• Mycobiology
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• 제33권4호
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• pp.188-193
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• 2005

Twenty nine samples of pigeon droppings (n = 12) and soil contaminated with avian excreta (n = 19), collected from different sites in Busan, were examined for isolation and characterization of Cryptococcus neoformans. Of these samples, 5 strains of C. neoformans were recovered from pigeon droppings (5/12 : 41.7%). All isolates were belonged to C. neoformans var. grubii (serotype A). The extracellular enzyme activities of the strains by using the API-ZYM system showed two different enzymatic patterns. The genetic variability among C. neoformans isolates was analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) using three 10-mer primers. Two different RAPD patterns, which clearly distinguished the isolates, were identified. Analysis of RAPD patterns provided a good characterization of environmental strains of C. neoformans serotype A as a heterogeneous group and were in good agreement with enzymatic profiles.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제16권2호
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• pp.125-129
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• 2013

Vibrio ichthyoenteri is a facultatively anaerobic gram-negative bacterium with straight or slightly curved rod morphology. The bacterium is an etiological agent of bacterial enteritis of Olive flounder Paralichthys olivaceus. Only a handful of studies, using a limited number of isolates, have investigated the phenotypic and genetic characteristics of V. ichthyoenteri. We isolated 40 V. ichthyoenteri strains, identified based on the 16S rRNA gene sequence, from the diseased flounder larvae and investigated the API 20E and ZYM profiles. The isolates exhibited highly divergent phenotypic characteristics regardless of sampling time point and location, and fish age. Essential enzymes produced by V. ichthyoenteri seemed to be alkaline phosphatase, leucine arylamidase, and N-acetyl-${\beta}$-glucosaminidase. This study reveals a much greater enzymatic and biochemical phenotype diversity than has been evident to date. These results suggest that a given population of V. ichthyoenteri could be heterogeneous in terms of its phenotypic characteristics.

• 한국어병학회지
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• 제20권1호
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• pp.49-60
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• 2007

우리 나라 남해안의 병든 넙치로부터 분리한 non-hemolytic Streptococcus parauberis의 지역적 특성을 구명하고자 균의 생리적, 생화학적 및 분자생물학적 분석을 실시하였다. 먼저, catalase-negative Gram-positive cocci를 대상으로 multiplex PCR을 실시하여 S. parauberis 12 균주를 선정하였으며, 표현형적 동정을 위해 시판되고 있는 API 20 Strep 및 API ZYM kit를 사용하였다. 분리 균주의 API porfile을 분석한 결과, Lactococcus lactis, S. constellatus 및 S. uberis 등으로 동정되었다. 또한, 터봇에서 분리된 S. parauberis와 비교해 볼 때 Voges-Proskauer, arginine, hippurate, alkiline phosphatase 및 pyrroidonyl arylamidase의 반응 결과는 동일하였으나, β-glucuronidase 활성은 다양한 것으로 나타났다. 약제 감수성 시험 결과에서는 florfenicol, ampicillin, ofloxacin 및 vancomycin에 대해 감수성이 있는 것으로 나타났으며, oxolinic acid, flumequine, nalidixic acid 및 sulfisoxazol에 대해 내성이 있는 것으로 나타났다. 그러나, 분리 균주의 16S rDNA 염기서열을 분석한 결과, 참조균주인 S. parauberis KCTC 3651 (AY584477)과 99%의 상동성을 나타내었으며, 넙치 분리 균주들이 유전적으로 동일한 그룹에 속하는 것으로 나타났다.

• 한국어병학회지
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• 제27권1호
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• pp.25-33
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• 2014

