• 제목/요약/키워드: Editing patterns

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옥수수 미토콘드리아 NAD4유전자의 cDNA cloning과 특이한 RNA editing 현상 (Molecular cDNA cloning and unusual RNA editings of NAD4 gene from Zea mays mitochondrion)

  • 설일환
    • 생명과학회지
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    • 제8권2호
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    • pp.203-207
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    • 1998
  • 본 연구는 옥수수에서 분리한 미토콘드리아에서 NADH-dehydrogenase 유전자 (subunit 4)의 cDNA를 RT-PCR의 방법을 사용하여 조제 한 ㅜ 염기서열 수행한 경과 특이한 점을 감지 할 수 있었다. 일반적인 RNA cditing은 C에서 U로 또는 U에서 C로 치환되는 현장으로 옥수수의 NAD4유전자에서도 이러한 editing 형상이 일어나는 것을 발견하였다. 또는 T가 G로 그리고 G 가 A로 변화되는 특이한 부분들이 생성되는 것을 관찰하였다. 이러한 RNA ediring은 주로 exon 1과 exon 4 에 많이 일어나며, 염기 치환되는 부분들은 에서늬 NAD4유전자의 RNA edting site들과 일피하지 않은 점으로 미루어 보아 RNA editing 현상은 무작의로 생성된다고 본다.된다고 본다.

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Development of CRISPR technology for precise single-base genome editing: a brief review

  • Lee, Hyomin K.;Oh, Yeounsun;Hong, Juyoung;Lee, Seung Hwan;Hur, Junho K.
    • BMB Reports
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    • 제54권2호
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    • pp.98-105
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    • 2021
  • The clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) system is a family of DNA sequences originally discovered as a type of acquired immunity in prokaryotes such as bacteria and archaea. In many CRISPR systems, the functional ribonucleoproteins (RNPs) are composed of CRISPR protein and guide RNAs. They selectively bind and cleave specific target DNAs or RNAs, based on sequences complementary to the guide RNA. The specific targeted cleavage of the nucleic acids by CRISPR has been broadly utilized in genome editing methods. In the process of genome editing of eukaryotic cells, CRISPR-mediated DNA double-strand breaks (DSB) at specific genomic loci activate the endogenous DNA repair systems and induce mutations at the target sites with high efficiencies. Two of the major endogenous DNA repair machineries are non-homologous end joining (NHEJ) and homology-directed repair (HDR). In case of DSB, the two repair pathways operate in competition, resulting in several possible outcomes including deletions, insertions, and substitutions. Due to the inherent stochasticity of DSB-based genome editing methods, it was difficult to achieve defined single-base changes without unanticipated random mutation patterns. In order to overcome the heterogeneity in DSB-mediated genome editing, novel methods have been developed to incorporate precise single-base level changes without inducing DSB. The approaches utilized catalytically compromised CRISPR in conjunction with base-modifying enzymes and DNA polymerases, to accomplish highly efficient and precise genome editing of single and multiple bases. In this review, we introduce some of the advances in single-base level CRISPR genome editing methods and their applications.

영화 클라이맥스 패턴의 데이터시각화를 통해 분석한 장면 배열 (Scene Arrangement Analyzed through Data Visualization of Climax Patterns of Films)

  • 임양미;엄주언
    • 디지털콘텐츠학회 논문지
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    • 제18권8호
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    • pp.1621-1626
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    • 2017
  • 본 연구에서는 국내에서 성공한 영화들의 쇼트 분석을 통해 흥행한 영화의 클라이맥스부분에서 공통된 편집 패턴 분석을 찾아 씬(작은 이야기 단위)의 구성이 잘 기획되어 있는지 데이터 시각화 연구를 한다. 이 연구는 편집패턴들의 모형을 참조하여 영화 전체에 클라이맥스 표현 패턴이 몇 개로 구성되어 있는지 분석하는 것으로 쇼트이미지들의 자동 수집과 수집된 데이터들의 샷사이즈 자동 분류 시스템을 설계하고 이 시스템을 통해 클라이맥스 패턴 중심으로 하나의 씬을 이루고 있음을 증명한다. 작은 이야기인 씬의 구성이 클라이맥스 패턴으로만 판단하기 어려워 배우들의 대화를 통해 씬을 찾아 비교분석을 하였다. 배우들 간의 대화 기반 씬 예측을 위한 character-net은 등장인물들 간의 대화 내용을 추적하여 인물들 간의 대화 형성을 네트워크 망 모양으로 시각화할 수 있다. 망 모양의 시각화를 통해 큰 이야기와 작은 이야기의 구성을 분석할 수 있으며, 씬 수에 따른 밀집도로 영화의 흥행 여부를 예측할 수 있다. 이 두 가지 연구를 비교하여 영화의 기획 구성 및 제작 방법에 기여를 할 것이라 판단한다.

