Kim, Seong-Ryul;Lee, Kwang-Sik;Kim, Iksoo;Kang, Seok-Woo;Nho, Si-Kab;Sohn, Hung-Dae;Jin, Byung-Rae
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제6권1호
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pp.93-97
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2003
We describe here the cloning of a cDNA encoding putative calreticulin (CRT) from the silkworm, Bombyx mori. The CRT cDNA comprised of 1,194 bp encoding 398 amino acid residues. B. mori. CRT has a HDEL sequence at the end of the C-domain. The B. morl, CRT showed 88% protein sequence identity to the G. mellonella CRT, 71 % to A. aegypti CRT, and 63% to H. sapiens CRT, Phylogenetic analysis revealed that the deduced amino acid sequences of the B. mori CRT formed a highly inclusive subgroup with other insect CRTs. Northern blot analysis exhibited an expression of the B. mori CRT gene in the fat body, evidencing the fat body as a major site for CRT synthesis.
Velu, Dhanikachalam;Ponnuvel, Kangayam M.;Qadri, Sayed M. Hussaini
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제15권2호
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pp.123-130
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2007
The Hsp 20.8 and Hsp 90 cDNA sequence retrieved from NCBI database and consists of 764 bp and 2582 bp lengths respectively. The corresponding cDNA homologus sequences were BLAST searched in Bombyx mori genomic DNA database and two genomic contigs viz., BAAB01120347 and AADK01011786 showed maximum homology. In B. mori Hsp 20.8 and Hsp 90 is encoded by single gene without intron. Specific primers were used to amplify the Hsp 20.8 gene and Hsp 90 variable region from genomic DNA by using the PCR. Obtained products were 216 bp in Hsp 20.8 and 437 bp in Hsp 90. There was no variation found in the six silkworm races PCR products size of contrasting response to thermal tolerance. The comparison of the sequenced nucleotide variations through multiple sequence alignment analysis of Hsp 90 variable region products of three races not showed any differences respect to their thermotolerance and formed the clusters among the voltinism. The comparison of aminoacid sequences of B. mori Hsps with dipteran and other insect taxa revealed high percentage of identity growing with phylogenetic relatedness of species. The conserved domains of B. mori Hsps predicted, in which the Hsp 20.8 possesses ${\alpha}-crystallin$ domain and Hsp 90 holds HATPase and Hsp 90 domains.
Kim, Iksoo;Bae, Jin-Sik;Sohn, Hung-Dae;Kang, Phil-Don;Ryu, Kang-Sun;Sohn, Bong-Hee;Jeong, Won-Bok;Jin, Byung-Rae
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제1권1호
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pp.9-17
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2000
Genetic variation in the domestic silkworm strains (Bombyx mori) and phylogenetic relationships between domestic silkworms and wild silkworms (B. mandarina) were investigated by using a portion of mitochondrial CGI gene sequences. Ten geographic strains of B. mori we sequenced were identical in the 410 bp-section of mitochondrial COI gene. This sequence was also identical to the homologous sequence of the four Gen-Bank-registered strains, but one strain of B. mori differed a single nucleotide (0.2%) from others. MtDNA homogeneity in the B. mori strains appears to be resulted from fixation into the mast frequent mtDNA type during the course of breeding for new strains, in which an extensive indoor rearing and removal of unwanted individuals were accompanied. In the comparisons between domestic and wild silkworms, some wild silkworms were closely related to domestic silkworms (0.2%-1.2% of divergence), but the others were not (2.7%-3.7% of sequence divergence). This result was also reflected in the phylogenetic analyses, showing two independent phylogenetic groups: one including all B. mandarina sequences and the other including both B. mandarina and B. mori sequences. Thus, domestic silkworms may have been derived from the ancestor of B. mandarina, which belongs to this group, alto-ough more extensive study will provide better understanding on this issue.
