• 제목/요약/키워드: Bacteria screening

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발효 소시지 제조를 위한 기능성 유산균의 선발 (Screening of Lactic Acid Bacteria as Starter Culture for Making Fermented Sausage)

  • 한수민;김영주;이홍철;진구복;오세종
    • 한국축산식품학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.511-516
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    • 2006
  • 발효 소시지의 제조에 starter로 사용한 균주를 선발하기 위해 각 유산균 균주들의 ACE 저해 활성, 콜레스테롤 흡착능력, 발효 육제품 저장 중 S. aureus에 대한 저해 황성을 평가하였다. ACE 저해 활성은 L. plantarum L167이 가장 우수하였고(58.75%), 콜레스테롤 흡착 능력이 우수한 균주로는 L. plantarum L155를 선발하였다. 박테리오신을 생산하는 P. damnosus를 starter로 이용하여 제조한 발효 소시지에 S. aureus를 접종하여 상온 저장 중 생균수를 측정한 결과 저장 35일째에 대조구에 비하여 1 log의 균수 감소 효과가 나타났다.

고온세균을 이용한 남은 음식물의 호기적 액상발효 (Aerobic Liquid Fermentation of Residual Food Waste by Thermophilic Bacteria)

  • 류승용;박명주;김소영;이기영
    • 유기물자원화
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    • 제10권3호
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    • pp.126-131
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    • 2002
  • 남은 음식물을 기질로 생균사료를 생산하기위하여 고온성 세균에 의한 호기적 액체 발효가 시도되었다. 토양이나 남은 음식물들로부터 11종의 고온성 세균이 $55^{\circ}C$에서의 진탕배양에 의해 분리되었다. 이들 분리균 들의 기질분해능을 평가하기위해 배양액 중에서의 ${\alpha}-amylase$ 와 protease효소역가를 측정 비교하였다. 이 결과 6종의 세균이 선택되었고 남은 음식물 기질 적응력을 높이기 위해 반복 배양을 실시하였다. 발효말기에서의 생균농도는 대부분 $3{\sim}7{\times}10^9/ml$에 이르렀다. 이들 중 B3, B6가 가장 높은 효소역가를 나타냈다. B3, B6, 그리고 분양받은 균주인 Bacillus Stearothermophillus를 2L-jar fermenter를 이용해 혼합발효시킨 결과발효개시 8시간 내에 생균수가 $1.4{\times}10^{10}/ml$에 이르렀다.

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Identification of Antimicrobial Peptide Hexamers against Oral Pathogens through Rapid Screening of a Synthetic Combinatorial Peptide Library

  • Song, Je-Seon;Cho, Kyung Joo;Kim, Joungmok;Kim, Jeong Hee
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제39권4호
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    • pp.169-176
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    • 2014
  • A positional scanning synthetic peptide combinatorial library (PS-SCL) was screened in order to identify antimicrobial peptides against the cariogenic oral bacteria, Streptococcus mutans. Activity against Streptococcus gordonii and Aggregatibacter actinomycetemcomitans was also examined. The library was comprised of six sub-libraries with the format $O_{(1-6)}XXXXX-NH_2$, where O represents one of 19 amino acids (excluding cysteine) and X represents equimolar mixture of these. Each sub-library was tested for antimicrobial activity against S. mutans and evaluated for antimicrobial activity against S. gordonii and A. actinomycetemcomitans. The effect of peptides was observed using transmission electron microscopy (TEM). Two semi-mixture peptides, RXXXXN-$NH_2$ (pep-1) and WXXXXN-$NH_2$ (pep-2), and one positioned peptide, RRRWRN-$NH_2$ (pep-3), were identified. Pep-1 and pep-2 showed significant antimicrobial activity against Gram positive bacteria (S. mutans and S. gordonii), but not against Gram negative bacteria (A. actinomycetemcomitans). However, pep-3 showed very low antimicrobial activity against all three bacteria. Pep-3 did not form an amphiphilic ${\alpha}$-helix, which is a required structure for most antimicrobial peptides. Pep-1 and pep-2 were able to disrupt the membrane of S. mutans. Small libraries of biochemically-constrained peptides can be used to generate antimicrobial peptides against S. mutans and other oral microbes. Peptides derived from such libraries may be candidate antimicrobial agents for the treatment of oral microorganisms.

