The KMA has cooperated with the Oklahoma University in USA to develop a Polarimetric Radar Data (PRD) simulator to improve the microphysical processes in Korea Local Analysis and Prediction System (KLAPS), which is critical for the utilization of PRD into Numerical Weather Prediction (NWP) field. The simulator is like a tool to convert NWP data into PRD, so it enables us to compare NWP data with PRD directly. The simulator can simulate polarimetric radar variables such as reflectivity (Z), differential reflectivity ($Z_{DR}$), specific differential phase ($K_{DP}$), and cross-correlation coefficient (${\rho}_{hv}$) with input of the Drop Size Distribution (DSD) and scattering calculation of the hydrometeors. However, the simulator is being developed based on the foreign observation data, therefore the PRD simulator development reflecting rainfall characteristics of Korea is needed. This study analyzed a potential application of the 2-Dimension Video Disdrometer (2DVD) data by calculating the raindrop axis ratio according to the rain-types to reflect Korea's rainfall characteristics into scattering module in the simulator. The 2DVD instrument measures the precipitation DSD including the fall velocity and the shape of individual raindrops. We calculated raindrop axis ratio for stratiform, convective and mixed rainfall cases after checking the accuracy of 2DVD data, which usually represent the scattering characteristics of precipitation. The raindrop axis ratio obtained from 2DVD data are compared with those from foreign database in the simulator. The calculated the dual-polarimetric radar variables from the simulator using the obtained raindrop axis ratio are also compared with in situ dual-polarimetric observation data at Bislsan (BSL). 2DVD observation data show high accuracies in the range of 0.7~4.8% compared with in situ rain gauge data which represents 2DVD data are sufficient for the use to simulator. There are small differences of axis ratio in the diameter below 1~2 mm and above 4~5 mm, which are more obvious for bigger raindrops especially for a strong convective rainfall case. These differences of raindrop axis ratio between domestic and foreign rainfall data base suggest that the potential use of disdrometer observation can develop of a PRD simulated suitable to the Korea precipitation system.
Kim, Ah-Yeon;Shim, Hyun-Jin;Kim, Su-Yeon;Heo, Sung-Hye;Youn, Hyung-Sun
대한의생명과학회지
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제24권2호
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pp.102-107
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2018
Toll-like receptors (TLRs) play an important role for host defense against invading pathogens. The activation of TLRs signaling leads to the activation of $NF-{\kappa}B$ and the expression of pro-inflammatory gene products such as cytokines and inducible nitric oxide synthase (iNOS). To evaluate the therapeutic potential of cardamonin, which is a naturally occurring chalcone from Alpinia species (zingiberaceous plant species), $NF-{\kappa}B$ activation and iNOS expression induced by MALP-2 (TLR2 and TLR6 agonist) or LPS (TLR4 agonist) were examined. Cardamonin inhibited the activation of $NF-{\kappa}B$ induced by MALP-2 or LPS. Cardamonin also suppressed the iNOS expression induced by MALP-2 or LPS. These results suggest that cardamonin has the specific mechanism for anti-inflammatory responses by regulating of TLRs signaling pathway.
Elevated serum uric acid and resting heart rate are risk factors and predictors of metabolic syndrome. However, few studies have examined the optimal cutoff value for serum uric acid and resting heart rate to predict metabolic syndrome in Korean adults. Subjects for this study were 22,302 adults (average age 45 years old), who underwent health screening examination from January 2010 to December 2012 at the Health Promotion Center of one hospital in Gyeonggi-do for general health check-up. The uric acid and resting heart rate cutoff values were calculated by ROC analysis for metabolic syndrome. Elevated serum uric acid and resting heart rate were associated with an increased prevalence of metabolic syndrome in Korean adults. The optimal cutoff value for uric acid level to predict metabolic syndrome in adults was 4.95 mg/dL (male 6.35, female 4.55) and optimal cutoff value for resting heart rate to predict metabolic syndrome was 68 beats per minute (male 66, female 68). However, serum uric acid and resting heart rate were found to have limitations for the diagnosis of metabolic syndrome.
