Park, Jong-hyeon;Song, Jae-young;Lee, Jung-bok;Hyun, Bang-hun;An, Soo-hwan;Jun, Moo-hyung
Korean Journal of Veterinary Research
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v.32
no.4
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pp.597-603
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1992
To elucidate the molecular genetical properties of the canine parvoviruses isolated from the diseased puppies in the regions of Kyunggi and Chungnam provinces, the replicative form (RF) DNA of four field isolates were compared with those of two attenuated vaccine strains and a reference strains of CPV by restriction endonuclease analysis (REA). REA by Hinf I showed that three CPV isolates except CPV-V15 had an identical banding pattern with two vaccine strains, one standard strain and feline panleukopenia virus (FPLV). In CPV-V15 strain the fourth fragment of DNA with 800 bp was deleted. REA by Bgl II and Pst I indicated that CPV-V15 and FPLV had a bigger second fragment than those of the other strains of CPV. Meanwhile REA by Bam HI revealed that all the field isolates and vaccine strains used in this experiment showed similar banding patterns.
Event-specific real-time polymerase chain reaction (PCR) detection method for genetically modified (GM) maize MIR604 was developed based on integration junction sequences between the host plant genome and the integrated transgene. In this study, 2 primer pairs and probes were designed for specific amplification of 100 and 111 bp DNA fragments from the zSSIIb gene (the maize endogenous reference gene) and MIR604. The quantitative method was validated using 3 certified reference materials (CRMs) with levels of 0.1, 1, and 10% MIR604. The method was also assayed with 14 different plants and other GM maize. No amplification signal was observed in real-time PCR assays with any of the species tested other than MIR604 maize. As a result, the bias from the true value and the relative deviation for MIR604 was within the range from 0 to 9%. Precision, expressed as relative standard deviation (RSD), varied from 2.7 to 10% for MIR604. Limits of detections (LODs) of qualitative and quantitative methods were all 0.1%. These results indicated that the event-specific quantitative PCR detection system for MIR604 is accurate and useful.
Purpose: This research is to find a solution for educational work on high blood pressure control in public health centers by analyzing their current status. Method: It analyzed data from 133 public health centers that had been doing educational work on high blood pressure, through a questionnaire. Also, it developed recommendations by converging opinions from an expert group made of 25 people with nominal group technique. Result: The educational methods of public health centers did not make any approach to get to the goal of the work. The mass media education and campaign activities for the general public had just temporary and passive propensities. In education for patients, it did not use appropriate methods to present management techniques for diagnosis process of patients, medication management, self monitoring BP, and risk factors. Pocket book for monitoring high blood pressure was not focused on self-recording for self-management. The expert group recommended that educational materials for adults should be developed focusing on treatments and observance of risk factors through daily living, and those for children should be focused on basic understanding about diseases, and life style. Conclusion: Presenting direction and strategy of fundamental education work is needed for public health centers by giving them standard educational guidelines of managing high blood pressure nationally, and it is desirable that fundamental frameworks of educational materials should be developed and distributed by professional groups nationally.
Objective: The present study is aimed at phenotypic characterization and mitochondrial d-loop analysis of indigenous "Diara" buffalo population, which are mostly confined to the villages on the South and North Gangetic marshy plains in the Bihar state of India. These buffaloes are well adapted and are best suited for ploughing and puddling the wet fields meant for paddy cultivation. Methods: Biometric data on 172 buffaloes were collected using a standard flexible tape measure. Animals are medium in size; the typical morphometric features are long head with a broad forehead and moderately long and erect ears. Genomic DNA was isolated from unrelated animals. The mtDNA d-loop 358-bp sequence data was generated and compared with 338 sequences belonging to riverine and swamp buffaloes. Results: Based on the mitochondrial d-loop analysis the Diara buffaloes were grouped along with the haplotypes reported for riverine buffalo. Sequence analysis revealed the presence of 7 mitochondrial D loop haplotypes with haplotype diversity of 0.9643. Five of the haplotypes were shared with established swamp breeds and with Buffalo population of Orissa in India. Conclusion: Morphometric analyses clearly shows distinguishing features like long and broad forehead which may be useful in identification. The germplasm of Diara buffalo is much adapted to the marshy banks of river Ganga and its tributaries. It constitutes a valuable genetic resource which needs to be conserved on priority basis.
