• International journal of advanced smart convergence
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• 제12권4호
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• pp.134-141
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• 2023

We present a novel method aimed at refining ground truth data through regularization and modification, particularly applicable when working with the original ground truth set. Enhancing the performance of deep neural networks is achieved by applying regularization techniques to the existing ground truth data. In many machine learning tasks requiring pixel-level segmentation sets, accurately delineating objects is vital. However, it proves challenging for thin and elongated objects such as blood vessels in X-ray coronary angiography, often resulting in inconsistent generation of ground truth data. This method involves an analysis of the quality of training set pairs - comprising images and ground truth data - to automatically regulate and modify the boundaries of ground truth segmentation. Employing the active contour model and a recursive ground truth generation approach results in stable and precisely defined boundary contours. Following the regularization and adjustment of the ground truth set, there is a substantial improvement in the performance of deep neural networks.

• 한국방사선학회논문지
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• 제12권5호
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• pp.669-675
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• 2018

X선 장비를 이용한 심장혈관 조영술 시 프레임 변화에 따른 입사 표면 선량과 흡수선량을 비교 분석하여 피폭의 차이를 알아보고자 하였고 image J를 통한 촬영 영상의 SNR과 CNR을 측정 분석하여 프레임 변화가 영상 화질에 주는 영향을 비롯해 검사에 있어 적절한 프레임 선택의 방안을 모색하고자 하였다. 2017년 6월부터 2017년 10월까지 본원에서 CAG를 시행한 30명(남19, 여11)을 대상으로 하였고, 환자들의 연령대는 49-82세(평균 $65{\pm}9$세), 몸무게45-91kg (평균 $67{\pm}8.9kg$), 키 150-179cm (평균 $165.1{\pm}8.9kg$), BMI 19.5-30.5(평균 $24.5{\pm}2.9$)이었다. 입사표면선량 및 흡수선량은 후향적으로 Air kerma값과 DAP를 획득하여 비교 분석 하였고 SNR과 CNR은 Image J를 통하여 측정 분석 한 후 공식에 대입하여 결과 값을 도출하였다. 통계분석을 통한 상관관계 확인을 위해 통계프로그램은 SPSS를 사용하여 프레임 변화에 따른 입사표면선량과 흡수선량 및 SNR CNR의 상관관계 등을 분석하였다. 10프레임으로 촬영할 때와 15프레임으로 촬영 할 때 모두 입사표면선량과 흡수선량관계는 통계적으로 유의하지 않았다(p>0.05). SNR과 CNR의 관계에선 10프레임으로 촬영했을 때의 SNR($3.374{\pm}2.1297$)과 CNR($0.234{\pm}0.2249$)이 15프레임에서의 SNR($4.929{\pm}2.8532$)과 CNR($0.391{\pm}0.3025$)보다 SNR $1.43{\pm}0.4861$, CNR $0.132{\pm}0.0555$로 낮았으나 통계적으로는 유의하지 않았다(p>0.05). 상관관계 분석결과에서는 BMI와 air kerma, DAP간에, air kerma와 DAP간에, SNR과 CNR간에 통계적으로 유의한 결과를 얻었다(p<0.001, p<0.001). 결론적으로 심장혈관 조영술 시 10프레임과 15프레임으로 변화를 주어 촬영하여도 입사표면선량과 흡수선량은 큰 차이를 나타내지 않았으며, 10프레임보다 15프레임 촬영에서의 SNR과 CNR이 증가하였으나 통계적으로는 유의하지 않았기에 본 논문을 통해 환자와 시술자 모두 10프레임과 15프레임 촬영으로 인한 X선 피폭 문제뿐 아니라 영상의 화질감소에 관한 우려 역시 줄어들 수 있을 것으로 사료된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제44권2호
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• pp.218-226
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• 2016

