• 제목/요약/키워드: Bacillus Megaterium

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Biochemical and Molecular Characterization of High Population Density Bacteria Isolated from Sunflower

  • Goes, Kelly Campos Guerra Pinheiro De;Fisher, Maria Luisa De Castro;Cattelan, Alexandre Jose;Nogueira, Marco Antonio;Carvalho, Claudio Guilherme Portela De;Oliveira, Andre Luiz Martinez De
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권4호
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    • pp.437-447
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    • 2012
  • Natural and beneficial associations between plants and bacteria have demonstrated potential commercial application for several agricultural crops. The sunflower has acquired increasing importance in Brazilian agribusiness owing to its agronomic characteristics such as the tolerance to edaphoclimatic variations, resistance to pests and diseases, and adaptation to the implements commonly used for maize and soybean, as well as the versatility of the products and by-products obtained from its cultivation. A study of the cultivable bacteria associated with two sunflower cultivars, using classical microbiological methods, successfully obtained isolates from different plant tissues (roots, stems, florets, and rhizosphere). Out of 57 plant-growth-promoting isolates obtained, 45 were identified at the genus level and phylogenetically positioned based on 16S rRNA gene sequencing: 42 Bacillus (B. subtilis, B. cereus, B. thuringiensis, B. pumilus, B. megaterium, and Bacillus sp.) and 3 Methylobacterium komagatae. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis showed a broad diversity among the Bacillus isolates, which clustered into 2 groups with 75% similarity and 13 subgroups with 85% similarity, suggesting that the genetic distance correlated with the source of isolation. The isolates were also analyzed for certain growth-promoting activities. Auxin synthesis was widely distributed among the isolates, with values ranging from 93.34 to 1653.37 ${\mu}M$ auxin per ${\mu}g$ of protein. The phosphate solubilization index ranged from 1.25 to 3.89, and siderophore index varied from 1.15 to 5.25. From a total of 57 isolates, 3 showed an ability to biologically fix atmospheric nitrogen, and 7 showed antagonism against the pathogen Sclerotinia sclerotiorum. The results of biochemical characterization allowed identification of potential candidates for the development of biofertilizers targeted to the sunflower crop.

전통발효식품과 토양으로부터 분리된 혼합균주의 최적생육조건 및 음식물쓰레기 분해 효과 (Optimal Culture Conditions and Food Waste Decomposition Effects of Mixed Strains Separated from Traditional Fermented Food and Soils)

  • 김민선;김희정;정은선;박주용;채종찬;황권택;이승제
    • 한국키틴키토산학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.285-292
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    • 2018
  • 음식물쓰레기 분해용 균주를 선발하기 위하여 전통발효식품과 토양으로부터 내염성, 내열성을 갖는 균주 분리를 시도하였으며, protease, amylase, cellulase 및 lipase의 효소활성도를 평가하였다. 5% NA 배지에서 분리된 균주는 212종이었으며, 전통발효식품의 경우 4가지 효소활성을 가지고, 토양의 경우 2가지 이상의 효소활성을 가지며, 억제환이 15 mm 이상의 크기를 지닌 79종의 균주를 우선 선발하였다. 선발된 균주를 대상으로 분자유전학적 동정을 진행한 결과, 중복성을 배제하여 11종의 균주를 최종적으로 선발하여 혼합균주로 사용하였다. 혼합균주의 최적 배양조건으로는 배양시간은 24시간, 배양온도는 $30^{\circ}C$ 그리고 pH의 최적 조건은 7.0 부근인 것으로 확인되었다. 최적배양된 혼합균주 처리에 따른 음식물쓰레기 분해능 평가 결과 멸균수 첨가군은 10 mesh ($2000{\mu}m$)에서 103 g, 혼합균주 첨가군은 10 mesh ($2000{\mu}m$)에서 18 g인 것으로 보아 혼합균주로 나타나 음식물의 고형분의 입자가 액상으로 분해되었음을 확인하였다.

