Hexaploid wheat (common wheat/bread wheat) is one of the most important cereal crops in the world and a model for research of an allopolyploid plant with a large, highly repetitive genome. In the heritability of agronomic traits, variation in gene presence/absence plays an important role. However, there have been relatively few studies on the variation in gene presence/absence in crop species, including common wheat. Recently, a reference genome sequence of common wheat has been fully annotated and published. In addition, advanced next-generation sequencing (NGS) technology provides high quality genome sequences with continually decreasing NGS prices, thereby dawning full-scale wheat functional genomic studies in other crops as well as common wheat, in spite of their large and complex genomes. In this review, we provide information about the available tools and methodologies for wheat functional genomics research supported by NGS technology. The use of the NGS and functional genomics technology is expected to be a powerful strategy to select elite lines for a number of germplasms.
Objects : To investigate the relationship between the age of onset with the atrophy and the white matter hyperintensities observed in the brain MRI of Alzheimer patients. Methods : The authors measured volumetrically cortical and ventricular brain atrophy and rated semiquantitatively white matter signal hyperintensities in nine presenile and 18 senile Alzheimer patients, who were matched for dementia severity, according to NINCDS-ADRDA criteria and in age-matched 10 presenile and 11 senile control subjects. Results : Presenile Alzheimer patients showed significantly greater cortical and ventricular atrophy indices(p<0.05) but no difference in white matter hyperintensity scores compared to the age-matched control group. On the contrary, senile Alzheimer patients showed significantly greater white matter hyperintensity scores(p<0.05) but no difference in cortical and ventricular atrophy indices compared to the age-matched control group. Conclusion : An earlier onset was related to marked brain atrophy with less white matter lesions and a later onset is related to marked white matter lesions with less brain atrophy in Alzheimer's disease. Our results suggested the passible difference in the pathophysiology between the presenile and the senile-onset Alzheimer's disease.
Background: Surgical closure of the PDA in premature infants with complications or contraindications to indomethacin use, or recurrence of symptomatic PDA is a safe and effective procedure with low operative risk and minimal complications. Material and Method: From April 1996 to August 1998, 11 premature infants with body weight under 1.5 kg at operation underwent operation for a symptomatic PDA (male:5, female: 6). Associated dise ases were congenital heart disease(7), hyaline membrane disease(6), intraventricular hemor rhage(4), pneumonia(4), pneumothorax(3), hyperbilirubinemia(2), necrotizing enterocolitis(2), renal failure(1), epilepsy(1), and hydrocephalus(1). Surgical techniques are hemoclipping(8) and ligation(3). The size of PDA was 3~6 mm (5.0$\pm$1.2). Result: Systolic and diastolic blood pressure rised and heart rates decreased after PDA closure. ABGA improved postoperatively. There were no surgical complications. Six infants with improved ABGA data were weaned from mechanical ventilatory support. The follow-up durations after discharge were 3 month to 12 month. Five deaths were not related to operation. The causes of death were hyaline membrane disease(2), bronchopulmonary dysplasia with pneumonia(1), sepsis(1), and con gestive heart failure with respiratory distress syndrome(1). Conclusion: Early operative closure is the treatment of choice in most premature infants with a hemodynamically significant shunt(PDA), recurrence of symptomatic PDA, complications of Indomethacin, or contraindi cations to Indomethacin.
A 3-year-old, intact male Pungsan dog was presented for a 2-week history of a non-weight-bearing lameness of left hindlimb with anorexia. The dog had no history of trauma, and never been routinely vaccinated or treated with heartworm preventatives. The complete blood count showed severe leukocytosis and neutrophilia with left shift. Serum biochemistry showed hypoalbuminemia, azotemia, and increased hepatobilliary enzyme activity. A canine heartworm antigen test was positive. Thoracic radiographs were consistent with heartworm disease as evidences by main pulmonary artery enlargement, right-sided cardiomegaly, and interstitial lung pattern. Echocardiography revealed pulmonary valvular regurgitation and pulmonary hypertension. Selective femoral arterial angiogram was performed, and bilateral femoral arterial occlusion was identified. The dog died after angiogram, and necropsy was performed. At necropsy, adult heartworm and a large blood clot were found within the lumen of left and right femoral artery. This case report describes an unusual migration of heartworm to femoral artery that caused hindlimb lameness.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.20
no.2
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pp.99-112
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2015
Datum point for displaying location and altitude of point has being advantage usefully in various measurement parts. However, datum point has been increasing loss cases owing to weather changes and stratum changes and neglecting meaninglessly. In this paper, we design and implement a multi electronic measurement system monitoring software with functions such as include maximize utilization of existing measurement datum system as well as collected various environment data and detection stratum changes of surround area. Proposed software is implemented to support that reusability and extensibility of software using object oriented modeling method. Our software supports a GUI for electronic measurement datum point administrator as well as for web user and mobile user. Our system can support a graph GUI for various data analysis and reposition in realtime to database that measured location information and various sensing information to prevent loss of electronic measurement datum point and to detected stratum changes. In addition, we include a QR code and RFID recognition function. Finally, we suggest performance evaluation result to confirm stratum changes detection and GPS location error rate.
