Random amplified polymorphic DAN markers were characterized for three taxonomically problematic Penicillium species : P. aurantiogriseum var. Aurantiogriseum, P. verrucosum and P. puberulum, as well as for 25 species of mono, bi-, and terverticillate Penicillia. The relationships among mono, bi-, and terverticillate Penicillium species were determined from these RAPD markers. Eight species from mono-, eight from bi-, and nine from terverticilate Penicillia were examined. With 14 randomly chosen 10-mer primes, a 310 character by 25 species matrix was generated. Phenetic analysis separated the 25 species into three genetically distinct groups that correspond to the different arrangements of penicilli (mono-, bi-, and terverticillate). The results of this study suggest that P. aurantiogriseum var. aurantiogriseum, P. VERRUCOSUM, AND P. puberulum represent genetically distinct species, and that P. vulpinum should be included in terverticilate Penicillia. Phenogram branching patterns indicated that biverticillate species are genetically more similar to monoverticilate species than they are to terverticillate species.
A revised checklist of Korean Trichoptera is provided for the species recorded from the Korean Peninsula, including both North and South Korea. The checklist includes bibliographic research as well as results after reexamination of some specimens. For each species, we provide the taxonomic literature that examined Korean Trichoptera materials or mentioned significant taxonomic treatments regarding to Korean species. We also provide the records of unnamed species based on larval identification for further study. Based on taxonomic considerations, 20 species among the previously known nominal species in Korea are deleted or synonymized, and three species omitted from the previous lists, Hydropsyche athene Malicky and Chantaramongkol, 2000, H. simulata Mosely, 1942 and Helicopsyche coreana Mey, 1991 are newly added to the checklist. Hydropsyche formosana Ulmer, 1911 is recorded from the Korean Peninsula for the first time by the identification of Hydropsyche KD. In addition, we recognized 14 species of larvae separated with only tentative alphabetic designations. As a result, this new Korean Trichoptera checklist includes 218 currently recognized species in 66 genera and 25 families from the Korean Peninsula.
Characteristics of species distribution in the Baekdoo Great Mountain Chain of Kangwon Province were discussed. Resulting from Detrending Correspondence Analysis based on the floristic composition of 48 mountains, the mountains of the Baekdoo chain tended to aggregate on DCA axis. it represented that there was the peculiar floristic composition of the Baekdoo chain separated from the other mountains. High altitude, longitude near the East Sea and large number of vascular species were main factors for the distribution pattern. And exponential relationships between endemic rare species and number of species were clarified. Even though the regions of the Baekdoo Great Mountain Chain had been conserved relatively well, many regions have been faced to be disturbed for tourism, agriculture, forestry, livestock industry and mining since the local autonomy. Thusm, the necessity for the establishment of large area network through the connection of scattered protected areas in the Baekdoo Great Mountain Chain was suggested. it would play a role as a core of nature conservation to sustain species diversity in Korea.
Two new species of the genus Luffariella (Dictyoceratida: Thorectidae), L. tubula n. sp. and L. koreana n. sp. were collected from Jeju-do, Korea. These species differ significantly from the previously reported five species in terms of shape and skeletal structure. L. tubula n. sp. has two categories in thickness of secondary fibres which were different from other species. L. koreana n. sp. is very similar to L. variabilis from Tahiti in skeletal structure, but differs in sponge shape with irregular branching and indistinct surface conules. Primary fibres of the two new species are separated from secondary and tertiary fibres.
Two Pseudopolydora polychaetes, P. bassarginensis and P. reticulata, originally described from Peter the Great Bay in Russia and Taiwan, respectively, were recorded firstly in Korea with DNA information. Two species are known to have distinct morphological characteristics that are separated from other Pseudopolydora species. They are characterized by reticulate pigmentations on the dorsal sides of the anterior chaetigers, a longitudinal black band-like pigmentation on the caruncle, and black paired spots on the ventral sides of the anterior chaetigers. These two species can be distinguished morphologically from each other by the length of the caruncle. Methyl green staining pattern of the species is a good method for delimiting Pseudopolydora species. The partial sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI), 16S ribosomal DNA (16S rDNA), and the nuclear 18S ribosomal DNA (18S rDNA) from Korean specimens of the two species were determined. The morphological descriptions and images of the two Pseudopolydora species are provided.