Isolation and Identification of Biofilm-Forming Marine Bacteria on Glass Surfaces in Dae-Ho Dike, Korea

  • Kwon, Kae-Kyoung;Lee, Hyun-Sang;Jung, Sung-Young;Yim, Joung-Han;Lee, Jung-Hyun;Lee, Hong-Kum
    • Journal of Microbiology
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    • 제40권4호
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    • pp.260-266
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    • 2002
  • Bacterial strains were isolated from biofilms formed on glass slides submerged in seawater in Dae-Ho Dike. Eight strains showing fast attaching ability were selected and identified. Their exopolysaccharide (EPS)-producing ability and EPS properties were characterized. Based on Microlog System, 4 among the 8 strains were identified as Micrococcus luteus and the rest were Bacillus thuringiensis, Bacillus megaterium,, Staphylococcus saprophyticus and Agrobacterium vitis. A, vitis was reidentified as Sulfitobacter pontiacus based on 16S rDNA sequence data. The amount of water-soluble EPS produced by the 8 strains ranged from 0.114 to 1.329 g$.$l$\^$-1/ and the productivity was negatively correlated with the cell biomass. The molecular weight of the produced EPS ranged from 0.38 to 25.19$\times$10$\^$4/ Da. Glucose and galactose were ubiquitous sugar components. Mannose, ribose, and xylose were also major sugar components. The molecular weight and composition of the EPS showed strain-specific variation.

장기 보존 한약 파우더의 미생물 모니터링 (Monitoring on Microbial flora of Herbal Powder in Long Term Preservation)

  • 서창섭;신현규;신광수
    • 대한한의학방제학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.83-92
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    • 2011
  • Objectives : This study was carried out to moniter microbial flora on freeze-dried herbal powder and identify isolated bacteria. Methods : We measured the total number of bacteria and fungi in 29 herbal powder which had made according to the guideline of KFDA. For the identification, we observed microscopic properties and carried out polymerase chain reaction(PCR). The purified DNA was analyzed by DNA sequencer. Results : Among the 29 herbal powders, the fungi were detected only one sample as unacceptable range of total aerobic bacteria. Isolated bacteria were identified as Bacillus cereus, B. subtilis, B. megaterium, B. licheniformis, Erwinia tasmaniensis, E. amylovora, and Pantoea agglomerans by 16S rDNA analysis. E. tasmaniensis was observed 20 herbal samples. Conclusions : According to above results, further studies for the effective sterilization of low herbal materials should be needed.

Microbial Conversion of Major Ginsenoside $Rb_1$ to Pharmaceutically Active Minor Ginsenoside Rd

  • Kim Myung Kyum;Lee Jun Won;Lee Ki Young;Yang Deok-Chun
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권5호
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    • pp.456-462
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    • 2005
  • More than seventy strains of aerobic bacteria showing ${\beta}$-glucosidase activity were isolated from a ginseng field, using a newly designed Esculin-R2A agar, and identified by their 16S rRNA gene sequences. Of these microorganisms, twelve strains could convert the major ginsenoside, $Rb_1$, to the pharmaceutically active minor ginsenoside Rd. Three strains, Burkholderia pyrrocinia GP16, Bacillus megaterium GP27 and Sphingomonas echinoides GP50, were phylogenetically studied, and observed to be most potent at converting ginsenoside $Rb_1$ almost completely within 48 h, as shown by TLC and HPLC analyses.

Biological Control of Gray Mold Rot of Perilla Caused by Boftis cinerea 1. Resistance of Perilla Cultivars and Selection of Antagonistic Bacteria

