• 한국수산과학회지
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• 제50권3호
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• pp.302-310
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• 2017

Interferon regulatory factor 8 (IRF8) is essential for the development of B and T cells, as well as for the activity of dendritic cells and macrophages. We performed molecular characterization of IRF8 from rock fish, Sebastes schlegelii (Ss), and investigated the spatial and temporal profile of mRNA expression after challenge with lipopolysaccharide (LPS), polyinosinic:polycytidylic acid (poly I:C), or Streptococcus iniae. The full-length cDNA sequence of SsIRF8 was 1,657 bp, containing an ORF of 1,266 bp. The gene had a predicted molecular mass of 47.7 kDa and an isoelectric point of 5.99. The amino acid sequence coded by this gene showed the highest degree of identity (90.8%) and similarity (96.2%) with IRF8 from Oplegnathus fasciatus. The SsIRF8 mRNA was expressed ubiquitously, at varying levels, with the highest level of expression observed in the spleen. To confirm the role of SsIRF8 in mediating the immune response, we measured SsIRF8 mRNA expression in the splenic tissue at different time points after injection with LPS, poly I:C, or S. iniae. The qRT-PCR results showed that SsIRF8 mRNA expression in the poly I:C-injected group was highly upregulated 6 hr after exposure (P<0.05). Expression of SsIRF8 mRNA in the S. iniae-injected group peaked at 24 hr. These results suggest that SsIRF8 might be important in regulating the strength of the rockfish immune response to immunostimulatory agents.

• 생명과학회지
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• 제23권2호
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• pp.190-196
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• 2013

멍게의 물렁증 발병으로 인해 멍게 양식에 커다란 타격을 받고 있는 가운데 물렁증 발병에 대한 분자적인 접근을 위해 정상 멍게와 물렁증 걸린 멍게에서 DEG 법을 수행하였다. 이번 연구에서 멍게의 당 생합성 효소인 PGK가 물렁증에 걸린 멍게 개체에서 발현이 감소하는 것을 다양한 실험을 통해서 확인하였다. PGK에 대한 유전자 서열을 확보함과 동시에 이 유전자의 발현에 영향을 미치는 부위인 프로모터를 클로닝 하였다. 프로모터 부위의 단일 염기 다형성 분석을 통해서 -106과 -254 위치의 염기에서 다형성이 일어나는 것을 확인하였다. 물렁증에 대한 저항성을 가진 멍게와 다른 개체군의 멍게와의 염기서열을 비교한 결과 많은 차이가 나타남을 확인하였다. 이러한 염기의 차이가 PGK의 발현에 영향을 미치는 지 확인하기 위해서 각각의 멍게 개체군에서 genomic DNA와 total RNA를 분리하여 genotyping과 RT-PCR을 수행하였다. 그 결과 -106과 -254 위치의 염기가 AA와 GT인 개체에서 PGK의 발현량이 상대적으로 많은 것을 확인할 수 있었다. 이러한 결과는 물렁증에 대한 저항성을 가진 멍게를 선발육종하기 위한 분자적인 마커의 개발에 활용됨으로써 물렁증 발병을 줄일 수 있음을 시사하였다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제27권8호
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• pp.1189-1195
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• 2014

Natural resistance-associated macrophage protein 1 encoding gene (NRAMP1) plays an important role in immune response against intracellular pathogens. To evaluate the effects of NRAMP1 gene on immune capacity in pigs, tissue expression of NRAMP1 mRNA was observed by real time quantitative polymerase chain reaction (PCR), and the results revealed NRAMP1 expressed widely in nine tissues. One single nucleotide polymorphism (SNP) (ENSSSCG00000025058: g.130 C>T) in exon1 and one SNP (ENSSSCG00000025058: g.657 A>G) in intron1 region of porcine NRAMP1 gene were demonstrated by DNA sequencing and PCR-RFLP analysis. A further analysis of SNP genotypes associated with immune traits including contain of white blood cell (WBC), granulocyte, lymphocyte, monocyte (MO), rate of cytotoxin in monocyte (MC) and $CD4^-CD8^+$ T lymphocyte subpopulations in blood was carried out in four pig populations including Large White and three Chinese indigenous breeds (Wannan Black, Huai pig and Wei pig). The results showed that the SNP (ENSSSCG00000025058: g.130 C>T) was significantly associated with level of WBC % (p = 0.031), MO% (p = 0.024), MC% (p = 0.013) and $CD4^-CD8^+$ T lymphocyte (p = 0.023). The other SNP (ENSSSCG00000025058: g.657 A>G) was significantly associated with the level of MO% (p = 0.012), MC% (p = 0.019) and $CD4^-CD8^+$ T lymphocyte (p = 0.037). These results indicate that the NRAMP1 gene can be regarded as a molecular marker for genetic selection of disease susceptibility in pig breeding.

