• 제목/요약/키워드: 단일가닥

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산화 그래핀 플랫폼을 이용한 DNA 중합효소의 실시간 형광에세이 (Real-time Fluorescence Assay of DNA Polymerase Using a Graphene Oxide Platform)

  • 강종백
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.456-461
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    • 2013
  • 단일가닥 DNA와 이중가닥 DNA의 흡착 율의 차이를 이용하여, 본 연구는 산화 그래핀에 흡착된 단일 가닥 DNA을 사용하여 Klenow fragment의 효소 활성을 검출하기 위하여 실시간 형광에세이 방법을 사용했다. 실험 결과에 의하면, 산화그래핀에 흡착된 형광표지 ssDNA는 형광이 ��칭(quenching) 되지만, cDNA 첨가에 의해서 흡착된 단일가닥 DNA가 유리되었다. Klenow fragment의 활성을 측정하기 위해서 형광표지 틀(template) DNA, 산화그래핀과 시발체(primer)가 존재할 때, 고분자 반응이 진행됨에 따라 ��칭된 형광세기가 증가하였다. 그리고 겔 전기영동 실험은 산화 그래핀에서 DNA 합성과 hybridization 반응을 확인하였다.

효모 감수분열과정에서의 유전자 재조합 기전 특이적 DNA 중간체의 구조 변화 (Identification of Meiotic Recombination Intermediates in Saccharomyces cerevisiae)

  • 성영진;윤상욱;김근필
    • 미생물학회지
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    • 제49권1호
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    • pp.1-7
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    • 2013
  • 유전자 재조합체는 상동염색체간의 예정된 DNA 가닥 전이와 교환이 이루어지는 상동염색체 재조합 과정에 의하여 생성된다. 이 재조합 경로는 DNA 이중 가닥 절단(double-strand breaks, DSBs)에 의해서 개시되며, 전이 과정의 중간단계에서 DNA의 구조적 변이 중간체인 단일 가닥 침투(single-end invasions, SEIs)와 이중 홀리데이 접합(double-Holliday junctions, dHJs)이 형성되어 교차성(crossover, CO) 혹은 비교차성(non-crossover, NCO) 결과물이 만들어진다. 본 연구는 이중 가닥 절단, 단일 가닥 침투, 이중 홀리데이 접합과 같은 재조합 중간체와 재조합 결과물의 구조분석에 초점을 두고, 이를 출아효모에서 인위적으로 이중 가닥 절단을 발생시킬 수 있는 HIS4LEU2 "hot spot" 을 이용한 물리적 분석방법으로 감수분열 재조합 중간체를 규명하였다. 물리적 분석을 위하여 동조화 된 세포에 감수분열을 유도한 후 hot spot 자리를 인식하는 제한효소를 처리하면, 재조합 중간체를 형성하고 있는 DNA 단편들을 Southern 분석법을 통해 탐지 및 정량 할 수 있다. 본 연구는 이 시스템으로 감수분열에서 이중가닥 절단으로부터 기인하는 단일 가닥 침투, 이중 홀리데이 접합 그리고 교차성/비교차성 재조합체로 전이되는 DNA의 구조 다형을 분석할 수 있음을 제시한다.

반건양건 단일 4가닥을 이용한 전방십자인대 재건술 (Anterior Cruciate Ligament Reconstruction with a Four-Strand Single Semitendinosus Tendon Autograft)

  • 경희수;김태공;오창욱;윤상협
    • 대한관절경학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.138-142
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    • 2009
  • 목적: 반건양건과 박건을 모두 채취함으로써 야기되는 공여부 이환을 줄이기 위하여 반건양건 단일 4가닥 건을 이용한 전방십자인대 재건술을 시행하여 결과를 보고한다. 대상 및 방법: 반건양건 단일 4가닥 건을 사용한 전방십자인대 재건술을 37명의 환자에게 시행하였다. 평균 나이는 28.6세였고, 남자 34명, 여자 3명이었다. 수상으로부터 수술까지의 기간은 5.4개월이었다. 동반 손상은 반월상 연골 손상 10예, 내측부인대 손상 3예, 골연골 손상 1예 있었다. 평균 추시는 16개월(12~18개월)이었고, 임상 평가는 관절 운동범위, Lachman 검사, pivot-shift 검사, Lysholm 점수, KT-2000 슬관절계를 이용하였다. 결과: 37명 모두 평균 150도로 정상측과 같은 슬관절 운동범위를 보였으며, 35예에서 Lachman 검사 및 pivot-shift 검사 상 음성이었다. Lysholm 점수는 84점에서 92점으로 개선되었다. 비협조적인 재활로 인하여 2예에서 슬관절의 이완이 남았으며, KT-2000 슬관절계를 이용하여 건측과 비교 측정한 평균 슬관절 전방 전위는 술 전 6.7 mm에서 최종 추시 시 2.1 mm로 개선되었다. 결론: 반건양건 단일 4가닥 건을 이용한 전방십자인대 재건술은 만족할 만한 임상적 결과를 보여 주었다.

