• 제목/요약/키워드: serotype variation

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국내 Bordetella pertussis 분리균주에서 Agglutinogen과 Fimbriae 혈청형 변이 분석 (Serotype Variations of Agglutinogen and Fimbriae in the Korean Isolates of Bordetella pertussis)

  • 정상운;문유미;성화영;강연호;유재연
    • 미생물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.221-227
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    • 2008
  • Bordetella pertussis는 유아의 호흡기감염질환인 백일해의 원인균으로 배신도입에 의해 발생률이 크게 낮아졌다. 그러나 최근에 일부 백신접종률이 높은 국가에서 증가된 백일해 발생건수가 보고되고 있으며, 그 추정 원인 중에 하나는 백신주와 유행주 사이의 유전형 흑은 혈청형 변이 이다. 따라서 분리주에 대한 변이 현황을 유전형 혹은 혈청형 분석을 통하여 확인하는 것이 필요하고 국내에서 백일해 발병증가에 대한 가능성을 추정해야 한다. 이에 본 연구에서는 $1999\sim2006$년 사이에 분리된 국내 백일해 분리균주의 변이 양상을 agglutinogen과 fimbriae에 대한 혈청형 조사를 통해 확인하였다. 그 결과 agg 1과 fim 2가 국내 분리주에서 가장 많이 발견되는 혈청형이었고, 두 항원 모두 시대에 따른 혈청형 변이 현상이 확인되었으며, 특히 agglutinogen의 경우는 백신균주(agg 1,2)와는 다른 유형(agg 1)이 증가되는 유형으로 나타났다. 그러나 fimbriae의 경우는 백신균주(fim 2)와 동일한 유형이 증가되어 차이를 나타내었다. 이러한 결과는 백일해 발병증가가 나타나는 국가들에서도 확인되는 현상으로 국내에서의 백일해 발병증가에 대한 보다 정확한 예측을 위해서는 항원결정기 유전자에 대한 변이정도 및 정상인에서의 항체가 분포양상 등에 대한 연구가 필요할 것으로 사료된다.

한국인 Actinobacillus actinomycetemcomitans 균주의 특이 독성 clone형과 혈청형 및 백혈구독성과의 관계 (INTERRELATIONSHIP BETWEEN VIRULENT CLONAL TYPES, SEROTYPES AND LEUKOTOXICITY OF KOREAN STRAINS OF A. ACTINOMYCETEMCOMITANS)

  • 구영
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제25권3호
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    • pp.487-496
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    • 1995
  • Previous studies have demonstrated that not all A. actinomycetemcomitans produced significant level of leukotoxic factor and its leukotoxicity have associated with serotype and genetic variation. Our aim was to investigate on the interrelationship between serotype and leukotoxicity of an A. actinomycetemcomitans consisting of 13 clinically well characterized. Korean isolates and to evaluate if particular virulent clonal types of A. actinomycetemcomitans are associated with periodontal disease. For this study, 13 strains of A. actinomycetemcomitans from 6 patients with periodontal disease were isolated and identified by using a selective medium(tryptic soy agar supplemented with 10% serum, $75{\mu}g$ of bacitracin and $5{\mu}g$ of vancomycin per ml) in 10% C02 incubator for 3days with routine Gram staining, colony morphology and biochemical test..For serotyping, antisera were prepared from reference strains of 5 serotypes. (ATCC 29523,Y4, SUNY aB 67, IDH 781, IDH 1705) and then ammonium sulfate precipitation, immunoabsorption and indirect immunofluoroscent procedures were done. For analysis of leukotoxicity, sonic extract of A. actinomycetemcomitans exposed to PMN, and trypan blue was stained for counting the cell viability. Finally Southern blot analyses of genomic DNA digested with the restriction enzyme Tag I was done and the Southern blots were hybridized with the 530bp fragment, termed delta 530, originating from the ltx promoter of strain 652 and deleted from strain JP2. Also ltxA-3.1 and SC2 probe from strain JP2 were hybridized with genomic DNA fragments. Results reveal that strains isolated showed approximately equal proportions of 3 serotypes(b, d, e) and serotype b was not detected. 2 patients harbored 2 different serotypes in the same disease site. The prevalence of leukotoxic strain was 23% and there was no relationship between serotype, leukotoxicity and clinical observations. Especially virulent clonal types of Actinobacillus actinomycetemcomitan (JP2 strain) could not found. Further studies are necessary on the genetic polymorphism of leukotoxin and its relations to clinical status.