• 한국임상수의학회지
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• 제27권5호
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• pp.501-507
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• 2010

본 연구는 국내 타일레리아에서 주요항원단백질(major surface protein) 유전자의 다양성을 분석해 보고자 수행되었다. 나아가 Msp 유전자의 다양성과 타일레리아의 병원성과의 관계도 분석하였다. 제주에 있는 목장으로부터 총 177마리의 한우 혈액을 공시재료로 사용하여 혈액검사와 18S rRNA를 표적으로 하는 PCR을 실행하였다. 그 후, 타일레리아 18S rRNA에 양성인 28마리 (16마리 빈혈군과 12마리의 정상군)를 무작위로 선발하여 Msp유전자의 염기 서열을 반복하여 분석하였다. 총 56개의 염기서열 결과는 다변성 부위(517-571 bp)에 따라 크게 type I에서 type V까지 5가지 형태로 나눌 수 있었는데, 이는 유전자은행(GenBank)에 등록되어 있는 다음의 유전자와 98.9% 이상 일치하였다 (Theileria spp. from China-EU584237; T. sergenti from China-DQ078264; Theileria spp. from Thailand-AB081329; Theileria spp. from Japan-AB218442; T. sergenti from Japan-AB016280). 그 분포는 22, 15, 9, 8, 2개가 각각 type I에서 V까지 분포하였고 빈혈과 관계없이 type I이 가장 많이 나타나는 것으로 밝혀졌다(37.5%의 빈혈군과 41.7%의 정상군). 나머지 type중에서는 type II가 빈혈군에서 가장 많이(37.5%) 나타났으며, 반면 type IV는 정상군에서 많이 (25%) 나타났다. 본 연구는 국내 타일레리아 Msp유전자의 다양성을 밝히는데 좋은 자료로 활용될 수 있을 것이다.

• 식물조직배양학회지
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• 제21권1호
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• pp.55-58
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• 1994

Agrobacterium-based vector를 이용하여 상추를 형질전환 및 재분화 하였다. 즉 $C_{a}$ MV 35S promoter와 GUS 유전자를 reporter로 가지고 있는 pBl121을 Agrobacterium tmfaciens LBA4404에 도입시킨 후 상추의 자엽 절편과 cocultivation을 통하여 형질전환 시키고 재분화 시켰다. Southern 및 Northern 분석을 통하여 형질 전환 및 재분화된 상추에 GUS 유전자가 안정하게 도입되고 식물체내에서 mRNA로 발현됨을 확인하였다. 또한 GUS 유전자가 식물 체내에서 단백질로 발현됨을 확인하기 위하여 상추 잎의 단백질 추출액을 이용하여 분광분석법에 의하여 GUS의 활성을 측정하였다. 시료간의 약간의 차이는 있으나 시료로부터 유의적인 GUS 활성을 확인하였다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제36권3호
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• pp.255-260
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• 2009

The translation elongation factor 1A, eEF1A, catalyzes the binding of aminoacyl-tRNA to the A-site of the ribosome by a GTP-dependent mechanism. By subtractive suppression hybridization technique, we have isolated a soybean low-temperature inducible gene, SLTI100 encoding translation elongation factor 1A. Multiple sequence alignments and phylogenic analysis showed that SLTI100 and other eEF1As originated from diverse organisms are highly conserved. RNA expression of SLTI100 was specifically induced by low temperature, high salt, ABA, or drought stress. Based on the subcellular localization of the corresponding gene product fused to GFP, we were able to confirm that SLTI100-GFP was restricted to the nucleus and cytoplasm. We propose that soybean eEF1A may play an important role in translational regulation during abiotic stress responses in plants.

