• 제목/요약/키워드: specific probe

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자바 클래스 영역 크기 예측을 위한 탐침 클래스의 사용 (Use of Probe Class for Estimating Java Class Area Size)

  • 양희재
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2003년도 컴퓨터소사이어티 추계학술대회논문집
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    • pp.19-22
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    • 2003
  • Class area is a portion of memory where the constants, fields, and codes of the classes loaded into the Java virtual machine are kept. Knowing the site of the class area is very important especially for embedded Java system with limited memory resources. This paper induces a formula which makes it possible estimate the size of the area. The formula needs some constant values specific to target JVM implementation. We also show that these values can be found using some simple probe classes. An experimental result is included in this paper to confirm the correctness of our approach.

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Atom Probe Tomography를 이용한 나노 스케일의 조성분석: II. 전자소자 및 나노재료에서의 응용 (Nano Scale Compositional Analysis by Atom Probe Tomography: II. Applications on Electronic Devices and Nano Materials)

  • 정우영;방찬우;장동현;구길호;박찬경
    • Applied Microscopy
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    • 제41권2호
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    • pp.89-98
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    • 2011
  • Atom Probe Tomography는 원자 수준의 분해능으로 원소의 위치 및 조성 정보를 3차원으로 제공해 주는 분석 장비이다. APT의 우수한 성능에도 불구하고 반도체 등, 저전도성 물질 분석에는 그 동안 적용이 어려웠다. 그러나 특정 시료 내 위치의 시편을 가공할 수 있는 FIB 시편 제조법과 laser펄스를 이용한 전계증발법의 개발로 APT의 분석 영역이 반도체에서 절연체까지 크게 확대 되고 있다. 본 논문에서는 최근에 적용되기 시작한 MOS-FET, GaN LED, Si-Nanowire 등 전자소자에서의 APT분석 응용사례에 대하여 살펴보았다.

소 모색관련 MC1R 유전자의 SNP와 관련한 MGB probe에 기초한 real-time PCR을 이용한 한우육과 Holstein육의 판별 (Identification of Hanwoo and Holstein meat using MGB probe based real-time PCR associated with single nucleotide polymorphism (SNP) in Melanocortin 1 receptor (MC1R) gene)

  • 박성도;김태중;이재일
    • 대한수의학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.25-28
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    • 2005
  • The melanocortin 1 receptor (MC1R) plays an important role in regulation of melanin pigment synthesis within mammalian melanocytes. Mutations within the gene encoding MC1R have been shown to explain coat color variations within several mammalian species including cattle. To develope a rapid and accurate method for the identification of Hanwoo meat, we performed a single nucleotide polymorphism (SNP) analysis in Melanocortin 1 receptor (MC1R) gene using TaqMan$^{(R)}$ MGB probe-based real-time PCR. Two specific probes (one for Hanwoo and the other for Holstein and Black angus) were designed. At the 5' end of 2 TaqMan$^{(R)}$ MGB probes, 6-carboxyfluorescein (FAM) was labeled for Hanwoo, and VIC for Holstein and Black angus. As a result, Hanwoo samples showed FAM-positive signal only, whereas other samples showed VIC-positive. This result suggests that the TaqMan$^{(R)}$ MGB probe based real-time PCR technique would be very accurate, easy and reproducible method to discriminate between Hanwoo meat and Holstein/Black angus meat.

임상 객담검체에서 Peptide Nucleic Acid Probe를 이용한 결핵과 비결핵 항산균의 구분 (Evaluation of Peptide Nucleic Acid Probe-Based Fluorescence In Situ Hybridization for the Detection of Mycobacterium tuberculosis Complex and Nontuberculous Mycobacteria in Clinical Respiratory Specimens)

