• 제목/요약/키워드: strains G5 and G7H

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Complete Genome Sequences of the Genomic RNA of Soybean mosaic virus Strains G7B and G5

  • Kim, Kook-Hyung;Lim, Won-Seok;Kim, Yul-Ho
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제19권3호
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    • pp.171-176
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    • 2003
  • The complete nucleotide sequences of the genomic RNAs of Soybean mosaic virus strains GS (SMV-G5) and G7H (SMV-G7H) were determined and compared with sequences of other SMV strains. Each viral RNA was determined to be 9588 nucleotides in length excluding the poly (A) tail and contained an open reading frame to encode a polyprotein subsequently processed into up to ten proteins by proteolytic cleavage. Com-parison of the amino acid sequences with those of other SMV strains showed high percentage of amino acid sequence homology with the same genome organization. The nucleotide and the deduced amino acid sequences between SMV-G5 and SMV-G7H were greater than 99% identity. When compared with those of other SMV strains in a phylogenetic analysis of the nucleotide and deduced amino acid sequences, they formed a distinct virus clade showing over 97% amino acid identity, but were more distantly related to the other potyvirus (44.1-69.6% identity). Interestingly, SMV G7H strain caused a severe mosaic or necrosis symptom in soybean cultivars including Jinpum-1, Jinpum-2, and Sodam, whereas, no symptom was observed in SMV-G5 inoculation. Complete nucleotide sequences of these strains will give clues for determining symptom determinant(s) in future research.

Isolation and Identification of Staphylococcus sp. from Korean Fermented Fish Products

  • Um, Mi-Na;Lee, Cherl-Ho
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제6권5호
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    • pp.340-346
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    • 1996
  • In order to find out if staphylococci occur in significant numbers in Korean fermented fish products, a total of 40 different fermented fish products were collected from different markets in Korea and analyzed for their physico-chemical and microbiological states. The pH, salt concentration and water activity of the products were measured and the total viable cell count and the number of Staphylococcus grown on mannitol salt agar were determined. The identification of the strains of Staphylococcus were made by API Staph Strip and MIS identification kits, and the physiological properties of the identified strains were further characterized by different conventional methods. The pH, salt content and water activity of fermented fish samples varied widely from 4.8 to 7.1, 7.4-28.7$%$ and 0.77-0.84, repectively, depending on the type of product. The total viable cell count varied from $10^4-10^9$ cfu/ml, and most of the samples had $10^5-10^6$ cfu/ml No correlation was found between the viable cell count and the pH, NaCl concentration and water activity of the samples. Among the 35 colonies identified as Staphylococcus strains by the identification kits, S. xylosus was the most frequently occurring strain marking 17, and S. warneri was 8, S. epidermidis 4 and S. cohnii 2. S. hominis, S. saprophyticus, S. haemolyticus and S. aureus were also identified once each. In some samples (K-3, P-6, K-8, G-5 and G-10), 2-3 different species of Staphylococcus were found. Considering the region of sampling, among the 10 samples from Kunsan 5 were identified as S. warneri, while in the other regions S. xylosus was predominant. Although the physiological characteristics of the identified strains were generally consistent with those in Bergey's Manual, some discrepances were also observed. All the strains were highly salt tolerant, growing in the media containing over 18$%$ NaCl. All the strains except S. aureus (G-11) showed negative in hemolysis activity, plasma coagulation and DNase tests. All the strains including S. aureus (G-11) showed negative in enterotoxin test.

