• Title, Summary, Keyword: 다형성

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Study on identification of candidate DNA marker related with beef quailty in QTL region of BTA 2 in Hanwoo population (한우 2번 염색체 양적형질좌위 영역에서 육질 연관 후보 DNA 마커 규명에 관한 연구)

  • Lee, Yoon-Seok;Oh, Dong-Yep;Yeo, Jung-Sou
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • v.22 no.4
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    • pp.661-669
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    • 2011
  • By direct sequencing of 12 STS marker, we identified 10 polymorphic SNPs. As a result of genotype frequency analysis between 10 polymorphic SNPs and extreme population (n=20) for marbling score in Hanwoo (n=233), there was over 40 percent of frequency difference of HWSNP_1-1 and HWSNP_9-4 SNP. HWSNP_1-1 SNP was significantly associated with marbling score in large-scale population (n=233). Therefore we suggested that HWSNP_1-1 SNP can be useful as a positional candidate for beef quality for marker-assisted selection in Hanwoo.

Detection of Worm Generated by Polymorphic Engine (다형성 엔진으로 생성된 웜의 탐지 기법)

  • Lee, Ki-Hun;Lee, Seung-Ick;Choi, Hong-Jun;Kim, Yu-Na;Hong, Sung-Je;Kim, Jong
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • pp.515-520
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    • 2006
  • 다형성 웜은 새로운 감염시도 때마다. 그 형태가 계속 변형되기 때문에 시그너처 기반의 탐지 기법으로는 탐지될 수 없다. 또한 이러한 다형성 웜은 주로 공개된 다형성 엔진을 이용하여 쉽게 자동적으로 생성할 수 있다. 본 연구에서는 네트워크 트래픽에 포함된 실행코드의 명령어 분포를 분석하여, 다형성 웜을 포함한 트래픽을 탐지하는 기법을 제시한다. 또한 제안하는 시스템의 성능을 모의 실험을 통해 평가한 결과, 다형성 엔진으로 생성된 웜은 전부 탐지되고 약 0.0286%의 낮은 오탐지율을 보인다.

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Lack of Association of the Mitochondrial DNA 5178 A/C Polymorphism with Hypertension in a Korean Population (한국인 집단에서 사립체 DNA에 존재하는 5178 A/C 다형성과 고혈압과의 관련성에 관한 연구)

  • Kang, Byung-Yong;Kim, Seon-Jeong;Jang, Dai-Ho;Kim, Hyun-Hee;Lee, Kang-Oh
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • v.18 no.1
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    • pp.27-32
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    • 2003
  • 고혈압은 다양한 유전적 요인과 환경적 요인이 상호작용하는 다인자성 질환으로 알려져 있으며, 최근의 연구에 의하면 사립체 DNA에 존재하는 유전적 다형성이 고혈압과 유의한 관련성을 나타낸다는 보고가 있다. 이에 본 연구에서는 한국인 집단을 대상으로 하여 사립체 DNA의 5178번째 위치의 염기서열에 존재하는 A/C 다형성이 고혈압과 관련성을 나타내는 지를 분석하였다. 환자-대조군 연구를 수행한 결과, 사립체 DNA의 5178번째 위치에 존재하는 다형성의 대립 유전자 빈도는 한국인에서 고혈압군과 정상 혈압군 사이에 유의한 차이를 나타내지 않았다. 따라서, 이 다형성은 적어도 한국인에 대해서는 고혈압에 유의하게 영향을 미치는 유전적 소인은 아닌 것으로 사료된다.

Association between the Polymorphism of Glutathione S-transferase Genes and Chronic Myeloid Leukemia in Asian Population: a Meta-analysis (아시아인종에서 만성골수성백혈병과 Glutathione S-transferase 유전자 다형성의 메타분석)

  • Kim, Hee Sung
    • The Journal of the Korea Contents Association
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    • v.17 no.10
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    • pp.289-299
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    • 2017
  • To verify the association between susceptibility to chronic myeloid leukemia (CML) and GSTM1, GSTT1 gene polymorphisms in Asian populations, 9 papers published until July 2017 were cited in a meta-analysis. The null present types of the GSTM1, GSTT1 gene were analyzed individually. The significant association was found between CML and GST polymorphism (GSTM1; OR=1.306, 95% CI=1.091-1.563, p=0.004, GSTT1; OR=1.987, 95% CI=1.438-2.746, p=0.000). In addition, there was association between CML and the null type of the combination GSTM1-GSTT1 polymorphisms (OR=4.191, 95% CI=2.833-6.201, p=0.000). Thus, genetic polymorphisms of the GSTM1, GSTT1 and combination GSTM1-GSTT1 polymorphism in Asian populations may be risk factors for CML.