헬리코박터 파이로리균은 인간의 위에 감염하여 위염, 위궤양, 심지어 위암을 포함한 다양한 위장 질환의 발생시키는 원인으로 알려져 있다. 이러한 헬리코박터균의 제균을 위해 항생제 치료법이 이용되고 있지만 이러한 항생제들에 대한 헬리코박터균의 내성 증가가 전세계적인 문제로 대두되고 있다. 보고들에 따르면, 천연물질인 plumbagin은 항균 및 항암 효과를 가지고 있는 것으로 알려져있다. 따라서 본 연구에서는 헬리코박터 표준균주(ATCC 49503)에 plumbagin을 처리한 후 항균효과를 확인하였으며, 세균의 성장 및 병원성과 관련된 다양한 물질들의 발현에 미치는 영향을 immunoblotting 및 RT-PCR 방법을 이용하여 조사하였다. plumbagin의 헬리코박터균 억제효과를 확인하기 위해 한천희석법과 액체배지희석법을 이용해 최소억제농도를 도출하였다. 위와 같은 Plumbagin에 의한 헬리코박터균의 억제기전을 이해하기 위하여 헬리코박터균에 plumbagin을 처리한 후 세균 의 증식과 관련된 물질들을 대상으로 RT-PCR을 수행한 결과 RNA polymerase subunit α (rpoA)의 mRNA 발현이 감소한 것을 확인하였다. 또한, 헬리코박터균에 plumbagin을 처리한 후 주요 병원성인자들의 발현을 조사한 결과 CagA와 VacA 독소들의 mRNA 및 단백질양이 감소한 것을 확인하였으며, 유레아제(ureA)와 부착단백(alpA)의 발현도 plumbagin 처리에 의해 감소한 것을확인하였다. 위와 같은 결과들을 토대로, plumbagin은 본 연구에서 밝힌 기전들을 통해 헬리코박터균의 성장, 감염 및 발병을 억제하는 것으로 사료된다.

• 한국초지조사료학회지
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• 제18권4호
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• pp.277-284
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• 1998

재배콩과 돌콩의 유전적 다양성과 유연관계를 밝히고, 콩을 사료작물로 개량하는데 필요한 유전정보를 얻기 위하여, RAPD 분석방법을 이용한 결과는 다음과 같다. 1. 증폭된 polymorphicband의 총 수는 74개였으며, 이중 다형현상을 보인 것은 50개로 67.6%, 증폭된 band의 크기는 0.13~2.0 Kb 범위에 있었다. 2. Random primer의 sequence 5'-CAG GCC CTT C-3'를 사용하였을 때, 0.56-2.0 Kb에서 콩의 종피 색깔에 따른 변이 (누런색과 검은색)가 나타났다. 그리고 Sequence 5'-TGC TCT GCC C-3'과 5'-GTC CAC ACG G-3'인 primer를 사용하였을 때, 각각 0.63~0.94, 0.94~2.0 Kb에서 검정콩 2호에 특정적인 genetic marker가 검출되었다. 3. Genetic similarity 값에 의한 품종간 유전적 변이성은 검정콩 2호 (0.81)가 가장 낮았고 검정콩 1호 (0.46)에서 가장 높았다. 4. 콩의 품종과 돌콩의 유연관계는 황금콩과 석량붓콩이 0.52로 가장 가까웠고 검정올콩 (0.47), 검정콩 l호 (0.46), 검정콩 2호 (0.42), 돌콩 (0.38)의 순서로 멀었다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권9호
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• pp.5199-5205
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• 2013