Knowledge of the distribution and biodiversity of environmental bacteria and the ecosystem that influences them is crucial for predicting an ecosystem. However, bacterial culture methods can only analyze approximately 0.1% of the existing microorganisms, those that are readily cultured under laboratory conditions. By contrast, next-generation sequencing (NGS) has generally been known to obtain more diverse profiling of bacterial composition. We compared the bacterial communities using both a culture-dependent (MALDI-TOF) and culture-independent (NGS) methods. Environmental specimens were obtained from both freshwater and seawater. Water samples were also analyzed by both pyrosequencing and MiSeq sequencing, in order to select one NGS platform which could analyze comparatively more diverse microbiota. Bacterial distribution analyzed with MALDI-TOF showed no difference between the microbiota of freshwater and seawater, whereas the results analyzed with NGS distinguished between the two. The diversity indexes of MiSeq sequencing were higher than for Pyrosequencing. This indicated that MiSeq sequencing is capable of analyzing a comparatively wider diversity of bacteria. The genus of Flavobacterium and Planktophila were identified as being unique to freshwater, whereas EU801223 and OM43 were found in the seawater. Difference between the bacterial composition of the freshwater and seawater environments was identified by MiSeq sequencing analysis.
Lee, Sae A;Cho, Chul Min;Jang, Il Ho;Kang, Jung Sook
대한의생명과학회지
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제22권4호
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pp.160-166
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2016
To provide a basis for a homogeneous fluorescence resonance energy transfer (FRET) immunoassay for celiac disease, we carried out a FRET experiment using guinea pig tissue transglutaminase (tTG) and antibodies to tTG (anti-tTG) purified from rat serum. Fluorescein was utilized as the probe, and a nonfluorescent dye, QSY 7 served as the quencher. We labeled anti-tTG and tTG with fluorescein isothiocyanate and QSY 7 succinimidyl ester, respectively. Fluorescein-labeled anti-tTG was the donor, and QSY 7-labeled tTG was the acceptor of the FRET experiment. When we titrated fluorescein-labeled anti-tTG with QSY 7-labeled tTG, we observed a large decrease in the steady-state fluorescence intensity, which was due to strong FRET from fluorescein-labeled anti-tTG to QSY 7-labeled tTG. Using time-resolved fluorescence spectroscopy, we could also observe a decrease in the fluorescence lifetime, which confirms the steady-state data. We expect that these results might be useful in the development of a novel fluorescence immunoassay for an easy screening and follow-up of celiac patients.
The problems of tuberculosis and its drug resistance are very severe. Therefore, rapid and accurate drug susceptibility assay is required. Recently, there has been an increased understanding of the genetic mechanism of Mycobacterium tuberculosis (MTB) drug resistance as well as advancement of molecular technologies. While many gene mutations correlate well with drug resistance, many genes do not show a strong correlation with drug resistance. For this reason, the current study assessed the utility of rpoB mRNA as a target to detect live mycobacteria. In this study, RT-PCR targeting of rpoB mRNA in BCG treated with rifampin was performed. Conventional RT-PCR and real-time PCR targeting rpoB mRNA as well as 85B mRNA was performed to determine whether these two methods could distinguish between viable and non-viable MTB. The levels of rpoB and 85B mRNA detected by RT- PCR were compared in parallel with colony forming unit counts of BCG that were treated with rifampin for different periods of time. The data suggests that that even though both mRNA levels of rpoB and 85B decreased gradually when rifampin-treatment increased, the rpoB mRNA seemed to represent live bacteria better than 85B mRNA. This study clearly indicates that RT-PCR is a good method to monitor viable cell counts in the liquid culture treated with the anti-tuberculosis drug.