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냉동식품에서 분리한 Yersinia enterocolitica의 특성 (Characteristics of Yersinia enterocolitica Isolated from Frozen Foods)

  • 임순영;윤석권
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권6호
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    • pp.1336-1340
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    • 2000
  • 서울등 5개지역에서 수거한 냉동식품 624건을 대상으로 Y. enterocolitica를 분리하였다. 분리대상 식품군 중 해산물가공품중에서 Y. enterocolitica의 분리율(9.1%)이 가장 높았고, 다음으로 식육가공품(7.7%), 만두류(3.5%), 기타 냉동식품(3.4%)의 순이었으며 냉동피자류(1.7%)는 분리율이 가장 낮았다. 그리고 상반기와 하반기의 분리율이 차이를 보였는데 각각 1.6%와 9.6%로 하반기가 상반기에 비하여 분리율이 6배가 높았다. 냉동식품에서 분리된 Y. enterocolitica 균주는 모두 35개(5.6%)였고, 분리균주의 serotype은 O:5(9균주)와 O:1,2(1균주)이었다. 이외의 나머지 25개 균주는 본 연구에서 사용한 항혈청에 응집반응을 보이지 않아 혈청형을 typing할 수 없었다. 그리고 이들 균주를 biotype한 결과 모두 비병원성인 biotype 1A이었으며 중합효소연쇄반응(PCR)으로 확인 결과 또한 모두 비병원성으로 판명되었다.

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Validation of a Multiplexed Opsonophagocytic Assay for 11 Additional Pneumococcal Serotypes and Its Application to Functional Antibody Evaluation Induced by Pneumococcal Polysaccharide Vaccine

  • Cha, Jihei;Kim, Han Wool;Lee, Ji Hyen;Lee, Soyoung;Kim, Kyung-Hyo
    • Journal of Korean Medical Science
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    • 제33권51호
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    • pp.340.1-340.14
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    • 2018
  • Background: Various pneumococcal vaccines have been evaluated for immunogenicity by opsonophagocytic assay (OPA). A multiplexed OPA (MOPA) for 13 pneumococcal serotypes was developed by Nahm and Burton, and expanded to 26 serotypes in 2012. The development of new conjugate vaccines with increased valence has necessitated expanded MOPAs to include these additional serotypes. In this study, we validated this expanded MOPA platform and applied to measure antibodies against 11 additional serotypes (2, 8, 9N, 10A, 11A, 12F, 15B, 17F, 20B, 22F, and 33F) in human sera. Methods: All materials, including serum, complement, bacterial master stocks, and HL-60 cells, were evaluated for assay optimization. Following optimization, the assay was validated for accuracy, specificity, and intra- and inter-assay precision with sera from adult donors following standard protocols. The assay was applied to evaluate functional antibodies of 42 sera immunized with 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine (PPV23). Results: The expanded MOPA platform was specific for all serotypes, with the exception of serotype 20. The assay results were highly correlated with those obtained from single-serotype OPA, indicating acceptable accuracy. The coefficients of variation were 7%-24% and 13%-39% in tests of intra- and inter-assay precision, respectively, using three quality-control samples. A MOPA that included 11 additional serotypes in the PPV23 was established and validated with respect to accuracy, specificity, and precision. The opsonic indices of immune sera were obtained using this validated assay. Conclusion: The expanded MOPA will be useful for evaluation of the immunogenicity of PPV23 and future conjugate vaccine formulations.

