 알려진 아미도 화합물이 동일하게 포유류의 배양세포의 동결보존에서 동결보호작용이 있는지를(8종류의 아미드 화합물) 배양 마우스 혈관내피세포를 이용해 조사했다. 조사한 아미드 화합물 중에 아세트아미드와 락트아미드의 2종류가 배양세포에 대해서 동결보호작용이 있고, 가장 효과적인 것은 농도가 1.5 M의 락트아미드이다. 배양세포의 동결보존에 관해서는 삼투압 스트레스를 받지 않을 필요가 있기 때문에, 1.5 M 락트아미드 용액을 제작 시, 용매를 각 희석율의 PBS로 하고, 삼투압을 바꾼 동결 보존액에 동결세포의 생존율을 조사했다. 그 결과, 0.4배 농도의 PBS가 삼투압 스트레스를 가장 낮고 생존율이 가장 높음을 확인했다. 동결보존배지에 고 분자량재료를 첨가하면 세포생존율이 개선되는 것이 알려져 있기 때문에 BSA, HES, 데키스트란의 효과를 조사했다. 그 결과, 락트아미드를 이용한 동결보존배지는 $0.4{\times}PBS$를 이용한 1.5 M 락트아미드용액에 1%의 BSA를 첨가한 경우, DMSO의 동결보호작용에 필적하는 동결보호작용을 나타내는 것을 확인했다.

시중 유통 막걸리의 유기산 조성과 생리활성 (Composition of Organic Acids and Physiological Functionality of Commercial Makgeolli)

  • 이상진;김지혜;정용우;박선영;신우창;박천석;홍성렬;김계원
    • 한국식품과학회지
    • /
    • 제43권2호
    • /
    • pp.206-212
    • /
    • 2011
  • 막걸리는 고려시대 이후 제조된 우리나라 전통술이다. 본 연구는 막걸리의 유기산 분석과 생리 기능활성을 평가하고자 수행하였다. 막걸리의 유기산 분석 결과, 막걸리는 유기산 중에서 유산균에 의한 대사 산물인 lactic acid를 가장 많이 함유하고 있었으며 시판 막걸리에 따라 다양한 유기산 조성을 나타내고 있었다. 막걸리의 항비만 효과를 전지방세포인 3T3-L1 세포주를 사용하여 평가한 결과, 대조군 대비 막걸리는 전지방세포 분화를 저해하였으며, 특히 $100{\mu}g/mL$의 농도에서 40-70% 수준으로 분화를 억제하였다. 또한 혈관신생 억제 효과와 항염증 활성을 관찰하기 위하여, 각각 CAM assay와 LPS를 처리하여 염증반응을 유발한 murine macrophage RAW264.7 세포주에서 NO를 정량하였다. 그 결과, 대부분의 막걸리는 50% 이상의 혈관신생 억제 효과를 확인하였다. 또한 농도의존적으로 NO의 생성량을 유의적 수준으로 저해하였다. 이런 결과를 종합할 때, 막걸리는 항비만, 혈관신생 억제, 그리고 항염증 활성을 가지고 있으며, 이는 막걸리의 누룩미생물 균총의 2차 대사산물의 효과에 기인한다고 생각된다.

리지나뿌리썩음병균 분리주들의 배양 특성 및 RAPD에 의한 유전적 다양성 분석 (Cultural Characteristics and Genetic Diversity of Rhizina undulata Isolates by Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD))