Anisakis simplex sensu stricto와 A. pegreffii의 3기 유충과 4기 유충에서 얻은 excretory-secretory (ES) products 및 somatic extracts의 가수분해효소 활성을 API ZYM kit를 이용하여 비교하였다. Esterase 그룹의 가수분해효소 중 acid phosphatase는 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두에서 높은 활성을 나타냈으며, esterase (C 4)의 경우 somatic extracts에서만 가수분해효소 활성이 나타났는데 A. simplex (s.s.)가 A. pegreffii와 비교하여 3기와 4기 유충 모두에서 2배 가량 높은 활성을 나타냈다. alkaline phosphatase, acid phosphatase 그리고 naphthol-AS-BI-phosphohydrolase의 경우 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두 3기 유충보다 4기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. Aminopeptidase 그룹의 가수분해효소 활성은 leucine arylamidase에서 관찰되었는데, somatic extracts의 경우 A. pegreffii 보다 A. simplex (s.s.)에서 가수분해 효소 활성이 두 배 가량 높게 확인되었으며, 대부분의 다른 효소들에서는 활성이 거의 나타나지 않았다. Glycosidase 그룹의 가수분해효소 활성은 N-acetyl-${\beta}$-glucosaminidase, ${\alpha}$-mannosidase 그리고 ${\alpha}$-fucosidase에서 확인되었는데, A. simplex (s.s.) 보다 A. pegreffii에서 높은 가수분해효소 활성을 확인할 수 있었으며, 대부분 4기 유충보다 3기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. 이러한 아니사키스속 선충의 종과 유충단계에 따른 가수분해 효소의 활성 차이는 선충의 성장, 탈피, 소화, 섭이 등의 대사과정의 차이에 기인한 것으로 생각된다.

• 미생물학회지
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• 제42권4호
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• pp.257-264
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• 2006

한국의 임상검체와 자연환경에서 분리된 Cryptococcus neoformans 58주에 대한 혈청형과 세포외효소 생성능에 관한 셍물학적 특성을 조사하였다. 환자로부터 분리된 임상균주 51주 중 48주는 혈청형 A (94.1%) 였으며 2주는 혈청형 B (3.92%),그리고 나머지 1주는 혈청형 D (1.96%)였다. 자연환경에서 분리된 7주는 비둘기 분변에서 분리된 것들이며 모두 혈정형 A였다. 모든 균주는 proteinase와 phnospholipase를 생성하였고, 또한 API-ZYM system을 이용한 19종류의 효소생성능 시험에서는 alkaline phosphatase, esterase (C4), esterase lipase (C8), leucine arylamidase, acid phosphatase, naphthol-AS-BI-phosphohydrolase, $\alpha$-glucosidase, 그리고 $\beta$-glucosidase를 생성하였으나, N-acetyl-$\beta$-glucosarninidase는 39주 (67.2%)에서만 생성하였다. 혈청형 B로 동정된 2주와 혈청형 A로 동정된 균주중 1주는$\beta$-glucuronidase를 생성하였다. 본 연구에 사용된 총21종류의 효소 생성능 시험을 기초로 하여 생물형을 구분하였는데, 모두 4가지의 유형을 나타내었고, 또한 임상과 환경균주에서 혈정형과 생물형 특성간의 유의한 상관성를 나타내었다.

• 한국어병학회지
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• 제32권2호
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• pp.81-89
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• 2019

As an epidemiological survey, mortality of marbled rockfish, Sebastiscus tertius observed from a fish farm in Gyeongnam province of South Korea. The major macroscopic sign of the diseased fish was severe multifocal dermal ulceration. Histological observation revealed inflammation, necrosis and colonization of bacteria in various tissues (gill, liver, spleen and kidney). Bacteria was isolated from spleen and kidney in moribund and mortality fish. Seven bacterial isolates from the diseased fish were identified as Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida using API 20E and 20NE, API 50CH API ZYM system. Under light microscopy, infected marbled rockfish showed the lifting of the lamella epidermal layer, edematous changes and hypertrophy of epithelial cell in the gill filament. The atrophy of the mucosal fold, erythema in the intestine, and the necrosis of hematopoietic tissue and renal tubule cells with karyolysis were observed in the kidney. In this study was demonstrated the histological reaction of red marbled rockfish infected by Aeromonas salmonicida. Furthermore, this is the first account of extensive dermatitis in Sebastiscus tertius due to atypical A. salmonicida infection, which has high potential in aquaculture among native fish species.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제39권2호
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• pp.119-125
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• 2011