장르 특성 패턴을 활용한 매칭시스템 기반의 자동영상편집 기술 (Automatic Video Editing Technology based on Matching System using Genre Characteristic Patterns)

  • 문혜준;임양미
    • 방송공학회논문지
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    • 제25권6호
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    • pp.861-869
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    • 2020
  • 본 논문은 영화 장르마다 나타나는 클라이맥스 패턴이 다름을 활용하여 사용자의 디바이스 내에 저장되어 있는 이미지들을 하나의 영상으로 자동생성해주는 애플리케이션 개발을 소개한다. 영화의 장르 특성 분류는 국내 영화 드라마, 액션, 공포와 국외 영화 드라마, 액션, 공포 장르를 분석하여 클라맥스 패턴 모델형을 만들었다. 클라이맥스 패턴은 영화의 특정 씬 부분에서 샷사이즈의 변화, 샷의 길이, 인서트샷 사용의 빈도를 특성 요소로 하였고, 결과를 시각화하였다. 장르별 시각화된 모델을 Firebase DB를 활용하는 템플릿으로 개발하였다. 사용자의 디바이스에 저장된 이미지를 선택하여 장르별 템플릿으로 개발된 클라이맥스 패턴 모델과 매칭하였다. 짧은 영상이지만 장르의 특성이 반영되어 감성스토리 영상을 자동생성할 수 있는 것이 본 애플리케이션의 특징이다. 최근 유튜브, 네이버와 같은 플랫폼 사업자들은 사용자가 스마트폰으로 직접 촬영한 사진이나 영상을 활용하여 자동으로 영상을 생성해주는 애플리케이션들을 매년 업그래이드하고 있으나, 영화와 같이 장르 특성을 갖는다거나, 스토리가 보이는 영상생성 기술을 포함한 애플리케이션은 아직 미흡하다. 제안한 자동영상편집은 감성전달이 가능한 영상편집 애플리케이션으로써의 발전 가능성이 있다고 예측한다.

posVibEditor: 모바일 기기에서 진동촉감 패턴의 디자인 저작 도구 (posVibEditor: Authoring Tool for Designing Vibrotactile Patterns in Mobile Devices)

  • 류종현;최승문
    • 한국HCI학회:학술대회논문집
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    • 한국HCI학회 2008년도 학술대회 1부
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    • pp.256-261
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    • 2008
  • 본 연구에서는 모바일 기기에서의 진동 패턴을 손쉽고 빠르게 디자인 할 수 있는 저작도구를 개발하였다. 개발한 진동 패턴 디자인 저작 도구는 드래그-앤-드랍 저작 방식을 통해서 손쉽고 빠르게 진동 패턴을 디자인 할 수 있으며, 만들어진 진동 패턴을 데이터베이스에 등록하여 관리함으로써 진동 패턴의 재사용성을 높이고, XML 형식을 통해 진동 패턴을 저장하므로 진동 패턴 데이터 형식의 확장성이 뛰어나다. 또한, 다수의 진동자를 사용하는 환경을 위해 멀티 채널 진동 패턴을 디자인 할 수 있으며, 내부 플레이어를 통해서 진동 패턴을 빠르게 검증하며 수정할 수 있고, 사용자의 인지 모델을 고려한 진동 렌더링방법을 통해서 디자인 할 때 고려한 인지적 효과별 사용자가 통일하게 느낄 수 있게 하였다. 진동 패턴 저작 도구는 기본적으로 모바일 기기에서 진동 모터를 사용하는 환경에 적합하도록 개발되었으나 가상 현실이나 햅틱 인터랙션과 같은 진동 모터를 사용하는 연구 분야에도 적용하여 사용할 수 있다.

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제품 분석을 통한 패턴 제작 및 가상 모델링 제작 매뉴얼 설계 -부직포 전신 보호복을 중심으로- (Manual Design for Pattern Developing and Virtual Modelling through Product Analysis -Focused on Disposable Protective Coverall-)

  • 전은경;문지현
    • 한국의류학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.457-467
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    • 2015
  • The demand for coverall-type protective clothing are increasing in many industrial fields; however, it is impossible to evaluate the wearers' apparel fit because there is no commercialized pattern in the market. This study produces a manual for the process of acquiring patterns by separating PPE products into pieces to provide information on acquiring patterns. The analysis was on coverall-type non woven protective clothing in the domestic market, and 4 panels examined the validity, reliability, and efficiency of various possible methods on each step of process. Five steps were conducted to acquire patterns removing wrinkles, marking seams lines, separating seams, and pattern completing. The process of converting these into pattern files was designed through three procedures of digitizing, editing, and exporting and detailed stages. Fitting tests were undertaken, real patterns by actual modeling and pattern files by virtual modeling; all showed similar forms with outfits wearing ready-made protective coveralls. This study sought the most efficient and objective method of virtual modeling and proposed it as a manual. It is expected for the pattern reverse-designing manual through products analysis presented in this study that would be a helpful addition of information to the pattern tracing of pattern-less clothing products.