참돔 lipoprotein lipase 유전자의 다형성에 관한 연구

  • 장요순;홍경표;노충환;명정구;김종만
    • Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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    • pp.33-33
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    • 2003
  • Lipoprotein lipase (LPL)은 지방축적과 대사에 있어 중요한 효소로서 지방조직과 근육 내로의 지방산 유입을 조절하며, 여러 조직에서 합성되고, 조직 특이적인 방법으로 동물의 생리상태, 영양상태 및 발달단계에 따라 유전자 발현이 조절되는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 어류의 체지방 축적과 대사과정을 이해하고 성장 및 경제형질 관련 DNA marker를 확보하기 위한 1차적인 연구로서, 한국산 선발계통 및 일본산 양식계통과 이들 두 계통간 잡종 참돔 집단을 이용하여 LPL 유전자 내의 다형성을 탐색하고 분석하였다. PCR-RFLP 분석을 실시하여 참돔 LPL 유전자 exon 2번을 포함하는 영역에서 3개의 (Msp I, Alu I 및 Hsp92II) 다형성을 확인하였고, 각 집단간 대립유전자의 빈도를 분석하였다. Exon 2번에서 관찰된 Msp I 다형성은 염기치환 (C$\longrightarrow$G)이 일어난 형태로서 아미노산 서열에는 변화가 없는 silent mutation 이었으며, 대립유전자의 빈도를 분석한 결과, 각 집단간 뚜렷한 차이는 없었다. Alu I 및 Hsp92II 다형성은 intron 영역에서 발견되었으며, Alu I 다형성으로 인한 4개의 대립유전자형 중 D 대립유전자는 한국산 선발 계통과 한국산 선발계통을 포함하는 교배집단에서만 검출되었다. 이 후의 연구에서는 참돔 LPL 유전자의 exon 영역에 존재하는 다형성을 탐색하고, 형질과의 연관성 및 지방축적 기능과의 관련성 등을 분석하고자 한다.

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다형성 바이러스의 소개(Win32/Kashu)

  • Choi, Dong-Kyun;Yang, Ha-Young
    • Review of KIISC
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    • v.18 no.3
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    • pp.53-59
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    • 2008
  • 본 논문에서는 최근 국내에서 발견된 바이러스 중 다형성 바이러스인 Win32/Kashu에 대한 특징을 설명하고자 한다. 이를 통해 다형성 바이러스의 일반적인 특징을 알 수 있으며, 나아가 안티바이러스 제품에서 어떻게 치료가 이루어지는지를 알 수 있다. 다형성 바이러스는 일반적인 바이러스와 달리 감염 시 자신의 코드가 매번 다른 형태를 나타내는 것으로 진단과 치료가 어려운 것이 특징이다. 최근에는 이러한 복잡한 형태의 바이러스가 점점 증가하고 있는 추세이며, 이러한 현상은 사용자 및 안티바이러스 업체 모두에게 큰 위협으로 다가올 수 있다.

Dispersal Polymorphisms in Insects-its Diversity and Ecological Significance (곤충의 분산다형성-그의 다양성과 생태학적 의의)

  • 현재선
    • Korean journal of applied entomology
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    • v.42 no.4
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    • pp.367-381
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    • 2003
  • Dispersal polymorphism in insects Is a kind of adaptive strategy of the life history together with the diapause, consisting of the “long-winged or alate forms” of migratory phase and the “short-winged or apterous forms” of stationary phase. Dispersal polymorphism is a polymorphism related with the flight capability, and has three categories ; the wing polymorphisms, flight muscle polymorphisms, and flight behavior variations. Phase variation is another type of dispersal polymorphism varying in morphology, physiology and wing forms in response to the density of the population. The dispersal migration is a very adaptive trait that enables a species to keep pace with the changing mosaic of its habitat, but requires some costs. In general, wing reduction has a positive effect on the reproductive potential such as earlier reproduction and larger fecundity The dispersal polymorphism is a kind of optimization in the evolutionary strategies of the life history in insects; a trade-off between the advantages and disadvantages of migration. Wing polymorphism is a phenotypically plastic trait. Wing form changes with the environmental conditions even though the species is the same. Various environmental factors have an effect on the dispersal polymorphisms. Density dependent dispersal polymorphism plays an important role In population dynamics, but it is not a simple function of the density; the individuals of a population may be different in response to the density resulting different outcomes in the population biology, and the detailed information on the genotypic variation of the individuals in the population is the fundamental importance in the prediction of the population performances in a given environment. In conclusion, the studies on the dispersal polymorphisms are a complicated field in relation with both physiology and ecology, and studies on the ecological and quantitative genetics have indeed contributed to understanding of its important nature. But the final factors of evolution; the mechanisms of natural selections, might be revealed through the studies on the population biology.