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사상균에 의한 구연산발효에 관한 연구 (제III보) 선정균에 의한 구연산발효 (Studies on the Citric Acid Fermentation with Fungi (Part III) Citric Acid Fermentation with Selected Strains)

  • 성낙계;김명찬;심기환;정덕화
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제8권3호
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    • pp.181-191
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    • 1980
  • 전보에서 분리선정된 균의 발효조건 및 각종첨가물의 영향을 검토하고 배양물을 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 선정균의 최적배양 조건은 표면배양의 경우, M-80은 sucrose 140g, (N $H_4$)$_2$S $O_4$3.0g, K $H_2$P $O_4$1.5g, MgS $O_4$.7$H_2O$ 0.25g, F $e^{++}$ 3.0mg, $Zn^{++}$ l.0mg, D. W. 1ι, pH 5.0 이었고, M-315는 sucrose 140g, N $H_4$N $O_3$2.0g, K $H_2$P $O_4$1.0g, MgS $O_4$. 7$H_2O$ 0.25g, F $e^{++}$ 2.0mg, $Zn^{++}$ 2.0mg, C $u^{++}$ 0.05mg, D. W. 1ι pH 4.5 이였으며, M-315의 액내배양의 경우 sucrose 140g, N $H_4$N $O_3$2.5g, K $H_2$P $O_4$1.5g, MgS $O_4$.7$H_2O$ 0.3g, F $e^{++}$ 3.0mg, $Zn^{++}$ 3.0mg, C $u^{++}$ 0.1mg, D. W. 1ι, pH 4.5이었다. 배양온도는 28~3$0^{\circ}C$, 포자접종량은 배양액에 $10^{7}$ -$10^{8}$ 개/ml 접종하였을 때 산생성이 가장 좋았다. 2. 선정균의 생육상태와 산생성관계를 경시적으로 조사한 결과 배양 3~4일 후에 균체의 증식은 거의 끝나고 pH는 2.0이하로 저하되었으며 구연산은 이때부터 급속히 축적되기 시작하여 표면배양의 경우, M-80은 8일, M-315는 9일, M-315의 액내배양의 경우는 10일간 배양하였을 때 구연산생성량이 최고치에 달하였다. 3. Methanol의 첨가는 구연산생성에 좋은 영향을 미쳤으며 표면배양의 경우 M-80, M-315의 배양액에 2.0%, 3.0% 첨가하였을 때 카곽 6.5%, 20%의 수율이 향상되었고, M-315의 액내배양액에는 3.0%의 첨가로 5.0% 의 수율이 향상되었다. 4. 최적조건하에서 발효시킨 분리균의 배양물을 분석한 결과 대부분이 구연산만을 선택적으로 축적하고 있었고, 표면배양의 경우 M-80, M-315 배양액에 각각 72.1mg/ml, 98.1mg/ml이, M-315의 액내배양액에는 59.8mg/ml 구연산이 정량되었다.

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노루궁뎅이버섯류의 톱밥재배와 항산화물질 비교 연구 (Comparative Study on the Sawdust Cultivation and the Antioxidants of Hericium spp.)

  • 유성열;이위영;가강현
    • 한국균학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.80-85
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    • 2009
  • 신품종 개발을 위한 예비조사로써 본 연구는 국립산림과학원에서 보존중인 노루궁뎅이류의 균주를 이용하여 균사생장을 위한 최적온도, 신갈나무에 톱밥재배, 황산화 활성물질인 ergothioneine와 polyphenols에 대해 조사하였다. 노루궁뎅이의 균사생장 최적온도는 $20^{\circ}C$에서 KFRI 842, $25^{\circ}C$에서 5개 균주(KFRI 507, 508, 509, 843, 845), $30^{\circ}C$에서 2균주(KFRI 582, 844) 이었다. 산호침버섯의 균사생장 최적온도는 $25^{\circ}C$ 이었다. 노루궁뎅이류 9개 균주중 4개(KFRI 508, 843, 844, 713)는 $25^{\circ}C$에서 20일내에 직경 85 mm의 페트리디쉬 PDA 배지를 채웠다. 그리고 나머지 균주들은 페트리디쉬를 채우는데 더 많은 시간이 필요하였다. 노루궁뎅이의 버섯 생산량은 $149{\sim}205$ g 범위 이었고 자실체 건물율은 $7{\sim}9%$ 이었다. 산호침버섯은 261 g 이었고 건물율은 10% 이었다. 노루궁뎅이의 ergothioneine과 polyphenols는 $1.6{\sim}3.7$ mg/g과 $5.9{\sim}7.8$ mg/g 이었고, 균주별로 차이가 있었다. 산호침버섯은 1.7mg/g의 ergothioneine과 3.9mg/g의 polyphenols를 함유하고 있었다. Ergothioneine과 polyphenols은 균주 간 두 성분의 함량 차이는 나타났으나 함량비는 차이가 없었다($R^2$= 0.1).