Two cymothoid isopods, Rocinela niponia Richradson, 1909 and Bopyrus squillarum Latreille, 1802, are first reported from Korean waters. Rocinela niponia can be distinguished from its congeners by the following characteristics: the rostral point is round; the eyes are separated from each other; and each pereopods 1-3 has the propodal blade bearing eight robust setae. Bopyrus squillarum is distinguishable from its related species by the following characteristics: the head is separated from pereonite 1, but partially fused on the lateral margins; the first pleonite on the short side is much smaller than other segments; and it is parasitic on the branchial chamber of Palaemon serrifer. Detailed descriptions and figures of these two species are provided in this paper.
Park, Hong Je;Shin, Kee Sun;Lee, Dong Hun;Bae, Kyung Sook
Journal of Microbiology
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제34권2호
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pp.117-123
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1996
Restriction-polymorphic patterns of nuclear-ITS were examined for the genetic relationships among 12 bisidiomycetous mushrooms to Aphyllophorales and Agaricales. The taxonomic affinity of Ganoderma species with the family Polyporaceae also was examined. With 13 restriction endonucleases, 159 restriction characters were generated form the 12 species examined. UPGMA and neighbor-joining analyses separated the 12 species into two genetically distinct groups that correspond to orders (Agaricales and Aphyllophorales) where each species is included. This result indicates that there is clear genetic demarcation between Agaricales and Aphyllophorales. Dendrograms constructed by several data analyses showed that even though Ganoderma species are somewhat in intermediate taxonomic position between the Polyporaceae and families of the Agaricales, they are genetically more related to the Polyporaceae. These results are consistent with morphological characters observed in those mushrooms. However, it is premature to conclude taxonomic status Ganoderma species in the present study employing small sample size.
Parmotrema clavuliferum ($R{\ddot{a}}s{\ddot{a}}nen$) Streimann and P. reticulatum (Taylor) M. Choisy (Parmeliaceae, lichenized Ascomycotina) have similar morphological characters such as wide lobes with soralia, reticulate-maculate on upper surface of lobes, and marginal cilia. In addition, they both produce salazinic acid and atranorin as major chemical substances. These similar properties found in both species have led to confusion in recognizing them as distinct species; however, P. clavuliferum is distinguished from the latter by capitate soralia on short laciniae which are always mottled white and by the production of fatty acid and gyrophoric acid together with salazinic acid. In addition, the most likely phylogenetic tree of these species shows that they are nested in well-supported monophyletic groups. Therefore, it is reasonable to recognize them as two separate species, P. clavuliferum and P. reticulatum.
The simultaneous determination of As(III), As(V), and DMA has been performed by ion chromatography (IC) coupled with inductively coupled plasma-mass spectrometry (ICP-MS). The separation of the three arsenic species was achieved by an anionic separator column (AS 7) with an isocratic elution system. The separated species were directly detected by ICP-MS as an element-selective detection method. The IC-ICP-MS technique was applied for the determination of arsenic species in a NIST SRM 1643d water sample. An As(III) only was detected in the sample. The detection limits of As(III), As(V) and DMA were 0.31, 0.45, and 2.09 ng/mL, respectively. It was also applied for the determination of arsenic species in a human urine obtained by a volunteer, and three arsenic species were identified. The determination of total As in human urines that were obtained from 25 volunteers at the different age was also carried out by ICP-MS.
In 2015, Bacillus paralicheniformis was separated from B. licheniformis on the basis of phylogenomic and phylogenetic studies, and urease activity was reported as a phenotypic property that differentiates between the two species. Subsequently, we have found that the urease activity of B. paralicheniformis is strain-specific, and does not reliably discriminate between species, as strains having the same urease gene cluster were identified in B. licheniformis and B. sonorensis, the closest relatives of B. paralicheniformis. We developed a multilocus sequence typing scheme using eight housekeeping genes, adk, ccpA, glpF, gmk, ilvD, pur, spo0A, and tpi to clearly identify B. paralicheniformis from closely related Bacillus species and to find a molecular marker for the rapid identification of B. paralicheniformis. The scheme differentiated 33 B. paralicheniformis strains from 90 strains formerly identified as B. licheniformis. Among the eight housekeeping genes, spo0A possesses appropriate polymorphic sites for the design of a B. paralichenofomis-specific PCR primer set. The primer set designed in this study perfectly separated B. paralicheniformis from B. licheniformis and B. sonorensis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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