A Detecting Method of Polymorphic Virus Using Advanced Virtual Emulator (개선된 가상 에뮬레이터를 이용한 다형성 바이러스 탐지 방법)

  • Kim, Du-Hyeon;Baek, Dong-Hyeon;Kim, Pan-Gu
    • The KIPS Transactions:PartC
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    • v.9C no.2
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    • pp.149-156
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    • 2002
  • Current vaccine program which scans virus code patterns has a difficult to detect the encrypted viruses or polymorphic viruses. The decryption part of polymorphic virus appears to be different every time it replicates. We must monitor the behavior of the decryption code which decrypts the body of the virus in order to detect these kinds of viruses. Specialty, it is not easy for the existing methods to detect the virus if the virus writer has modified the loop count of execution intentionally. In this paper, we propose an advanced emulator using a new algorithm so as to detect various kinds of polymorphic viruses. As a result of experiment using advanced emulator, we found that our proposed method has improved the virus detecting rate about 2%. In addition, our proposed system has a merit that it runs on not only MS-Windows but also Linux, and Unix-like Platform.

Chemotherapeutic Drug Resistant Cancer Stem-like Cells of Glioma (다형성 교모세포종의 항생제 내성 종양 줄기세포)

  • Kang, Mi-Kyung;Kang, Soo-Kyung
    • Journal of Life Science
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    • v.17 no.8
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    • pp.1039-1045
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    • 2007
  • Glioblastoma multiforme (GBM) is the most frequently occurring brain cancer. Although the existence of cancer stem cells (CSCs) in GBM has been established, there is little evidence to explain the link between CSCs and chemoresistance. In this study, we investigated that only a few cells of A172 and established GBM2 survived after 1,3-bis(2chloroethyl)-1-nitrosourea (BiCNU) exposures and these sur-vived cells resist the subsequent BiCNU treatment. In addition, these BiCNU-resistant small pop-ulations derived from GBM cells increased the phosphorylations of Erk and Akt and highly expressed CD133 stem cell surface marker. Furthermore, we observed that the BiCNU-resistant cancer cells de-rived from GBM have grown tumors when transplanted into severe combined immuno-deficient (SCID) mouse brain. These results demonstrate that BiCNU-resistant subpopulation cells derived from GBM have cancer stem-like cell properties. Therefore, it may provide provide further evidence that CSCs in GBM have chemotherapeutic drug resistance.

Design of a Fast Algorithm for Computing Contingency Tables that are Used to Construct Epistasis Networks of SNPs (단일염기다형성 상위성 네트워크를 구성하기 위한 분할표를 생성하는 빠른 알고리즘의 설계)

  • Wang, Sehee;Wee, Kyubum
    • Proceedings of the Korean Society of Computer Information Conference
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    • pp.21-24
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    • 2016
  • 전장유전체 연관성 연구에서 상위성 탐색은 많은 단일염기다형성 수로 인해 계산이 어렵기 때문에 네트워크에서의 탐색을 이용한 방법이 사용되고 있다. 그러나 전장유전체 연관성 연구에서 단일염기다형성들의 상위성 네트워크의 구성 역시 큰 계산 비용을 필요로 한다. 본 논문에서는 단일염기다형성과 표현형의 상호정보량을 이용한 네트워크를 구성하는데 드는 시간을 줄이는 알고리즘을 제안한다. 또한 표본 크기별로 계산 시간을 실험해 보았으며, 기존의 방법과 비교해 실행 속도가 향상됨을 보였다.

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