Correlation of Virologic Property and Phylogenetic Analysis of Hantaan Viruses Isolated from Patients and Reservoirs in Korea

  • Jung, Yong-Tae;Lee, Sun-Ryang;Paik, Soon-Young;Kim, Gum-Ryong
    • 대한바이러스학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.11-20
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    • 1998
  • Twenty isolates of Hantavirus were isolated from patients and reserovirs from 1988 to 1994 in Korea. Isolation rate was 1.9% (10/538) in patients, 6.2% (5/81) in Apodemus sp., 2.6% (1/38) in Rattus sp. and 0.6% (4/677) in bats. Reciprocal mean IFA titers ranged from 27.5 to 1,024 at the specimen collection. According to the growth rate and reaching peak titier of infectivity, the isolates were grouped as rapid, intermediate, and slow growing groups. All isolates were confirmed as Hantaan type by the nested RT-PCR on the G1 region of the M segment. Comparison of nucleotide sequence (Nt: 2101 - Nt: 2280) of the G2 region revealed that the sequence homology bewteen Hantaan 76/118 virus and the isolates was more than 90%. Several nucleotide positions of the isolates showed high variation. The variation rate of patientisolates was about one-half when compared with that of rodentisolates. On the basis of phylogenetic analysis Hantaan viruses isolated were divided into two genogroups. These results indicate that Hantaan virus is highly dominant serotype in Korea and the virologic property and genogroup are not correlated.

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Pasteurella multocida type A의 lipopolysaccharide-protein 복합체의 특성 (Characterization of a lipopolysaccharide-protein complex of type A Pasteurella multocida)

  • 류효익;김철중
    • 대한수의학회지
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    • 제40권1호
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    • pp.63-71
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    • 2000
  • An immunogenic, high molecular weight lipopolysaccharide (LPS)-protein complex isolated from a potassium thioncyanate extract of a Pasteurella multocida (P multocida ; strain P-2383, capsular type A and somatic type 3) was characterized. Chemical analysis of the complex by gas chromatography on a capillary column demonstrated that this complex contained most of the chemical constituents characteristic of LPS extracted by the phenol-water methed from the whole bacterium. However, there was proportionately more carbohydrate than fatty acid in the complex in contrast to LPS in which fatty acid seemed to be in excess. When toxicity of the complex was evaluated in 10-day-old chicken embryos, the complex was less toxic ($LD_{50}=12.72{\mu}g$) than the purified LPS ($LD_{50}=0.44{\mu}g$). The $LD_{50}$, of the LPS moiety extracted from the complex was $5.24{\mu}g$. Composition of the complex was analyzed by SDS-PAGE with silver staining and Western immunoblotting. The complex did not migrate through the polyacrylamide gel unless dissociated with SDS. The complex dissociated with SDS contained at least 32 different protein and polysaccharide components: 18 components reacted with an antiserum against the complex. There was no significant compositional variation between the complexes from different strains, but quantitative differences in individual components were noted. When cross-protectivity of the complex was evaluated in mice, this complex provided substantial protection not only against the homologous bacteriun but also against different P multocida strains of the same serotype. LPS-protein complexes isolated by the same method from other strains also induced protection against an challenge with P-2383.

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3형 아데노바이러스의 면역조절 유전자 다양성 (Genetic Variation in the Immunoregulatory Gene of Adenovirus Type 3)

