In this paper, we propose a method to compute the interface between protein molecules. When a molecules is represented as a set of spheres with van der Waals radii, the distance from a spatial point p to the molecule corresponds to the distance from p to the closet sphere. The molecular interface is composed of equi-distant points from two molecules. Our algorithm decomposes the space into a set of voxels, and then constructs a voxel map by storing the information of spheres intersecting each voxel. By using the voxel map, we compute the distance between a point and the molecule. We also use GPU for the parallel processing, and efficiently approximate the interface of a pair of molecules.
Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
/
v.9
no.5
/
pp.1102-1110
/
2005
In this paper, we proposed a advanced approach to resolve the trade-off problem for the threshold value determining the photo-consistency in the previous algorithms. The threshold value for the surface voxel is substituted the photo-consistency value of the inside voxel. As iterating the voxel coloring process, the threshold is approached to the optimal value for the individual surface voxel. we present an energy minimization formulation of the binary labeling problem that surface voxels classify into opacity or transparency. The energy formula consists of the data term and the smoothness term. As considering neighboring voxels in the labeling problem, the unevenness of reconstructed surface is reduced. The labeling whose energy is the global minimum can be computed using a graph cut.
Purpose: This study was designed to investigate the effects of voxel size, the oversampling technique, and the direction and area of measurement on modulation transfer function (MTF) values to identify the optimal method of MTF measurement. Materials and Methods: Images of the wire inserts of the SedentexCT IQ phantom were acquired, and MTF values were calculated under different conditions(voxel size of 0.1, 0.2, and 0.3 mm; 5 oversampling techniques; simulated pixel location errors; and different directions and areas of measurement). The differences in the MTF values across various conditions were evaluated. Results: The MTF 10 values showed smaller standard deviations than the MTF 50 values. Stable and accurate MTF values were obtained in the 0.1-mm voxel images. In the 0.3-mm voxel images, oversampling techniques of 11 lines or more did not show significant differences in MTF values depending on the presence of simulated location errors. MTF 10 values showed significant differences according to the direction and area of the measurement. Conclusion: To measure more accurate and stable MTF values, it is better to measure MTF 10 values in small-voxel images. In large-voxel images, the proper oversampling technique is required. MTF values from the radial and tangential directions may be different, and MTF values vary depending on the measured area.
Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea CI
/
v.42
no.6
/
pp.93-100
/
2005
We propose an optimal thresholding method for the voxel coloring in the reconstruction of a 3D shape. Our purposed method is a new approach to resolve the trade-off error of the threshold value on determining the photo-consistency in the conventional method. Optimal thresholding value is decided to compare the photo-consistency of a surface with inside voxel on the optic ray of the center camera. As iterating the process of the vokels, the threshold is approached to the optimal value for the individual surface voxel. And also, graph cut method is reduced to the surface noise on eliminating neighboring voxel. To verify the proposed algorithm, we simulated in the virtual and real environment. It is advantaged to speed up and accuracy of a 3D face reconstruction by applying the methods of optimal threshold and graph as compare with conventional algorithms.
In this study, information on vegetation was collected using a point cloud through a 3-D Terrestrial Lidar Scanner, and the physical shape was analyzed by reconfiguring the object based on the refined data. Each filtering step of the raw data was optimized, and the reference volume and the estimated results using the Alpha Shape and Voxel techniques were compared. As a result of the analysis, when the volume was calculated by applying the Alpha Shape, it was overestimated than reference volume regardless of data filtering. In addition, the Voxel method to be the most similar to the reference volume after the 8th filtering, and as the filtering proceeded, it was underestimated. Therefore, when re-implementing an object using a point cloud, internal voids due to the complex shape of the target object must be considered, and it is necessary to pay attention to the filtering process for optimal data analyzed in the filtering process.