Curcumin is known as a natural antioxidant, decreasing oxidative stress in animal cells. Generally, oxidative stress induces reactive oxygen species in sperm and leads to decreased sperm characteristics in pigs. Therefore, this study investigated the influence of curcumin on sperm motility, viability, mitochondrial activity and plasma membrane integrity in pigs. Curcumin (0, 5 and $10{\mu}M$) was treated in boar semen, which were incubated for 9 hours in $37^{\circ}C$. Then, motility, viability, mitochondrial activity, plasma membrane integrity of sperm was analyzed every 3 hours. In the results, sperm motility was significantly increased by $5{\mu}M$ curcumin after 3 and 9 hours after incubation, and viability was significantly higher in $5{\mu}M$ curcumin treatment at 3 hours (P<0.05). Similarly, sperm mitochondrial activity and plasma membrane integrity were significantly increased by $5{\mu}M$ curcumin at 3, 6 and 9 hours after incubation (P<0.05). There results suggest that curcumin improve sperm characteristics such as motility, viability, mitochondrial activity, and plasma membrane integrity, and may exert a positive effect on sperm fertility in pigs.
This study was performed to evaluate the cytotoxicity induced by ischemia-like condition (ILC) in cultured neuroglial cells (C6 glioma cells). The protective effect of kaempferol (KAE), flavonoid against the cytotoxicity induced by ILC induction was assessed. In addition, antioxidative effects of KAE were done by colorimetric assays. Cell viability and the antioxidative effects such as DPPH-radical scavenging activity, superoxide dismutase (SOD)-like activity and inhibitory activity of lipid peroxidation (LP) were analyzed. ILC induction decreased cell viability in a dose-dependent manner, and the $XTT_{90}$ value (low cytotoxicity value) and $XTT_{50}$ value (high cytotoxicity value) were determined during ILC induction for 15 and 40 minutes, respectively. The butylated hydroxytoluene (BHT) antioxidant significantly increased cell viability damaged by the ILC-induced cytotoxicity. In the protective effect of KAE on ILC-induced cytotoxicity, KAE protected the ILC-induced cytotoxicity by the significant increase of cell viability, and also it showed DPPH-radical scavenging ability, SOD-like ability and inhibitory ability of LP. From these results, it is suggested that ILC induction showed cytotoxicity in these cultures and the oxidative stress is involved in the ILC-induced cytotoxicity. While, KAE prevented ILC-induced cytotoxicity by antioxidative effects. In conclusion, natural products like KAE may be a putative therapeutic agent for the treatment of disease associated with oxidative stress such as ischemia.
The purpose of this study is to investigate difficulties in using prosodic information to identify the meaning of ambiguous sentences in children with high functioning autism (HFA). Fifteen high functioning autistic children and fifteen children who matched their chronological age (CA) participated in this study. We compared the performance of the two groups by conducting syntactically and affectively ambiguous sentence comprehension (SASC and AASC) tasks. The results of this study show that in both tasks, the difference between the two groups was statistically significant at each condition and the performance of high functioning autistic children was significantly lower. In a correlation analysis of major variables, children who matched CA showed a correlation between prosody-only (PO) and AASC, while children with HFA showed a correlation between PO and MO (morpheme-only). Children with HFA used grammatical morpheme information to understand general sentences. We found that the ability to use prosodic information in children with HFA is significantly lower than that of normally developed children. Considering the relevance of prosody to linguistic, non-linguistic and emotional aspects of communication, improving prosodic perception is thought to be a way to mediate deficits in the comprehension of ambiguous sentences in children with HFA.
Endoplasmic reticulum (ER) stress induces unfolded protein response (UPR) via inositol-requiring enzyme 1 (IRE1) activation, which sends a molecular signal for X box-binding protein 1 (XBP1) mRNA splicing in the cytosol. IRE1 endoribonuclease activity induces cleavage of XBP1 mRNA. The XBP1 mRNA is then ligated by an uncharacterized RNA ligase and translated to produce spliced XBP1 by 23 nt removed in which contains the PstI restriction enzyme site. The splicing of XBP1 mRNA can be detected by semiquantitative RT-PCR, and then splicing of XBP1 is a useful tool to measure the genetic variability in ER stress. In this study, we have estimated IRE1-dependent splicing of XBP1 mRNA under conditions of various hypothermia. The results indicated that hypothermia regulated ER stress. This study demonstrated that hypothermia is closely related to ER stress and may be useful for early diagnosis of ER-associated disease.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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