  • Moon, Byung-Ju;Son, Yeong-Jun;Lee, Jae-Pil;Kim, Choul-Seung;Song, Ju-Hee;Kim, Hyun-Ju;Kim, Jae-Woo;Kim, Do-Hoon;Park, Hyean-Cheal
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제18권1호
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    • pp.36-42
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    • 2002
  • Resistance of perilla varieties to Botrytis cinerea LVF12 was evaluated, while antagonistic bacteria were selected and tested for their efficacy towards biological control of gray mold rot caused by B. cinerea. Among 11 perilla varieties tested for disease resistance, Milyang variety showed some degree of resistance, while the rest of varieties showed no resistance. Among 250 bacterial isolates collected from perilla loaves and rhizosphere of perilla plants, six isolates showed high levels of inhibitory effect on mycelial growth and conidial germination of B. cinerea in in vitro test. Using the pot test in growth chambers these isolates showed high levels of disease suppression, with Nl isolate showing 95.3% of control value and N4 isolate showing 90.8% of control value. Further test was performed to evaluate the two isolates ability for disease prevention and/or disease therapy, and results showed almost 100% of control vague. Isolates Nl and N4 were identified as Bacillus licheniformis and 5. megatepium, respectively, according to Bergey's manual, API 20E and 50CHB test kit, and Transmission electron microscope.

엽연초(葉煙草) 인공(人工) 숙성중(熟成中)의 미생물(微生物)에 관(關)한 연구(硏究) (A study on microorganisms during the tobacco fermentation)

  • 양차범;전재근;김재훈;배효원
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제7권
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    • pp.53-58
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    • 1966
  • 엽연초인공숙성(葉煙草人工熟成)에 관여(關與)하는 미생물(微生物)들을 분리(分離)하고 분리균주(分離菌株)에 대(對)하여 배양(培養), 형태(形態), 생리(生理) 및 회수화물(灰水化物) 발효시험(醱酵試驗)을 행(行)하고 이 결과(結果)들로부터 이들 미생물군(微生物群)을 각각(各各) Asperfillus gavus, A. restrictus, A. nidulans, A. awamori, Oidium sp. Edmundmasonia Sp. spicaria Sp. Bacillus subtilis, B. subtilis var aterrimus, B. licheniformis Flaavobacterium harrisonii, Aerobacter aerogenes으로 동정(同定)하였다. 그리고 이들 균주중(菌株中)에서 발효전기간(醱酵全期間)에 걸쳐, 관여(關與)한 것으는 Aspergillus flavus, A. restriclus.,와 Bacillus subtilis, B. licheniformis이었고 이 곰팡과, 세균(細菌)은 각각(各各) 14, 7 일간(日間)에 최고분포(最高分布)를 이루었으며 기후(其後)에는 뚜렷한 분포(分布)의 변화(變化)를 보이지 않았다.

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Bacillus spp. 및 Serratia marcescens에 의한 사과 푸른곰팡이병의 생물적 방제 (Biological Control of Blue Mold of Apples by Bacillus spp. and Serratia marcescens)

  • 김용기;이승돈;류재기;류재당
    • 식물병연구
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    • 제9권4호
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    • pp.229-236
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    • 2003
  • 사과 푸른곰팡이병을 방제하기 위하여 사과, 배, 복숭아 등 370점의 과일을 채취하여 과일표면으로부터 세균 1,080균주를 분리하였다. 분리한 1,080균주를 공시 하여 사과 저장병을 일으키는 Penicillium expansum, Alternaria alternata 그리고 Botrytis cinerea을 대상으로 항균활성 및 병 진전억제효과를 검정하여 8종의 길항세균을 선발하였다. 이 들 길항세균에 대한 세균학적 특성과 Biolog system에 의한 영양원 이용성을 조사한 결과 Bacillus amyloliquefaciens가 2균주, B. megaterium, B. subtilis var. gladioli, B. licheniformis, B. pumilus 및 Serratia marcescens로 동정하였다. Glucose, mannose, starch 등 8종의 탄소원을 공시하여 병원균의 생장 및 길항균의 중식에 미치는 영향을 조사한 결과, 병원균의 증식을 억제하고 길항균의 증식을 촉진하는 영양원으로 glucose가 선발되었다. 길항균의 처리효과를 높이기 위하여 길항균 현탁액에 glucose를 1% 첨가하여 사과에 처리한 다음 푸른곰팡이 병균을 $10^5$포자/ml 농도로 처리하였을 때, 병 진전억제효과가 S. marsecens P76-9처리에서 48%, B. amyloliquefaciens P43-2 처리에서 46% 그리고 B. licheniformis P94-1 처리에서 14% 증가되었다. 사과표면의 상처부위에서 처리한 길항균의 밀도변동에 있어서는 Bacillus 속 세균인 B. amyloliquefaciens P43-2과 B. licheniformis P94-1는 처리 후 7일까지 밀도가 증가하다가 처리 후 10일부터는 감소되는 경향이었으며, S. marsecens P76-9는 초기(처리 후 4일)에는 밀도가 감소되다가 처리 후 7일부터 증가되어 처리 후 7일까지도 일정한 수준으로 밀도가 유지되었다.

