• Title/Summary/Keyword: 유전자집합분석

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Korea Information Science Society (유전자 알고리즘을 이용한 홍채 특징 추출)

  • 원현석;손병준;이일병
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2004.04b
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    • pp.826-828
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    • 2004
  • 홍채인식 시스템은 영상획득, 전처리, 특징 추출, 패턴 정합의 단계로 이루어져 있다. 이 중 특징 추출은 특징 차원의 감소뿐만 아니라 분류 정착도의 증가를 위한 필수적인 과정이다. 본 논문에서는 특징을 추출하는데 있어서, 홍채데이타에 웨이블렛 변환의 다해상도 분석 기법을 시도하여 일정 영역을 추출한 후, 그 영역에 유전자 알고리즘(Genetic Algorithm)을 적용하여 가장 분별력 있는 특징들만을 추출 및 사용하는 홍채인식 시스템을 제안한다. 유전자 알고리즘의 선택연산자로는 적응도 비례 방식과 전역 엘리트 방식을 사용하였으며, 적합도 함수로는 Gaussian Kernel을 사용하는 Support Vector Machine(SVM)을 사용하였다. 본 시스템을 통해 나온 최적의 특징집합을 이용한 SVM분류기로 인식률을 알아본 결과 웨이블렛만을 사용했을 때 보다 대략 1.5%정도 더 좋은 인식률을 얻을 수 있었다.

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The Intelligent Intrusion Detection Systems using Automatic Rule-Based Method (자동적인 규칙 기반 방법을 이용한 지능형 침입탐지시스템)

  • Yang, Ji-Hong;Han, Myung-Mook
    • Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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    • v.12 no.6
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    • pp.531-536
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    • 2002
  • In this paper, we have applied Genetic Algorithms(GAs) to Intrusion Detection System(TDS), and then proposed and simulated the misuse detection model firstly. We have implemented with the KBD contest data, and tried to simulated in the same environment. In the experiment, the set of record is regarded as a chromosome, and GAs are used to produce the intrusion patterns. That is, the intrusion rules are generated. We have concentrated on the simulation and analysis of classification among the Data Mining techniques and then the intrusion patterns are produced. The generated rules are represented by intrusion data and classified between abnormal and normal users. The different rules are generated separately from three models "Time Based Traffic Model", "Host Based Traffic Model", and "Content Model". The proposed system has generated the update and adaptive rules automatically and continuously on the misuse detection method which is difficult to update the rule generation. The generated rules are experimented on 430M test data and almost 94.3% of detection rate is shown.3% of detection rate is shown.

Rule Generation by Search Space Division Learning Method using Genetic Algorithms (유전자알고리즘을 이용한 탐색공간분할 학습방법에 의한 규칙 생성)

  • Jang, Su-Hyun;Yoon, Byung-Joo
    • The Transactions of the Korea Information Processing Society
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    • v.5 no.11
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    • pp.2897-2907
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    • 1998
  • The production-rule generation from training examples is a hard problem that has large space and many local optimal solutions. Many learning methods are proposed for production-rule generation and genetic algorithms is an alternative learning method. However, traditional genetic algorithms has been known to have an obstacle in converging at the global solution area and show poor efficiency of production-rules generated. In this paper, we propose a production-rule generating method which uses genetic algorithm learning. By analyzing optimal sub-solutions captured by genetic algorithm learning, our method takes advantage of its schema structure and thus generates relatively small rule set.

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Design and Implementation of a Genetic Algorithm for Optimal Placement (최적 배치를 위한 유전자 알고리즘의 설계와 구현)

  • 송호정;이범근
    • Journal of the Korea Society of Computer and Information
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    • v.7 no.3
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    • pp.42-48
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    • 2002
  • Placement is an important step in the physical design of VLSI circuits. It is the problem of placing a set of circuit modules on a chip to optimize the circuit performance. The most popular algorithms for placement include the cluster growth, simulated annealing and integer linear programming. In this paper we propose a genetic algorithm searching solution space for the placement problem, and then compare it with simulated annealing by analyzing the results of each implementation.

