• 대한화장품학회지
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• 제50권2호
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• pp.171-178
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• 2024

본 연구에서는 목서(Osmanthus fragrans, O. fragrans) 꽃 추출물을 화장품 소재로 활용하기 위해 피부에 대한 다양한 효능을 확인하고자 하였다. 이를 위해 제주산 목서 꽃 추출물(O. fragrans flower extract, OFFE)을 제조하여 실험에 이용하였다. 실험은 실시간 중합효소 연쇄반응인 qRT-PCR과 lipid droplet 염색법으로 평가하였다. 먼저 OFFE는 표피 각질세포에서 poly I:C로 유도된 3 종의 대표적인 전염증성 사이토카인 (IL-8, IL-6, IL-1α)과 염증 관련 효소인 PTGS2의 유전자 발현을 감소시켰다. 또한 OFFE는 진피 섬유아세포에서 콜라겐(COL1A1)과 엘라스틴(ELN) 유전자 발현을 증가시켰다. 더 나아가 OFFE는 피지세포에서 linoleic acid에 의해 유도된 피지 생성을 억제하는 효능 보여주었다. 따라서 본 연구를 통해 OFFE은 항염, 항노화, 그리고 피지억제 효능을 위한 천연 화장품 소재로써 적용이 가능할 것으로 기대된다.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2017년도 춘계학술발표대회
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• pp.577-580
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• 2017

중합 효소 연쇄 반응 (PCR) 젤 전기영동 이미지에서 DNA 지문을 분석하기 위한 새로운 레인 검출 및 추적 알고리즘이 제안하였다. 이전에 여러 연구 결과가 보고되었지만 갑작스런 배경 밝기 차이와 구부러진 레인이 있는 이미지에서 레인을 정확하게 추출하는 것은 여전히 어려움이 있다. 우리는 평균 레인 폭과 레인 주기를 계산하기 위한 에지 기반 알고리즘을 제안한다. 본 논문에서 제안한 방법은 k-means 클러스터링 알고리즘을 이용하여 상승 에지와 하강 에지를 정확하게 추출하는 부화소(sub-pixel) 알고리즘을 적용하여 레인 폭과 주기를 추정한다. 구부러진 레인을 처리하기 위해 젤 이미지를 정상영역과 비정상영역으로 분할하고, 각 분할 된 이미지의 레인 중심을 추적한다. 우리가 제안한 방법의 성능을 평가하기 위해 534 레인을 포함한 32 개의 젤 이미지가 사용되었다. 실험 결과는 우리의 방법이 전처리 과정 없이 배경 차이와 구부러진 레인을 갖는 이미지에 강인함을 보여 주었다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제52권6호
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• pp.705-709
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• 2009

대상포진은 흔한 질환으로 여러 가지 합병증을 동반 할 수 있으나 대상포진에 동반되어 수막염이 생긴 경우는 보고는 많지 않다. 저자들은 15개월에 수두 예방접종을 시행 받았고, 5세 때 수두를 앓은 과거력이 있던 건강한 14세 남자 환아에서 대상포진에 동반되어 급성 무균성 수막염이 발생한 증례에서 뇌척수액에서 중합효소연쇄반응을 통해 VZV DNA를 검출한 1예를 경험하였기에 문헌 고찰과 함께 보고하는 바이다.

• 한국컴퓨터산업학회논문지
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• 제2권10호
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• pp.1349-1354
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• 2001

외판원 문제(Traveling Salesman Problem)는 주어진 n개의 도시들과 그 도시들 간의 거리비용이 주어졌을 때, 모든 도시들을 정확히 한번씩만 방문하면서 걸린 비용이 최소가 드는 경로를 찾는 문제이다. 따라서 최적해(optimal)를 구하는 것은 전형적인 NP-완전 문제 중의 하나로, 외판원 문제를 해결하려는 다양한 알고리즘들이 개발되고 있다. 특히 실제 생체 분자(bio-molecule)를 계산의 도구로 사용하는 새로운 계산 방법인 DNA 컴퓨팅은 DNA 분자가 잠재적으로 가지고 있는 막대한 병렬성을 이용해서 NP-완전 문제들을 해결하고자 하는 연구들이 많이 진행되고 있다. 그러나 아직 실제 생체 분자의 특성을 잘 반영하는 계산 모델이나 분자 생물학에서 사용하는 연산들이 많이 개발되지 않아 계산 효율이 비교적 좋지 않다. 따라서 본 논문에서는 외판원 문제를 해결하기 위한 DAN컴퓨팅의 새로운 중합 효소 연쇄 반응(Polymerase Chain Reaction, PCR) 연산을 개발하였다.

• Environmental Analysis Health and Toxicology
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• 제23권1호
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• pp.1-9
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• 2008

유산균인 비피도박테리아는 사람과 동물에서 유익한 프로바이오틱 미생물로 알려져 있다. 본 연구에서는 이러한 비피도박테리아 균주의 분류를 위한 repetitive DNA element PCR fingerprinting (ERIC-또는 TAP-PCR)의 사용을 평가하였다. 사람분변으로부터 분리한 알려지지 않은 비피도박테리움 균주와 한국생명공학연구원 생물자원센터로부터 분양받은 표준균주를 가지고 분류 및 동정에 ERIC-PCR과 TAP-PCR을 이용한 RAPD-fingerprinting을 수행하였다. 그 결과 비피도박테리움 균주에 대한 속과 종단위의 분류가 가능하였으며, 실험에 사용된 모든 비피도박테리움 균주는 RAPD-fingerprinting 분석을 통해 유전적 다양성을 확인하였다. 또한 ERIC2와 TAP1 프라이머를 이용한 실험에서는 Bifidobacterium adolescenits 특이 유전자 단편을 확인하였으며 이는 B. adolescenits 균주의 동정에 유용할 것으로 사료된다.

