• Journal of Plant Biotechnology
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• 제49권1호
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• pp.46-60
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• 2022

The genetic variability and population structure of apple mosaic virus (ApMV) have been studied; however, synonymous codon usage patterns influencing the survival rates and fitness of ApMV have not been reported. Based on phylogenetic analyses of 52 ApMV coat protein (CP) sequences obtained from apple, pear, and hazelnut, ApMV isolates were clustered into two groups. High molecular diversity in GII may indicate their recent expansion. A constant and conserved genomic composition of the CP sequences was inferred from the low codon usage bias. Nucleotide composition and relative synonymous codon usage (RSCU) analysis indicated that the ApMV CP gene is AU-rich, but G- and U-ending codons are favored while coding amino acids. This unequal use of nucleotides together with parity rule 2 and the effective number of codon (ENC) plots indicate that mutation pressure together with natural selection drives codon usage patterns in the CP gene. However, in this combination, selection pressure plays a more crucial role. Based on principal component analysis plots, ApMV seems to have originated from apple trees in Europe. However, according to the relative codon deoptimization index and codon adaptation index (CAI) analyses, ApMV exhibited the greatest fitness to hazelnut. As inferred from the results of the similarity index analysis, hazelnut has a major role in shaping ApMV RSCU patterns, which is consistent with the CAI analysis results. This study contributes to the understanding of plant virus evolution, reveals novel information about ApMV evolutionary fitness, and helps find better ApMV management strategies.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제64권3호
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• pp.515-530
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• 2022

Sequence type (ST) 5 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) with staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) type II (ST5-MRSA-II) and ST72-MRSA-IV represent the most significant genotypes for healthcare- (HA) and community-associated (CA) MRSA in Korea, respectively. In addition to the human-type MRSA strains, the prevalence of livestock-associated (LA) MRSA clonal lineages, such as ST541 and ST398 LA-MRSA-V in pigs and ST692 LA-MRSA-V and ST188 LA-MRSA-IV in chickens, has recently been found. In this study, clonotype-specific resistance profiles to cathelicidins derived from humans (LL-37), pigs (PMAP-36), and chickens (CATH-2) were examined using six different ST groups of MRSA strains: ST5 HA-MRSA-II, ST72 CA-MRSA-IV, ST398 LA-MRSA-V, ST541 LA-MRSA-V, ST188 LA-MRSA-IV, and ST692 LA-MRSA-V. Phenotypic characteristics often involved in cathelicidin resistance, such as net surface positive charge, carotenoid production, and hydrogen peroxide susceptibility were also determined in the MRSA strains. Human- and animal-type MRSA strains exhibited clonotype-specific resistance profiles to LL-37, PMAP-36, or CATH-2, indicating the potential role of cathelicidin resistance in the adaptation and colonization of human and animal hosts. The ST5 HA-MRSA isolates showed enhanced resistance to all three cathelicidins and hydrogen peroxide than ST72 CA-MRSA isolates by implementing increased surface positive charge and carotenoid production. In contrast, LA-MRSA strains employed mechanisms independent of surface charge regulation and carotenoid production for cathelicidin resistance. These results suggest that human- and livestock-derived MRSA strains use different strategies to counteract the bactericidal action of cathelicidins during the colonization of their respective host species.

• Journal of Ecology and Environment
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• 제47권3호
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• pp.103-116
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• 2023

Background: This study analyzed the physiological adaptations of a woody plant, Vitex rotundifolia, in Goraebul coastal sand dunes from May to September 2022. Environmental factors and physiological of plants growing under field and controlled (pot) conditions were compared. Results: Photosynthesis in plants growing in the coastal sand dunes and pots was the highest in June 2022 and July 2022, respectively. Chlorophyll fluorescence indicated the presence of stress in the coastal sand dune environment. The net photosynthesis rate (P_N) and Y(II) were highest in June in the coastal sand dune environment and July in the pot environment. In August and September, Y(NPQ) increased in the plants in the coastal sand dune environment, showing their photoprotective mechanism. Chlorophyll a and b contents in the pot plant leaves were higher than those in the coastal sand dune plant leaves; however, chlorophyll-a/b ratio was higher in the coastal sand dune plant leaves than in the pot plant leaves, suggesting a relatively high photosynthetic efficiency. Carotenoid content in the coastal sand dune plant leaves was higher in August and September 2022 than that in the pot plant leaves. Leaf water and soluble carbohydrate contents of the coastal sand dune plant leaves decreased in September 2022, leading to rapid leaf abscission. Diurnal variations in photosynthesis and chlorophyll fluorescence in both environments showed peak activity at 12:00 hour; however, the coastal sand dune plants had lower growth rates and Y(II) than the pot plants. Plants in the coastal sand dunes had higher leaf water and ion contents, indicating that they adapted to water stress through osmotic adjustments. However, plants growing in the coastal sand dunes exhibited reduced photosynthetic activity and accelerated decline due to seasonal temperature decreases. These findings demonstrate the adaptation mechanisms of V. rotundifolia to water stress, poor soils, and high temperature conditions in coastal sand dunes. Conclusions: The observed variations indicate the responses of the V. rotundifolia to environmental stress, and may reveal its survival strategies and adaptation mechanisms to stress. The results provide insights into the ecophysiological characteristics of V. rotundifolia and a basis for the conservation and restoration of damaged coastal sand dunes.

