Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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v.14
no.1
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pp.145-155
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2010
In this paper, we suggest a fish drug domain ontology to show an associated information and hierarchy together through concept-relation and inference mechanism instead of keyword matching. First, we investigate competency questions from workers of fishery industry and then we derive concepts and terminologies. Next, we present a process of fish drug ontology modelling using Protege-OWL editor, which is an extension of Protege that supports the Web Ontology Language(OWL). Last, we suggest the user interface of semantic web-based fish drug information system to search easily associated informations of fish drug using this ontology. It is to provide an effective search method that fish disease manager, fish farmer, and students majoring in fisheries can confirm details of diseases, fish, and drug evaluations associated with fish drug within one screen without moving to another position.
Lipoprotein-associated phospholipase A2 (Lp-$PLA_2$) is a crucial enzyme in atherosclerosis as a potential drug target. The most remarkable Lp-$PLA_2$ inhibitory drug is Darapladib. We determined the binding pose of Darapladib to Lp-$PLA_2$ through docking study. Darapladib formed two hydrogen bonding interactions with the side chain of Tyr160 and Gln352 and several pi-pi interactions with aromatic and aliphatic hydrophobic residues of Lp-$PLA_2$. It is known that the dietylpropan-amine moiety of Darapladib has influence on the improvement of its oral bioavailability and we supposed this in our docking results.
Cisplatin, a platinum coordinated complex, is a widely used antineoplastic agent for the treatment of metastatic tumors of the testis, metastatic ovarian tumors, lung cancer, advanced bladder cancer and many other solid tumors. The cytotoxic action of the drug is often thought to be associated with its ability to bind DNA to form cisplatin-DNA adducts. The development of resistance to cisplatin during treatment is common and constitutes a major obstacle to the cure of sensitive tumors. Although to understand the clinically relevant mechanisms of resistance, many studies have been aimed at clarifying the biochemical/molecular alterations of cisplatin-resistance cells, these studies did not conclusively identify the basis of cellular resistance to cisplatin. In this review, cisplatin resistance was discussed in terms of the relevant transporters, such as copper transporters (CTRs), organic cation transporters (OCTs) and multi-drug resistance related transporters (MDRs). These transporters seem to be contributed to cisplatin resistance through the reduction of drug accumulation in the cell. Better understanding the mechanism of cisplatin resistance associated with transporters will provide the useful informations for overcoming the cisplatin resistance.
Youngho Koh;Yunyoung Bae;Min-Jung Lee;Yu-Si Lee;Dong-Hyun Kang;Soon Han Kim
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.32
no.12
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pp.1605-1614
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2022
The strains associated with foodborne Salmonella enterica Thompson outbreaks in Korea have not been identified. Therefore, we characterized S. Thompson strains isolated from chocolate cakes linked to foodborne outbreaks in Korea. A total of 56 strains were isolated from preserved cake products, products in the supply chain distribution, the manufacturer's apparatus, and egg white liquid products used for cream preparation. Subsequently, serological typing, pathogenic gene-targeted polymerase chain reaction (PCR), pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and whole-genome multi-locus sequence typing (wgMLST) were performed to characterize these isolates. The antigen formula of all isolates was 7:k:1,5, namely Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Thompson. All 56 isolates harbored invA, his, hin, and stn, and were negative for sefA and spvC based on gene-targeted PCR analyses. Based on PFGE results, these isolates were classified into one group based on the same SP6X01.011 pattern with 100% similarity. We selected 19 strains based on the region and sample type, which were subjected to wgMLST. Although the examined strains showed 100% similarity, they were classified into seven clusters based on allelic differences. According to our findings, the cause of these outbreaks was chocolate cake manufactured with egg white liquid contaminated with the same Salmonella Thompson. Additionally, comparative analysis of wgMLST on domestic isolates of S. Thompson from the three outbreaks showed genetic similarities of over 99.6%. Based on the results, the PFGE and wgMLST combination can provide highly resolved phylogeny and reliable evidence during Salmonella outbreak investigations.
Objectives : The aim of this study was to systematically investigate herbal-drug-associated adverse drug reactions (herbal ADRs) reports submitted by a single oriental hospital and to analyze the general characteristics, causative agents, clinical manifestations, severity and types of herbal medicines which caused herbal ADRs. Methods : This study proceeded with IRB approval. The data on herbal ADR were collected prospectively from January 2008 to February 2012 by EMR of Dongguk University Ilsan Oriental Hospital. The World Health Organization (WHO)-Uppsala Monitoring Center (UMC) criteria was used to determinate causality for each herbal ADR. WHO-Adverse Reaction Terminology (WHO-ART) System Organ Class (SOC) code and WHO severity category were also used in this study. Results : A total of twenty eight cases were reported. Twenty two cases were assessed to have over possible relations with herbal medication. The gender ratio of these cases were 64.6 percent female and 36.4 percent male, demonstrating no statistical significance. Patients aged over 60 were 59.1%. Gastro-intestinal system was reported to be the most frequently affected organ (38.8%), and followed by psychiatric system (22.4%), and integumentary system (22.4%). The most common clinical symptom was headache (12.2%), followed by diarrhea (10.2%), and pruritus (10.2%). The severity of most cases was assessed to be mild (89.8%). The percentage of moderate ones was 10.2%, and there were no severe cases. Conclusions : Progressive study and further analysis on herbal ADRs are warranted for safety in the clinical use of herbal medicines.