혼성 아가로즈젤 스탬프를 이용한 박테리아 마이크로 컨택트 프린팅 (Microcontact Printing of Bacteria Using Hybrid Agarose Gel Stamp)

  • 심현우;이지혜;이창수
    • KSBB Journal
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    • 제21권4호
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    • pp.273-278
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    • 2006
  • 박테리아 패터닝을 위한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프는 PDMS 몰드를 이용한 replica moding 공정을 이용하여 제작하였다. 완성된 스탬프를 박테리아를 잉크로 사용한 후, $50{\mu}m$ 원 모양을 가지는 2차원 박테리아 어레이를 구현할 수 있었다. 또한, 상기 방법을 통하여 실험 목적에 적합한 다양한 모양을 가지는 패턴을 쉽게 만들 수 있다. 패터닝된 박테리아의 형광 세기는 스팟과 주변간에 매우 높은 대조비를 이루며, 각각의 스팟 및 스팟간의 형광 세기가 매우 균일함을 보여 프린팅 시 매우 균일한 패턴을 얻을 수 있었다. 박테리아 패터닝을 할 경우 큰 문제점인 낮은 젖음성과 미끄럽고 작은 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 취급의 어려움을 본 연구에서 제안한 혼성 아가로즈젤 마이크로 스탬프를 이용하여 해결할 수 있었다. 상기 방법의 가장 큰 장점은 세포를 이용한 패터닝의 경우 세포의 활성을 유지시키는 것인데 다량의 수분을 포함하는 아가로즈젤을 사용할 경우 세포의 활성을 유지시키면서 패턴을 구현할 수 있으므로 매우 중요한 기술로 생각된다. 본 연구에서 제안된 방법은 매우 재현성이 높으며, 편리하고, 빠르게 구현할 수 있어서 미생물 생태학, 세포와 표면간의 상호작용 그리고 세포를 바탕으로 하는 스크리닝 시스템에 활용 되어 질것으로 기대된다.

Growth-Inhibiting Effects of Vegetable Extracts on Beneficial and Harmful Human Intestinal Bacteria

  • Kim, Moo-Key;Kim, Min-Jeong;Shin, Dong-Hwa;Song, Chul-Gyu;Lee, Hoi-Seon
    • Journal of Applied Biological Chemistry
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    • 제44권2호
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    • pp.65-70
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    • 2001
  • Ethanol extracts of 38 vegetables were subjected to an in vitro screening for their growth-inhibitory activities towards Bifidobacterium bifidum, B. longum, Clostridium perfringens, Lactobacillus acidophilus, L. casei, and Escherichia coli using paper disc agar diffusion methods under anaerobic conditions. The responses varied with both bacterial strain and vegetable species. In a test with 20 mg/disc, Zingiber officinale extracts showed significant growth-inhibitory responses against B. bifidum, and strong inhibitions against L. casei were detected in the extracts of Chrysanthemum coronarium var. spatiosum and Lactuca sativa. The extracts of Allium sativum, Capsicum annuum, L. esculentum, L. esculentum var. cerasiforme, and Z. officinale showed strong inhibitory activities against C. perfringens, while moderate growth-inhibitory responses were observed in the extracts of C. ffutescens, Cucurbita moschata, Daucus carota var. sativa, and Rubus coreanus. However, all vegetable extracts showed no inhibitions against B. longum, L. acidophilus, and E. coli. In tests with 5 mg/disc, moderate inhibitions were observed in the extracts of C. coronarium var. spatiosum and L. sativa against L. casei and Z. officinale against B. bifidum. Vegetables extracts, except for C. coronarium var. spatiosum, L. sativa, and Z. officinale, did not affect the growth of beneficial bacteria. Strong inhibitory responses against C. perfringens were detected in the extracts of C. annuum and L. esculentum var. cerasiforme. Daily intake of vegetables may be important in the prevention of human diseases caused by the intestinal bacteria.