• 한국경제지리학회지
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• 제18권3호
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• pp.296-318
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• 2015

베트남의 소수민족 중 하나인 브루반큐 민족은 오랜 기간 동안 라오스와 국경을 이루는 산악지역에서 거주해 왔으며, 적어도 베트남전쟁이 끝날 무렵까지는 혈연관계에 기초한 무계급사회를 유지하면서 자급적 경제에 의존한 생활을 영위하여 왔다. 그러나 이러한 전통적 지리환경은 지난 몇 세기 동안 베트남의 국가형성과 경제정책에 의해 급격하게 변화되었다. 이 논문에서는 먼저 국경지역의 소수민족들이 외부적 경제환경 변화에 어떻게 적응하여 왔는가을 분석한다. 구체적으로는 브루반큐 민족의 생업 적응을 살펴봄으로써, 베트남 국경지역의 소수민족이 거대한 정치경제권력에 맞서거나 때로는 타협하는 과정에서 어떠한 생존전략을 구사하였는지를 고찰한다. 그 결과 이 논문에서는 브루반큐 민족이 그들의 사회문화적 관계를 최대한 지키기 위한 '일상적 저항'과, 다민족 경제주체들이 혼합된 새로운 경제환경에 적응하기 위해 이러한 사회문화적 관계를 활용하는 전략을 동시에 구사하여 왔으며, 그 결과 그들 자신을 새로운 자원과 그 이용 가능성을 접목시켜 왔음을 밝혀 내었다.

• 한국농림기상학회지
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• 제19권2호
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• pp.62-72
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• 2017

농경지에서의 증발산량 예측은 농업 분야에서의 기후변화 영향 평가 및 적응 계획 수립에 도움을 줄 수 있다. 본 연구에서는 격자형 국가 표준 기후변화 시나리오 자료를 이용해 잠재 증발산량 (PET)과 가뭄지수 (DI) 전자 기후도의 생산 및 분석을 수행하였다. 특히, 격자형 기상 자료의 처리를 지원하는 도구인 readGrADSWrapper를 기반으로 격자형 기후변화 시나리오 자료를 통계 분석 도구인 R에서 활용하는 기술에 중점을 두었다. FAO-56 공식을 R 스크립트에 구현하여 현재와 미래 조건에서 벼 재배기간 동안의 PET를 계산하였다. 또한, 이를 활용하여 벼 재배에 따른 증발산량 ($PET_{rice}$)과 DI 자료를 생산하고 시공간적 분석을 수행하기 위한 R 스크립트를 구현하였다. 한반도에서 PET의 시공간적 변화 양상은 현재와 미래 조건에서 지역에 따라 차이를 보였다. 전반적으로 한반도에서는 PET와 $PET_{rice}$가 21세기 후반으로 갈수록 증가하는 것으로 나타났다. 이러한 예측 결과들은 지역과 시기에 따라 증발산량 증가에 대응하기 위한 수자원 관리가 필요하다는 것을 암시하였다. 예를 들어, 현재 조건에서 습윤 지역으로 분류되던 충청남도 지역이 21세기 중반 이후에는 아습윤 지역으로 바뀔 것으로 전망되었다. 이러한 결과들은 PET와 DI 등 수자원과 관련된 변수 값들의 시공간적인 계산과 분석을 통해 미래 기후조건에서 작물 생산성을 증진시키기 위한 적응 대책 수립을 지원할 수 있을 것이다. 또한, readGrADSWrapper와 같은 격자형 기상 자료의 처리도구의 활용을 통해 보다 다양한 응용기후 변수에 대한 전자기후도 생산 및 분석을 원활히 수행할 수 있을 것이다.