The Bombyx mori parvo-like virus (China isolate) DNA polymerase (BmDNV-3 dnapol) gene has been tentatively identified based on the presence of conserved motifs. In the present study, we perform a transcriptional analysis of the BmDNV-3 dnapol gene using the total RNA isolated from BmDNV-3 infected silkworm at different times. Northern blot analysis with a BmDNV-3 dnapol-specific riboprobe showed a major transcript of 3.3 kb. 5'-RACE revealed that the major transcription start point was located 20 nucleotides downstream of the TATA box. In a temporal expression analysis using differential RT-PCR, BmDNV-3 dnapol transcript was detected at low levels at 6 h.p.i., increased from 6 to 36 h.p.i., and remained fairly constant thereafter. Analysis of the predicted DNA polymerase sequence using neighborjoining and protein parsimony algorithms indicated that the predicted 1115-residue polypeptide contained five motifs associated with DNA polymerases synthetic activities and three additional motifs associated with polymerases possessing 3' to 5' exonuclease activity. The molecular phylogenetic analysis of this gene supported the placement of Bombyx mori parvo-like virus in a separate virus family.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제6권1호
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pp.21-25
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2003
The implications of temperature $(25, 30 and 35{\times}1^{\circ}C)$ and relative humidity $(60, 70 and 80{\times}2%)$ on the moulting pattern, moulting duration and moulting survival were studied in the silkworm, Bombyx mori L. Larvae of two pure silkworm breeds, Pure Mysore (PM) and NB$_4$D$_2$and their hybrid, $PM{\times}NB_{4} D_{2}$ were reared under experimental conditions under natural day photoperiodic (LD 12:12) condition. Two developmental marker events in the fourth moulting, settling for moult (SM) and completion of moult (CM) occurred at or around the middle of the photophase. The computed mean vector (equation omitted), based on the circular statistics also confirmed the above. Temperature and humidity did not alter the moulting rhythmicity much. However, extreme temperature and humidity conditions reduced moulting survival in PM and $PM {\times}NB_{4} D_{2}$. Further, moulting survival reduced below the economic level in $NB_{4} D_{2}$. The temperature and humidity together seem to exert synergic impact on the moulting survival of the silkworm Bombyx mori, at least in $NB_{4} D_{2}$.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제6권2호
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pp.179-181
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2003
$F(ab`)_2$-ELISA and direct antigen coating-ELISA (DAC-ELISA) were evaluated in the detection of purified Bombyx mori nuclear polyhedrosis virus (BmNPV) and nuclear polyhedrosis virus infection in silkworm larvae inoculated with BmNPV polyhedra. Although nanogram levels of BmNPV was detected in both DAC- and $F(ab`)_2$-ELISA, similar concentrations of antigen was detected in case of F(ab’)$_2$-ELISA even at higher dilution of antibody (up to 1 : 20 K). One hundred percent nuclear polyhedrosis infection was detected 6 hrs after inoculation in BmNPV infected silkworm larvae by $F(ab`)_2$-ELISA. On the other hand, detection of 100% infection was observed only three days after inoculation in DAC-ELISA. In this study, it was observed $F(ab`)_2$-ELISA was more sensitive than DAC-ELISA in the detection of purified BmNPV as well as nuclear polyhedrosis infection in silkworm larvae.
Krishnan, N.;Chaudhuri, A.;Sengupta, A.K.;Chandra, A.K.;Sen, S.K.;Saratchandra, B.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제2권2호
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pp.149-153
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2001
The influence of baculovirus Bombyx mori Nuclear Polyhedrosis virus (BmNPV) infection on intermediary metabolic pathways in silkworm Bombyx mori L. was investigated. Studies revealed that NADP-linked malate dehydrogenase activity in hemolymph of infected silkworms at 96 hrs post infection (p.i.) with visible symptoms of infection was enhanced in comparison to healthy larvae of the same age. Also, NADP-dependent MDH activity was significantly lower in fat body cytosol of infected larvae at 96 hrs p.i. when compared to healthy larvae. Similarly, some biometabolic parameters like growth, protein content and cholesterol titer were observed to be influenced by baculovirus infection. While the growth of infected larvae was significantly retardedi protein content was also drastically reduced in both hemolymph and fat body tissues. Cholesterol titers however, was enhanced in infected larvae. The results observed herein point to a significant change in the normal biochemical and biometabolic pathways required for growth and development following BmNPV infection.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제5권1호
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pp.67-71
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2002
The implications of temperature (25,30 and 35$^{\circ}C$) and relative humidity (60, 70 and 80%) on the pupation patterns were studied in the silkworm, Bombyx mori L. Larvae of two pure silkworm breeds, Pure Mysore (PM) and NB4D2 and their hybrid, PM ${\times}4 NB4D2 were reared under experimental conditions under natural day photoperiodic (LD 12: 12) condition. The three developmental marker events viz., larval ripening, pharate pupal formation and pupal formation occurred at or around the beginning of the photo-phase. The computed of mean vector (equation omitted), based on the circular statistics, also confirmed the above. However, the length of mean vector, r and the mean vector angular variance, s varied according to temperature and humidity conditions imposed; the variations being non-significant. Extreme temperature and humidity conditions, however, resulted in reduction in pupation rate (%) for PM and PM ${\times}4 NB4D2. On the other hand, in NB4D2 pupation percentage reduced below the economic level. The temperature and humidity together seems to exert synergic impact on the pupation rate at least in the silkworm Bombyx mori, L.
Kim, Kyung-A;Kang, Min-Uk;Hong, Sun-Mee;Lee, Kyeong-Yeoll;Nho, Si-Kab
한국잠사학회:학술대회논문집
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한국잠사학회 2003년도 International Symposium of Silkworm/Insect Biotechnology and Annual Meeting of Korea Society of Sericultural Science
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pp.75-75
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2003
1. To compare a full cDNA sequence of hemolin, a bacteria-induced protein of lepidopteran insects, from 4 geographically different strains of Bombyx mori. 2. To determine developmental profiles of hemolin gene expression in Bombp mori. (omitted)
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제14권2호
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pp.69-74
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2007
As the genome of B. mori is available in GenBank and the EST database of B. mori is expanding, identification of novel genes of B. mori was conceivable by datamining techniques and bioinformatics tools. In this study, we used the in silico cloning method to get the 6-Phosphogluconolactonase (6PGL) gene of B. mori and analysed with bioinformatics tools. The result was confirmed by RT-PCR and prokaryotic expression. The 6PGL cDNA comtains a 702 bp ORF. The deduced protein has 233 amino acid residues, with the predicted molecular weight of 25946. 72 Da, isoelectric point of 5.41, and contains conserved NagB domains. This gene has been registered in GenBank under the accession number EF198104.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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