Objectives: To identify the associations of characteristics of the neighborhood environment with substance abuse among clients receiving treatment for drug abuse in Thailand. Methods: A cross-sectional study was conducted of 1128 drug addicts from 28 neighborhoods who were receiving treatment at all 7 compulsory drug detention centers in Thailand. A trained interviewer conducted structured interviews with the subjects about substance use and the perceived neighborhood environment in their community. A multilevel logistic regression model was applied to estimate the effects of the neighborhood environment on substance use. Results: The majority of participants, 53.8% only used methamphetamine pills, 31.3% used other illicit drugs as well as methamphetamine pills, and 14.9% used an illicit drug other than methamphetamine. Three neighborhood characteristics were associated with substance use. A 1-unit increase in the perceived neighborhood cohesion score was associated with a 15% reduction in methamphetamine pill use and an 11% reduction of the use of both methamphetamine pills and another illicit drug. Conversely, a 1-unit increase in perceived neighborhood crime predicted 19 and 14% increases in the use of methamphetamine pills and the use of both methamphetamine pills and another illicit drug, respectively. In addition, a 1-unit increase in the scores for stigma surrounding addiction corresponded to a 25% increase of the use of methamphetamine pills and a 12% increase in the use of both methamphetamine pills and another illicit drug. Conclusions: Substance use among drug addicts was influenced by characteristics of the neighborhood environment. Therefore, prevention and intervention strategies should be designed based on a consideration of the impact of neighborhood context on substance use behaviors.
Anti-cancer drug resistance is a major problem in colorectal cancer (CRC) research. Although several studies have revealed the mechanism of cancer drug resistance, molecular targets for chemotherapeutic combinations remain elusive. To address this issue, we focused on the expression of cellular prion protein ($PrP^C$) in 5-FU-resistant CRC cells. In 5-FU-resistant CRC cells, $PrP^C$ expression is significantly increased, compared with that in normal CRC cells. In the presence of 5-FU, $PrP^C$ increased CRC cell survival and proliferation by maintaining the activation of the PI3K-Akt signaling pathway and the expression of cell cycle-associated proteins, including cyclin E, CDK2, cyclin D1, and CDK4. In addition, $PrP^C$ inhibited the activation of the stress-associated proteins p38, JNK, and p53. Moreover, after treatment of 5-FU-resistant CRC cells with 5-FU, silencing of $PrP^C$ triggered apoptosis via the activation of caspase-3. These results indicate that $PrP^C$ plays a key role in CRC drug resistance. The novel strategy of combining chemotherapy with $PrP^C$ targeting may yield efficacious treatments of colorectal cancer.
This study examines factors associated with drug approvals and patent issues of the Korean pharmaceutical firms. The 22 firms were selected based on 2006 year's publicly noticed sales amount. Number of approved drugs was identified through Korea Food and Drug Administration and the information regarding the patents that each firm has issued during the year 2000~2006 was collected from the Korea Patent Office. The number of approved drugs has increased annually, especially after the introduction of substance patent system in 1987 and in 2000 again with the policy change into the separation of drug prescribing and dispensing practice. The number of initial approval of NCEs as well as the number of patents per firm decreased during the year 2000~2006. The 12 firms with larger revenue occupied more than 80% of the patents being issued. There was a positive relationship between share of prescription drugs out of approved drugs and the average number of patents issued. However, number of approved drugs did not show positive association with the number of patents issued per firm. Therefore, the study results imply that firms need to invest more in increasing number of approvals for their specific prescription drugs in order to achieve a good performance in the future.
Background : Acute drug intoxication has recently become an important issue in the social and clinical areas. There are various complications associated with acute drug intoxication such as pneumonia, but the process is was not fully understood. The aim of this study was to analyze our cases of pneumonia associated with acute drug intoxication and to determine the associated risk factors. Methods : Forty four cases out of 237 patients, who were acute drug intoxicated from May 2000 to Feb. 2005, were diagnosed with pneumonia at the Konyang University hospital. These cases were analyzed by a retrospective review of their medical records. Results : The incidence of pneumonia in acute drug intoxication was 18.6%. There was no gender difference in terms of the incidence, but the age group with the highest incidence was in the $5^{th}$ decade (22.5%) followed by the $7^{th}$ decade (17.9%). Most common drug of associated with pneumonia was organophosphate insecticides, and the others were herbicides. Suicidal attempts were the most common motive of intoxication. The incidence of pneumonia was increased in old age (${\beta}=0.128$, p<0.05). A drowsy or comatous mental status was an independent risk factors of pneumonia (${\beta}=-0.209$, p=0.006). A longer hospital duration was also a risk factor for pneumonia (${\beta}=0.361$, p<0.001). The intubated state, intensive care unit care and longer duration of admission correlated with the course of pneumonia in acute drug intoxicated patients (p<0.05). The culture study revealed MRSA to be most common pathogen. Conclusion : The incidence of pneumonia associated with acute drug intoxication was higher in the older aged patients, those with a decreased initial mental status and a longer hospital duration. The number of days in the intensive care unit and intubation were associated prognostic factors for pneumonia in acute drug intoxication patients.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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