피부 미백제의 타겟 단백질인 인간 티로시나제의 3차원 구조 상동 모델링 (Comparative Modeling of Human Tyrosinase - an Important Target for Developing Skin Whitening Agents)

  • 최종근;서주원
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제13권11호
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    • pp.5350-5355
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    • 2012
  • 사람의 티로시나제는 사람의 피부색을 결정하는 멜라닌 생합성의 첫 번째 반응을 촉매하며, 이 단계는 반응 속도를 결정하는 가장 중요한 단계이다. 따라서, 많은 화장품 회사들은 hTyr의 저해제를 찾고자 하였으나 사람 티로시나제의 3차원구조의 부재로 구조기반의 가상탐색은 불가능하다. 따라서 본 연구에서는 구조기반의 저해제 탐색을 위하여 기존에 그 구조가 알려진 Bacillus megaterium의 티로시나제의 3차 구조를 이용하여 인간 티로시나제의 3차원 구조를 상동모델링법으로 예측하였다. 3차원 구조 분석 결과 인간 티로시나제의 활성부위에 위치한 여섯 개의 히스티딘 잔기가 2개의 구리원자와 결합할 수 있으며, 이 활성부위는 단백질의 안쪽에 위치함을 알 수 있었다. 기질 또는 저해제가 결합할 수 있는 결합부위는 단백질의 표면에서 안쪽 깊은 곳의 활성부위와 연결되어 있으며 입구 쪽은 넓고 납작했으며 활성부위로 갈수록 좁아지는 깔대기와 같은 모양의 구조를 하고 있었다. 자체 제작 소프트웨어를 활용하여 solvent accessible surface를 만들고 여기에 가장 최적의 위치 및 형태를 갖는 모델을 티로신과 저해제로 가장 잘 알려진 코직산의 결합모델을 제안하였다. 이 결과 티로신과 코직산의 페놀그룹의 히드록시 기능단의 산소가 정확히 구리와 배위결합하는 것을 알 수 있었다. 결론적으로 본 연구 결과는 새로운 미백제를 설계하고 스크리닝하는데 유용한 정보를 제공할 수 있을 것으로 사료된다.

식물생육촉진 세균이 오이 생육 및 수량에 미치는 영향 (Effect of Plant-growth-promoting Bacteria Inoculation on the Growth and Yield of Cucumber(Cucumis sativa L.))

  • 이영한;조우석;김종균;이한생;박상렬;윤한대
    • 한국토양비료학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.196-199
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    • 1997
  • 식물생장촉진 효과가 있는 Micrococcus sp., Bacillus subtilis, Enterobacter agglomerans, Bacillus megaterium, Pseudomonas putide, Pseudomans fluorescens, Cellulomonas sp., Staphylococcus xylosus등 8종의 혼합균주 배양액을 오이에 처리하였을때 작물에 미치는 영향을 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 균처리구는 대조구에 비해 수량은 18% 증수되었으며, 주당 수확과수는 평균 5.1개 정도 많았다. 2. 만장, 엽장, 엽폭은 균처리구와 대조구간에 차이가 없었지만 줄기의 굵기, 2차측지 발생율, 유인 측지절수, 절성성은 균처리구가 대조구에 비해 양호하였다. 3. 토양의 물리성중 가밀도, 공극률은 차이가 없었으나 수분율은 균처리구가 대조구에 비해 높은 경향이었으며, 토양 화학성은 균처리구가 대조구에 비해 EC, 유기물, Ca, $NO_3-N$ 함량은 낮아졌으며, 그외 성분은 높은 경향이었다.

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