PDAT1 genome editing reduces hydroxy fatty acid production in transgenic Arabidopsis

  • Mid-Eum Park;Hyun Uk Kim
    • BMB Reports
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    • 제57권2호
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    • pp.86-91
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    • 2024
  • The fatty acids content of castor (Ricinus communis L.) seed oil is 80-90% ricinoleic acid, which is a hydroxy fatty acid (HFA). The structures and functional groups of HFAs are different from those of common fatty acids and are useful for various industrial applications. However, castor seeds contain the toxin ricin and an allergenic protein, which limit their cultivation. Accordingly, many researchers are conducting studies to enhance the production of HFAs in Arabidopsis thaliana, a model plant for oil crops. Oleate 12-hydroxylase from castor (RcFAH12), which synthesizes HFA (18:1-OH), was transformed into an Arabidopsis fae1 mutant, resulting in the CL37 line producing a maximum of 17% HFA content. In addition, castor phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1-2 (RcPDAT1-2), which catalyzes the production of triacylglycerol by transferring HFA from phosphatidylcholine to diacylglycerol, was transformed into the CL37 line to develop a P327 line that produces 25% HFA. In this study, we investigated changes in HFA content when endogenous Arabidopsis PDAT1 (AtPDAT1) of the P327 line was edited using the CRISPR/Cas9 technique. The successful mutation resulted in three independent lines with different mutation patterns, which were transmitted until the T4 generation. Fatty acid analysis of the seeds showed that HFA content decreased in all three mutant lines. These findings indicate that AtPDAT1 as well as RcPDAT1-2 in the P327 line are involved in transferring and increasing HFAs to triacylglycerol.

Leap Motion 시스템을 이용한 손동작 인식기반 제어 인터페이스 기술 연구 (A new study on hand gesture recognition algorithm using leap motion system)

  • 남재현;양승훈;허웅;김병규
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제17권11호
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    • pp.1263-1269
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    • 2014
  • As rapid development of new hardware control interface technology, new concepts have been being proposed and emerged. In this paper, a new approach based on leap motion system is proposed. While we employ a position information from sensor, the hand gesture recognition is suggested with the pre-defined patterns. To do this, we design a recognition algorithm with hand gesture and finger patterns. We apply the proposed scheme to 3-dimensional avatar controling and editing software tool for making animation in the cyber space as a representative application. This proposed algorithm can be used to control computer systems in medical treatment, game, education and other various areas.

가상의상 모델링 및 착장 소프트웨어를 위한 가이드라인 (Guidelines for Virtual Clothes Modeling and Draping Software - Based on the Analysis of Maya Cloth -)

  • 김숙진
    • 대한가정학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.127-135
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    • 2006
  • This paper suggests guidelines for virtual clothes modeling and draping software suitable for clothes designers. We first analyze Maya Cloth, which is widely used in game and animation fields, and which has been adopted by Pad System as a 3D cloth draping system. We then discuss what functions and procedures would improve Maya Cloth to assist designers in being able to create the clothes they have conceptualized. While Maya Cloth has many good functions and features forvirtual cloth modeling and draping, it treats input 2D patterns as approximat and it creates 3D clothes by considering other factors such as the 3D body model. As a result, it is hard for clothes designers to control the shape of the 3D clothes by changing 2D patterns. Furthermore, Maya Cloth does not handle seamlines satisfactorily. We suggest that the following new features should be added to Maya Cloth : respecting the input 2D patterns, handling seamlines, and controlling the shape of the clothes in 3D space.

기존 시스템에서 CBD 지원을 위한 설계 패턴 재공학 (Reengineering Legacy systems into Design Patterns of Component Base Design (CBD))

  • 김국보
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제5권1호
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    • pp.1-13
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    • 2004
  • 클래스 단위의 응용 시스템 구성은 코드 중심의 컴포넌트 추상화로 각 요소의 독립성 유지 및 재사용이 구현상에만 치우쳐 효과가 미흡하다. 따라서 상위의 개발 단계에 대한 객체 지향적 접근을 위해서는 설계 문제의 추상화와 특정 영역의 일반적인 해결에 대한 정보 표현 및 구성요소 상호 간의 관련성을 패턴을 통하여 나타낼 필요가 있다. 또한 기존 시스템의 성능을 변경, 개선하고 변화하는 환경에 적응하기 위해서는 기존 시스템을 실험, 분석함으로써 정확한 이해를 하고 나아가 재사용 자원으로 활용할 수 있는 소프트웨어 역공학이 필요하다. 따라서 본 논문에서는 기존 객체지향 시스템 코드에서 설계 패턴 추출을 위한 역공학 적용에 관한 타당성과 설계 패턴 자동 추출을 위한 알고리즘을 Java를 적용하여 살펴보고 설계 패턴의 자동 추출을 위한 역공학 및 패턴 재사용을 위한 자동화 도구의 아키텍쳐를 설계 구현한다.

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