  • 이승희;김신영;김형회;이은엽;장철훈
    • Annals of Clinical Microbiology
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    • 제18권2호
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    • pp.37-43
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    • 2015
  • 배경: 결핵은 전세계적으로 단일 원인균으로는 가장 높은 치사율을 가진 질병이다. 결핵의 치료에 있어서 마이코박테리아를 빠르고 정확하게 확인하는 것이 필수적이다. 본 연구에서는 임상 객담 검체의 도말 슬라이드에서 결핵균과 비결핵 항산균의 감별을 위해 Peptide Nucleic Acid (PNA) Probe를 이용한 FISH assay를 평가하고자 한다. 방법: 결핵균과 비결핵 항산균의 16s rRNA를 타겟으로 한 PNA probe를 합성하였다. 각 probe의 특이도는 표준 균주인 Mycobacterium tuberculosis ATCC 13950, M. kansasii ATCC 12479, 임상 검체에서 분리된 마이코박테리아 3종(M. abscessus, M. avium, and M. intracellulare) 그리고 호흡기계에서 흔히 분리되는 10종류의 박테리아를 이용하였다. Centers for Disease Control and Prevention (CDC)의 Acid fast bacili (AFB) 염색 기준상 trace 이상인 128개의 임상 객담 검체를 이용하여 Probe의 성능을 평가하였다. PNA FISH와 항산균 염색결과는 CDC 기준에 따라 단계를 분류하고 서로 비교하였다. 결과: 결핵균과 비결핵 항산균 특이 PNA probe는 결핵균과 M. kansasii 표준 균주 그리고 임상검체에서 분리된 3종의 마이코박테리아에 대해 특이적인 반응을 보였고 다른 박테리아와 교차반응을 보이지 않았다. 또한 89개의 결핵균 배양 양성 객담 검체와 29개의 비결핵 항산균 배양 양성 객담 검체에 각각 특이적인 반응을 보였고 CDC 기준에 따라 분류한 PNA FISH와 AFB염색 결과는 2+ 이상의 검체에서 서로 잘 일치하였다. 결론: PNA FISH 방법은 임상 객담 검체에서 결핵을 진단하고, 항산균과 비결핵 항산균을 구분하는데 있어서 민감하고 정확한 결과를 보였다.

원전 증기발생기 전열관 와전류검사 보빈탐촉자 설계 (Eddy Current Bobbin Probe Design for Steam Generator Tubes in NPPs)

  • 남민우;이희종;지동현;정지홍;김철기
    • 비파괴검사학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.89-96
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    • 2007
  • 원자력발전소 증기발생기 전열관의 건전성을 평가하기 위해서 계획예방정비 기간에 수행되는 와전류검사의 여러 가지 기법중에서 보빈 탐촉자 검사는 가장 기본적인 중요한 검사이다. 와전류 탐촉자는 검사 계통의 핵심적인 부분으로서 특정 절차서에 따라 평가가 이루어질 때 대상 시험체의 합부를 결정하는 자료를 제공하게 된다. 또한, 수집된 와전류신호의 품질은 사용되는 탐촉자의 설계특성, 기하학적 형태, 운전주파수에 따라 결정되고, 검사결과에 미치는 영향이 크기 때문에 와전류검사 탐촉자의 선정은 특히 중요하다. 본 연구에서는 국내 원전 증기발생기 전열관 검사를 위한 최적의 차동형 보빈탐촉자를 설계하였다. 또한 보빈탐촉자 시작품의 전기적 특성과 와전류신호 특성 평가를 수행하여 만족한 결과를 도출하였다.

FISH(fluorescence in situ hybridization)를 이용하여 분석한 크롬에 의해 유발된 염색체 이상 (Detection of Chromosomal Rearrangements by Chromium in Human Lymphocyte Using Fluorescence in situ Hybridization (FISH) with Triple Combination of Composite whole Chromosome Specific Probe)

  • 정해원;김수영;맹승희;이용묵;유일재
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.14-19
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    • 1999
  • Chromosome rearrangements induced in human lymphocyte after in vitro exposure to chromium were analysed by the use of fluorescence in situ hybridization(FISH) with triple combination of composite whole chromosome-specific probe for chromosome 1, 2 and 4. Chromosome aberrations was scored by the Protocol for Aberration Identification and Nomenclature Terminology (PAINT). Stable translocation was the most frequent type of aberrations and dicentrics and insertions were also observed. Chromium treatment enhanced the frequencies of stable translocations and color junctions in a dose-dependent manners, but no distinct increase of dicentrics and insertions was seen. The ratio of the yields of translocation to the yields of dicentric varied between 13 to 27. The presents results demonstrate fluorescent in situ hybridization (FISH) is useful for detecting chromosomal rearrangements induced by chromium.

Hybridization by an Electrical Force and Electrochemical Genome Detection Using an Indicator-free DNA on a Microelectrode-array DNA Chip

  • Choi, Yong-Sung;Lee, Kyung-Sup;Park, Dae-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제26권3호
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    • pp.379-383
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    • 2005
  • This research aims to develop DNA chip array without an indicator. We fabricated microelectrode array by photolithography technology. Several DNA probes were immobilized on an electrode. Then, indicator-free target DNA was hybridized by an electrical force and measured electrochemically. Cyclic-voltammograms (CVs) showed a difference between DNA probe and mismatched DNA in an anodic peak. Immobilization of probe DNA and hybridization of target DNA could be confirmed by fluorescent. This indicator-free DNA chip microarray resulted in the sequence-specific detection of the target DNA quantitatively ranging from $10^{-18}\;M\;to\;10^{-5}$ M in the buffer solution. This indicator-free DNA chip resulted in a sequence-specific detection of the target DNA.