Background/Aim: The Hippo signaling pathway is a newly discovered and conserved signaling cascade, which regulates organ size control by governing cell proliferation and apoptosis. This study aimed to investigate its effects in human gastric cancer. Methods: Tumor tissues (n=60), adjacent non-tumor tissues (n=60) and normal tissues (n=60) were obtained from the same patients with primary gastric cancer (GC). In addition, 70 samples of chronic atrophic gastritis (CAG) tissues were obtained from patients with intestinal metaplasia (IM) by endoscopic biopsy. Hippo signaling molecules, including Mst1, Lats1, YAP1, TAZ, TEAD1, Oct4 and CDX2, were determined by quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Protein expression of Mst1, Lats1, YAP1, TEAD1 and CDX2 was assessed by immunohistochemistry and Western blotting. Results: Mst1, Lats1 and Oct4 mRNA expression showed an increasing tendency from GC tissues to normal gastric tissues, while the mRNA expression of YAP1, TAZ and TEAD1 was up-regulated (all P<0.01). Mst1 and Lats1 protein expression presented a similar trend with their mRNA expression. In addition, YAP1 and TEAD1 protein expression in GC was significantly higher than in the other groups (all P<0.01). CDX2 mRNA and protein expression in the CAG group were higher than in the other groups (all P<0.01). In GC, mRNA expression of Mst1, Lats1, Oct4, YAP1, TAZ, TEAD1 and CDX2 had a close correlation with lymphatic metastasis and tumor TNM stage (all P<0.01). Furthermore, protein expression of Mst1, Lats1, YAP1, TAZ, TEAD1 and CDX2 had a close correlation between each other (P<0.05). Conclusion: The Hippo signaling pathway is involved in the development, progression and metastasis of human gastric cancer. Therefore, manipulation of Hippo signaling molecules may be a potential therapeutic strategy for gastric cancer.

• Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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• 제42권5호
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• pp.362-368
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• 2008

목적: T1-201 심근 SPECT에서 심장 대 폐 섭취비의 증가(LHR)는 심근관류스캔의 고위험소견으로 알려져 있으나, 약물부하 Tc-99m tetrofosmin 게이트 심근 SPECT에서 측정되는 LHR도 같은 역할을 하는지에 대하여는 의문이 있다. 이에 저자는 약물부하 Tc-99m tetrofosmin 게이트 심근 SPECT에서 측정된 LHR과 관상동맥조영술 및 게이트 심근관류 SPECT소견을 비교하여 이의 유용성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 관상동맥질환이 의심되어 아데노신 부하 Tc-99m tetrofosmin 게이트 심근 SPECT를 시행한 환자 중 관상동맥조영술을 한 달 이내에 시행한 환자 157명을 대상으로 하였다. 게이트 SPECT는 먼저 휴식기 영상을 얻고, 3-4시간 후 아데노신 부하 영상을 얻었다. 총 157명의 대상환자에서 측정된 LHR과 관상동맥조영슬과 게이트 심근 관류 SPECT 결과를 비교하였다. 결과: 정상 대조군 50명에서 얻은 LHR은 $0.33{\pm}0.04$이었으며, 성별의 차이는 없었다. LHR이 0.41(평균+2표준편차)을 초과한 경우 LHR이 증가된 것으로 간주하였다. 정상관상동맥을 보인 53명 중 2명 (3.8%), 단일혈관질환 44명에서는 0명, 두혈관질환 27명 중 2명(7.4%), 세혈관질환 33명 중 8명(24.2%)에서 증가된 LHR을 보였다. LHR은 부하기 및 휴식기의 좌심실구혈률과 약한 음의 상관관계를 보였으며(r=-0.25, -0.25), 부하기 및 휴식기 관류결손의 총합과는 약한 양의 상관관계를 보였다(r=0.37, 0.36). 결론: 약물부하 후 1시간에 촬영한 Tc-99m tetrofosmin의 LHR은 세혈관질환을 가진 군과 심한 좌심실 기능부전을 가진 군, 그리고 부하기 및 휴식기 영상에서 심한 관류결손을 가진 군에서 높아서, 기존의 T1-201을 이용한 연구와 비슷하였으나, 연관성은 낮았다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권3호
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• pp.368-379
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• 2021

