• Molecules and Cells
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• 제42권10호
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• pp.687-692
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• 2019

Transfer RNA-derived small RNAs (tsRNAs) play a role in various cellular processes. Accumulating evidence has revealed that tsRNAs are deeply implicated in human diseases, such as various cancers and neurological disorders, suggesting that tsRNAs should be investigated to develop novel therapeutic intervention. tsRNAs provide more complexity to the physiological role of transfer RNAs by repressing or activating protein synthesis with distinct mechanisms. Here, we highlight the detailed mechanism of tsRNA-mediated dual regulation in protein synthesis and discuss the necessity of novel sequencing technology to learn more about tsRNAs.

• BMB Reports
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• 제56권2호
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• pp.49-55
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• 2023

Aging is characterized by a gradual decline in biological functions, leading to the increased probability of diseases and deaths in organisms. Previous studies have identified biological factors that modulate aging and lifespan, including non-coding RNAs (ncRNAs). Here, we review the relationship between aging and tRNA-derived small RNAs (tsRNAs), ncRNAs that are generated from the cleavage of tRNAs. We describe age-dependent changes in tsRNA levels and their functions in age-related diseases, such as cancer and neurodegenerative diseases. We also discuss the association of tsRNAs with aging-regulating processes, including mitochondrial respiration and reduced mRNA translation. We cover recent findings regarding the potential roles of tsRNAs in cellular senescence, a major cause of organismal aging. Overall, our review will provide useful information for understanding the roles of tsRNAs in aging and age-associated diseases.

• BMB Reports
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• 제40권2호
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• pp.156-162
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• 2007

Two lysis-defective but DNA synthesis non-defective temperature-sensitive (ts) mutants of mycobacteriophage L1, L1G23ts23 and L1G25ts889 were found to be defective also in phage-specific RNA synthesis in the late period of their growth at 42$^{\circ}C$each to the extent of 50% of that at 32$^{\circ}C$The double mutant, L1G23ts23G25ts889 showed the ts defect in phage RNA synthesis that was nearly additive of those shown individually by the two single-mutant parents. Both G23 and G25 were shown to start functioning sometimes between 30 and 45 min after infection but the former gene might be dispensable after 45 min, while the latter was not. Northern analysis also shows that at 42$^{\circ}C$>, L1G23ts23 affects RNA synthesis more strongly than L1G25ts889 from L1 DNA segments that serve as the template for late gene transcription. Among the 21 virion and 12 non-virion late proteins synthesized by L1, L1G23ts23 is defective in the synthesis of at least 9 virion and all of non-virion proteins at 42$^{\circ}C$>. In contrast, L1G25ts889 is completely defective in synthesis of all the 33 late proteins. Possible roles of G23 and G25 in the positive regulation of transcription of different sets of late genes of L1 have been discussed.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권1호
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• pp.89-93
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• 1990

재조합 pBR322-trp$^+$ 플라스미드의 숙주내 안정적 유지를 목적으로 tRNA phe 의 구조유전자인 pheW$^+$ 유전자를 pBR322-trp$^+$의 플라스미드에 도입시키고, 숙주세포로는 트립토판 생산을 위한 정상숙주 LC901의 phenylalanyl tRNA synthetase 온도감수성 변이체인 LC901-pheS-ts를 구성하여 이 온도감수성 숙주의 제한온도 (restrictive temperature)에서 재조합 trp$^+$ 플라스미드의 안정적 유지와 trp$^+$ 유전자가 미치는 효과를 조사하였다.

• 한국발생생물학회:학술대회논문집
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• 한국발생생물학회 2003년도 제3회 국제심포지움 및 학술대회
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• pp.59-59
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• 2003