  • 이상용;이선근;이종규;김경희;이승규
    • 한국산림과학회지
    • /
    • 제95권4호
    • /
    • pp.388-392
    • /
    • 2006
  • 국내에 분포하는 리지나뿌리썩음병균(Rhizina undulata)의 생리적 특성 및 유전적 다양성을 밝히기 위하여, 소나무(Pinus densiflora) 및 곰솔(P. thunbergii) 림으로부터 분리한 13종의 리지나뿌리썩음병균 분리주를 공시하여 각 분리주들의 배양 특성 및 RAPD에 의한 유전적 다양성을 분석하였다. P. densiflora 및 P. thunbergii로부터 제조한 수용성 추출물 첨가배지에서의 각 분리주들의 균사생장 특성을 조사한 결과, 각 분리주들의 기주와 분리주들의 기주로 부터 추출한 수용성 추출물 배지에서의 균사생장량 간에는 상관관계를 발견할 수 없었다. 한편, 12종의 random primer를 사용하여 R. undulata 분리주들의 genomic DNA의 random amplified polymorphic DNA(RAPD)에 의한 유전적 다양성을 분석한 결과, 국내 분리주들의 RAPD profile은 모두 동일하였다. 그러나, 국내 분리주들의 RAPD profile과 일본 분리주와는 다소 차이를 나타내었는데 즉, RAPD profile의 phylogenetic tree 분석 결과, 국내 분리주들과 일본분리주와는 88%의 상동성을 나타내었다.

비자나무 집단(集團)에서의 I-SSR 변이체(變異體)의 다양성(多樣性) (Diversity of I-SSR Variants in the Populations of Torreya nucifera)

  • 홍용표;조경진;김용률;신은명;표선경
    • 한국산림과학회지
    • /
    • 제89권2호
    • /
    • pp.167-172
    • /
    • 2000
  • 국내 5개 지역에서 채집한 비자나무(Torreya nucifera Siev. et Zucc.) 95개체를 대상으로 I-SSR 표지자를 분석하였다. 총 62개의 I-SSR 증폭산물(增幅産物)이 관찰되었으며, 그 중 7개의 증폭산물(增幅産物)은 분석된 95개 개체에서 단형성(單形性)이었다. 관찰된 전체 I-SSR 증폭산물(增幅産物)을 통합(統合)하여 분석한 결과 개체목에 대한 DNA지방판별(指放判別)이 가능하였다. 대부분의 유전다양성(遺傳多樣性)이 임분(林分)내의 개체목 간에 존재하는 것으로 나타났고(90.65%), 전체 5개 임분(林分)에서 유사한 수준의 유전다양성(遺傳多樣性)을 보였다. 집단간의 유전적(遺傳的) 분화(分化)정도는 심하지 않았다(${\phi}_{ST}=9.35%$). UPGMA법에 의한 유집분석(類集分析) 결과 각 집단의 유전적(遺傳的) 유연관계(類緣關係)는 임분(林分)의 지리적(地理的) 분포양상(分布樣相)과 일치(一致)하지 않았으며, 각 교점(交點)의 형성(形成)에 있어서 통계적 유의성이 없었고 따라서 전체 집단들이 유전적(遺傳的)으로 크게 분화(分化)되지 않았음을 알 수 있었다.

  • PDF

Comparison of Multilocus Sequence Typing (MLST) and Repetitive Sequence-Based PCR (rep-PCR) Fingerprinting for Differentiation of Campylobacter jejuni Isolated from Broiler in Chiang Mai, Thailand

  • Patchanee, Prapas;Chokboonmongkol, Chomporn;Zessin, Karl-Hans;Alter, Thomas;Pornaem, Sarinya;Chokesajjawatee, Nipa
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제22권11호
    • /
    • pp.1467-1470
    • /
    • 2012
  • We compared rapid fingerprinting using repetitive sequencebased PCR (rep-PCR) for subtyping Campylobacter jejuni isolates to the widely used multilocus sequence typing (MLST). Representative C. jejuni isolates (n = 16) from broilers were analyzed using MLST and rep-PCR. Both techniques demonstrated an equal discriminatory power of 0.8917, and 9 subgroups were identified. Clonal identification of all 16 isolates was identical for both techniques. The rep-PCR as described in this study may be used as a rapid and cost-effective alternative for subtyping of C. jejuni isolates, or as an effective screening tool in large epidemiological studies.