정어리 내장세균의 특성과 균체외 단백분해효소에 관한 연구 (Characteristics of Intestinal Microflora and Their Extracellular Pretense of Sardine, Sardinops melanosticta)

  • 장동석;조학래;최승태
    • 한국수산과학회지
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    • 제17권3호
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    • pp.184-190
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    • 1984
  • 매년 정어리의 어획량은 많으나, 선도저하 속도가 빨라서 대부분 어분등 비식용으로 소비되고 있다. 따라서 정어리의 빠른 선도저하에 대한 세균학적 원인규명의 일환으로 정어리 내장세균의 조성을 밝히고 단백질 분해능이 강한 세균을 분리하여 그 균의 배양학적 특성과 생성 효소의 최적 활성조건을 실험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 신선된 정어리 내장에서 분리된 세균은 대부분 내냉성 중온세균이었고, 생균수는 $25^{\circ}C$의 호기적조건하에서 배양했을 때, $1.7{\times}10^4{\sim}3.6{\times}10^5/g$이었고, 혐기적조건하에서는 $2.9{\times}10^4{\sim}5.5{\times}10^5/g$이었으며, $18{\sim}20^{\circ}C$에서 48시간 방치한 시료에서는 호기성균이 $1.3{\times}10^7{\sim}5.5{\times}10^8/g$이었고, 혐기성균은 $3.8{\times}10^7{\sim}3.3{\times}10^8/g$으로 나타났다. 2. 신선한 시료에서 분리된 280 균주중에서 단백질 분해능이 있는것은 $20\%$였고, 지방분해능이 있는 것은 $62.5\%$, $H_2S$를 생성하는 것은 $10.5\%$였다. 또 상온에서 48시간 방치한 시료에서는 213 균주중 110균주가 단백질 분해능이 있었다. 3. 신선한 정어리의 내장에는 Moraxella spp.와 Pseudomonas spp.이 각각 $31.4\%,\;28.6\%$로 주종을 이루고 있었으며, 이외 Flavobacterium-Cytophaga spp., Vibrio spp., Acinetobacter spp.등이 각각 $6{\sim}8\%$로 비교적 많은 편이며, 이외 $2\%$ 내외로 차지하는 세균종류가 수종있었다. 4, 분리된 280 균주중에서 단백질분해능이 제일 강한 균주는 Pseudomonas 101이었으며, 균의 발육 최적조건은 $25^{\circ}C$, pH7.5이었고 generation time은 76분이었다. 5. Pseudomonas 101 균주가 생성한 효소는 alkaline protease였으며, 효소의 활성 최적조건은 pH 9.0, $53^{\circ}C$였으며 pH $5.0{\sim}11.0$, 온도 $30{\sim}50^{\circ}C$ 범위에서는 효소활성이 강했다.

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Polygodial의 식품 오염 진균에 대한 항균 활성과 그 활성능에 미치는 온도 및 pH의 영향 (Antifungal Activity of Polygodial against Food-Contaminants and Effects of Temperature and pH on the Action)

