• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2003년도 제2차 연례학술대회 발표논문집
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• pp.183-192
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• 2003

With the availability of complete whole-genomes such as the human, mouse, fugu and chimpanzee chromosome 22, comparative analysis of large genomes from cross-species at varying evolutionary distances is considered one of a powerful approach for identifying coding and functional non-coding sequences. Here we describe a fast and efficient global alignment method especially for large genomic regions over mega bases pair. We used an approach for identifying all similarity regions by HSP (Highest Segment Pair) regions using local alignments and then large syntenic genome based on the both extension of anchors at HSP regions in two species and global conservation map. Using this alignment approach, we examined rearrangement loci in human chromosome 21 and chimpanzee chromosome 22. Finally, we extracted syntenic genome 30 Mb of human chromosome 21 with chimpanzee chromosome 22, and then identified genomic rearrangements (deletions and insertions ranging h size from 0.3 to 200 kb). Our experiment shows that all jnsertion/deletion (indel) events in excess of 300 bp within chimpanzee chromosome 22 and human chromosome 21 alignments in order to identify new insertions that had occurred over the last 7 million years of evolution. Finally we also discussed evolutionary features throughout comparative analyses of Ka/ks (non-synonymous / synonymous substitutions) rate in orthologous 119 genes of chromosome 21 and 53 genes of MHC-I class in human and chimpanzee genome.

• BMB Reports
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• 제55권6호
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• pp.281-286
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• 2022

Hepatocellular carcinoma is a major health burden, and though various treatments through much research are available, difficulties in early diagnosis and drug resistance to chemotherapy-based treatments render several ineffective. Cancer stem cell model has been used to explain formation of heterogeneous cell population within tumor mass, which is one of the underlying causes of high recurrence rate and acquired chemoresistance, highlighting the importance of CSC identification and understanding the molecular mechanisms of CSC drivers. Extracellular CSC-markers such as CD133, CD90 and EpCAM have been used successfully in CSC isolation, but studies have indicated that increasingly complex combinations are required for accurate identification. Pseudogene-derived long non-coding RNAs are useful candidates as intracellular CSC markers - factors that regulate pluripotency and self-renewal - given their cancer-specific expression and versatile regulation across several levels. Here, we present the use of microarray data to identify stemness-associated factors in liver cancer, and selection of sole pseudogene-derived lncRNA ZNF204P for experimental validation. ZNF204P knockdown impairs cell proliferation and migration/invasion. As the cytosolic ZNF204P shares miRNA binding sites with OCT4 and SOX2, well-known drivers of pluripotency and self-renewal, we propose that ZNF204P promotes tumorigenesis through the miRNA-145-5p/OCT4, SOX2 axis.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제13권2호
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• pp.19-31
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• 2013

가독성 있는 소스코드는 이해하기 쉽고 수정하기 편하기 때문에 손쉽게 유지보수할 수 있다. 소스코드의 가독성은 프로그램의 제어 구조와 같은 알고리즘의 복잡도뿐만 아니라 함수명, 들여쓰기 등과 같은 코딩스타일에 의해서도 많은 영향을 받는다. 지금까지 소스코드의 가독성을 높이기 위해 다양한 코딩 표준들이 제안되었으나 프로그래밍 교과목에서는 코딩스타일을 다루지 않거나 무시하는 경우가 많았다. 그 이유는 코딩스타일이 프로그램의 효율에는 영향을 주지 않기 때문에 강제하기 어렵기 때문이다. 이 논문에서는 프로그램 소스코드의 코딩스타일을 분석하고 그 결과를 시각화하는 스타일직소(StyleJigsaw) 시스템을 제안한다. 스타일직소 시스템은 C/C++나 Java 언어로 작성된 소스코드의 코딩스타일을 분석하여 이를 정량화하고 그 결과를 퍼즐화된 이미지로 시각화한다. 스타일직소 시스템의 교육적 효과를 입증하기 위해 C++프로그래밍 수업을 듣는 학생들을 대상으로 스타일직소 사용 실험을 진행하였다. 실험 결과 스타일직소 시스템을 사용한 경우 코딩스타일 평균 점수가 약 8.0점(10.9%) 가량 향상된 것으로 나타났다. 또한, 프로그래밍 수업의 수강생들을 대상으로 한 설문조사에서 약 88.5%의 학생이 스타일직소 시스템이 코딩스타일 학습에 도움이 되었다고 응답하였다. 프로그래밍 수업에서 스타일직소 시스템을 활용함으로써 학생들이 가독성 있는 프로그램 작성 능력을 기르는 데 도움을 줄 수 있을 것이다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제20권1호
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• pp.144-151
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• 2019