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신규 섬유질 분해성 젖산균 Enterococcus sp. TO-94를 이용한 오미자의 발효 특성 (Fermentation Property by Novel Cellulolytic Lactic Acid Bacteria Enterococcus sp. TO-94 on Omija (Schizandra chinensis Baillon))

  • 류일환;이어진;권지웅;이강수;권태오
    • 한국약용작물학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.429-438
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    • 2010
  • The use of cellulolytic lactic acid bacteria in new method to prepare high nutrition complementary foods was investigated. For the screening of cellulolytic lactic acid bacteria, more than 1,150 bacterial colony were isolated from diluted infant feces samples. A typical strain which appeared the most excellent cellulolytic activities was identified novel acidophilic Enterococcus sp. TO-94 through the results of morphological, biochemical and chemotaxonomic characteristics and 16S rDNA sequencing. The optimal lactic acid fermentation conditions of Omija(Schizandra chinensis Baillon) by Enterococcus sp. TO-94 were as follows: pH and temperature were 3.0 and $37^{\circ}C$, respectively, and fermentation time was 20hrs. The fructose and glucose were major free sugar and the contents were 5.83 and 4.30 mg/g after fermentation, respectively. The contents of lactic acid and acetic acid were 9.84 mg/g and 2.08 mg/g after fermentation, respectively. The vitamin $B_1$, $B_2$, niacin, folic acid and C were major vitamin in the fermented broth, the contents were 1.5~3 times higher than those of initial fermentation time. Also, the contents of polyphenol and anthocyanine were 3.8 and 1.2 times higher than those of initial fermentation time.

장내 유해세균을 억제하는 양돈용 프로바이오틱스 개발을 위한 비피도박테리아 탐색 (Screening of Bifidobacteria for the Development of Probiotics Inhibiting Intestinal Pathogenic Bacteria)

  • 이재연;신영오;김근
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.211-218
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    • 2014
  • 본 연구에서는 동물유래 시료들로부터 양돈 사료첨가용 유산균을 개발하기 위하여 enterotoxigenic E. coli, Salmonella Typhimurium, Clostridium perfringens 등 양돈산업에서 심각한 문제를 일으키는 인수공통 병원성 세균들과 Clostridium jejuni, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus와 같은 식중독균을 강하게 저해하는 Bifidobacterium 유산균을 분리하고자 하였다. 이를 위하여 소의 반추위 내용물, 닭 창자 내용물, 돼지 분변 등의 시료들로부터 총 65주의 혐기성미생물을 분리하였다. 이 중에서 항병원세균활성이 가장 높은 4주를 선별하였는데, 이들은 16S rDNA 염기서열 분석방법에 의하여 3주의 B. boum과 1주의 B. thermophilum으로 동정되었다. 특히 B. thermophilum는 분리주들 중에서 가장 높은 돼지 장 상피세포에 대한 부착성을 보였고, 여러 인수공통병원세균들과 식중독균들에 대한 높은 항균력, 산과 담즙내성을 보여 양돈용 생균제 후보균주로서 우수한 특성을 나타내었다.

Draft Genome Analysis of Antimicrobial Streptomyces Isolated from Himalayan Lichen

  • Kim, Byeollee;Han, So-Ra;Lamichhane, Janardan;Park, Hyun;Oh, Tae-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제29권7호
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    • pp.1144-1154
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    • 2019
  • There have been several studies regarding lichen-associated bacteria obtained from diverse environments. Our screening process identified 49 bacterial species in two lichens from the Himalayas: 17 species of Actinobacteria, 19 species of Firmicutes, and 13 species of Proteobacteria. We discovered five types of strong antimicrobial agent-producing bacteria. Although some strains exhibited weak antimicrobial activity, NP088, NP131, NP132, NP134, and NP160 exhibited strong antimicrobial activity against all multidrug-resistant strains. Polyketide synthase (PKS) fingerprinting revealed results for 69 of 148 strains; these had similar genes, such as fatty acid-related PKS, adenylation domain genes, PfaA, and PksD. Although the association between antimicrobial activity and the PKS fingerprinting results is poorly resolved, NP160 had six types of PKS fingerprinting genes, as well as strong antimicrobial activity. Therefore, we sequenced the draft genome of strain NP160, and predicted its secondary metabolism using antiSMASH version 4.2. NP160 had 46 clusters and was predicted to produce similar secondary metabolites with similarities of 5-100%. Although NP160 had 100% similarity with the alkylresorcinol biosynthetic gene cluster, our results showed low similarity with existing members of this biosynthetic gene cluster, and most have not yet been revealed. In conclusion, we expect that lichen-associated bacteria from the Himalayas can produce new secondary metabolites, and we found several secondary metabolite-related biosynthetic gene clusters to support this hypothesis.