Barrow 정리의 수학사적 분석과 그에 따른 교육적 시사점에 대한 연구 (A Historical Analysis of Barrow's Theorem and Its Educational Implication)

  • 박선용
    • 한국수학사학회지
    • /
    • 제26권1호
    • /
    • pp.85-101
    • /
    • 2013
  • 이 연구에서는 수학사에 대한 해석학적 관점에서 Barrow 정리의 특징에 대해 분석하고, 현대적인 역사발생적 원리에 기초해 수학적 재발명 활동을 이끄는 미적분학 교수-학습 계열에 대해 논의한다. Barrow 정리에 대한 수학사적 분석을 통해서는, 그 정리의 기하학적 특성을 드러내고, 그 정리를 다룬 Barrow의 의도에 대해 추측하고, Barrow가 겪은 인식론적 장애에 대해 고찰하였다. 그리고 이러한 분석을 바탕으로 하여, 학생들이 '적분'과 '미분의 역'이 같다는 것을 인식하도록 하기 위한 목적 지향적이고 의미 지향적 교수-학습을 제안하고 현재 학교수학 미적분학에서 보완해야 할 사항에 대해 지적하였다.

Fine-scale initiation of non-native Robinia pseudoacacia riparian forests along the Chikumagawa River in central Japan

  • Kurokochi, Hiroyuki;Hogetsu, Taizo
    • Journal of Ecology and Environment
    • /
    • 제37권1호
    • /
    • pp.21-29
    • /
    • 2014
  • Robinia pseudoacacia has become invasively naturalized in Japan. We investigated the role of sexual reproduction in the development of R. pseudoacacia riparian forests along the Chikumagawa River in Japan, by using five chloroplast (cpSSR) and seven nuclear (nSSR) markers. We identified eight chloroplast haplotypes and 147 nuclear genotypes from 619 R. pseudoacacia trees sampled in three plots (Plots A, B, and C) and along two line transects (Lines D and E). CpSSR analyses showed that multiple maternal lines were distributed along the river, and that some haplotypes from different populations overlapped. In addition, while Plots A and B were separated by a short distance, only these two plots exhibited genetic differentiation in the haplotypes. In the nSSR analysis, all pairwise $F_{ST}$ values among the three plots were significantly different from zero. Kinship analysis based on nSSR markers revealed that kinship connected many individuals to another individual from the same plot. These results indicate that seed dispersal near to mother trees contributes to the fine-scale genetic structure of R. pseudoacacia riparian forests. Our results indicate that sexual reproduction, in addition to asexual reproduction, is a major contributor to the fine-scale formation of R. pseudoacacia forests.

인동등(忍冬藤)이 인간 유래 악성 흑색종 세포의 유전자 발현에 미치는 영향 (Effects of Lonicerae Caulis (LC) on Gene Expression of Human melanoma cells)

  • 김대수;최정화;김종한;박수연;강성인
    • 한방안이비인후피부과학회지
    • /
    • 제22권1호
    • /
    • pp.11-32
    • /
    • 2009
  • Objective : This study was designed to investigate anti-cancer and whitening activities (LC). So it was investigated the effects of LC on proliferation rates of melanoma genetic profile by LC. Methods : The genetic profile for the effect of LC on human derived melanoma cell, SK-MEL-2, was measured using microarray technique, and the functional analysis on these genes were conducted. Total 441 genes were up-regulated and 830 genes down-regulated in cells treated with LC. Genes induced or suppressed by LC were all mainly concerned with basic signalling pathways, which are involved in cell growth, differentiation and migration. Especially, many genes, which are related in apoptosis and cell cycle arrest were up-regulated by treatment with LC, and genes related in cell cycle were down-regulated. Result : The network of total protein interactions were identified by using cytoscape program, and some key molecules, such as BCL2L1, SIN3A, SMAD2 and c-myc that can be used for elucidation of therapeutical mechanism of medicine in the future. Conclusion : These results suggest possibility of LC as addition drug and whitening cosmetics. In addition, it was also suggested that related mechanisms are involved in BCL2L1, SIN3A, SMAD2 and c-myc related signalling pathways.

  • PDF