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Mining of Subspace Contrasting Sample Groups in Microarray Data (마이크로어레이 데이터의 부공간 대조 샘플집단 마이닝)

  • Lee, Kyung-Mi;Lee, Keon-Myung
    • Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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    • v.21 no.5
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    • pp.569-574
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    • 2011
  • In this paper, we introduce the subspace contrasting group identification problem and propose an algorithm to solve the problem. In order to identify contrasting groups, the algorithm first determines two groups of which attribute values are in one of the contrasting ranges specified by the analyst, and searches for the contrasting groups while increasing the dimension of subspaces with an association rule mining strategy. Because the dimension of microarray data is likely to be tens of thousands, it is burdensome to find all contrasting groups over all possible subspaces by query generation. It is very useful in the sense that the proposed method allows to find those contrasting groups without analyst's involvement.

Diversity based Ensemble Genetic Programming for Improving Classification Performance (분류 성능 향상을 위한 다양성 기반 앙상블 유전자 프로그래밍)

  • Hong Jin-Hyuk;Cho Sung-Bae
    • Journal of KIISE:Software and Applications
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    • v.32 no.12
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    • pp.1229-1237
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    • 2005
  • Combining multiple classifiers has been actively exploited to improve classification performance. It is required to construct a pool of accurate and diverse base classifier for obtaining a good ensemble classifier. Conventionally ensemble learning techniques such as bagging and boosting have been used and the diversify of base classifiers for the training set has been estimated, but there are some limitations in classifying gene expression profiles since only a few training samples are available. This paper proposes an ensemble technique that analyzes the diversity of classification rules obtained by genetic programming. Genetic programming generates interpretable rules, and a sample is classified by combining the most diverse set of rules. We have applied the proposed method to cancer classification with gene expression profiles. Experiments on lymphoma cancer dataset, prostate cancer dataset and ovarian cancer dataset have illustrated the usefulness of the proposed method. h higher classification accuracy has been obtained with the proposed method than without considering diversity. It has been also confirmed that the diversity increases classification performance.

Detecting cell cycle-regulated genes using Self-Organizing Maps with statistical Phase Synchronization (SOMPS) algorithm (SOMPS 알고리즘을 이용한 세포주기 조절 유전자 검출)

  • Kang, Yong-Seok;Bae, Cheol-Soo
    • Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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    • v.13 no.9
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    • pp.3952-3961
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    • 2012
  • Developing computational methods for identifying cell cycle-regulated genes has been one of important topics in systems biology. Most of previous methods consider the periodic characteristics of expression signals to identify the cell cycle-regulated genes. However, we assume that cell cycle-regulated genes are relatively active having relatively many interactions with each other based on the underlying cellular network. Thus, we are motivated to apply the theory of multivariate phase synchronization to the cell cycle expression analysis. In this study, we apply the method known as "Self-Organizing Maps with statistical Phase Synchronization (SOMPS)", which is the combination of self-organizing map and multivariate phase synchronization, producing several subsets of genes that are expected to have interactions with each other in their subset (Kim, 2008). Our evaluation experiments show that the SOMPS algorithm is able to detect cell cycle-regulated genes as much as one of recently reported method that performs better than most existing methods.

IoT-based Feature Selection Technique Research Trend (IoT 기반의 특징 선택 기법 연구 동향)

  • Lim, Hwan-Hee;Lee, Tae-Ho;Lee, Byung-Jun;Kim, Kyung-Tae;Youn, Hee-Yong
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • 2018.07a
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    • pp.41-42
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    • 2018
  • 특징 선택이란, 기계학습에서 분류 정확도를 향상시키기 위해서 많은 특징들을 분석해 가장 좋은 성능을 나타낼 수 있게끔 특징의 부분집합을 찾아내는 방법이다. 특징 선택 연구는 수십만개의 변수가 있는 데이터 세트를 이용하는 응용분야에서 주로 연구된다. 이러한 응용 분야는 주로 텍스트 처리, 유전자 배열 분석과 같은 고차원 데이터를 분석하는 분야이다. 또한, IoT 환경은 많은 데이터를 처리하기 때문에, 데이터 분류나 데이터의 가공을 위해서는 특징 선택 기법이 필수적이다. 본 논문에서는 특징 선택 기법에 대해 설명하고, IoT 환경에서 특징 선택 기법을 제안한다.