Myoung, Se Hun;Woo, Min-Su;Min, Won Gi;Park, Joo Myun
Fisheries and Aquatic Sciences
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v.25
no.9
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pp.489-497
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2022
The first specimen (54.8 mm standard length) of Ernogrammus zhirmunskii Markevich & Kharin, 2011, belonging to the family Stichaeidae, was recorded in Dokdo, East Sea, Korea on July 26, 2021. This species was characterized by a single ventral lateral-line canal from the posterior margin of the pelvic-fin base extending to the anus and one or two rigid spines on the posterior part of the anal fin. This species is similar to Ernogrammus hexagrammus and Ernogrammus walkeri but differs in the number of ventral lateral-line canal present, with E. zhirmunskii consisting of one (unpaired) ventral lateral-line canal compared to other two Ernogrammus species, which have a pair of parallel ventral lateral-line canal. For further analysis of species identification, a partial gene sequence from the mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I (554 bp) of E. zhirmunskii was obtained for the first time. This study documents the first record of E. zhirmunskii in Korean waters and proposes the new Korean name of 'Il-gob-julbe-do-la-chi' for the species.
Cho, Yoonjung;Lee, Min Ho;Kim, Su Jin;Park, Ji Hwan;Jung, Ju Yeon
Biomedical Science Letters
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v.28
no.3
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pp.157-169
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2022
DNA typing is the typical technology in the forensic science and plays a significant role in the personal identification of victims and suspects. Short tandem repeat (STR) is the short tandemly repeated DNA sequence consisting of 2~7 bp DNA units in specific loci. It is disseminated across the human genome and represents polymorphism among individuals. Because polymorphism is a key feature of the application of DNA typing STR analysis, STR analysis becomes the standard technology in forensics. Therefore, the DNA database (DNA-DB) was first introduced with 4 essential STR markers for the application of forensic science; however, the number of STR markers was expanded from 4 to 13 and 13 to 20 later to counteract the continuously increased DNA profile and other needed situations. After applying expanded STR markers to the South Korean DNA-DB system, it positively affected to low copy number analysis that had a high possibility of partial DNA profiles, and especially contributed to the theft cases due to the high portion of touch DNA evidence in the theft case. Furthermore, STR marker expansion not only contributed to the resolution of cold cases but also increased kinship index indicating the potential for improved kinship test accuracy using extended STR markers. Collectively, the expansion of the STR locus was considered to be necessary to keep pace with the continuously increasing DNA profile, and to improve the data integrity of the DNA-DB.
Staphylococcus aureus is one of the major pathogens that can cause staphylococcal infection and food poisoning. In this study, we compared conventional culture methods and real-time PCR for detection of S. aureus in artificially inoculated milk, sausage, raw pork, and vegetable salad. The performance of a coagulase test for confirming S. aureus was also compared with a colony PCR test. Bulk food samples (500 g each) were artificially inoculated with S. aureus and divided into 20 samples (25 g or mL each). All samples were added to tryptic soy broth (225 mL/sample) with 10% NaCl and incubated at $37^{\circ}C$ for 24 h. After the enrichment, broth cultures were streaked onto Baird-Parker (BP) agar with egg yolk tellulite, and incubated at $37^{\circ}C$ for 24 h. In addition, 1 mL of broth cultures was collected to perform real-time PCR. Two suspicious colonies from the BP agar were picked up and plated on nutrient agar and incubated at $37^{\circ}C$ for 24 h followed, by a coagulase confirmation test and a colony PCR analysis. There were no statistical differences between culture methods and realtime PCR in food samples with low background microflora, such as milk and sausage. However, a significant statistical difference was found between the culture methods and real-time PCR for raw pork and vegetable salad. Furthermore, the colony PCR test of the presumptive colonies on BP agar for confirming S. aureus is more accurate and efficient than the coagulase test for unprocessed foods.