Park, Junhyeok;Lee, Songwook;Lim, Yoonseob;Choi, Jongsuk
KIPS Transactions on Software and Data Engineering
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v.8
no.5
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pp.213-222
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2019
Determining the meaning of a keyword in a speech dialogue system is an important technology for the future implementation of an intelligent speech dialogue interface. After extracting keywords to grasp intention from user's utterance, the intention of utterance is determined by using the semantic mark of keyword. One keyword can have several semantic marks, and we regard the task of attaching the correct semantic mark to the user's intentions on these keyword as a problem of word sense disambiguation. In this study, about 23% of all keywords in the corpus is manually tagged to build a semantic mark dictionary, a synonym dictionary, and a context vector dictionary, and then the remaining 77% of all keywords is automatically tagged. The semantic mark of a keyword is determined by calculating the context vector similarity from the context vector dictionary. For an unregistered keyword, the semantic mark of the most similar keyword is attached using a synonym dictionary. We compare the performance of the system with manually constructed training set and semi-automatically expanded training set by selecting 3 high-frequency keywords and 3 low-frequency keywords in the corpus. In experiments, we obtained accuracy of 54.4% with manually constructed training set and 50.0% with semi-automatically expanded training set.
We used the health screening data of some rural and urban residents to examine the cross-sectional association between leukocyte count and hypertension. The 206 male and 203 female rural residents were selected by multi-stage cluster sampling method in Kyungsan-Kun area of Kyungbuk province in 1985 and 600 urban residents were selected by the same sampling method as the rural residents in Daegu city of the same province in 1986 compatible with age-sex distribution of Daegu city of 1985 census, but of whom 384 actually responded. The rest of 600 were replaced by age and sex with those who were members of the medical insurance plan visiting the health management department of the university hospital to get the biannual preventive medical checkups. Excluded in the analysis were those having hypertensive history, diseases and extreme outlying values of the screening tests, leaving 373 rural and 571 urban residents. Leukocyte count was measured with ELT-8 Laser shadow method and the unit $cells/mm^3$, Blood pressures were determined with an aneroid sphygmomanometer with pre-standardized method and hypertensives were defined as those showing systolic blood pressure more than 140mmHg and/or diastolic blood pressure more than 90mmHg. Total residents pooled (N=944) showed a significant difference between hypertensives and normotensives ($6965.93{\pm}1997.01\;vs\;6490.61{\pm}1941.32,\;P=0.00$) and in rural residents was noted the similar significant difference (P=0.03). None of significant differences were noted in any stratum stratified by residency and sex. Compared to the lowest quintile of WBC, 2/5 quintile showed odds ratio 0.99 (95% Confidence interval, Ci 0.62-1.59), 3/5 quintile 1.41 (95% CI 0.90-2.21), 4/5 quintile 1.76 (95% CI. 1.14-2.72), and highest quintile 1.80 (1.15-2.82) in the total residents. Likelihood ratio test for linear trend for it indicated a significant trend ($X^2_{trend}=5.53,\;df=1,\;P<0.05$). There were no other significant odds ratios compared to the lowest quintile of WBC in strata stratified by residency and sex. The odds ratios in total residents which had showed significant odds ratios became nonsignificant and of reduced magnitude after controlling age, frequency of smoking and drinking with multiple logistic. regression. In each stratum, it changed magnitudes of odds ratios slightly and unstably. None of the trend tests showed any significant trend. These results suggest that the Friedman et al's finding of association between leukocyte count and hypertension may be due to an statistical type I error resulting from the data dredging in an exploratory study, in which more than 800 variables were screened as possible predictors of hypertension.
An experiment was conducted in 1990~1991 to study the effects of various soil amelioration on the soil productivity and machine workability at tidal land paddy field of Kyewhado Substation, Homam Crop Experiment Station. The soil, Munpo Series(fine sandy loam, Typic Fluvaquents) was treated with gipsum, rice straw, rice straw compost and foreign soil(at 20cm depth) after deep ploughing. The results are surmerized as follows. 1. Sand and clay were slightly increased, while silt was slightly decreased in the rice straw and compost plots. The soil texture was changed from loam to sand loam by the addition of foreign soil 2. Soil bulk density and porosity was decreased in the rice straw, compost and foreign soil addition plots. 3. Cone penetration resistance was $12.5kg/cm^2$ at 10cm of soil depth before experiment and $12.5kg/cm^2$ at 20cm of soil depth after experiment except control, and the root zone was expended down to 20cm. 4. Soil salt content before experiment was 0.46 and 0.48% for surface soil(10cm) and subsoil(20cm), respectively ; The salt content of ameliorated plot was 0.26~0.32% and 0.16~0.31%, respectively, indicating good leaching of soil salt by the soil improvements. 5. The yields of rice in different treatments were in the order of the foreign soil addition > compost > gypsum > rice straw > control.