미소전극어레이형 DNA칩을 이용한 유전자다형의 전기화학적 검출 (Electrochemical Detection of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Using Microelectrode Array on a DNA Chip)

  • 최용성;권영수;박대희
    • 대한전기학회논문지:전기물성ㆍ응용부문C
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    • 제53권5호
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    • pp.286-292
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    • 2004
  • In this study, an integrated microelectrode array was fabricated on glass slide using microfabrication technology. Probe DNAs consisting of mercaptohexyl moiety at their 5-end were spotted on the gold electrode using micropipette or DNA arrayer utilizing the affinity between gold and sulfur. Cyclic voltammetry in 5mM ferricyanide/ferrocyanide solution at 100 ㎷/s confirmed the immobilization of probe DNA on the gold electrodes. When several DNAs were detected electrochemically, there was a difference between target DNA and control DNA in the anodic peak current values. It was derived from specific binding of Hoechst 33258 to the double stranded DNA due to hybridization of target DNA. It suggested that this DNA chip could recognize the sequence specific genes. It suggested that multichannel electrochemical DNA microarray is useful to develop a portable device for clinical gene diagnostic System.

미소전극형 DNA칩 어레이를 이용한 유전자의 검출 (A Study on Electrical Properties of Dendrimer)

  • 최용성;이경섭
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2006년도 제37회 하계학술대회 논문집 C
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    • pp.1324-1326
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    • 2006
  • In this study, an integrated microelectrode array was fabricated on glass slide using microfabrication technology. Probe DNAs consisting of mercaptohexyl moiety at their 5-end were spotted on the gold electrode using micropipette or DNA arrayer utilizing the affinity between gold and sulfur. Cyclic voltammetry in 5mM ferricyanide/ferrocyanide solution at 100 mV/s confirmed the immobilization of probe DNA on the gold electrodes. When several DNAs were detected electrochemically, there was a difference between target DNA and control DNA in the anodic peak current values. It was derived from specific binding of Hoechst 33258 to the double stranded DNA due to hybridization of target DNA. It suggested that this DNA chip could recognize the sequence specific genes. It suggested that multichannel electrochemical DNA microarray is useful to develop a portable device for clinical gene diagnostic system.

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Subtraction 기법을 이용한 한우 성장 단계 특이 발현 유전자 탐색 (Identification of the Differentially Expressed Genes of Hanwoo During the Growth Stage by Subtractive cDNA Hybridization)

  • 장요순;김태헌;윤두학;박응우;정일정;조진기
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권1호
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    • pp.13-22
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    • 2002
  • 한우의 성장단계 특이발현 유전자를 탐색하기 위하여, 본 연구에서는 유전자의 발현 유무 및 발현정도의 차이를 나타내는 유전자를 분리하는데 있어 가장 강력한 수단으로 알려진 subtractive cDNA hybridization 기법을 이용하여 한우 등심조직으로부터 12개월령 및 24개월령 특이적인 subtractive cDNA library를 제작하였다. 성장단계 특이적인 유전자를 탐색하기 위하여, 6, 12 및 24개월령 cDNA를 사용하여 reverse northern blot 분석을 실시하였으며, 6개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타낸 3개의 clone은 EPV 20, Ca2+ ATPase, 및 TCTP 유전자와 유사성을 나타내었다. 12개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타낸 9개의 cDNA clone은 각각 VCP, HSP 70, aldolase A, MSSK1, GM-2 activator protein, ryanodine receptor, acidic ribosomal phosphoprotein p1, ADP/ATP translocase T1 및 UCP 2 유전자와 높은 homology를 가지고 있었다. 또한 2개의 clone이 각각 12개월령 및 24개월령 cDNA probe에 대하여 특이적인 signal을 나타내었는데, 12개월령 cDNA probe에 대해서만 signal을 나타낸 clone은 ferrochelatase 유전자와 유사하였으며, 24개월령 probe에 대해서만 signal을 나타낸 clone은 ADRP 유전자와 유사하였다. 이상에서와 같이, 본 연구에서 제작한 성장단계 특이적인 subtractive cDNA library를 분석하여 14종의 유전자를 한우 성장단계 특이 발현 후보 유전자로 선정하여 염기서열을 분석하였으며, 이외에도 성장단계에 있어 특이적으로 발현될 것으로 추정되는 cDNA 클론의 염기서열을 분석하였다.