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Characterization of Glycerol Dehydrogenase from Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 and GGG Motif Identification

  • Wang, Liangliang;Wang, Jiajun;Shi, Hao;Gu, Huaxiang;Zhang, Yu;Li, Xun;Wang, Fei
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권6호
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    • pp.1077-1086
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    • 2016
  • Glycerol dehydrogenases (GlyDHs) are essential for glycerol metabolism in vivo, catalyzing its reversible reduction to 1,3-dihydroxypropranone (DHA). The gldA gene encoding a putative GlyDH was cloned from Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 (TtGlyDH) and expressed in Escherichia coli. The presence of Mn2+ enhanced its enzymatic activity by 79.5%. Three highly conserved residues (Asp171, His254, and His271) in TtGlyDH were associated with metal ion binding. Based on an investigation of glycerol oxidation and DHA reduction, TtGlyDH showed maximum activity towards glycerol at 60℃ and pH 8.0 and towards DHA at 60℃ and pH 6.0. DHA reduction was the dominant reaction, with a lower Km(DHA) of 1.08 ± 0.13 mM and Vmax of 0.0053 ± 0.0001 mM/s, compared with glycerol oxidation, with a Km(glycerol) of 30.29 ± 3.42 mM and Vmax of 0.042 ± 0.002 mM/s. TtGlyDH had an apparent activation energy of 312.94 kJ/mol. The recombinant TtGlyDH was thermostable, maintaining 65% of its activity after a 2-h incubation at 60℃. Molecular modeling and site-directed mutagenesis analyses demonstrated that TtGlyDH had an atypical dinucleotide binding motif (GGG motif) and a basic residue Arg43, both related to dinucleotide binding.

고창군 광승리 연안 퇴적층의 퇴적 시기와 범람 기원 특성 (Burial Age and Flooding-origin Characteristics of Coastal Deposits at Gwangseungri, Gochanggun, Korea)

  • 김종연;양동윤;신원정
    • 한국지구과학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.222-235
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    • 2015
  • 고창군 광승리 지역의 해발고도 5 m 내외의 해안 지점(DH)과 해발고도 10-15 m의 단구 상부 지점(KS)에서 시료를 채취하여 화학 분석과 입도 분석 등을 통하여 퇴적 물질의 특성을 파악하였다. DH는 풍화된 기반암을 피복하는 적색 토양층으로 하부에서 상부로 가면서 물질 조성이 점진적으로 변화하였다. DH 시료 내에 점토광물이 포함되어 있는 것으로 나타났다. 이를 근거로 하여 이 층을 제자리 풍화층으로 판단하였다. KS의 경우 구릉의 말단부에 위치하는 자갈층을 피복하는 층으로 물질 조성이 전반적으로 DH 부분과 상당히 다른 것으로 나타났으며, 일부 구간에서 물질의 교란이 일어나거나 외부 물질의 유입이 있었던 것으로 추정되었다. 한편 입자의 입도에 있어서 KS 시료들은 현재의 해빈 물질과 다른 특성이 나타난다. KS의 하부는 해빈에 비하여 세립 물질로 나타났으며, 중간 부분은 해빈보다 조립 물질이다. KS 시료의 분급은 해빈에 비하여 나쁜 것으로 나타났으며, 이 퇴적층중 일부는 지속적인 파랑과 조류에 의한 것보다는 일시적인 고에너지 환경에서 퇴적된 것으로 추정된다. 한편 KS 부분 시료의 매몰 연대는 광여기루미네센스(OSL) 분석에 의하여 0.65-0.71 ka로 추정되었다. 추가적인 연구를 통해 해당 퇴적층과 형성 과정의 특성에 대해서는 명확히 밝혀져야 할 것이지만, 해당 퇴적층은 폭풍에 의한 연안 범람 퇴적층일 가능성이 높은 것으로 추정된다.

고농도 Heme-iron의 생산을 위한 Hemoglobin의 가수분해 및 분리 조건 (Conditions of Hemoglobin Hydrolysis and Separation for the Production of Enriched Heme-iron)