전국 경작지 토양에서 분리한 저 영양 세균 3,800주를 대상으로 암 억제유전자의 작동과 관여하는 전사인자인 Egr-1의 promoter 활성화를 유도하는 세 균주(SSG5, SSG6, SSG10)가 Egr-1 reporter assay와 western blotting 분석으로 최종 선발되었다. 이들 선발 균주들은 16S rDNA와 상업용 생화학적 키트(API 20NE, API ZYM, ID 32GN) 분석에 의해 모두 Pseudomonas koreensis인 것으로 최종 동정되었다. 이들 균주들은 Egr-1 발현을 유도하는 물질뿐만 아니라 다양한 세균의(B. subtilis, S. aureus, and L. monocytogenes) 성장을 저해하는 항균물질도 생산하는 것을 확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제50권3호
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• pp.245-248
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• 2014

Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 참다래 속(genus Actinidia) 식물에 궤양병을 일으키는 원인세균이다. 7개의 필수 유전자와 11개의 타입 III 효과기 유전자에 대한 다중염기서열 분석을 통해 전 세계 여러 곳에서 분리된 병원성 균주들은 세 그룹으로 나눌 수 있었고 각각 Psa1-Psa3 그룹으로 명명되었다. 본 연구에서는 3개의 Psa1, 3개의 Psa2 및 우리나라와 이탈리아에서 분리된 3개씩의 Psa3 균주 등 총 12 균주를 대상으로 그룹별 표현형을 비교하였다. 그 결과 모든 그룹의 균주가 $22^{\circ}C$ 이하에서 최대의 성장을 보였으며, Psa3 균주들은 $30^{\circ}C$ 이상의 온도에서 성장이 정지되었다. 또한 우리나라의 Psa3 균주의 지연기가 이탈리아 Psa3 균주 보다 긴 특징을 보였다. API 20NE 시험에서 Psa2 균주는 potassium gluconate, capric acid 및 trisodium citrate를 이용하지 못하는 점에서 Psa1과 Psa3 균주와 구별되었다. 다른 그룹과 달리 우리나라 Psa3 균주는 esculin을 가수분해할 수 있었다. API ZYM 시험에서는 Psa3에 속하는 균주들에서만 ${\beta}$-glucosidase 활성이 있는 것으로 나타났다. Psa 그룹에 따라 ampicillin, novobiocin 및 oleandomycin 등의 항생물질에 대한 민감성 양상이 서로 달랐다.

• 대한수의학회지
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• 제43권1호
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• pp.121-127
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• 2003

Ornithobacterium rhinotracheale (OR) is a bacterium responsible for a respiratory disease in turkeys and chickens, and has been identified as one of the emerging respiratory bacterial pathogens. Ten cases of four hundred cases submitted to National Veterinary Research & Quarantine Service for diagnosis in 2001 and in 2002 were diagnosed as OR infection. The major clinical signs of chickens infected with OR were respiratory symptoms including sneezing, sniveling, wet eyes, and swelling of the sinus infraorbitalis at 3 to 4 weeks of age. At necropsy, gross lesions were commonly found to foamish, white, and yoghurt-like exudates in the peritonium and abdominal air sacs. Microscopically, epithelial metaplasia and proliferation of air sacs were prominant with accompaning inflammatory reactions characterized by heterophils, fibrins, and bacterial colonization. Ten field isolates were obtained from air sacs and peritonium of these affected chickens, and were identified as OR, resulted from by gram-staining, catalase, oxidase, API NE and API ZYM Kit. In additon, using a previously reported primer targeted to 16S rRNA of ORT, 784bp fragment was successfully amplified from templates extracted from the isolates and a reference strain. This report describes an occurrence of Ornithobacterium rhinotracheale infection in chickens in Korea.

• Food Science and Biotechnology
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• 제15권2호
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• pp.227-231
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• 2006

Strain NK181 was isolated for probiotic use from jeotkal and based on results of API 50 CHL kit and 16S rDNA sequencing was tentatively named Lactobacillus plantarum NK181. L. plantarum NK181 was highly resistant to artificial gastric juice (pH 2.5) and bile acid and demonstrated strong adherence to Caco-2 cells. In test using API ZYM kit, eight enzymes were produced. Supernatant of L. plantarum NK181 exhibited about 30% 1,1-diphenyl-2-picyryl hedrazyl (DPPH) radical-scavenging activity and reduced cholesterol by 70%. These results demonstrate potential use of L. plantarum NK181 as health-promoting probiotic.