• 생명과학회지
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• 제13권4호
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• pp.535-540
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• 2003

최근 발효식품의 건강학적 활용면에 관한 연구는 활발히 진행되고 있다. 또한 발효식품 중에 가장 중요한 간장 발효미생물의 건강제품의 활용에 대해서 많은 연구가 진행되었다. 재래식 간장에 관한 연구결과로 항암작용, 노화지연, 호르몬 분비 촉진 등이 보고되고 있으나, 구강질환 원인균에 대한 방제효과가 있는가에 관한 연구는 거의 이루어지지 않고 있는 실정이다. 본 연구는 치아우식 등 구강질환 원인균인 Streptococcus sanguis, S. salivarius, S. mutans들의 성장을 억제하는 방제균을 선발하고 이들을 동정하기 위해 시행되었다. 우선 25종의 간장발효 균주를 분리하였고, 그 중 구강질환 방제력이 높은 2 균주(NG 06, NG 16)를 선별하였다. Bergey's manual of systematic bacteriology의 세균분류동정표에 의해 각종 동정에 필요한 배양학적, 형태학적, 생화학적 특성을 시험한 결과와 $Biolog^{(R)}$사의 세균동정시스템(MicroLogTM 3)을 이용하여 검정 실험한 결과 NG 06은 Bacillus racemilacticus로 NG 16은 Bacillus amyloliquefaciens으로 최종 확인, 동정되었다(Table 3). 앞으로 이 균들이 생산해내는 항균물질의 길항 기작에 관한 연구와 그 효능을 검증하고자 하며 그 항균물질 효과생산 최적조건에 대한 연구를 수행할 계획이다. 나아가 세치제 및 구강위생용품으로 활용면에 관한 연구를 확대하고자 한다.

• Journal of Species Research
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• 제8권2호
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• pp.197-214
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• 2019

The taxonomic hierarchy of the phylum Proteobacteria was assessed, after which the isolation and classification state of Proteobacteria species with valid names for Korean indigenous isolates were studied. The hierarchical taxonomic system of the phylum Proteobacteria began in 1809 when the genus Polyangium was first reported and has been generally adopted from 2001 based on the road map of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Until February 2018, the phylum Proteobacteria consisted of eight classes, 44 orders, 120 families, and more than 1,000 genera. Proteobacteria species isolated from various environments in Korea have been reported since 1999, and 644 species have been approved as of February 2018. In this study, all novel Proteobacteria species from Korean environments were affiliated with four classes, 25 orders, 65 families, and 261 genera. A total of 304 species belonged to the class Alphaproteobacteria, 257 species to the class Gammaproteobacteria, 82 species to the class Betaproteobacteria, and one species to the class Epsilonproteobacteria. The predominant orders were Rhodobacterales, Sphingomonadales, Burkholderiales, Lysobacterales and Alteromonadales. The most diverse and greatest number of novel Proteobacteria species were isolated from marine environments. Proteobacteria species were isolated from the whole territory of Korea, with especially large numbers from the regions of Chungnam/Daejeon, Gyeonggi/Seoul/Incheon, and Jeonnam/Gwangju. Most Halomonadaceae species isolated from Korean fermented foods and solar salterns were halophilic or halotolerant. Air-borne members of the genera Microvirga, Methylobacterium, and Massilia had common characteristics in terms of G+C content, major respiratory quinones, and major polar lipids.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제50권1호
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• pp.51-62
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• 2022

Lactobacillus rhamnosus SKG34 (LrSKG34), a potential probiotic strain, was successfully isolated from Sumbawa Mare's milk. Our previous studies showed that the strain is resistant to gastrointestinal conditions, possesses antioxidant activity, and lowers blood cholesterol levels. Further clarification of the potential probiotic characteristics and safety assessment are necessary. This study aimed to evaluate the adhesion of LrSKG34 to Caco-2 cell monolayers and its effect on mucosal integrity in vitro. We also examined the LrSKG34 safety profile based on antimicrobial susceptibility testing, haemolytic activity determination, Caco-2 cell monolayer translocation evaluation, and in vivo investigation of the effect of LrSKG34 on the physiology, biochemical markers, and histopathological appearance of major organs in an animal model. LrSKG34 attached to Caco-2 cell monolayers and maintained mucosal integrity in vitro. The typical resistance of lactobacilli to ciprofloxacin, gentamicin, vancomycin, trimethoprim-sulfamethoxazole, and metronidazole was confirmed for LrSKG34. No haemolytic activity was observed on blood agar plates, and no LrSKG34 translocation was observed in Caco-2 cell monolayers. Administration of LrSKG34 to Sprague-Dawley rats did not adversely affect body weight. No abnormalities in hematological parameters, serum biochemistry levels, or histopathological structures of major organs were observed in LrSKG34-treated rats. Collectively, the results implicate LrSKG34 as a promising and potentially safe probiotic candidate for further development.