• 대한한방부인과학회지
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• 제18권4호
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• pp.54-71
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• 2005

Purpose : The purpose of this research was to investigate the effects of Saurui Herba Seu Rhizoma(SHSR) on Anti-inflammatory properties in Raw264.7 cell line and murine models of inflammation. Methods : To investigate the effects of Saurui Herba Seu Rhizoma(SHSR) on anti-inflammation, we study cytotoxicity effects of SHSR on Mouse Lung Fibroblast Cells and Peritoneal Macrophages, Inhibitory effects of SHSR on the nitric oxide (NO) release, the ROS production, and the interleukin-6 production. Results : The cytotoxicity of SHSR on mouse lung fibroblast Cells and Raw264.7 cell line was not observed. SHSR in RAW264.7 cell line inhibited $IL-1{\beta}$, IL-6 mRNA gene expression depending upon the concentrations of extract and inhibited IL-18 mRNA gene expression at 100 ${\mu}g/ml$ of extract. SHSR in RAW264.7 cell line inhibit COX-2 mRNA gene expression at 100, 10 ${\mu}g/ml$ of extract. SHSR in RAW264.7 cell line inhibited NOS-II mRNA gene expression depending upon the concentrations of extract. SHSR in RAW264.7 cell line didn't inhibit $TNF-{\alpha}$ mRNA　gene expression. SHSR in RAW264.7 cell line decreased IL-6 production depending　upon the concentrations of extract. SHSR in RAW264.7 cell line decreased $ITNF-{\alpha}$ production according to the concentrations of extract. SHSR in RAW264.7 cell line inhibited NO release specially SHSR 100, 10 ${\mu}g/ml$ concentrations of extract. SHSR inhibit ROS production depending upon the concentrations of extract. Conclusion : These results suggest that SHSR can be used treating a lot of women disease caused by inflammation.

• Ocean and Polar Research
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• 제43권4호
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• pp.371-374
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• 2021

Triglopsis quadricornis Linnaeus, 1758 (Cottidae) is distributed in the Atlantic and Arctic and has four unique bony protuberances on its head. Here, we report the complete, circular, and annotated mitochondrial genome of T. quadricornis. The complete T. quadricornis mitochondrion was sequenced by high-throughput Illumina HiSeq platform. The sequences are 16,736 bp in size and contains 13 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA (tRNA) genes, a control region, and large and small ribosomal subunits. The overall genomic structure of T. quadricornis mitochondrion was conserved with the gene arrangement of Megalocottus and Myoxocephalus species, and phylogenetic analysis supports their sister relationships. Most PCGs consist of TAA or TAG as a termination codon, whereas COII, ND4, and CYTB have T-- as a stop codon. This complete mitochondrial DNA information of T. quadricornis will provide an essential genomic resource to elucidate the phylogenetic relationship and evolutionary history of the family Cottidae.

• 미생물학회지
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• 제54권4호
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• pp.309-319
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• 2018