ADAM은 metalloprotease/disintegrin domain을 가진 transmembrane glycoprotein으로서 지금까지 30종류 이상의 ADAM 및 10종류 이상의 ADAM-TS 단백질이 알려져 있다. 이들의 기능은 포유동물의 수정 시 sperm-egg binding과 fusion, myoblast fusion, integrin과의 결합 등에 직접 관여하거나, TNF-alpha 등의 생체신호전달물질이 세포로부터 분비될 때에 이들의 구조를 변화시켜 활성화시키는 효소로서의 작용, 그리고 dendritic cell differentiation 등에 관여하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 난소가 제거된 생쥐를 이용하여 자궁조직의 ADAM-8, -9, -10, -12, -15, -17 그리고 -TS1의 gene의 발현이 $17 \beta $-estradiol에 의하여 조절되는 지를 알아보았다. 생후 6 - 8주 된 암컷 생쥐의 난소를 제거하고, 2 주 후에 $17 \beta $-estradiol ($E_2$), progesterone ($P_4$) 혹은 이 둘 혼합액 ($E_2 + P_4$)을 sesame oil에 녹여 근육주사하였다. 2, 6, 12 시간 후 각각 자궁 조직을 얻고 유전자의 발현 양상을 알아보기 위하여 시료로부터 total RNA을 추출하여 역전사 중합효소반응 (RT-PCR)을 실시하였다. Densitometry를 이용, rpL7에 대한 ADAMS의 mRNA 발현 양을 상대적으로 분석하였다. 그 결과 ADAM-8과 -15는 6시간째에서, ADAM-10과 -TS1은 2시간째에서 sesame oil을 주사하거나 $P_4$만을 주사한 군보다 E$_2$를 주사한 군에서 mRNA의 양이 현저하게 증가하였고 ADAM-12는 2시간째에서 ADAM-17은 12시간째에서 sesame oil을 주사하거나 $P_$만을 주사한 군보다 E$_2$를 주사한 군에서 mRNA의 양이 현저하게 증가하였다. 이러한 결과로 미루어 ADAM-8, -10, -15 그리고 TS1은 progesterone에 의하여, ADAM-12와 17은 $17 \beta $-estradiol에 의하여 유전자의 발현이 upregulation 되는 것으로 생각되어진다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제2권2호
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• pp.201-207
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• 1998

To evaluate the possibility that the ginseng saponins could be developed as an anti-arteriosclerotic agent, we examined the inhibitory effects of ginseng saponins (total saponin[TS], panaxatriol[PT], panaxadiol[PD]) on the expression of c-fos mRNA and the proliferation of cultured rat aortic vascular smooth muscle cells (VSMCs) stimulated by angiotensin II (Ang II). TS and PT (1.0 mg/ml) suppressed c-fos mRNA induction in VSMCs stimulated by $10^{-5}$ M Ang II. The order of inhibitory potency was PT>TS. Ginseng saponins ($0.01{\sim}1.0$ mg/ml) inhibited the proliferation of VSMCs stimulated by Ang II in a concentration dependent manner, the inhibitory potency was TS＞PT＞PD at $0.1{\sim}1.0$ mg/ml. These results suggest that ginseng saponins may suppress Ang II-stimulated proliferation of aortic VSMCs which can be seen in atherosclerosis, hypertension and restenosis.

• 생명과학회지
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• 제20권1호
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• pp.103-112
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• 2010

페메트렉시드(pemetrexed, $alimta^{(R)}$)는 중피종(mesothelioma)과 비소세포폐암 (non-small cell lung cancer)을 비롯한 다양한 암종에서 엽산(folate) 대사과정에 관여하는 대사물질의 활성을 억제하여 항암효능을 나타낸다. 다중표적 항암제 (multitargeted antifolate)인 pemetrexed는 엽산의 세포내 주요 이동통로인 reduced folate carrier(RFC)를 통해 세포 내로 유입된 후 folylpolyglutamate synthetase (FPGS)에 의해 폴리글루타민산염(polyglutamate) 유도체로 활성되고 thymidylate synthase (TS)와 dihydrofolate reductase (DHFR)를 표적하는 것으로 알려져 있다. 조직형이 서로 다른 비소세포폐암 세포주를 선정하여 pemetrexed의 대사과정에 관여하는 유전자들의 단일염기서열 다형성을 조사하고, mRNA와 단백질의 발현 정도를 비교하여 pemetrexed의 세포독성 효과와의 상관성을 분석하였다. 4개의 비소세포폐암 세포주인 A549, PC14, HCC-1588과 H226에서 RFC, FPGS, TS와 DHFR의 유전형을 조사하였다. Pemetrexed의 약물의 감수성을 알아보기 위해 real-time PCR과 Western blot 방법으로 mRNA 발현과 단백질 발현 정도를 비교하였고, SRB 법으로 약물에 대한 세포독성 효과를 측정했다. PC14 세포주와 H226 세포주에서는 약물처리 전 RFC와 FPGS의 mRNA 발현이 높은 것으로 나타났고, $IC_{50}$값이 각각 $0.08{\pm}0.01\;uM$과 $0.07{\pm}0.01\;uM$로 pemetrexed에 대한 감수성이 높은 것을 알 수 있었다. A549 세포주에서 TS의 유전형이 2R/2R일 때 mRNA발현이 증가하고 pemetrexed의 약물 저항성과 관련이 있었다. 반면, TS의 유전형이 3R/3R로 나타난 H226에서는 mRNA 발현이 낮은 것을 알 수 있었지만 pemetrexed의 높은 감수성과 관련이 있었다. 세포주 모두에서 pemetrexed 약물처리 후 DHFR의 mRNA 발현은 약물처리 전보다 낮아지는 경향을 보였지만 단백질 발현은 오히려 증가하는 상반된 결과를 보였다. 또한 DHFR 프로모터에 위치한 -1726C>T, -1188A>C SNP는 서로 연쇄 불평형 상태(linkage disequilibrium, LD)에 있었다. 연구결과에서 pemetrexed의 세포독성 효과는 약물 대사과정에 관여하는 여러 분자들의 유전형과 발현 정도에 의해 결정되는 것을 알 수 있었고, 다양한 분석결과를 토대로 항암효능을 평가하는 것이 필요하다고 생각된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권5호
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• pp.535-540
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• 1990