• 환경영향평가
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• 제27권5호
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• pp.489-508
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• 2018

기후변화에 대응하여 보다 적극적인 생물보전전략 수립을 위해 생물 서식환경의 변화예측이 필요하며, 생물기후권역은 유용한 생태계 관리체계를 제공할 수 있다. 이에 따라 본 연구에서는 생물기후권역구축을 통해 동북아시아의 생물 서식환경을 파악하고, 생물 서식관점에서 기후변화의 영향을 분석하였다. Worldclim에서 제공하는 현재(1970~2000년) 기후자료 및 17개 전 지구 기후모형의 예측자료(RCP4.5, RCP8.5)를 이용하여 2050년대와 2070년대의 변화를 모의하였다. 먼저 현재와 미래의 주요생물기후변수(Aridity index, growing degree days, potential evapotranspiration seasonality, temperature seasonality)를 구축하여 동북아시아의 생물기후환경 특성을 파악하고, 기후변화에 따른 시공간적 변화를 분석하였다. ISODATA 군집분석으로 현재의 생물기후권역을 구분하고, MLC(Maximum Likelihood Classification)를 통해 미래의 권역변화를 예측하였다. 기후변화에 따라 대부분의 권역이 북상하는 경향성을 확인할 수 있었으며, 권역의 면적과 위도 분포변화를 분석함으로써 권역의 축소가 가장 두드러지게 나타나는 중국 남부에 위치한 권역을 집중 관리권역으로 제시하였다. 본 연구는 한반도를 포함한 동북아시아 지역의 다양한 기후변화 시나리오에 따른 영향평가를 바탕으로 향후 기후변화에 대응한 생물종 혹은 생태계 관련 적응정책 수립 시 활용 가능한 기초자료를 제공할 수 있을 것으로 사료된다.

• 한국대기환경학회지
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• 제28권1호
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• pp.22-38
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• 2012

Adaptation of climate change is necessary to avoid unexpected impacts of climate change caused by human activities. Vulnerability refers to the degree to which system cannot cope with impacts of climate change, encompassing physical, social and economic aspects. Therefore the quantification of climate change impacts and its vulnerability is needed to identify vulnerable regions and to setup the proper strategies for adaptation. In this study, climate change vulnerability is defined as a function of climate exposure, sensitivity, and adaptive capacity. Also, we identified regions vulnerable to ozone due to climate change in Korea using developed proxy variables of vulnerability of regional level. 18 proxy variables are selected through delphi survey to assess vulnerability over human health sector for ozone concentration change due to climate change. Also, we estimate the weighting score of proxy variables from delphi survey. The results showed that the local regions with higher vulnerability index in the sector of human health are Seoul and Daegu, whereas regions with lower one are Jeollanam-do, Gyeonggi-do, Gwangju, Busan, Daejeon, and Gangwon-do. The regions of high level vulnerability are mainly caused by their high ozone exposure. We also assessed future vulnerability according to the Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) Special Report on Emissions Scenarios (SRES) A2, A1FI, A1T, A1B, B2, and B1 scenarios in 2020s, 2050s and 2100s. The results showed that vulnerability increased in all scenarios due to increased ozone concentrations. Especially vulnerability index is increased by approximately 2 times in A1FI scenarios in the 2020s. This study could support regionally adjusted adaptation polices and the quantitative background of policy priority as providing the information on the regional vulnerability of ozone due to climate change in Korea.

• 대한간호학회지
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• 제26권3호
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• pp.709-729
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• 1996