  • 강인규;인만진;오남순
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제44권4호
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    • pp.219-223
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    • 2001
  • Hemoglobin(Hgb)의 효소 가수분해액으로부터 고농도 heme-iron의 분리에 영향을 주는 기질의 농도, 가수분해도 (DH, degree of hydrolysis) 및 분리 pH의 효과 등을 조사하였으며, pilot scale에서 고농도 heme-iron을 생산하였다. 최적 반응조건(pH 10.0, $50^{\circ}C$, 5 hr)에서의 Esperase에 의한 Hgb의 DH는 $24{\sim}25%$였다. Hgb의 농도는 heme-iron의 분리에 영향을 미쳐서 Hgb의 농도가 2.5%, 5.0%, 10.0%로 증가할수록 heme-iron/peptide(heme-iron의 분리도)는 각각 47.4%, 35.6%, 21.8%로 감소하였으며, 이에 따라 농축율도 감소하였다. Hgb의 가수분해액으로부터 고농도 heme-iron의 분리에 효율적인 pH 영역은 DH에 따라 달라졌으며, DH가 6.3%의 경우는 pH $5.0{\sim}6$에서 heme-iron/peptide의 비가 8.92%, DH가 14.5%인 경우는 pH $4.0{\sim}6.0$에서 $12.1{\sim}19.5%$였으며, DH가 24.3%인 경우는 pH $3.0{\sim}5.0$에서 $34.7{\sim}36.4%$로 가수분해도가 높을수록 고농도 heme-iron의 분리시 최적 PH 범위가 산성 영역으로 이동되었으며, 이 영역의 pH에서 peptide의 용해도 증가로 분리도가 증가되었다. 가수분해액으로부터 분리된 heme-iron의 분자량은 약 1 kDa정도로 hematin과 유사한 분리패턴을 보였다. Pilot scale로 제조한 고농도 heme-iron 제품에서의 heme-iron 함량은 27.1%, heme-iron/peptide 비는 38.7%, 생산수율은 9.3%이었다.

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Determination of coronal electron density distributions by DH type II radio bursts and CME observations

  • Lee, Jae-Ok;Moon, Yong-Jae;Lee, Jin-Yi;Lee, Kyoung-Sun;Kim, Rok-Soon
    • 천문학회보
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    • 제40권1호
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    • pp.63.1-63.1
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    • 2015
  • In this study, we determine coronal electron density distributions by analyzing DH type II radio observations based on the assumption: a DH type II radio burst is generated by the shock formed at a CME leading edge. For this, we consider 11 Wind/WAVES DH type II radio bursts (from 2000 to 2003 and from 2010 to 2012) associated with SOHO/LASCO limb CMEs using the following criteria: (1) the fundamental and second harmonic emission lanes are well identified; (2) its associated CME is clearly identified in the LASCO-C2 or C3 field of view at the time of type II observation. For these events, we determine the lowest frequencies of their fundamental emission lanes and the heights of their leading edges. Coronal electron density distributions are obtained by minimizing the root mean square error between the observed heights of CME leading edges and the heights of DH type II radio bursts from assumed electron density distributions. We find that the estimated coronal electron density distribution ranges from 2.5 to 10.2-fold Saito's coronal electron density models.

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벼의 Doubled-haploid 집단육성과 SSR 마커를 이용한 유전자 지도작성 (Development of Doubled-haploid Population and Construction of Genetic Map Using SSR Markers in Rice)

  • 김경민;남우일;권용삼;손재근
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제31권3호
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    • pp.179-184
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    • 2004
  • 본 연구에서는 1998년부터 2003년 하계까지 약배양 기법 및 콜히친 처리를 이용하여 개발한 '삼강벼/낙동벼' DH(doubled-haploid) 183계통의 주요 농업 형질을 조사$.$분석하였다. DH 집단의 주요 농업형질을 조사한바 초장, 간장, 수장, 삼절간장, 수수 및 출수일수는 양적형질의 특징인 넓은 범위의 변이폭, 연속적인 빈도 분포양상 및 양친을 초월하는 초월분리 현상을 보였다. SSR 마커를 이용한 유전자지도의 작성에는 양친에 다형성을 나타내는 136개의 마커를 사용하였다. 작성된 유전자 지도는 전체 길이가 1,909cM이었으며, 마커간 평균길이는 14 cM을 나타내었다.

Proline Analogs, L-Azetidine-2-Carboxylic Acid and 3,4-Dehydro-L-Proline, Induce Stress Response in Drosophila Kc Cells