  • 이재란;이상화;홍순덕
    • 생명과학회지
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    • 제8권4호
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    • pp.421-425
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    • 1998
  • 식품양념으로 사용되고 있는 Polygonum hydropiper로부터 분리된 polygodial의 향진균 활성은 Saccharomyces cerevisiae 4균주, Zygosaccharomyces 속의 3균주, 그리고 Aspergillus 속의 5균주를 포함하는 식품 오염균들에 대해 그 MIC와 MFC들을 측정하여 조사되었다. 모든 효모성 진균들은 $3.13{\mu}g$/ml이하의 MIC와 MFC를 갖는 강한 항진균감수성을 나타내었다. 또한 polygodial의 항진균활성에 대한 다양한 온도와 pH들의 효과가 S.cerevisiae를 대상으로 조사되었다. $4^{\circ}C$에서, polygodial의 살균활성(MFC)은 배양 시간과 함께 점진적으로 증가하여 5기간만에 최고($3.13{\mu}g$/ml의 MFC)에 도달하였다. 30-$45^{\circ}C$의 온도 범위에서, polygodial의 살균활성은 온도 상승에 비례적으로 증가하였으며 특히 $45^{\circ}C$에서는 $0.1{\mu}g$/ml의 농도에서도 가능하였다. 한편 배지 pH는 또한 polygodial의 항진균 활성에 큰 영향을 주는 것으로 나타났다. 즉, 중성에 비해 산성(pH 3) 및 염기성(pH 9) 배지는 polygodial의 항진균(정균 및 살균)활성을 각각 8배, 2배 상승시켰다.

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여름철 부산시 소재 해수욕장 해수의 용혈성 비브리오균 분포 (Distribution of Hemolytic Vibrio sp. in Sea Water of the Beaches of Busan During Mid-summer)

  • 김영만;김민우;오은경;권은선
    • 한국수산과학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.293-299
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    • 2007
  • The distribution of hemolytic Vibrio sp. from sea water of three main beaches located in Busan (Gwangan(G), Haeundae(H) and Songjeong(S) beaches) was investigated from June to September 2006 ; this is mid-summer and the main season for bathing. The monthly detection ratio from each beach was 29.2% (7 of 24 samples, G), 33.3% (8 of 24 samples, H), and 16.7% (4 of 24 samples, S). The most probable number(MPN) of strains detected ranged from 1.8-36(G), 1.8-180(H) and 1.8-18(S) MPN/100mL. Of the isolated strains, 24 strains showed definite hemolytic activity. These 24 strains were identified as Vibrio fluvialis, Vibrio vulnificus, Aeromonas hydrophila, Actinobacillus ureae and Eikenella corrodens. Vibrio fluvialis was detected from all three beaches investigated. Vibrio vulnificus was detected from Haeundae and Gwangan beaches. Gwangan beach had a higher detection ratio of Vibrio sp. than Haeundae and Songjeong beaches. These results suggest that seafood harvested from the vicinity of theses beaches may cause food poisoning and risk management to prevent Vibrio septicemia is required, especially for Haeundae and Gwangan beaches.