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A Hybrid System of Wavelet Transformations and Neural Networks Using Genetic Algorithms: Applying to Chaotic Financial Markets (유전자 알고리즘을 이용한 웨이블릿분석 및 인공신경망기법의 통합모형구축)

  • Shin, Taek-Soo;Han, In-Goo
    • Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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    • 1999.03a
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    • pp.271-280
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    • 1999
  • 인공신경망을 시계열예측에 적용하는 경우에 고려되어야 할 문제중, 특히 모형에 적합한 입력변수의 생성이 중요시되고 있는데, 이러한 분야는 인공신경망의 모형생성과정에서 입력변수에 대한 전처리기법으로써 다양하게 제시되어 왔다. 가장 최근의 입력변수 전처리기법으로써 제시되고 있는 신호처리기법은 전통적 주기분할처리방법인 푸리에변환기법(Fourier transforms)을 비롯하여 이를 확장시킨 개념인 웨이블릿변환기법(wavelet transforms) 등으로 대별될 수 있다. 이는 기본적으로 시계열이 다수의 주기(cycle)들로 구성된 상이한 시계열들의 집합이라는 가정에서 출발하고 있다. 전통적으로 이러한 시계열은 전기 또는 전자공학에서 주파수영역분할, 즉 고주파 및 저주파수를 분할하기 위한 기법에 적용되어 왔다. 그러나, 최근에는 이러한 연구가 다양한 분야에 활발하게 응용되기 시작하였으며, 그 중의 대표적인 예가 바로 경영분야의 재무시계열에 대한 분석이다. 전통적으로 재무시계열은 장, 단기의사결정을 가진 시장참여자들간의 거래특성이 시계열에 각기 달리 가격으로 반영되기 때문에 이러한 상이한 집단들의 고요한 거래움직임으로 말미암아 예를 들어, 주식시장이 프랙탈구조를 가지고 있다고 보기도 한다. 이처럼 재무시계열은 다양한 사회현상의 집합체라고 볼 수 있으며, 그만큼 예측모형을 구축하는데 어려움이 따른다. 본 연구는 이러한 시계열의 주기적 특성에 기반을 둔 신호처리분석으로서 기존의 시계열로부터 노이즈를 줄여 주면서 보다 의미있는 정보로 변환시켜줄 수 있는 웨이블릿분석 방법론을 새로운 필터링기법으로 사용하여 현재 많은 연구가 진행되고 있는 인공신경망의 모형결합을 통해 기존연구과는 다른 새로운 통합예측방법론을 제시하고자 한다. 본 연구에서는 제시하는 통합방법론은 크게 2단계 과정을 거쳐 예측모형으로 완성이 된다. 즉, 1차 모형단계에서 원시 재무시계열은 먼저 웨이브릿분석을 통해서 노이즈가 필터링 되는 동시에, 과거 재무시계열의 프랙탈 구조, 즉 비선형적인 움직임을 보다 잘 반영시켜 주는 다차원 주기요소를 가지는 시계열로 분해, 생성되며, 이렇게 주기에 따라 장단기로 분할된 시계열들은 2차 모형단계에서 신경망의 새로운 입력변수로서 사용되어 최종적인 인공 신경망모델을 구축하는 데 반영된다. 기존의 주기분할방법론은 모형개발자입장에서 여러 가지 통계기준치중에서 최적의 기준치를 합리적으로 선택해야 하는 문제가 추가적으로 발생하며, 본 연구에서는 이상의 제반 문제들을 개선시키기 위해 통합방법론으로서 기존의 인공신경망모형을 구조적으로 확장시켰다. 이 모형에서 기존의 입력층 이전단계에 새로운 층이 정의된다. 이렇게 해서 생성된 새로운 통합모형은 기존모형에서 생성되는 기본적인 학습파라미터와 더불어, 본 연구에서 새롭게 제시된 주기분할층의 파라미터들이 모형의 학습성과를 높이기 위해 함께 고려된다. 한편, 이러한 학습과정에서 추가적으로 고려해야 할 파라미터 갯수가 증가함에 따라서, 본 모델의 학습성과가 local minimum에 빠지는 문제점이 발생될 수 있다. 즉, 웨이블릿분석과 인공신경망모형을 모두 전역적으로 최적화시켜야 하는 문제가 발생한다. 본 연구에서는 이 문제를 해결하기 위해서, 최근 local minimum의 가능성을 최소화하여 전역적인 학습성과를 높여 주는 인공지능기법으로서 유전자알고리즘기법을 본 연구이 통합모델에 반영하였다. 이에 대한 실증사례 분석결과는 일일 환율예측문제를 적용하였을 경우, 기존의 방법론보다 더 나운 예측성과를 타나내었다.

