Pythium species (Pythiales, Oomycetes) are well known as the algal pathogen that causes red rot disease in Pyropia / Porphyra species (Bangiales, Rhodophyta). Accurate species identification of the pathogen is important to finding a scientific solution for the disease and to clarify the host-parasite relationship. In Korea, only Pythium porphyrae has been reported from Pyropia species, with identifications based on culture and genetic analysis of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region. Recent fungal DNA barcoding studies have shown the low taxonomic resolution of the ITS region and suggested the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene as an alternative molecular marker to identify Pythium species. In this study, we applied an analysis of both the ITS and cox1 regions to clarify the taxonomic relationships of Korean Pythium species. From the results, the two closely related Pythium species (P. chondricola and P. porphyrae) showed the same ITS sequence, while the cox1 marker successfully discriminated P. chondricola from P. porphyrae. This is the first report of the presence of P. chondricola from the infected blade of Pyropia yezoensis in Asia. This finding of the algal pathogen provides important information for identifying and determining the distribution of Pythium species. Further studies are also needed to confirm whether P. chondricola and P. porphyrae are coexisting as algal pathogens of Pyropia species in Korea.
Kim, Sun-Mi;Choi, Han-Gu;Hwang, Mi-Sook;Kim, Hyung-Seop
ALGAE
/
제33권1호
/
pp.55-68
/
2018
Foliose species of the Bangiaceae (Porphyra s. l.) are very important in Korean fisheries, and their taxonomy and ecophysiology have received much attention because of the potential for developing or improving aquaculture techniques. Although 20 species of foliose Bangiales have been listed from the Korean coast, some of them remain uncertain and need further comparative morphological studies with molecular comparison. In this study, we confirm the distribution of four Pyropia species from the east coast of Korea, Pyropia kinositae, P. moriensis, P. onoi, and P. retorta sp. nov., based on morphology and rbcL sequence data. Although P. onoi was listed in North Korea in old floral works, its occurrence on the east coast of South Korea is first revealed in this study based on molecular data. P. kinositae and P. moriensis, which were originally described from Hokkaido, Japan, are first reported on the east coast of Korea in this study. Pyropia retorta sp. nov. and P. yezonesis share a similar thallus color and narrow spermatangial patches in the upper portion of the frond, and they have a sympatric distribution. However, P. retorta can be distinguished by the curled or twisted thalli and by molecular data. The biogeographic pattern of the two native species, P. kinositae and P. retorta, suggests that the east coast of Korea may have been a place of refugia during the Last Glacial Maximum (LGM), and then recolonized to the northern part of Japan through the restored East Korean Warm Current after the LGM.
Genomic DNA isolated from two Porphyra species, P. tenera and P. dentate from Wando located on the southern coast of Korean peninsula was amplified by PCR reaction. The amplified products were separated by agarose gel electrophoresis (AGE) with decamer primer and stained with ethidium bromide. The eight arbitrarily selected primers OPA-04, OPA-06, OPB-01, OPB-08, OPB-10, OPB-11, OPB-14 and OPC-10 generated the shared loci, polymorphic, and specific loci. The size of DNA bands varies from 100 bp to 2,200 bp. The complexity of the banding patterns varies dramatically between the primers and two Porphyra species. A total of 528 loci observed were identified in P. tenera and 443 in P. dentata: 22 polymorphic loci (4.2%) in P. tenera and 30 (6.8%) in P. dentata. 154 shared loci observed, the average 19.3 per primer, were identified in P. tenera and 143 loci, the aver-age 17.9 per primer, in P. dentata species. The number of specific loci in P. tenera and P. dentata was 73 and 77, respectively. The average bandsharing value was $0.623{\pm}0.008$ with P. tenera and $0.560{\pm}0.009$ within P. dentata. The average bandsharing value between two Porphyra species was $0.408{\pm}0.004$, ranged from 0.305 to 0.564. The dendrogram obtained by the eight primers indicates four genetic clusters. The genetic distance between two Porphyra species ranged from 0.076 to 0.627. The individual no. 02 of P. tenera was genetically closely related to no. 01 of P. tenera(genetic distance=0.082). Especially, two entities between the individual DENTATA no.21 and DENTATA no. 19 of P. dentata showed the longest genetic distance (0.627) in comparison with other individuals used. In this study, RAPD-PCR analysis has revealed the significant genetic distance between two Porphyra species pairs (P<0.001).