  • 최은화;김희섭;이환종
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제16권2호
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    • pp.199-204
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    • 2009
  • 목 적: 아데노바이러스 early region 3 (E3) 유전자 단백은 세포독성 세포와 다양한 싸이토카인이 매개하는 세포파괴를 저해하는 기능을 한다. 본 연구는 E3 유전자의 다양성이 아데노바이러스의 분자생물학적 다양성을 설명할 수 있는지 밝히기 위하여 시행되었다. 방 법: 1990년부터 2000년까지 10년 동안 서울대학교 어린이병원에서 하기도 감염증으로 치료받은 소아로부터 분리 된 3형 아데노바이러스 14 주를 대상으로 하여 E3 유전자의 변이와 유전체형과의 연관성을 분석하였다. 결 과: 3형 아데노바이러스의 E3 유전자는 표준 주(M15952)와 비교하여 98%의 일치도를 보였으며, 국내 분리 주간의 일치도는 98.7%이었다. 아미노산 서열의 변이는 20.1 kDa, 20.6kDa, truncated 7.7 kDa, 10.3 kDa, 14.9 kDa, 그리고 15.3kDa에 나타났다. 또한, 14 주 모두에서 truncated 7.7 kDa의 시작 코돈에 missense 변이가 있었으며, 58개(10주) 혹은 94개(4주)의 염기쌍이 소실되는 변이가 동반되었다. 유전체형에 따른 E3 유전자의 변이는 대개 유전체형에 특이하게 나타나 연관성이 높은 것을 알 수 있었다. 결 론: 3형 아데노바이러스 주의 면역기능 조절 유전자 E3의 다양성은 유전체형과의 연관성이 높은 것으로 나타났다.

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한국과 일본에서 유행하는 장염비브리오의 병원성 인자와 유전자의 특성 (Genetic Characteristics and Virulence Factors of Pandemic Vibrio parahaemolyticus Isolated in South Korea and Japan)

  • 홍석원;문지영;이복권;김영부
    • 생명과학회지
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    • 제17권3호통권83호
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    • pp.386-395
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    • 2007
  • 본 연구는 1999년에서 2001년도 걸쳐서 3년간 국내에서 분리된 환자유래 장염비브리오 18균주와 일본 후쿠오카 지역에서 2002년도에 환자에서 분리한 장염비브리오 9균주 등 총 27균주에 대하여 toxR 유전자의 검출, 혈청형별 검사, 약제내성의 양상, tdh, trh1 및 trh2 유전자의 보유상태 및 urease 생성성을 살펴보고, 혈청형 O3:K6 균주에 대하여 TDH의 생성성 검사, tdh 양성균주의 RFLP 형별, ORF 8의 분포, PFGE법과 RAPD법을 실시하였으며 결과는 다음과 같다. 1. 한국 및 일본의 환자유래 균주 대부분에서 urease음성이었으며, toxR 유전자로 확인 동정하였고 혈청형의 분포는 국내 분리 주의 O3:K6, O4:K9, O6:K46, O3:K57, O5:Kl5와 일본 분리주의 O3:K6, O1:K38, O4:K68, O4:Kl2의 혈청형으로 나타났다. 2. 항생제 감수성 시험에서는 vancomycin과 oxacillin은 27균주 (100%), penicillin은 26균주 (96.3%)로 높은 내성을 나타내었고, 14균주 (51.9%)가 4가지 이상의 항생제에 다제내성을 나타내었다. 항생제의 내성양상은 6종류로 혈청형에 관계없이 vancomycin, oxacillin, penicillin에 내성을 나타내는 V형이 15균주 (55.6%)로 가장 많이 나타났다. 3. tdh 유전자는 26균주가 PCR법과 DNA probe hybridization법의 결과에서 양성으로 나타났으며, urease양성이었던 일본 환자유래 혈청형 O3:K6 1균주만이 tdh유전자 음성, trh2 유전자 양성을 나타냈다. 혈청형 O3:K6의 TDH 생성성역가는 전 균주가 256배에서 2,048배 정도로 나타났으며, RFLP 양상은 모든 균주가 11.5 kb와 4.3 kb에 tdh 유전자를 보유하고 있었다. 또한 혈청형 O3:K6 균주들은 RAPD법과 PFGE법으로 유전자형별을 비교 검토한 결과 8형으로 거의동일한 유전자형별의 결과를 나타내었다. 4. ORF 8의 분포는 혈청형 O3:K6 전 균주에서 양성이었고, 특히 혈청형 O6:K46 4균주 모두에서 ORF 8 양성을 나타내어 새롭게 나타난 유행균주일 가능성을 시사 하였다. 따라서 ORF 8 유전자의 검출은 범세계적으로 유행하는 균주들을 동정하는데 있어 genetic marker로서 매우 유용한 것으로 사료된다.