한국인으로부터 분리한 비피더스균의 특성과 Bifidobacterium longum A-2의 임상실험에 관한 연구

  • 김영찬
    • 한국축산식품학회:학술대회논문집
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    • 한국축산식품학회 1998년도 추계학술발표회
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    • pp.83-106
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    • 1998
  • 본 실험은 건강한 한국인의 분변으로부터 분리한 20종과 상업종균 3종을 대조군으로 하여 비피더스균의 특성을 내산성, 내담즙성, 발효특성, 생존성, 콜레스테롤 분석, 항미생물 분석, 항돌연변이 분석, Phagocytosis 분석, $TNF-{\alpha}$ 및 IL-6 분석치를 균주간 비교 분석하였다. 또한 비피더스균의 균주간 비교 분석 결과 최종 선정한 Bifidobacterium longum A-2의 임상실험에 의한 장내 변화를 분석하고자 건강한 한국인 성인 7명(남성, 평균 연령 36세)를 대상으로 Bif. longum A-2를 냉동건조한 분말($5.0{\times}10^9/g$/회)로 매일 식후 2회 7일간 섭취후 분변을 검색하였다. 분변검사 횟수는 총 4회로 비피더스균 섭취 7일전, 1일전, 섭취 7일중, 절식 14일후에 실시하였다. 비피더스 균주간 특성 비교 결과와 Bif. longum A-2의 임상실험 결과는 다음과 같다. 1. 내산성에서는 2균주(A-2, A-9가, 내담즙성에서 6균주(A-2, A-5, A-13, A-14, A-18, A-22) 균주가 높게 나타났다. 2. pH, TA, 비피더스균수를 비교한 발효특성에서는 6균주가 pH 4.5이하, TA 0.90이상으로 나타났으며 , A-23 균주는 젖산에 대한 초산의 생성이 가장 낮았다. 특히 A-2의 탄수화물 이용성에서 젖산에 대한 초산의 비율이 가장 낮은 것은 Mannitol로 분석되었다. 3. 생존성에서는 A-2가 상업종균 A-22에 비하여 $4^{\circ}C$, $20^{\circ}C$ 보관중에서도 감소 경향이 적어 안정성이 있는 것으로 나타났다. 4. 콜레스테롤 분석에서는 5균주(A-8, A-10, A-11, A-12, A-20)가 30% 이상 감소시켜 콜레스테롤 저하 효과가 매우 높게 나타났다. 5. E. coli, Sta. aureus, Pseudo. flores에 대한 항미생물 분석에서 Sta. aureus에 대하여 A-1, A-2가 높게 나타났다. 특히 pH를 조정하여도 Sta. aureus에 대하여 항미생물 작용이 높게 나타난 A-20균주는 추가실험의 가치가 있을 것으로 판단되었다. 6. 항돌연변이 분석에서는 돌연변이원인 NQO와 IQ에 대하여 공히 70%이상 항돌연변이작용을 나타낸 A-2, A-12 및 A-23균주가 높게 나타났다. 7. 면역능 분석은 phagocytosis, $TNF-{\alpha}$ 생성, IL-6 생성에 있어서 균주 4종(A-1, A-5, A-9,A-20)이 높게 나타났으며 그중에서도 A-5균주는 매우 높은 수치를 보였다. 8. Bif. longum A-2 식이에 따른 장내 비피더스균의 변화는 섭취 7일전 $1.0{\times}10^8$, 섭취 1일전 $1.1{\times}10^8$, 섭취 7일중 $2.5{\times}10^8$, 절식 14일후 $1.8{\times}10^8$으로 검출되어 섭취전에 비해 섭취중과 절식후에 비피더스균수는 유의성(P<0.05)이 있게 증가하였고 피험자에 따라서도 비피더스균수는 고도로 유의성(P<0.01)이 있게 증가하였다. 9. Bif. longum A-2의 섭취후 장내세균에 의해 생성되는 대장암 유발성 효소인 ${\beta}-gucuronidase$의 변화는 섭취 7일전 $14.148\;{\mu}g/hr/g$, 섭취 1일전 $13.447\;{\mu}g/hr/g$, 섭취 7일중 $8.123\;{\mu}g/hr/g$, 절식 14일후 $10.612\;{\mu}g/hr/g$으로 검출되어 섭취전에 비해 섭취중과 절식후 고도로 유의성(P<0.01)있게 감소하였고 피험자에 따라서도 유의성(P<0.05)이 있게 감소하였다. 10. 한편 lactobacilli, Enterobacteriaceae, Clostridium pefringens, pH, 암모니아의 변화는 유의 성이 없었다. 11. 임상실험에서 BS 배지에서 성장한 colony의 당발효성을 검색한 결과 식이로 섭취한 Bif. longum A-2의 당발효성과 동일하게 나타난 점으로 보아 경구 섭취한 Bif. longum A-2는 살아서 장까지 도달하며 장내에 정착할 수도 있을 것으로 추정되었다. 상기 결과와 같이 비피더스균주간 특성을 비교한 결과 많은 특성에서 좋은 결과를 나타낸 Bif. longum A-2 균주를 최종적으로 선발하게 되었고 이 균주가 외국의 상업종균과 특성의 비교에의의가 있었다. 또한 본 연구는 한국인으로부터 분리한 Bif. longum A-2에 대하여 한국인을 대상으로 임상실험에서 장내의 변화를 검증한 점에서 의의가 있었다.