• ALGAE
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• 제37권1호
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• pp.1-14
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• 2022

Cyanobacteria are distributed worldwide, and many new cyanobacterial species are discovered in tropical region. The Nostoc-like genus Amazonocrinis has been separated from the genus Nostoc based on polyphasic methods. However, species diversity within this genus remains poorly understood systematically because only one species (Amazonocrinis nigriterrae) has been described. In this study, two novel strains (NUACC02 and NUACC03) were isolated from moist rice field soil in Thailand. These two strains were characterized using a polyphasic approach, based on morphology, 16S rRNA phylogenetic analysis, internal transcribed spacer secondary structure and ecology. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences confirmed that the two novel strains formed a monophyletic clade related to the genus Amazonocrinis and were distant from the type species A. nigriterrae. The 16S rRNA gene sequence similarity (<98.1%) between novel strains and all other closely related taxa including the Amazonocrinis members exceeded the cutoff for species delimitation in bacteriology, reinforcing the presence of a new Amazonocrinis species. Furthermore, the novel strains possessed unique phenotypic characteristics such as the presence of the sheath, necridia-like cells, larger cell dimension and akinete cell arrangement in long-chains and the singularity of D1-D1', Box-B, V2, and V3 secondary structures that distinguished them from other Amazonocrinis members. Considering all the results, we described our two strains as Amazonocrinis thailandica sp. nov. in accordance with the International Code of Nomenclature for Algae, Fungi and Plants.

• 대한바이러스학회지
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• 제30권3호
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• pp.203-210
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• 2000

Hantaviruses are etiologic agents of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) and hantavirus pulmonary syndrome (HPS) in the world. Various hantaviruses were isolated from HFRS patients and several different rodent species in the world. Four hantavirus isolates from Indonesia and three isolates from Thailand among 89 Bandicotas captured in Yogyakarta, east region of Sumatra island, Indonesia and at Chiang Mai in Thailand during 1996 were made through several passages in Vero E6 cells. Viral genome M segment from two Indonesian isolates and three Thailand isolates were amplified using hantavirus generic primers of the M segment and cloned into pCRII vector. The genetic differences were analyzed by comparison of partial sequence of the M segment and antigenic differences were made by IFA. Nucleotide sequence homology of two isolates BC 8, BC 34 from Indonesia and two isolates thai 1322, thai 1330 to Seoul virus was 99% and 96%, respectively, but Thai 1164 was 80%Thai 1164 strain has shown 95% homology to Thai 749 virus. In conclusion it is indicated that two different serotype hantaviruses, Seoul and Thailand, are cocirculating among Bandicota in Thailand, in contrast Seoul serotype virus is circulating in Indonesia.

• Journal of Veterinary Science
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• 제24권6호
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• pp.82.1-82.12
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• 2023

Background: The current conventional serotyping based on antigen-antisera agglutination could not provide a better understanding of the potential pathogenicity of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Brancaster. Surveillance data from Malaysian poultry farms indicated an increase in its presence over the years. Objective: This study aims to investigate the virulence determinants and antimicrobial resistance in S. Brancaster isolated from chickens in Malaysia. Methods: One hundred strains of archived S. Brancaster isolated from chicken cloacal swabs and raw chicken meat from 2017 to 2022 were studied. Two sets of multiplex polymerase chain reaction (PCR) were conducted to identify eight virulence genes associated with pathogenicity in Salmonella (invasion protein gene [invA], Salmonella invasion protein gene [sipB], Salmonella-induced filament gene [sifA], cytolethal-distending toxin B gene [cdtB], Salmonella iron transporter gene [sitC], Salmonella pathogenicity islands gene [spiA], Salmonella plasmid virulence gene [spvB], and inositol phosphate phosphatase gene [sopB]). Antimicrobial susceptibility assessment was conducted by disc diffusion method on nine selected antibiotics for the S. Brancaster isolates. S. Brancaster, with the phenotypic ACSSuT-resistance pattern (ampicillin, chloramphenicol, streptomycin, sulphonamides, and tetracycline), was subjected to PCR to detect the corresponding resistance gene(s). Results: Virulence genes detected in S. Brancaster in this study were invA, sitC, spiA, sipB, sopB, sifA, cdtB, and spvB. A total of 36 antibiogram patterns of S. Brancaster with a high level of multidrug resistance were observed, with ampicillin exhibiting the highest resistance. Over a third of the isolates displayed ACSSuT-resistance, and seven resistance genes (β-lactamase temoneira [bla_TEM], florfenicol/chloramphenicol resistance gene [floR], streptomycin resistance gene [strA], aminoglycoside nucleotidyltransferase gene [ant(3")-Ia], sulfonamides resistance gene [sul-1, sul-2], and tetracycline resistance gene [tetA]) were detected. Conclusion: Multidrug-resistant S. Brancaster from chickens harbored an array of virulence-associated genes similar to other clinically significant and invasive non-typhoidal Salmonella serovars, placing it as another significant foodborne zoonosis.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권11호
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• pp.1420-1427
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• 2023