Two virulence factors of Helicobacter pylori, cagA and vacA, have been known to play a role in the development of severe gastric symptoms. However, they are not always associated with peptic ulcer or gastric cancer. To predict the disease outcome more accurately, it is necessary to understand the risk of severe symptoms linked to other virulence factors. Several other virulence factors of H. pylori have also been reported to be associated with disease outcomes, although there are many controversial descriptions. H. pylori isolates from Koreans may be useful in evaluating the relevance of other virulence factors to clinical symptoms of gastric diseases because the majority of Koreans are infected by toxigenic strains of H. pylori bearing cagA and vacA. In this study, a total of 116 H. pylori strains from Korean patients with chronic gastritis, peptic ulcers, and gastric cancers were genotyped. The presence of virulence factors vacAs1c, alpA, babA2, hopZ, and the extremely strong vacuolating toxin was found to contribute significantly to the development of severe gastric symptoms. The genotype combination vacAs1c/alpA/babA2 was the most predictable determinant for the development of severe symptoms, and the presence of babA2 was found to be the most critical factor. This study provides important information on the virulence factors that contribute to the development of severe gastric symptoms and will assist in predicting clinical disease outcomes due to H. pylori infection.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권18호
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• pp.7635-7638
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• 2014

Background: The aim of this study was to investigate the value of serum gastric markers to differentiate between patients with precancerous lesions and nonatrophic chronic gastritis. Materials and Methods: Serum samples of 128 patients with dyspepsia who were candidates for endoscopic examination were tested for pepsinogen (PG I and PG II), PG I/II ratio, gastrin 17(G-17), anti-Helicobacter pylori (anti-H pylori ) and anti-CagA antibodies. Two sample t-tests, chi-square tests and Pearson's correlation analyses were used for analysis using SPSS (version 20). Results: PGI, PG I/II ratio values were decreased significantly in the precancerous lesion group (0.05, 0.001 respectively). The frequency of H pylori infection was significantly (p=0.03) different between the two groups ofthe study. Conclusions: We suggest PGI and the PG I/II ratio as valuable markers for screening of premalignant gastric lesions.

• 한국어병학회지
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• 제22권1호
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• pp.85-90
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• 2009

본 연구에 사용한 Nseri-F와 Nseri-R primer는 N. seriolae의 16S-23S rRNA 부위에 위치한 영역으로 여러 종의 Nocardia spp.와 비교할 때 PCR 검출 특이성이 매우 높을 것으로 예상되었다. 실제로 이 primer를 이용하여 동물 (N. asteroides 와 N. farcinica), 어류 (N. asteroides, N. salmoniciada 및 N. seriolae) 뿐만 아니라 무척추동물 (N. crassostreae) 등에 감염되는 원인체들에 대하여 실험한 결과 N. seriolae의 특이적 검출이 가능 하였다.

• 한국농림기상학회:학술대회논문집
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• 한국농림기상학회 2003년도 춘계 학술발표논문집
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• pp.189-201
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• 2003

Grid is a new Information Technology (IT) concept of "super Internet" for high-performance computing: worldwide collections of high-end resources - such as supercomputers, storage, advanced instruments and immerse environments. The Grid is expected to bring together geographically and organizationally dispersed computational resources, such as CPUs, storage systems, communication systems, real-time data sources and instruments, and human collaborators. The term "the Grid" was coined in the mid l990s to denote a proposed distributed computing infrastructure for advanced science and engineering. The term computational Grids refers to infrastructures aimed at allowing users to access and/or aggregate potentially large numbers of powerful and sophisticated resources. More formally, Grids are defined as infrastructure allowing flexible, secure, and coordinated resource sharing among dynamic collections of individuals, institutions and resources referred to as virtual Organizations. GRID is an emerging IT as a kind of next generation Internet technology which will fit very well with Agrometeorological services in the future. I believe that it would contribute to the resource sharing in AgroMeteorology by providing super computing power, virtual storage, and efficient data exchanges, especially for developing countries that are suffering from the lack of resources for their agmet services at national level. Thus, the establishment of CAgM-GRID based on existing RAMINSII is proposed as a part of FWIS of WMO.part of FWIS of WMO.