Proceedings of the Korean Radioactive Waste Society Conference
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2004.06a
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pp.223-224
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2004
고준위폐기물 혹은 사용후 핵연료의 처분용기 재질은 각 국의 처분개념과 처분공의 주위 환경에 따라 달라질 수 있다. 용기의 후보재질로는 탄소강, 스텐레스 강, 구리, 니켈, 티탄 혹은 이들의 합금이 주로 고려되고 있으나, 국내에서는 아직 선정되지 않았다. 국내 처분환경에서 이들 재질의 부식특성을 조사하고자 모의 화강암 지하수를 가해 만든 겔 상태의 경주 벤토나이트에 탄소강, 스텐레스 강, 구리 시편을 넣고, $70^{\circ}C$, 아르곤 분위기에서 530일 경과한 후 시편의 표면 변화 (그림 1) 및 무게 감소를 측정하였다. 철 부식시편은 검정색의 철 화합물 층으로 덮여 있었으며, 구리표면에는 노란색의 부식층이 형성되었는데, 이를 XRD로 분석한 결과 $Cu_2O$로 판명되었다. 그러나 $700^{\circ}C$에서 각각 0, 24, 96시간동안 예민화시킨 스텐레스 강 시편들은 모두 초기상태 그대로 광택을 유지하고 있었으며, XRD에서 다른 화합물의 형성을 발견할 수 없었다 (그림 2). 시편의 무게 감소가 균일부식에 기인한 것으로 가정하여 환산한 결과, 구리와 스텐레스 강 모두 0.3~0.4 $\mu\textrm{m}/yr$의 부식속도를 나타내었다. 그러나 구리는 부식생성물이 표면에 부착되어 있기 때문에 실제 부식두께는 이 값보다 더 클 것으로 생각된다. 용기가 초기 530일간과 같은 속도로 처분용기의 부식이 진행된다면 한국에서 기준처분 개념으로 삼고 있는 50mm 두께의 내부식성 외벽 금속용기는 적어도 만년이상 견딜 수 있을 것으로 추정된다. 한편, 검정색 부식층을 제거한 무게감소로부터 계산한 철의 부식속도는 구리의 약 30배에 해당하였다. 금속 재질의 정확한 부식 거동을 파악하기 위해서는 보다 장기간의 실험이 요구된다. 시험법 선정에 각계(규제기관, 학계, 발전소 현장 및 산업계 등) 전문가로부터 기술자문회의를 통하여 자문 의견을 받기로 하였다. 특히 현재 폐기물 인수 기술기준치가 설정된 국가의 시험법을 심층 있게 검토하기로 하였다.검토하기로 하였다. 혹은 수성주변 환경이 지배하는 산악이나 구릉지에서 흔히 나타나는 침엽수-낙엽활엽수의 혼합림 식생상태를 잘 대변해 주고 있는 것으로 판단된다. 끝으로, 의림지 호저 퇴적층 중에서 인위적인 교란흔적이 없는 암회색 유기질 니층에 대한 탄소연대측정 결과, 제1호공 12번 시료에서 950$\pm$40 years B.P을 얻었으며, 제3-1호공에서도 아래로 내려가면서 8, 10, 11번 시료에 대하여 500$\pm$30 years B.P, 650$\pm$30 years B.P, 800$\pm$40 years B.P의 연대측정 결과를 획득하였다. 이상과 같은 의림지 호저 퇴적층의 형성환경과 형성시기 연구를 통하여 의림지의 제방축조의 최초시기를 해석해 보면, 의림지의 제방은 적어도 과거 약 827년 전에서 866년 전에는 이미 축조되어 있었음을 알 수 있다. 과거 제천 일대에 살았던 옛사람들이 의림지 하류의 곡지중앙과 고기 충적선상지에 대한 관계용 용수조달의 필요성에 부응하여 상류부 곡지하천의 자연입지 환경을 최대한 이용하여 축조한 것으로 판단된다..준비하였다.전류를 구성하는 주요 입자의 에너지 영역(75~l13keV)에서 가장 높은(0.80) 상관계수를 기록했다. 넷째, 회복기 중에 일어나는 입자들의 유입은 자기폭풍의 지속시간을 연장시키는 경향을 보이며 큰 자기폭풍일수록 현저했다. 주상에서 관측된 이러한 특성은 서브스톰 확장기 활동이 자기폭풍의 발달과 밀접한 관계가 있음을 시사한다.se that were all low
The improved performance and miniaturization of computer and the improvement of wireless communication technology have enabled the emergence of many high quality services. Among them multicast services are receiving much attention and their usage is increasing due to the increase of Internet multimedia services such as video conference, multimedia stream, internet TV, etc. Security plays an important role in mobile multicast services. In this paper, we proposed a secure multicast protocol for a hierarchical micro-mobility environment. The proposed secure multicast protocol provides security services such as authentication, access control, confidentiality and integrity using mechanisms including symmetric/asymmetric key crypto-algorithms and capabilities. To provide forward/backward secrecy and scalability, we used sub-group keys based on the hierarchical micro-mobility environment. With this security services, it is possible to guard against all kinds of security attacks performed by illegal mobile nodes. Attacks executed by internal nodes can be thwarted except those attacks which delete packet or cause network resources to be wasted. We used simulator to measure the performance of proposed protocol. As a result, the simulation showed that effect of these security mechanisms on the multicast protocol was not too high.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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