본 연구의 목적은 유아교사의 정보활용능력과 코딩교육에 대한 전반적인 인식을 알아보고 정보활용 능력과 코딩교육과의 관계를 알아봄으로써 예비유아교사의 코딩교육에 대한 프로그램을 구성 및 유아코딩교육을 현장에 적용하기 위한 기초자료를 제공하기 위함이다. 연구대상은 중소도시 A대학교 유아교육과에 재학 중인 예비유아교사 230명이며, 1학년 88명(38.3%), 2학년 84명(36.5%)이며, 3학년 58명(25.2%)이다. 수집된 자료는 평균과 표준편차를 구하고 일원배치분산분석과 pearson 적률상관관계를 구하였다. 연구결과는 예비유아교사의 정보활용 능력은 스마트폰 활용 능력이 가장 높았고 컴퓨터 활용능력이 그 다음으로 높았다. 예비유아교사의 코딩교육 관심도는 결과적 관심이 가장 높았고, 그 다음은 협력적 관심, 개인적 관심, 정보적 관심, 대안적 관심, 운영적 관심 순서대로 높게 나타났고, 무관심은 가장 낮은 관심이 있는 것으로 나타났다. 예비유아교사의 코딩교육에 대한 인식은 코딩교육 필요성에 대한 인식, 코딩수업내용에 대한 인식, 코딩교육환경에 대한 인식은 보통이상으로 나타났으나 코딩교육운영에 대한 인식은 낮게 나타났다. 둘째, 정보활용 능력에서 정보화 인지수준, 스마트폰 사용수준 및 정보유용성이 개인적관심과 정적상관이 있었으며, 컴퓨터사용 수준은 대안적 관심과 정보용이성은 결과적 관심과 정적상관이 가장 높게 나타났다. 그 다음으로 정보화 인지수준과 대안적 관심, 정보유용성은 정보적 관심, 스마트폰 사용수준은 결과적 관심, 컴퓨터 사용수준과 용이성은 개인적 관심단계와 정적상관이 있었다. 반면 정보활용 능력의 모든 영역들은 운영적 관심과는 상관이 없는 것으로 나타났다. 정보화인지수준은 교육 필요성과 가장 높은 관계가 있었으며, 그 다음은 교육내용, 교육운영 및 교육환경과 상관이 있었다. 반면 교육필요성과 용이성은 교육내용만이 정적인 관계가 있었다.

• ETRI Journal
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• 제5권4호
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• pp.17-21
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• 1983

Sine call handling for stored program control exchange can be regarded as finite state machine model of sequential process, the state transition concept is applied to describe its functions. Coding method of the state transition table applied to M10CN ESS call processing and concerned topics was discussed and proposed another method for reduction memory usage.

• 대한전자공학회논문지TC
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• 제49권5호
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• pp.21-26
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• 2012

인트라세션 네트워크 코딩은 멀티 홉 무선 네트워크의 스케줄링을 간소화하고 패킷 전송의 효율성을 통하여 처리율을 향상시킬 수 있는 방법으로 제시되었다. 다중 레이트는 대부분의 무선 네트워크에서 사용되고 있으며 기존 연구에서 기회주의적 라우팅 방식과 결합하여 처리율의 증가를 보였다. 본 논문에서는 다중 레이트와 인트라세션 네트워크 코딩 방식을 사용하여 멀티 홉 네트워크 환경에서 처리율을 향상하기 위한 방법을 제안한다. 네트워크 모델을 인트라세션 네트워크 환경으로 모델링하고 제안한 레이트 선택 방법을 통하여 각 노드에서 최적인 전송 속도를 결정한다. 선형계획법을 사용하여 최대 처리율을 도출하고 MATLAB과 lp_solve IDE 프로그램을 이용하여 성능을 평가한다. 성능평가 결과를 통해 다중 레이트를 사용할 경우 단일 레이트 환경에 비하여 처리율이 향상되며 인트라세션 네트워크 코딩 방식은 기회주의적 라우팅 방식에 비하여 처리율이 향상됨을 보였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제15권2호
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• pp.439-446
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• 2011

본 논문에서는 비디오 코덱을 비롯한 멀티미디어 데이터 압축에 주로 이용되는 엔트로피 코딩 방식 중의 하나인 허프만 코딩을 위한 전용 하드웨어를 제안하고 구현하였다. 제안한 허프만 코덱은 허프만 인코더와 디코더로 구성되어 있다. 허프만 인코더는 룩업 테이블을 이용하여 심볼을 허프만 코드로 변환한다. 가변 길이의 허프만 코드는 데이터 패킷화 블록에서 32 비트의 일정한 형식으로 맞추어진 후에 프레임 단위로 직렬로 출력된다. 허프만 디코더는 직렬로 입력되는 비트스트림을 버퍼링 없이 트리 구조의 FSM을 이용하여 디코딩하여 심볼로 변환한다. 제안한 하드웨어는 동작의 유연성을 위해서 인코딩과 디코딩 하드웨어를 프로그래머블하게 동작시킬 수 있도록 하여 프로그래밍 과정을 통해서 다양한 허프만 코딩을 수행할 수 있도록 하였다. 구현한 하드웨어는 Altera사의 Cyclone III FPGA를 이용하여 검증하였고, 3725개의 LUT를 사용하면서 최대 365MHz로 동작이 가능하였다.