Porphyra yezoensis is known to act as a biofilter against nutrient-rich effluent in seaweed-based integrated aquaculture systems. However, few studies have examined its physiological status under such conditions. In this study, we estimated the photosynthetic activity of P. yezoensis by chlorophyll fluorescence of PSII (${\Delta}F/F'm$ and relative $ETR_{max}$) using the Diving-PAM fluorometer (Walz, Germany). In addition, bioremediation capacity, tissue nutrients, and C:N ratio of P. yezoensis were investigated. The ammonium concentration in seawater of seaweed tank 4 decreased from $72.1{\pm}2.2$ to $33.8{\pm}0.4{\mu}M$ after 24 hours. This indicates the potential role of P. yezoensis in removing around 43% of ammonium from the effluents. Tissue carbon contents in P. yezoensis were constant during the experimental period, while nitrogen contents had increased slightly by 24 hours. In comparison with the initial values, the ${\Delta}F/F'm$ and $rETR_{max}$ of P. yezoensis had increased by about 20 and 40%, respectively, after 24 hours. This indicates that P. yezoensis condition improved or remained constant. These results suggest that chlorophyll fluorescence is a powerful tool in evaluating the physiological status of seaweeds in a seaweed-based integrated aquaculture system.
Amal H. Hajiya Hasan;Dhia A. Al-Bader;Steve Woodward;Csongor Z. Antony;Jared Kok Ong;Akira F. Peters;Frithjof C. Kupper
ALGAE
/
제38권2호
/
pp.127-139
/
2023
Cryptic stages of diverse macroalgae present in natural substrata, "the bank of microscopic forms", were isolated into clonal cultures and identified based on both morphological characteristics and DNA barcoding. Approximately 120 clonal isolates from 308 natural substratum samples were collected from the entire coastline of Kuwait. Amongst these isolates, 77 (64%) were identified through DNA barcoding using the nuclear ribosomal small subunit, RuBisCO spacer (ITS2, tufa, rbcL, psaA, and psbA) and sequencing. Twenty-six isolates (34%) were identified in the division Chlorophyta, 18 (23%) as Phaeophyceae, and 33 (43%) as Rhodophyta. For all DNA sequences in this study, species-level cut off applied was ≥98% homology which depend entirely on the markers used. Three putative new records of Chlorophyta new for the Arabian Gulf were made: Cladophora laetevirens (Dillwyn) Kützing, Ulva torta (Mertens) Trevisan and Ulvella leptochaete (Huber) R. Nielsen, C. J. O'Kelly & B. Wysor in Nielsen, while Cladophora gracilis Kützing and Ulva ohnoi M. Hiraoka & S. Shimada are new records for Kuwait. For Phaeophyceae, Ectocarpus subulatus Kützing and Elachista stellaris Areschoug were new records for the Gulf and Kuwait. In the Rhodophyta, Acrochaetium secundatum (Lyngbye) Nägeli in Nägeli & Cramer, Ceramium affine Setchell & N. L. Gardner, Gelidium pusillum var. pakistanicum Afaq-Husain & Shameel and Dasya caraibica Børgesen are new records for the Gulf and Kuwait, while the red alga Stylonema alsidii (Zanardini) K. Drew is a new record for Kuwait. Several isolates identified corresponded to genera not previously reported in Kuwait and / or the Arabian Gulf, such as Porphyrostromium Trevisan, a new genus from the Bangiales, and two unidentified species for the Planophilaceae Škaloud & Leliaert. The isolates cultivated from substrata enhance understanding of the marine macroalgal diversity in the region and confirmed that the Germling Emergence Method is suitable for determining the actual diversity of a given study area through isolation from cryptic life-history phases.
Sook Kyung Shin;Qikun Xing;Ji-Sook Park;Charles Yarish;Fanna Kong;Jang K. Kim
ALGAE
/
제39권1호
/
pp.31-41
/
2024
Acadian marine plant extract powder (AMPEP) and Kelpak are commercial biostimulants derived from brown algae Ascophyllum nodosum. This study was to determine if AMPEP and Kelpak can induce thermal resistance in Pyropia yezoensis. P. yezoensis blades were exposed to different concentrations (control: 0, low: 0.001, high: 1 ppm) of AMPEP and Kelpak at 10℃ for 6 and 7 days, respectively. Those blades were then cultivated in von Stosch enriched seawater medium at different temperatures (10, 15, 20, and 25℃) with 12 : 12 L : D photoperiod and 100 µmol m-2 s-1 of photosynthetically active radiation for additional 15 days. Results showed that P. yezoensisreproduced archeospores at 20 and 25℃ at all biostimulant conditions within 15 days. At lower temperatures (10 and 15℃), only AMPEP-treated P. yezoensis reproduced archeospores. P. yezoensis exposed to 1 ppm Kelpak exhibited higher phycoerythrin and phycocyanin contents than control and 0.001 ppm conditions at 15℃. AMPEP-treated conditions showed higher phycoerythrin and phycocyanin contents than control at 10℃. These results suggest that AMPEP and Kelpak may not enhance the thermal resistance of P. yezoensis. However, AMPEP stimulated archeospores release at lower temperatures. The treatment of AMPEP and Kelpak also increased the pigment contents in P. yezoensis. These results suggest that the use of seaweed-derived biostimulants can provide some economic benefits in P. yezoensis aquaculture. The enhancement of archeospores formation by AMPEP at lower temperature may also increase the productivity since Pyropia farming relies on the accumulation of secondary seedings via asexual reproduction.