B.sphaericus ts-D1290의 특성을 정상균주 (B.sphaericus 1593)와 비교하기 위하여 방사성 동위원소를 이용하여 DNA, RNA 그리고 단백질 생합성량을 허용온도와 비허용온도에서 측정하고, 온도의 영향을 조사하였다. 1. ts-D1290 돌연변이주를 $30^{\circ}C$에서 배양하였을 때는 정상균주와 유사한 증식을 보였으나, 제한 온도인 $42^{\circ}C$에서는 거의 증식을 하지 않았다. 2. 온도를 $30^{\circ}C$에서 $42^{\circ}C$로 상승하여 배양하였을 때는 두 균주 모두 정상적인 높은 증식률을 보였으며, 온도를 $42^{\circ}C$에서 4시간 배양 후 $30^{\circ}C$ 하강하여 배양하였을 때는 정상균주는 정상적인 증식을 하였으나, ts-D1290 돌연변이주는 거의 증식을 하지 않았다.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 1986년도 추계학술대회
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• pp.521.1-521
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• 1986

B. sphaericus의 sporeless ts-D1216 돌연변이체의 유전학적 특성을 방사성 동위원소를 이용하여 DNA의 합성과 RNA의 합성을 측정하였고 일반적 특성을 연구하였다. ts-D1216 돌연변이체의 대수증식기 세포를 3$0^{\circ}C$에서 제한온도 (42$^{\circ}C$)로 이동시켰을 때 RNA의 합성은 4-5시간 정상적으로 합성이 계속 일어났고, DNA의 합성은 60-100분까지는 정상적인 율로 일어나다가 그 후에 결정적으로 감소되었다. 또한, DNA합성이 멈춘후에도 세포수는 증가했고, 4$0^{\circ}C$에서 성장기간이 더 길면 길수록 DNA합성에의 회복능력이 상실되었다.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 2005년도 춘계학술대회
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• pp.5-14
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• 2005

Recently, data from several groups have raised the concept of 'checkpoint' in transcription. As capping of nascent RNA transcript is tightly coupled to RNA polymerase II transcription, we seek to obtain direct evidence that transcripiton checkpoint via capping enzyme functions in this early regulatory step. One of temperature sensitive (ts) alleles of ceg1, a guanylyltransferase subunit of the Saccharomyces cerevisiaecapping enzyme, showed 6-azauracil (6AU) sensitivity at the permissive growth temperature, which is a phenotype that is correlated with a transcription elongational defect. This ts allele, ceg1-63 also has an impaired ability to induce PUR5 in response to a 6AU treatment. However, this cellular and molecular defect is not due to the preferential degradation of the transcript attributed from a lack of guanylyltransferase activity. On the contrary, the data suggests that the guanylyltransferase subunit of the capping enzyme plays a role in transcription elongation. First, in addition to the 6AU sensitivity, ceg1-63is synthetically lethal with elongation defective mutations of the largest subunit of RNA polymerase II. Secondly, it exhibited a lower GAL1 mRNA turn-over after glucoseshut off. Third, it decreased the transcription read through a tandem array of promoter proximal pause sites in an orientation dependent manner. Interestingly, this mutant also showed lower pass through a pause site located further downstream of the promoter. Taken together, these results suggest that the capping enzyme plays the role of an early transcription checkpoint possibly in the step of the reversion of repression by stimulating polymerase to escape from the promoter proximal arrest once RNA becomes appropriately capped.