분홍색 색소를 형성하는 methylotrophic acteria(PPFMs): 최근 경향소개 (Pink Pigmented Facultative Methylotrophic Bacteria(PPFMs): Introduction to Current Concepts)

  • ;사동민;김재정
    • 한국토양비료학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.266-287
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    • 2004
  • 식물체에 해를 끼치지 않고 식물체와 공생하는 박테리아는 식물의 생장을 촉진 시키며 친환경적 식물 보호제 역할을 함으로서 높은 관심을 받아왔다. Methylobacterium spp.로 분리된 분홍색 색소를 형성하는 methylotrophic bacteria (PPFMS)는 식물의 잎 표면에 서식한다. 거의 모든 식물체의 잎에는 PPFMS를 가지고있으며, Methylobacterium의 특별한 특성을 가진 이들은 탄소와 에너지원으로 잎의 methanol를 이용한다. 비록 이들 박테리아들은 잘 알려 지지 않았지만. 그들은 식물 대사 작용에 영향을 주면서 함께 진화되어 왔다. 이 주장은 다음의 예로 보인 관찰로서 뒷받침 한다. (1) PPFMS는 씨 안에서 발견되고 (2) PPFMS는 자주 무균 세포 배양에서 발견되고 (3) 적은 수의 PPFMS를 지닌 종자는 낮은 발아율을 보였고, (4) 감소된 PPFMS를 가진 식물들은 낮은 줄기/뿌리 비율을 보이고, (5) 콩깍지 형성 시기에 콩잎에 PPFMS의 엽면처리는 종자 수와 생산량을 높이며, (6) 우산이끼를 배양하는데 있어서 PPFM에 의해 생성된 비타민 Rl2는 우산이끼의 생장을 위해 필요하고 (7) 벼에 있어서 Rhizoctonia solani에 인해 나타나는 엽초마름병의 발병률은 PPFMS를 처리한 벼에서 억제되거나 감소되었고, 그리고 (8) PPFM의 종은 기공과 엽록소의 농도, malic acid의 함량을 증가시켜 식물의 광합성 능을 증가시켰다. Methylobacterium spp.은 식물체의 잔사를 이용하거나 식물체에 유용한 대사산물을 생산함으로써 식물의 신진대사에 관여하는 것으로 알려진 공생자이다. 박테리아와 식물체간의 이로운 상호작용에 관해 알려진 많은 보고서들이 있다. 식물체의 수분장애 완화, 광합성호르몬 생산, 그리고 질소고정과 같은 식물의 생장을 촉진시키는 박테리아 종과 같은 선발은 성공적으로 분리 해낼 수 있었고, 작물생산에 있어서 이 같은 미생물의 처리는 생산력을 증가시킬 것이다.

담수산 미세조류로부터 생리활성물질의 탐색 (Screening of Bioactive Materials from Freshwater Microalgae)

  • 이완석;최애란;안치용;오현철;안종석;오희목
    • ALGAE
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    • 제19권3호
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    • pp.271-276
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    • 2004
  • One hundred and fifty four micro algal strains, newly isolated from nationwide freshwaters in Korea, were screened for their anticancer, ant diabetic, and antibiotic activities. The micro algal strains were cultured with different nutritional conditions that were divided into 4 groups as follows; a normal Allen medium, nitrogen (N)-limited medium, phosphorus (P)-limited medium, and N and P-limited medium. Algal biomass was extracted with a mixture of acetone:H₂O (1:1, v:v) and the extracts were used for the screening of bioactive materials. Anticancer, ant diabetic, and antibiotic materials were screened by the methods of vaccinia Hl-related protein tyrosine phosphates (VHR DS-PTPase) inhibition, protein tyrosine phosphates 1B (PTP1B) inhibition, and paper disk. The inhibition activity of VHR DS-PTPase was observed in 18 strains, having a maximum 79% inhibition from Anabaena affinis and the inhibition activity of PTP1B was observed in 9 strains, having a maximum 97% from Sphaerocystis schroeteri. Microcystis aeruginosa incubated in an N and P-limited medium showed antibiotic activity in 8 species out of 13 pathogenic bacteria. As a whole, it seemed that the stressed condition such as N and/or P limitation increased the production of bioactive materials in micro algae.