Fernanda Ferrari Esteves Torres;Reinhilde Jacobs;Mostafa EzEldeen;Karla de Faria-Vasconcelos;Juliane Maria Guerreiro-Tanomaru;Bernardo Camargo dos Santos;Mario Tanomaru-Filho
Restorative Dentistry and Endodontics
/
v.47
no.1
/
pp.2.1-2.11
/
2022
Objectives: This study investigated the impact of micro-computed tomography (micro-CT)-based voxel size on the analysis of material/dentin interface voids and thickness of different endodontic cements. Materials and Methods: Following root-end resection and apical preparation, maxillary premolars were filled with mineral trioxide aggregate (MTA), Biodentine, and intermediate restorative material (IRM) (n = 24). The samples were scanned using micro-CT (SkyScan 1272; Bruker) and the cement/dentin interface and thickness of materials were evaluated at voxel sizes of 5, 10, and 20 ㎛. Analysis of variance and the Tukey test were conducted, and the degree of agreement between different voxel sizes was evaluated using the Bland and Altman method (p < 0.05). Results: All materials showed an increase in thickness from 5 to 10 and 20 ㎛ (p < 0.05). When evaluating the interface voids, materials were similar at 5 ㎛ (p > 0.05), while at 10 and 20 ㎛ Biodentine showed the lowest percentage of voids (p < 0.05). A decrease in the interface voids was observed for MTA and IRM at 20 ㎛, while Biodentine showed differences among all voxel sizes (p < 0.05). The Bland-Altman plots for comparisons among voxel sizes showed the largest deviations when comparing images between 5 and 20 ㎛. Conclusions: Voxel size had an impact on the micro-CT evaluation of thickness and interface voids of endodontic materials. All cements exhibited an increase in thickness and a decrease in the void percentage as the voxel size increased, especially when evaluating images at 20 ㎛.
To evaluate the metabolic changes in normal adult brains due to alterations SENSE and NEX (number of excitation) by multi voxel MR Spectroscopy at 3.0 Tesla. The study group was composed of normal volunteers (5 men and 8 women) with a mean ($\pm$ standard deviation) age of 41 (${\pm}11.65$). Their ages ranged from 28 to 61 years. MR Spectroscopy was performed with a 3.0T Achieva Release Version 2.0 (Philips Medical System-Netherlands). The 8 channel head coil was employed for MRS acquisition. The 13 volunteers underwent multi voxel spectroscopy (MVS) and single voxel spectroscopy (SVS) on the thalamus area with normally gray matter. Spectral parameters were as follows: 15 mm of thickness; 230 mm of FOV (field of view); 2000 msecs of repetition time (TR); 288 msecs of echo time (TE); $110{\times}110$ mm of VOI (view of interest); $15{\times}15{\times}15$ mm of voxel size. Multi voxel spectral parameters were made using specially in alteration of SENSE factor (1~3) and 1~2 of NEX. All MRS data were processed by the jMRUI 3.0 Version. There was no significant difference in NAA/Cr and Cho/Cr ratio between MVS and SVS likewise the previous results by Ross and coworkers in 1994. In addition, despite the alterations of SENSE factor and NEX in MVS, the metabolite ratios were not changed (F-value : 1.37, D.F : 3, P-value : 0.262). However, line-width of NAA peak in MVS was 3 times bigger than that in SVS. In the present study, we demonstrated that the alterations of SENSE factor and NEX were not critically affective to the result of metabolic ratios in the normal brain tissue.
Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea SP
/
v.39
no.5
/
pp.544-555
/
2002
The aim of this study is to develop the $^1H$-MRS data postprocessing software for both single-voxel and multi-voxel technique, which plays and important role as a diagnostic tool in clinical field. This software is based on graphical user interface(GUI) under windows operating system of personal computer(PC). In case of single-voxel MRS, both of raw data in time-domain and spectrum data in frequency-domain are simultaneously displayed in a screen. Several functions such as DC correction, zero filling, line broadening, Lorentz-Gauss filtering and phase correction, etc. are included to increase the quality of spectrum data. In case of multi-voxel analysis, spectroscopic image reconstructed by 3-D FFT was displayed as a spectral grid and overlapped over previously obtained T1- or T2-weighted image for the spectra to be spatially registered with the image. The analysis of MRS peaks were performed by obtaining the ratio of peak area. In single-voxel method, statistically processed peak-area ratios of MRS data obtained from normal human brain are presented. Using multi-voxel method, MR spectroscopic image and metabolite image acquired from brain tumor are demonstrated.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.