• 한국임상수의학회지
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• 제22권4호
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• pp.348-352
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• 2005

We described a rapid, sensitive and reproducible real-time PCR assay for detection and quantitation of canine parvovirus type 2 in the feces of dogs with parvovirus infection. The method was demonstrated to be highly specific and sensitive, allowing a precise canine parvovirus type-2 quantitation over range of eight orders of magnitude from $10^2\;to\;10^9$ copies of standard DNA. Then, fecal samples from parvovirus infected dogs were analyzed by conventional PCR and real-time PCR. Real-time PCR is more sensitive than conventional PCR, allowing to detect low viral titers of CPV-2 in infected dogs. By real-time PCR, a wide range of parvovirus particles was found in the samples from $1.45\times10^6\;to\;9.45\times10^8$ copies/0.01g of feces. However, when dogs are in infection of parvovirus, it is difficult to prove that the numbers of peripheral blood leukocytes are correlated with those of fecal shedding virus.

• 대한수의학회지
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• 제38권3호
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• pp.559-564
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• 1998

The polymerase chain reaction(PCR) assay was used for rapid diagnosis from blood and organ samples experimentally infected with Listeria monocytogenes. This method used a pair of primers based on a unique region in the 16S rRNA sequence of L monocytogenes. Procedure A was based on dilution of the blood sample followed by lysis of bacterial cell and direct analysis of the lysate with PCR. In artificially infected blood samples with L monocytogenes, it was possible to detect fewer than 40 cells per ml of blood. However, L monocytogenes was detected low rates on infected organs by the direct PCR. In procedure B, enrichment cultivation was used to increase numbers of bacteria before lysis and PCR. L monocytogenes was detected from 23 samples of 24 liver and spleen, respectively, and 18 samples of 24 blood were found to be positive by PCR on a subset of 72 organ samples, whereas L monocytogenes were detected on 63 organ samples in classical culture technique. It was required to analyze including enrichment steps were 6h and 18h on the procedure A and B, respectively.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제3권2호
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• pp.207-213
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• 1996

Herpes simplex virus(HSV) infections of the CNS are associated with significant morbidity and mortality even when appropriate antiviral therapy is administered. HSV infections of the brain can be subdivided into two categories : neonatal HSV infections, which usually are caused by HSV type 2, and herpes simplex encephalitis(HSE), which occur in patients over 3 months old and is nearly uniformly caused by HSV type 1. The clinical presentation of HSE is one of the focal encephalopathic process associated with altered levels of consciousness, fever, focal seizures and hemiparesis. But because of the lack of pathognomic clinical presentation and diagnostic procedure, the efforts to develop alternative diagnostic procedure have led to the use of new diagnostic technique such as polymerase chain reaction(PCR). We report a case of HSV type 1 encephalitis in 13 month old male infant who presented with altered level of consciousness, fever and focal seizures. With the use of the PCR, HSV-1 DNA was detected in cerebrospinal fluid from the patient. The symptoms and signs of encephalitis subsided by treatment with acyclovir in 14 days.

• 동의생리병리학회지
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• 제22권2호
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• pp.427-430
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• 2008

Serious controls and cares using ID numbers and barcode needed throughly to have appropriate management in clinical tissues and nucleic acids inventories because these samples are the most essential and important materials in the experimental research laboratories. While almost all of the laboratories using and handling DNA samples as starting materials in their research, problems such as mixing up of two or more different samples together, contamination with other samples, and/or mistakes can occur, especially when it comes with large number of samples. These problems are rather frequent even though researchers pay more attentions to be far away from these obstacles. It has been such a long time since PCR became useful as an important and essential biological research tool among lots of bio-scientific research methods. In this research, we tried to set up a simple and cost-effective genotyping method using PCR and agarose gels, instead of expensive automated machines, for identification and discrimination among those DNA samples, as a kind of low level quality control and sample inventory management.

• 대한수의학회지
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• 제36권1호
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• pp.187-193
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• 1996

The T sergenti DNA fragments used as probes of KTS1(2.4kb) and KTS3(1.5kb) were labeled with digoxigenin-11-dUTP for the Southern hybridization. T sergenti DNAs from different geographic locations(Korea; Chonbuk, Kyungbuk, Chungnam, Kangwon, Cheju island, Japan; Shintoku, Shintoku 9209, Shintoku 9201, Shintoku 9202, Shintoku 9102) which had been digested with Pst I and EcoR I were probed by the digoxigenin-11-dUTP-labeled KTS1 and KTS3. As the results, the samples from Chonbuk, Kyungbuk, Cheju island in Korea and Shintoku, Shintoku 9209, Shintoku 9201, Shintoku 9102 in Japan were positively reacted, but the others from the other locations not reacted. In the comformation test of T sergenti DNA from different geographic locations, all of the samples were positively detected by PCR amplification.