The forkhead domain genes are important for development and morphogenesis in fungi. Six forkhead genes fkhA-fkhF have been found in the genome of the model filamentous Ascomycete Aspergillus nidulans. To identify the fkh gene(s) associated with fungal development, we examined mRNA levels of these six genes and found that the level of fkhB and fkhD mRNA was significantly elevated during asexual development and in conidia. To investigate the roles of FkhB and FkhD, we generated fkhB and fkhD deletion mutants and complemented strains and investigated their phenotypes. The deletion of fkhB, but not fkhD, affected fungal growth and both sexual and asexual development. The fkhB deletion mutant exhibited decreased colony size with distinctly pigmented (reddish) asexual spores and a significantly lower number of conidia compared with these features in the wild type (WT), although the level of sterigmatocystin was unaffected by the absence of fkhB. Furthermore, the fkhB deletion mutant produced sexual fruiting bodies (cleistothecia) smaller than those of WT, implying that the fkhB gene is involved in both asexual and sexual development. In addition, fkhB deletion reduced fungal tolerance to heat stress and decreased trehalose accumulation in conidia. Overall, these results suggest that fkhB plays a key role in proper fungal growth, development, and conidial stress tolerance in A. nidulans.

• 한국버섯학회지
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• 제12권3호
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• pp.201-208
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• 2014

버섯배지의 발효를 효율적으로 행하면서 버섯의 재배 시 빈번하게 발생하는 푸른곰팡이 병의 원인 균주인 Trichoderma sp. 곰팡이 성장을 억제하는 세균의 분리를 행하였다. 균원시료로부터 1차 분리한 약 200여 균주 중에서 성장속도가 빠르고, SM, AM 및 CM의 평판배지 상에서 clear zone이 뚜렷한 6균주를 2차 분리하였다. 분리한 6균주 중 cellulase, amylase 및 protease의 효소활성이 높고 T. virens와 T. harzianum에 대하여 강한 항균활성을 나타낸 C-1균주를 최종 분리균주로 선정하였다. 분리한 C-1균주는 Bergey's Manual of Systematic Bacteriology에 의한 동정과 16S rDNA 염기서열 분석을 행한 결과 Paenibacillus polymyxa 밝혀져 P. polymyxa CK-1으로 명명하였다. P. polymyxa CK-1균주의 생육조건을 검토한 결과 최적배양온도는 $45^{\circ}C$, 생육을 위한 배지의 최적 pH는 6.0~7.0 범위로 나타났다. T. virens와 T. harzianum 곰팡이의 생육억제를 위한 P. polymyxa CK-1의 배양시간은 22~36시간이 적당하였다. 그리고 P. polymyxa CK-1균주의 24시간째 배양용액을 처리한 petri dish에 두 곰팡이를 각각 접종한 후 10일 동안 방치하여도 곰팡이의 생육은 관찰되지 않았다. P. polymyxa CK-1 균주가 생산한 길항물질의 열안정성을 검토한 결과 $60^{\circ}C$ 및 $100^{\circ}C$로 20분 동안 처리한 시험구에서는 두 곰팡이의 균사성장이 전혀 관찰되지 않았지만 $121^{\circ}C$에서 20분 동안 처리한 시험구에서는 약간의 균사성장이 관찰되었다. P. polymyxa CK-1배양액이 버섯균사 생육에 미치는 영향을 검토한 결과 팽이버섯, 표고버섯 등의 다양한 버섯균사 생육에 전혀 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다.

• 대한방사선기술학회지:방사선기술과학
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• 제31권3호
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• pp.229-237
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• 2008