Du, Yu;Guan, Jian;Xu, Ruijun;Liu, Xin;Shen, Weijie;Ma, Yafeng;He, Yuan;Shen, Songdong
ALGAE
/
제32권4호
/
pp.359-377
/
2017
Pyropia haitanensis (T. J. Chang et B. F. Zheng) N. Kikuchi et M. Miyata is one of the most commercially useful macroalgae cultivated in southeastern China. In red algae, the biosynthesis of terpenoids through 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP) pathway can produce a direct influence on the synthesis of many biologically important metabolites. In this study, two genes of cDNAs, 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase (DXS) and 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductase (DXR), which encoding the first two rate-limiting enzymes among MEP pathway were cloned from P. haitanensis. The cDNAs of P. haitanensis DXS (PhDXS) and DXR (PhDXR) both contained complete open reading frames encoding polypeptides of 764 and 426 amino acids residues, separately. The expression analysis showed that PhDXS was significant differently expressed between leafy thallus and conchocelis as PhDXR been non-significant. Additionally, expression of PhDXR and its downstream gene geranylgeranyl diphosphate synthase were both inhibited by fosmidomycin significantly. Meanwhile, we constructed types of phylogenetic trees through different algae and higher plants DXS and DXR encoding amino acid sequences, as a result we found tree clustering consequences basically in line with the "Cavalier-Smith endosymbiotic theory." Whereupon, we speculated that in red algae, there existed only complete MEP pathway to meet needs of terpenoids synthesis for themselves; Terpenoids synthesis of red algae derivatives through mevalonate pathway came from two or more times endosymbiosis of heterotrophic eukaryotic parasitifer. This study demonstrated that PhDXS and PhDXR could play significant roles in terpenoids biosynthesis at molecular levels. Meanwhile, as nuclear genes among MEP pathway, PhDXS and PhDXR could provide a new way of thinking to research the problem of chromalveolata biological evolution.
Pure lines were isolated from young gametophytic blades of pigmentation and morphological mutants in Porphyra tenera. Growth, blade-shape and photosynthetic pigment content of pure lines were compared with the wild type. Growth of blade length in the wild type (W, R-B), with round shape and brown color, was fastest at $5{\sim}10^{\circ}C$ and became slower as temperature increased. The blade-shape of the wild type changed from linear to round as temperature increased. The green type (R-G), with round shape and green color, showed slower growth, and the red type (R-R) 'with round shape and red color' showed faster growth than the wild type. The blade-shapes of the green and red types changed from elliptical or linear to round as temperature increased. The phycoerythrin (PE) / phycocyanin (PC) ratio of the green type was markedly lower and the PE/PC ratio of the red type was markedly higher than that of the wild type. The linear type (L-B), with liner shape and brown color, showed faster growth in blade length than the wild type at $10{\sim}20^{\circ}C$ and maintained its linear shape at $5{\sim}15^{\circ}C$. The content of photosynthetic pigments of the linear type was similar to that of the wild type. Each of the pure lines of pigmentation and morphological mutants that were isolated in the present study showed particular patterns in growth, blade-shape and photosynthetic pigment composition. Therefore, they are expected to be useful as new varieties by themselves and to be available for breeding and biotechnological studies.
Xuefeng Zhong;Shuai Che;Congying Xie;Lan Wu;Xinyu Zhang;Lin Tian;Chan Liu;Hongbo Li;Guoying Du
ALGAE
/
제38권2호
/
pp.141-150
/
2023
Light quality is a common environmental factor which influences the metabolism of biochemical substances in algae and leads to the response of algal growth and development. Pyropia yezoensis is a kind of economic macroalgae that naturally grows in the intertidal zone where the light environment changes dramatically. In the present study, P. yezoensis thalli were treated under white light (control) and monochromatic lights with primary colors (blue, green, and red) for 14 days to explore their physiological response to light quality. During the first 3 days of treatment, P. yezoensis grew faster under blue light than other light qualities. In the next 11 days, it showed better adaptation to green light, with higher growth rate and photosynthetic capacity (reflected by a higher rETRmax = 61.58 and Ek = 237.78). A higher non-photochemical quenching was observed in the treatment of red light than others for 14 days. Furthermore, the response of P. yezoensis to light quality also results in the difference of photosynthetic pigment contents. The monochromatic light could reduce the synthesis of all pigments, but the reduction degree was different, which may relate to the spectral absorption characteristics of pigments. It was speculated that P. yezoensis adapted to a specific or changing light environments by regulating the synthesis of pigments to achieve the best use of light energy in photosynthesis and premium growth and metabolism.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.