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전통발효식품에서 Cholesterol Oxidase를 생산하는 미생물의 분리 및 효소생산에 관한 연구 (Studies on the Isolation of the Cholesterol Degrading Enzyme Producing Microorganism from Traditional Fermented Foods and the Culture Condition for the Production of the Enzyme)

  • 박상현;권익부;함영태;신동훈;전억한
    • KSBB Journal
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    • 제13권4호
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    • pp.343-351
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    • 1998
  • About 75 strains which utilize cholesterol as sole carbon and energy source were isolated from 10 samples of Kimchi and 18 samples of fermented fish food (2 Ojingo-jeots, salt-fermented squid ; 5 Changran-jeots, salt-fermented pollack tripe ; 5 Myungran-jeots, salt-fermented Alaska pollack roe ; 3 Gajami-sikhae-jeots, fermented flat fish ; 2 Gul-jeots, salt-fermented oyster ; a Juneo-jeots, salt-fermented shad). Among them tested, the 3T6-5Mj strain isolated from Changran-jeot showed the highest activity on cholesterol degradation. The optimal composition of medium for the producing cholesterol degradation enzyme by 3T6-5Mj strain was 1.0 g/L NH4NO3, 1.0 g/L K2HPO4, 0.1 g/L MgSO4.7H2O, 1.0 g/L FeSO4.7H2O, 1 g/L NaCl, 5 g/L Trypton, 1 g/L Cholesterol, and 5 g/L Maltose at 30$^{\circ}C$, pH 7.5, and the enzyme production reached a maximum level at 140 hours of cultivation.

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속간 원형질체 융합에 의한 섬유질 기질로부터 L-lysine 생산균주 개발 -원형질체의 형성 및 재생 - (Development of L-Lysine Producing Strains from Cellulosic Substrate by the Intergeneric Protoplast Fusion- Conditions for Formation and Regeneration of Protoplast -)

  • 성낙계;정덕화;이무영;정영철
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.150-155
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    • 1988
  • L-Lysine 생산균주인 Brevibacterium flavum ATCC 14067 과 Corynebacteriurn glutamicum ATCC13032에 섬유소 자화능이 우수한 Cellulomonas flavigena KFCC31221를 속간 융합시켜 섬유소로부터 L-lysine을 생산할 목적으로 이들 균주의 영양요구성 변이주 분리, 원형질체의 형성 및 재생의 조건을 조사하였다. NTG(500$\mu\textrm{g}$/$m\ell$)로 유기하여 penicillin-G(300$\mu\textrm{g}$/$m\ell$)로 농축한 변이주에서 B. flavum은 hse- str$^{r}$(100$\mu\textrm{g}$/$m\ell$), C. glutamicum는 Met$^{-}$T$hr^{-}$ Rif$^{r}$(5$\mu\textrm{g}$/$m\ell$), C. flavigena 는 T$hr^{-}$Val$^{-}$Kan$^{r}$(50$\mu\textrm{g}$/$m\ell$)의 gene marker를 가지는 영양요구성과 약제내성균주를 분리하였다. 공시균주의 원형질체 형성은 osmotic stabilizer로서는 0.5M sucrose, 배양기간은 대수증식기 중기의 균이 양호하였고, lysozyme 최적 처리 pH, 온도, 농도 및 반응시간은 각각 pH6.5, 33$^{\circ}C$, 500 $\mu\textrm{g}$/$m\ell$, 6시간으로 나타났으며, 이때의 원형질체형성율은 95-98%였다. 원형질체를 1.5% agar가 함유된 완전재생용 배지위에 0.7% agar가 함유된 완전재생용 배지로 중층했을 때 약 30~33%의 재생율을 보였다.

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