목적 : 검사실별 IP카세트와 테이블의 미생물 수와 세균학적 오염도를 알코올과 소독제가 포함된 티슈를 사용 전 후로 나누어 동정한 후 통계적으로 검정을 실시하여 영상의학과내 병원감염관리의 예방과 올바른 소독 지침을 위한 기초자료를 제공하고자 연구하였다. 대상 및 방법 : 본 연구는 대전광역시 소재의 1개 대학병원 영상의학과의 일반촬영실을 대상으로 하였다. 기간은 2007년 4월 5일부터 4월 12일까지 이루어졌으며, 검사실별 IP카세트와 테이블의 미생물 수와 세균학적 오염도를 알코올과 소독제가 포함된 소독용 티슈를 사용 전, 후로 나누어 실시하였으며, 정확한 수집을 위하여 병원내 감염관리 전문 간호사와 함께 시료를 채취하였다. 통계처리는 SPSS V13.0을 사용하였으며, 전 후 비교를 위해 T-검정을 실시하였으며 사후검증을 실시하였다. 결과 : 24개의 대상 중 19개(79.2%)에서 세균이 검출 되었으며 5개(20.8%)에서는 세균이 검출되지 않았다. 분리된 세균의 종류는 7종의 세균이 검출 되었는데 그 중 Methicillin Resistant coagulase-negative Staphylo-cocci(MRCNS)가 15(62.5%)곳으로 가장 많이 검출되었으며, 그 다음으로 Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus(MRSA)가 6(16.7%)곳으로 많았으며, Enterococcus Faecium(EFM)이 5(20.8%), Acinetobacter baumannii(ABA) 2(8.3%), Bacillus sp, Coagulase-negative Staphylococci(CNS), Enterococcus sp(ENT)가 각각 1(4.2%)곳에서 검출되었다. 또한 ABA를 제외한 모든 것이 그람양성구균(Gram positive bacilli)이 30(97%) 례에서 검출 되었으며, 1(3%)례에서만 그람음성균(Gram positive bacilli)이 검출되었다. Group별 70% Alchol 사용 전 후 균의 종류 및 군락 수에서는 70% Alchol로 소독을 한 후 세균을 동정한 결과 70% Alchol 소독군에서는 IP Cassette와 Table 그룹 모두에서 100% 세균이 사멸되었다. Group별 Tissue Cleaner 사용 전 후 균의 종류 및 군락 수에서는 Tissue Cleaner 그룹에서의 균의 사멸률은 10그룹(71.2%)에서만 세균이 완전히 사멸되었으며, 4 그룹에서는 많은 감소를 보였으나 여전히 세균이 검출되었다. 전체 균의 사멸률은 91.5%로 나타났는데 다른 균들은 모두 사멸된 반면 MRCNS 균은 사멸률이 가장 낮았(83.6%)으며, 다음으로 MRSA(95%)가 낮았다. 결론 : 70% Alchol과 Tissue Cleaner의 사용전 후 검출되는 세균의 평균을 비교한 결과 모두에서 유의수준5%에서 통계적으로 유의한 것으로 나타났다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제45권11호
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• pp.1368-1372
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• 2002

목 적: A군 연쇄구균의 세포벽은 M단백과 T단백으로 구성되어 있고, M단백의 항원성은 현재 90여 가지로 분류되고 있으며 균의 독성과 관련이 있고 질병의 병인론을 연구하는데 도움이 된다. 반면에 T단백은 항원성 분류는 연쇄구균의 역학적 상황을 이해하는데 유효하다고 알려져 있다. 이에 저자들은 지난 3년 동안 서울시내 5개 지역 병의원의 외래 및 입원환자를 대상으로 분리된 A군 연구균의 T단백 분류를 통해 역학적 동태를 알고자 하였다. 방 법: 1998년부터 2000년까지 서울 시내(남부, 북동부, 북부, 북서부, 북부)를 5개 지역으로 분류하여 외래 및 입원환자를 대상으로 분리된 A군 연구균의 T단백의 혈청형 분석을 시행하여 연도별 A군 연구균의 혈청학적 형 분류와 침투성질환에서 분류된 연구균의 혈청학적 형 분류의 특성을 알아보았다. 결 과 :1998년에 5개 지역에서 시행한 92례의 아동에서 A군 연구균을 분리하여 T12, T4, Non-typed(NT)가 72.2%를 차지하였고, 이중 성홍열은 7례가 있었으며 T12와 T4가 각각 3, 4례를 차지하였으며 경부임파선염 1례(T12), 편도농양 2례(T8, NT)이었다. 1999년에는 41례의 아동에서 시행하였으며 T12, T4, T1가 68%의 분포를 보였으며 성홍열은 5례 중 T12, T4가 3례를 차지하였고 폐렴 2례(T4, T1)와 경부임파선염 1례(T8/25)를 나타내었다. 2000년도는 서울 중부를 제외한 지역에서 시행한 83례의 아동에서 T12, T4, T1이 전체의 63.9%를 보였고 성홍열은 3례(T12, T4, T5 각각 1례)와 편도농양 T12 1례와 폐렴 NT 1례, 패혈증 T1 1례를 나타내었다. 결 론: A군 연구균의 T단백의 혈청학적 분석은 서울 내에서의 지역적 특정 분포는 없으나 T12가 감소하는 연도별 차이를 보였다. 성홍열이나 침투성 질환에서 특정 T단백의 분포도를 보이지는 않았다. 이에 T단백의 혈청학적 분석이 질병의 진단과 치료에 도움이 될 것으로 사료되며 앞으로 주기적으로 더 많은 아동을 대상으로 하는 역학적 검사가 이루어 져야할 것이다.