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A Hybrid System of Wavelet Transformations and Neural Networks Using Genetic Algorithms: Applying to Chaotic Financial Markets (유전자알고리즘을 이용한 웨이블릿분석 및 인공신경망기법의 통합모형구축)

  • Shin, Taeksoo;Han, Ingoo
    • Proceedings of the Korea Database Society Conference
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    • 1999.06a
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    • pp.271-280
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    • 1999
  • 인공신경망을 시계열예측에 적용하는 경우에 고려되어야 할 문제중, 특히 모형에 적합한 입력변수의 생성이 중요시되고 있는데, 이러한 분야는 인공신경망의 모형생성과정에서 입력변수에 대한 전처리기법으로써 다양하게 제시되어 왔다. 가장 최근의 입력변수 전처리기법으로써 제시되고 있는 신호처리기법은 전통적 주기분할처리방법인 푸리에변환기법(Fourier transforms)을 비롯하여 이를 확장시킨 개념인 웨이블릿변환기법(wavelet transforms) 등으로 대별될 수 있다. 이는 기본적으로 시계열이 다수의 주기(cycle)들로 구성된 상이한 시계열들의 집합이라는 가정에서 출발하고 있다. 전통적으로 이러한 시계열은 전기 또는 전자공학에서 주파수영역분할, 즉 고주파 및 저주파수를 분할하기 위한 기법에 적용되어 왔다. 그러나, 최근에는 이러한 연구가 다양한 분야에 활발하게 응용되기 시작하였으며, 그 중의 대표적인 예가 바로 경영분야의 재무시계열에 대한 분석이다 전통적으로 재무시계열은 장, 단기의사결정을 가진 시장참여자들간의 거래특성이 시계열에 각기 달리 가격으로 반영되기 때문에 이러한 상이한 집단들의 고유한 거래움직임으로 말미암아 예를 들어, 주식시장이 프랙탈구조를 가지고 있다고 보기도 한다. 이처럼 재무시계열은 다양한 사회현상의 집합체라고 볼 수 있으며, 그만큼 예측모형을 구축하는데 어려움이 따른다. 본 연구는 이러한 시계열의 주기적 특성에 기반을 둔 신호처리분석으로서 기존의 시계열로부터 노이즈를 줄여 주면서 보다 의미 있는 정보로 변환시켜 줄 수 있는 웨이블릿분석 방법론을 새로운 필터링기법으로 사용하여 현재 많은 연구가 진행되고 있는 인공신경망과의 모형결합을 통해 기존연구와는 다른 새로운 통합예측방법론을 제시하고자 한다. 본 연구에서 제시하는 통합방법론은 크게 2단계 과정을 거쳐 예측모형으로 완성이 된다. 즉, 1차 모형단계에서 원시 재무시계열은 먼저 웨이블릿분석을 통해서 노이즈가 필터링 되는 동시에, 과거 재무시계열의 프랙탈 구조, 즉 비선형적인 움직임을 보다 잘 반영시켜 주는 다차원 주기요소를 가지는 시계열로 분해, 생성되며, 이렇게 주기에 따라 장단기로 분할된 시계열들은 2차 모형단계에서 신경망의 새로운 입력변수로서 사용되어 최종적인 인공 신경망모델을 구축하는 데 반영된다.

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