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T7 박테리오파지 gp4 DNA helicase에 의한 DNA unwinding에서 step size의 반응속도론적 측정 (Kinetic Measurement of the Step Size of DNA Unwinding by Bacteriophage T7 DNA Helicase gp4)

  • Kim, Dong-Eun
    • 생명과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.131-140
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    • 2004
  • T7박테리오파지 gp4는 dTTP 가수분해에너지를 이용하여 DNA복제시 이중 나선 DNA를 단일가닥 DNA로 풀어내는 나선효소(helicase)이다. T7 나선효소의 활성형의 4차구조는 한가운데 구멍을 지닌 육량체 고리모양이다. 단일가닥 DNA는 나선효소가 $5'\rightarrow3'$방향으로 이동할 때 육량체 고리의 구멍으로 빠져나간다. 이러한 DNA의 이중나선 풀어헤침을 빠른 효소반응속도 측정법을 이용하여 정량적으로 측정하였으며, 그 결과 단일가닥 DNA 산물들이 생성되기 전에 지연상태(lag phase)가 존재함을 관찰하였다. 이러한 지연상태를 나선효소에 의한 이중나선 DNA의 풀어헤침이 속도론적 단계과정(kinetic stepping)을 거친다는 모델로써 분석하였다. 예상대로 이중나선의 길이가 클수록 지연상태의 지속시간이 늘어났다. $\tau7$ 나선효소가 이중나선 DNA를 풀어내는 과정에서 넣어준 trap DNA는 풀어내는 이중나선 DNA의 양을 변화시키지 못하여서, $\tau7$ 나선효소가 매우 큰 공정성을 지닌 효소임을 알 수 있었다. 이러한 속도론적 data를 global fitting법을 써서 kinetic stepping 모델에 적용한 결과 매 단계(step)마다 10∼l개의 염기쌍이 풀려지고 1초당 3.7번의 step이 일어난다는 것을 알 수 있었다. DNA 풀어헤침과 dTTP가수분해의 메커니즘과 이들의 연계성은 $4∼37^{\circ}C$사이의 온도범위에서 영향을 받지 않았다. 이상을 종합할 때, T7나선효소의 이중나선 DNA의 풀어헤침 시 나타나는 속도론적 단계과정은 DNA복제 시 이용되는 나선효소의 내재적 속성임을 알 수 있다.

Pb(Ⅱ) 이온을 이용한 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 고차원 구조 분석 (Analysis of Higher Order Structure of 5S rRNA from Pseudomonas alcaligenes by using Pb(Ⅱ) Ion)

  • 김상범;이영훈;박인원
    • 대한화학회지
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    • 제39권6호
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    • pp.453-458
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    • 1995
  • Pb^{2+}$을 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 구조 분석에 응용하였다. Pb^{2+}$이 5S rRNA를 절단하는 방식은 5S rRNA의 삼차구조의 조사에 이용할 수 있을 것으로 기대되는 몇 가지 특징들을 보였다. Pb^{2+}$은 안정한 나선형 줄기들에는 작용하지 않는다. 단일가닥으로된 구역들 또는 내밀린 부분들은 그들의 분자내에서의 위치에 따라 다른 민감도로 작용을 받는다. 불안정한 d 나선은 전혀 작용을 받지 않는다. 불안정한 C 줄기에서는 3'쪽의 가닥만이 작용을 받고 5'쪽의 가닥은 작용을 받지 않는다. Pb^{2+}$에 의한 절단과 Xanthomonas celebensis 5S rRNA의 구조분석의 결과들에 기초하여 우리는5S rRNA에서의 삼차상호작용에 대한 작업가설을 제안하였다.

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원형 브레이드 강화 일가소성 복합재료의 역학적 특성 연구(II)

  • 이덕래;김학용;최종주;서민강
    • 한국섬유공학회:학술대회논문집
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    • 한국섬유공학회 1998년도 가을 학술발표회논문집
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    • pp.299-302
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    • 1998
  • Textile composite란 직물, 편성물, 브레이드, 3축포 등의 텍스타일 제품을 강화재로 사용한 섬유강화 복합재료의 충칭으로서 텍스타일이 지닌 뛰어난 기능을 matrix에 부가함으로서 단일재료로서는 얻지 못하는 뛰어난 공업재료를 만들 수 있다. 브레이드는 3가닥 이상의 실이 서로 교착하여 2축포를 형성하며, 조성과정에서 중앙사를 삽입하면 3축포가 된다. (중략)

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DNA 이중나선구조에서의 오류 검출 및 복구방법연구 (A Study of Error Detection and Repair on DNA Duplicate Structure)

  • 김석환;허창우
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국해양정보통신학회 2011년도 추계학술대회
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    • pp.327-330
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    • 2011
  • 살아있는 생명체는 세포로 구성되며 성장 분열을 통해 스스로 복제할 수 있는 능력을 지녔다. DNA 상의 변이, 즉 돌연변이는 자손의 생존과 번식에 불리하게 작용할 수 있고 이점을 줄 수 있는 양면성을 지녔다. 본 연구에서는 DNA 이중나선은 복제 주형으로 사용되기 위해서는 먼저 이중나선이 열리고 단일 가닥으로 분리되어야 한다. 이중 나선구조결합에서의 결합의 오류부분의 위치를 찾아내고 복구하는 방법을 제시한다.

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