Purpose: Recognition of impending death is crucial not only for efficient communication with the caregiver of the patient, but also determination of the time to refer to a separate room. Current studies simply list the events 'that have already occurred' around 48 hours before the death. This study is to analyze the predictability of each event by comparing the time length from 'change' to death. Methods: Subjects included 160 patients who passed away in a palliative care unit in Incheon. The analysis was limited to 80 patients who had medical records for the last week of their lives. We determined 9 symptoms and 8 signs, and established the standard of 'significant change' of each event before death. Results: The most common symptom was increased sleeping (53.8%) and the most common sign was decreased blood pressure (BP) (87.5%). The mean time to death within 48 hours was 46.8% in the case of resting dyspnea, 13.6% in the ease of low oxygen saturation, and 36.9% in the case of decreased BP. The symptom(s) which had the highest positive predictive value (PV) for death within 48 hours was shown to be resting dyspnea (83%), whereas the combination of resting dyspnea and confusion/delirium (65%) had the highest negative PV. As for the most common signs before death within 48 hours, the positive PVs were more than 95%, and the negative PV was the highest when decreased BP and low oxygen saturation were combined. The difference in survival patterns between symptoms and signs was significant. Conclusion: The most reliable symptoms to predict the impending death are resting dyspnea and confusion/delirium, and decline of oxygen saturation and BP are the reliable signs to predict the event.
Parabens were commonly used for preventing the growth of microorganisms as preservatives in the pharmaceutical, cosmetic and food industry. Also, parabens are known endocrine disruptors because of their estrogenic effects on human. Parabens affect the endocrine system and show adverse effect such as, genital malformations, precocious puberty and testicular cancer in young children, infants and fetuses. In this study, we developed analytical method for four parabens (methyl paraben, ethyl paraben, propyl paraben, butyl paraben) in human breast milk which frequently consumed by newborn baby. The analytes were extracted using liquid-liquid extraction (LLE) after enzyme hydrolysis with protease and lipase, then quantitative analysis was performed by liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). The method validation results were as follows; the linearity of calibration curves were excellent with coefficient of determinations (r2) higher than 0.999, the limit of detections (LODs) were 0.019~0.044 ng/mL, the accuracies were 85.3~105.9% and the precisions were lower than 10%. The average concentration ± standard deviation of parabens in ten human breast milk sample were MP 0.660 ± 0.519 ng/mL, EP 1.631 ± 2.081 ng/mL and PP 0.326 ± 0.320 ng/mL, and BP was not detected.
One juvenile raptor which was not able to be identified due to its head damage was discovered on a roadside in Janggok-ri, Jori-eup, Paju on 28th June, 2011. The species was identified by DNA barcoding. After polymerase chain reaction (PCR) of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene (COI), we obtained 695 bp sequences. We analyzed the obtained COI sequence with similar sequences from the BOLD systems and BLAST of the NCBI Genbank, and discovered that its sequence showed 100 % similarity values with the one of the five gray-faced buzzards which were previously researched. In addition, it was confirmed to be a female through sex determination using DNA. Such results are important information as it confirms the breeding of the gray-faced buzzards for the first time in 43 years since its breeding was last recorded in 1968, in Paju. Wildlife rescue center needs to work with adjacent consigned registration and preservation institutions when carcass of wild animals is collected or DNA samples are obtained for more accurate both species and sex identification through a systematic management system in the future. Furthermore, the obtained DNA sample of the gray-faced buzzard and COI gene, DNA barcode, could be used as reference standards for similar researches in the future.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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