This study was done to analyze the trends of research on coping in Korea, to suggest future direction, for research on coping, and ultimately to contribute to an increase in explanation of adaptation. This article reviewed 79 nursing research papers on coping done since 1978 by examining them according to the period of publication or presentation, research design, type of subjects, measurement instruments, research for a degree or not, range of reliability, and association of coping and related variables. The results are as follows : The number of studies on coping increased rapidly from the mid-1980's and decreased slowly from the mid-1990's. The maority of the studies were surveys, comparative studies, or correlational studies. The subects of the 46 studies were healthy people, while those in the remaining studies were patients with a variety of illnesses. Thirth-eight studies on coping were done for master's thesis, three for dissertion, and 38 were not degrees. The Bell and Jalowiec coping scales have not been used since the early 1990's. In contrast, Lazarus and Folkman's W.C.C.L. has been used increasingly since that time. The reliabilities of the coping scale were reported in 37 cases and the Cronbach's alpha coefficients were .71 to .86. All subjects reported using more problem-oriented coping than emotion-oriented coping in short-term or emotion-oriented coping and healthy groups did more long-term coping. It was difficult to describe consistently the relationship between stress and coping according to the type of coping scale or research subjects, but generally moderate relationships were found. This was due to instrumental problems and no consideration of situational context. The subject group who used more short-term coping and less long-term coping reported poorer mental status, and higher scores in burnout and state anxiey than others. That is, the relationship between stress and adaptation increased the power of explanation with intervening the mediating effect of coping. The association of locus of control, mastery, social support, and self-concept with coping showed positive relationships : those of uncertainty and severity in illness with coping showed negativerelationships ; those of state anxiety and depression with short-term coping were positive, and those of self-esteem with long-term coping or problem-oriented coping were negative. There were significant differences in the scores of types of coping according to religion, level of education, and socio-economic status. That is, Presbyterians and Catholics, those with higher education levels and higher socio-economic status used more long-term or problem-oriented coping. On the basis of the above findings the following recommendations are made : 1. There is a need to test the mediating effect of coping variable in order to clarify the concept. 2. Longitudinal studies are needed to determine the patterns of change in coping strategies when stressful events are encountered. 3. It's necessary to develop a reliable and variable measurement tool for coping. 4. There is a need to identify subscales of coping to increase explanation of variance 5. It's necessary to consider personal, situational, and antecedent variables : the characteristics of subject populations, the natures of illness and treatment situations. 6. The power of explanation of studies designed to identify the stress-adaptation process should be increased using the combination model of process-oriented coping and cognitive-structural model.

• 문화기술의 융합
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• 제6권4호
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• pp.9-14
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• 2020

이 연구에서는 장애학생을 위해 개발된 통합교육 과학과 자료 e-book이 보편적 학습설계 측면에서 적합하게 구현되었는지 살펴보았다. 분석을 위해 2015 개정 교육과정 초등학교 과학과 3~6학년까지 일반 교과서 내용을 학습하기 어려운 장애학생을 위해 교수 적합화(adaptation)한 국가 수준 자료인 「장애학생 통합교육 교수-학습 자료: 과학과」를 선정하였다. 과학과 3~6학년 영역은 기초과학탐구, 물질, 생명, 운동과 에너지, 지구와 우주로 총 40개 단원으로 구성되어 있다. 내용분석기준은 CAST(2018)에서 제시된 UDL 3개 원칙에 따른 9개 항목의 세부항목을 기준으로 하였다. 연구결과 통합교육 과학과 e-book은 UDL 원칙 중 전략적 네트워크가 가장 많았으며, 운동과 에너지 영역에서 가장 많이 나타났다. UDL 원칙별로 살펴보면, 인지적 네트워크는 학습자에 맞는 정보제시 구현, 전략적 네트워크는 자료탐색 방식 다양화 등(4.1~5.2/6.3), 정서적 네트워크는 난이도를 최적화한 다양한 자료제시가 가장 많이 나타났다.

• 한국해양환경ㆍ에너지학회지
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• 제10권4호
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• pp.227-234
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• 2007

해수면 상승 현황 및 영향에 대한 검토를 토대로 해수면 상승의 효율적 대응을 위한 기초적인 방향을 제시하였다. 지구온난화로 인한 기후변화 중 자연 및 인간 시스템에 가장 큰 악영향을 줄 수 있는 요소 중의 하나가 해수면 상승인 것으로 평가되고 있다. 해수면 상승 영향에 대한 대응 방향은 기본적으로 온실가스 감축과 기후변화 영향 적응 측면을 동시에 고려하는 것이 필요하다. 그러나 온실가스 감축의 어려움과 더불어 해양의 큰 관성으로 인하여 해수면 상승을 회피할 수는 없을 것으로 예상되는바 계획적인 적응 전략에 초점을 맞추는 것이 중요하다. 해수면 상승 대응은 과학적으로 불확실한 상황에서 이루어지는 과정으로 대응 정책 결정은 정보와 인식 구축, 계획 및 정책구상, 실행, 모니터링 및 평가의 단계로 수행되어야 하며 관련 정책 결정은 환경, 경제, 위험에 대한사회의 태도 등을 고려하면서 장기적이고 연속적인 과정으로 이루어져야 한다. 대응을 위한 과제로는 현황 및 예측에 대한 과학적정보 증진, 적응 대책 검토 및 수립, 국민 의식 증진 및 대응 필요성에 대한 합의 형성 및 이들 과제를 종합적이며 지속적으로 다룰 수 있는 시스템 구축이 필요할 것으로 사료된다.