이전의 연구에서 질소원이 존재하여도 페로몬을 유도하는 6개의 Schizosaccharomyces pombe 돌연변이체를 온도민감성 돌연변이체들의 저장고로부터 분리하였음이 보고된 바 있다. 본 연구에서는 이들 중 하나인 pws6 돌연변이체의 특성을 더 연구하였다. 이 돌연변이체는 영양물질에 특이적으로 페로몬 유도를 나타내었다. 즉 질소의 고갈은 없어도 M-factor 페로몬을 유도하였으나 탄소의 고갈이 없으면 유도되지 않았다. 이러한 결과는 pws6 돌연변이체가 질소 고갈을 전달하는 경로에 특이한 결함을 가지고 있음을 시사한다. 이 돌연변이체는 M-factor 페로몬뿐만 아니라 P-factor 페로몬도 온도에 민감한 양식으로 질소의 고갈 없이 유도함을 보여 주어 이 돌연변이체의 페로몬 유도는 세포 유형에 특이적이지 않음을 시사하였다. 이 돌연변이체의 온도 민감성 성장 결함의 상보적 보완에 의해 $pws6^+$ 유전자를 클로닝하여 8.1 kb, 3.3 kb, 그리고 4.8 kb 효모 DNA를 가진 3개의 플라스미드가 분리되었다. 이 플라스미드들은 pws6 돌연변이체의 성장 결함을 각각 100%, 70%, 그리고 10-20% 보완하였다. 또한 이 플라스미드들은 pws6 돌연변이체의 페로몬 유도 특성을 보완하는 능력을 가지고 있었으며 이는 돌연변이체의 성장 결함 보완 효율과 밀접한 연관성이 있음을 보여 주었다. 이들의 오픈 리딩 프레임을 성장 결함의 보완 효율과 비교하여 오픈 리딩 프레임 SPBC19C7.06이 pws6 돌연변이체의 온도 민감성 특성을 상보적으로 보완하는데 원인이 되는 리딩 프레임으로 결론 내렸다. 이 오픈 리딩 프레임은 prs1으로 명명되었으며 인트론이 없이 하나의 긴 엑손을 가지고 있는 추정된 prolyl tRNA synthetase를 암호화한다. 추정된 Prs1 단백질은 다른 종의 prolyl tRNA synthetase와 상당한 유사성을 보여 주었다.

• 생명과학회지
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• 제19권12호
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• pp.1802-1807
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• 2009

Platycodi radix의 주요 성분으로 항염증, 항고지혈 및 항종양 등 다양한 약리적 기능을 가지는 platycodin D는 최근 비만 및 지방세포형성(adipogenesis)을 억제하는 효과를 가진다고 보고되고 있다. 본 연구에서는 adipogenesis의 상위단계에 위치한 다양한 pro-adipogenic regulators와 anti-adipogenic regulators의 발현이 platycodin D에 의해 어떻게 변화되는지 분석하였다. Real-time PCR을 이용한 mRNA 발현의 정량적 분석에서 adipogenesis의 marker라 불리는 ADIPOQ와 GLUT4의 mRNA 발현은 platycodin D의 처리에 의해 유의적으로 감소되었다. 또한 terminal marker의 발현을 조절하는 PPAR$\gamma$와 C/EPB$\alpha$의 mRNA 발현 역시 platycodin D에 의해 유의하게 억제되었다. Platycodin D의 지방세포 억제 효과에 대한 상세한 분자적 메커니즘을 규명하기 위해, PPAR$\gamma$와 C/EPB$\alpha$의 상위 조절자들의 mRNA 발현 변화를 분석하였다. Pro-adipogenic regulators에 대한 platycodin D의 효과를 분석한 결과, C/EBP$\beta$와 C/EPB$\delta$의 mRNA 발현은 platycodin D에 의해 변화가 없었던 반면, KROX20과 KLF15의 mRNA 발현은 각각 초기 분화(2일)와 후기 분화(4일)에서 platycodin D에 의해 유의한 감소를 보였다. 또한, 대표적인 anti-adipogenic regulators인 CHOP의 mRNA 발현은 초기분화에서 platycodin D에 의해 유의하게 증가한 반면, 또 다른 anti-adipogenic regulators인 C/EBP$\gamma$의 mRNA 발현은 platycodin D에 의해 영향을 받지 않았다. 따라서 adipogenesis 과정에서 platycodin D는 pro-adipogenic regulators인 KROX20, KLF15와 anti-adipogenic regulator인 CHOP의 mRNA 발현에 영향을 주어 PPAR$\gamma$와 C/EPB$\alpha$를 조절하는 것으로 보여진다. 결론적으로, platycodin D에 의한 adipogenesis 억제 효과는 KROX20, KLF15 등의pro-adipogenic regulator와 CHOP 등의 anti-adipogenic regulator의 상호작용을 통해 나타나는 결과라 사료된다.