  • Moon, Sung-Joon;Han, Ching-Tack
    • BMB Reports
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    • 제31권2호
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    • pp.201-208
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    • 1998
  • Amino acid analogs, like other inducers of stress response, induce the synthesis of stress proteins in mammalian cells. In this study, Drosophila Kc cells, in which translation is tightly controlled during stress response, was treated with proline analogs, L-azetidine-2-carboxylic acid (AzC) and 3,4-dehydro-L-proline (dh-P). Kc cells exposed to AzC or dh-P induced the synthesis of several proteins which had the same molecular weights as known heat shock proteins. However, in Kc cells, normal protein synthesis still continued in the presence of amino acids analogs unlike in heat-shocked cells. For the induction of stress response, the incorporation of dh-P into the protein was not essential, but the incorporation of AzC was. The stress protein synthesis was regulated mainly at the transcriptional level by AzC, whereas it was regulated by dh-P at the transcription level and possibly posttranscription level. During recovery, the stress protein synthesis stopped sooner in analog-treated cells than in heat-shocked cells even though the accumulated amount of Hsp70 was much less in proline analogstreated cells. It could be concluded that the proline analogs, AzC and dh-P, induced stress response through a different mechanism from heat shock.

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FESWMS-2DH를 이용한 하천의 흐름 해석 (Flow Analysis of Rivers by using FESWMS-2DH)

  • 이철응;심재욱;박동헌
    • 산업기술연구
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    • 제29권A호
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    • pp.111-122
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    • 2009
  • In this study, flood stage was computed by HEC-RAS, 1-D numerical analysis model and FESWMS-2DH, 2-D numerical model. Flood stages computed by two different models were compared for straight line, dot axle watercourse, dead-zone watercourse, section sudden-changing watercourse, and curved watercourse. From the results, flow velocity and water level were similar in straight watercourse and dot-reduction watercourse. However, there was difference of flow velocity and water level in dead-zone watercourse, sudden expansion, dot-reduction, and curve-watercourse. This result might be influenced by rapid change of watercourse due to dead-zone, the angle of inflow and outflow, and the curvature. Especially in this study, numerical model was applied to Wol-Song-Cheon at Chuncheon in order to analyze the effect of flood stage by two different models. By flowing properties around the bridge and confluence of rivers, it was found that flow velocity and water level was changed. Therefore, it was concluded that a lot of uncertainties are contained in the present bank.

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향상된 경계 결정 기반의 Diffie-Hellman 키 일치 프로토콜 (Design of Unproved Diffie-Hellman Key Agreement Protocol Based on Distance Bounding for Peer-to-peer Wireless Networks)

  • 박선영;김주영;송홍엽
    • 한국통신학회논문지
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    • 제33권1C호
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    • pp.117-123
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    • 2008
  • 본 논문은 무선 환경에서의 향상된 경계 결정 기반의 Diffie-Hellman(DH) 키 일치 프로토콜을 제안한다. 제안하는 프로토콜에서는 경계 결정을 통해 두 사용자간에 주고받는 메시지의 무결성과 안정성을 보장한다. 본 논문은 종래의 경계 결정 기반의 DH 키 일치 프로토콜의 비효율적이고 불안정적인 측면을 보완하여 교환되어야 할 메시지 수와 관리해야 할 파라미터 수를 줄였으며 2(7682(k/64)-64) 개의 XOR 연산을 절감하였다. 또한 DH 공개 정보의 안전한 재사용을 가능하게 함으로써 사용자의 개입을 감소시킬 수 있다.

디지털 홀로그래픽 콘텐츠 기술개발 동향 (R&D Trends of Digital Holographic Content)

  • 이범렬;손욱호;오승택;서호용;황치영;정일권
    • 전자통신동향분석
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    • 제27권3호
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    • pp.32-42
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    • 2012
  • 본고에서는 디지털 홀로그래피 기술을 디지털 콘텐츠 관점에서 다룰 수 있는 연구 개발 결과를 다루었다. 디지털 홀로그래피(DH: Digital Holographic) 기술을 디지털 홀로그래픽 콘텐츠 관점으로 접근하기 위한 기반 기술 분야로서 DH 콘텐츠 저작도구 기술, 매니지먼트 기술, 공간 인식 기반 인터랙션 기술, 화질 평가 및 휴먼팩터 기술 및 응용 콘텐츠 제작 기술 등으로 분류하여 기술하였다. 또한 디지털 홀로그래픽 콘텐츠 제작을 위한 연구 개발 결과로서 3차원 영상정보 획득, 홀로그래픽 프린지 데이터 생성과 DH 콘텐츠의 광학적 수치적 복원 및 DH 콘텐츠의 운용 테스트베드 등의 구현 결과를 제시하였다. 본고에서 제시한 디지털 홀로그래픽 콘텐츠 제작을 위한 기반 기술을 향후 실용화될 디지털 홀로그램의 광학적 복원 장치와 접목한다면 새로운 형태의 홀로그래픽 실감형 콘텐츠가 활성화될 수 있을 것으로 예상된다.

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