• 창의정보문화연구
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• 제6권1호
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• pp.31-40
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• 2020

본 연구의 목적은 블록코딩 소프트웨어(SW) 교육과 초등학생의 회복탄력성의 상관관계를 통계적으로 분석한 후 그 결과를 통해 SW 교육의 의의를 찾는 데 있다. 본 연구에서는 인천광역시 소재 A초등학교의 4학년 학생 61명을 대상으로 회복탄력성 사전 검사를 실시하였다. 학습자의 수준에 맞추어 code.org라는 비영리단체의 블록코딩 SW 교육 프로그램을 활용하여 15차시의 수업을 진행하였고 사후 검사를 실시하여 회복탄력성의 개선도를 분석하였다. 연구 결과, 블록코딩 SW 교육을 받은 학생들이 회복탄력성의 대영역인 자기조절력, 긍정성, 대인관계능력 중 자기조절력과 긍정성 등 2개의 영역에서 유의미한 향상을 나타냈으며, 회복탄력성 종합 점수가 통계적으로 유의미하게 증가하였음을 확인하였다. 이를 통해 SW 교육이 학생들의 컴퓨팅 사고력을 기르는 것뿐만 아니라 그들이 삶을 긍정적이고 유연하게 살아나갈 수 있는 힘인 회복탄력성을 기르는 데에도 영향을 줄 수 있다는 가능성을 엿볼 수 있었다.

• 방송공학회논문지
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• 제8권3호
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• pp.228-237
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• 2003

이동멀티미디어방송 시스템의 기본 시스템을 이루는 유럽 방식인 Eureka-147 디지털 오디오 방송 시스템의 기본 요구 사항은 컴팩트 디스크와 같은 음질을 목표로 하므로 요구 비트오류률 ${10}^{-4}$을 기준으로 설계가 이루어졌다. 이동멀티미디어방송 시스템은 오디오 중심의 Eureka-147 디지털 오디오 방송 시스템과 달리, 멀티미디어 서비스를 중심으로 설계가 이루어져야 하기 때문에 요구 비트오류확률은 ${10}^{-7}$∼${10}^{-8}$ 이하를 요구한다. 이를 위하여 기존의 Eureka-147 디지털 오디오 방송 표준에 대한 호환성을 유지하면서 이동멀티미디어방송에 대한 요구 비트오류율을 만족하기 위한 방법으로 RS(Reed-Solomon) 부호와 길쌈 인터리버를 조합한 외부호화채널부호화 방식을 추가적으로 도입한다. 본 논문에서는 채널부호화 방식을 추가하였을 경우의 이동채널 모델을 기반으로 이동멀티미디어방송 시스템에 대한 채널 성능을 시뮬레이션하며, 시뮬레이션 결과로부터 채널부호화 추가의 필요성 및 적합성을 분석한다.

• 한국지능시스템학회논문지
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• 제22권6호
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• pp.768-773
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• 2012

운전 중 운전자의 졸음은 교통 사망사고를 일으키는 중요한 요인이며 음주운전보다도 더 위험할 수 도 있다. 이러한 이유로 운전자의 졸음을 판별하고 경고하는 시스템 개발이 최근에 매우 중요한 이슈로 떠올랐다. 그중에서도 졸음과 가장 밀접한 관련이 있는 생체 신호 분석이 많이 적용되는데 그중에서도 뇌파(Electroencephalogram, EEG)와 안구전도(Electrooculogram, EOG)를 분석하는 연구가 주류를 이루고 있다. 본 논문에서는 실험 프로토콜를 바탕으로 측정된 뇌파를 주파수별로 분석하여 운전자의 상태별 뇌파 데이터베이스를 구축하였고 선형예측(Linear Predictive Coding, LPC) 계수와 Support Vector Machine(SVM)을 이용한 운전자 졸음 감지 시스템을 제안한다. 실험결과로 졸음의 뇌파분석에서 알파파가 감소하며 세타파가 증가하는 추세를 보였으며, LPC 계수가 각성, 졸음 및 수면상태의 특징을 잘 반영하였다. 특히 제안한 시스템은 적은 샘플(250ms)에서도 96.5%의 높은 분류 결과를 얻어 짧은 순간에 일어날 운전시 돌발 상황을 실시간으로 예측할 수 있는 가능성을 보였다.