• 제목/요약/키워드: sensu stricto

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Polysiphonia ulleungensis sp. nov. (Rhodomelaceae, Rhodophyta): a new diminutive species from Korea belonging to Polysiphonia sensu stricto

  • Bustamante, Danilo Edson;Won, Boo Yeon;Cho, Tae Oh
    • ALGAE
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    • 제29권2호
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    • pp.111-120
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    • 2014
  • Polysiphonia sensu stricto is characterized by having 4 ecorticate pericentral cells, rhizoids in open connection with the pericentral cells, four-celled carpogonial branches, spermatangial branches replacing the whole trichoblast, and tetrasporangia arranged in straight series. Polysiphonia ulleungensis sp. nov. is newly described from Sadongri, Ulleung Island, Korea, based on morphological and molecular evidence. It is mainly characterized by having ecorticate axes with 4 pericentral cells, apical cells transversely or obliquely divided, unicellular rhizoids in open connection with pericentral cells, very scarce trichoblasts and scar cells, procarps with a four-celled carpogonial branch, and spermatangial branches replacing the whole trichoblast. Polysiphonia ulleungensis is closely similar in morphology to P. atlantica sensu lato. We concluded that materials of P. atlantica sensu Nam and Kang from Korea correspond to P. ulleungensis. By contrast, the new species differs morphologically from the Atlantic specimens of P. atlantica as well as from P. atlantica sensu Kim and Lee from Korea. Morphological characteristics and rbcL sequence analyses support the taxonomic placement of P. ulleungensis within Polysiphonia sensu stricto.

어류 기생성 선충 Anisakis simplex sensu stricto와 Anisakis pegreffii 유충의 excretory-secretory products 및 somatic extracts의 가수분해효소 활성 비교 (A comparison of the hydrolase activities of excretory-secretory products and somatic extracts from fish parasitic nematodes, Anisakis simplex sensu stricto and Anisakis pegreffii larvae)

  • 전찬혁;위성;김정호
    • 한국어병학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.25-33
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    • 2014
  • Anisakis simplex sensu stricto와 A. pegreffii의 3기 유충과 4기 유충에서 얻은 excretory-secretory (ES) products 및 somatic extracts의 가수분해효소 활성을 API ZYM kit를 이용하여 비교하였다. Esterase 그룹의 가수분해효소 중 acid phosphatase는 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두에서 높은 활성을 나타냈으며, esterase (C 4)의 경우 somatic extracts에서만 가수분해효소 활성이 나타났는데 A. simplex (s.s.)가 A. pegreffii와 비교하여 3기와 4기 유충 모두에서 2배 가량 높은 활성을 나타냈다. alkaline phosphatase, acid phosphatase 그리고 naphthol-AS-BI-phosphohydrolase의 경우 A. simplex (s.s.)와 A. pegreffii 모두 3기 유충보다 4기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. Aminopeptidase 그룹의 가수분해효소 활성은 leucine arylamidase에서 관찰되었는데, somatic extracts의 경우 A. pegreffii 보다 A. simplex (s.s.)에서 가수분해 효소 활성이 두 배 가량 높게 확인되었으며, 대부분의 다른 효소들에서는 활성이 거의 나타나지 않았다. Glycosidase 그룹의 가수분해효소 활성은 N-acetyl-${\beta}$-glucosaminidase, ${\alpha}$-mannosidase 그리고 ${\alpha}$-fucosidase에서 확인되었는데, A. simplex (s.s.) 보다 A. pegreffii에서 높은 가수분해효소 활성을 확인할 수 있었으며, 대부분 4기 유충보다 3기 유충에서 더 높은 가수분해효소 활성이 확인되었다. 이러한 아니사키스속 선충의 종과 유충단계에 따른 가수분해 효소의 활성 차이는 선충의 성장, 탈피, 소화, 섭이 등의 대사과정의 차이에 기인한 것으로 생각된다.

PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism 방법에 의한 Borrelia burgdorferi Sensu Lato의 분류 (Molecular Typing of Borrelia burgdorferi Sensu Lato by PCR Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis)

  • 송혜원;박성언;박상욱;김근희;김홍;엄용빈;김종배
    • 대한의생명과학회지
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    • 제5권2호
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    • pp.209-212
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    • 1999
  • 라임병의 원인균인 Borrelia burgdorferi에 대하여 각 균종의 표준균주와 진드기에서 추출한 DNA를 template로 PCR을 실시한 후 그 증폭산물을 Alu I으로 처리한 restriction fragment length polymorphism (RFLP) 방법으로 각 균종의 연관성을 조사하고자 하였다. 표준균주로 RFLP를 실시한 결과 B. burgdorferi sensu stricto와 B. garinii의 RFLP 형태 (50 bp, 70 bp, 150 bp)가 유사하였으며 B. afzelii에서는 다른 RFLP 형태 (50 bp,110 bp,150 bp)를 관찰하였다. 그 중 B. afzelii KK-1과 B. garinii HPI은 새로운 RFLP형태를 보여 B. afzelii자 B. garinii는 각각 2 type의 subgroup으로 분류할 수 있었다. 진드기 DNA에서는B. afzelii를 포함한 각 균종에 대하여 모두 유사한 RFLP형태를 보였는데, 진드기 DNA에서 확인된 B. afzelii는 KK-1과 같은 군에 속하는 것으로 사료되었다.

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Genotype and Phenotype of Echinococcus granulosus Derived from Wild Sheep (Ovis orientalis) in Iran

  • Eslami, Ali;Meshgi, Behnam;Jalousian, Fatemeh;Rahmani, Shima;Salari, Mohammad Ali
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제54권1호
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    • pp.55-60
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    • 2016
  • The aim of the present study is to determine the characteristics of genotype and phenotype of Echinococcus granulosus derived from wild sheep and to compare them with the strains of E. granulosus sensu stricto (sheep-dog) and E. granulosus camel strain (camel-dog) in Iran. In Khojir National Park, near Tehran, Iran, a fertile hydatid cyst was recently found in the liver of a dead wild sheep (Ovis orientalis). The number of protoscolices (n=6,000) proved enough for an experimental infection in a dog. The characteristics of large and small hooks of metacestode were statistically determined as the sensu stricto strain but not the camel strain (P=0.5). To determine E. granulosus genotype, 20 adult worms of this type were collected from the infected dog. The second internal transcribed spacer (ITS2) of the nuclear ribosomal DNA (rDNA) and cytochrome c oxidase 1 subunit (COX1) of the mitochondrial DNA were amplified from individual adult worm by PCR. Subsequently, the PCR product was sequenced by Sanger method. The lengths of ITS2 and COX1 sequences were 378 and 857 bp, respectively, for all the sequenced samples. The amplified DNA sequences from both ribosomal and mitochondrial genes were highly similar (99% and 98%, respectively) to that of the ovine strain in the GenBank database. The results of the present study indicate that the morpho-molecular features and characteristics of E. granulosus in the Iranian wild sheep are the same as those of the sheep-dog E. granulosus sensu stricto strain.

Prevalence and Molecular Characterization of Echinococcus granulosus Sensu Stricto in Northern Xinjiang, China

  • Guo, Baoping;Zhang, Zhuangzhi;Zheng, Xueting;Guo, Yongzhong;Guo, Gang;Zhao, Li;Cai, Ren;Wang, Bingjie;Yang, Mei;Shou, Xi;Zhang, Wenbao;Jia, Bin
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제57권2호
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    • pp.153-159
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    • 2019
  • Echinococcus granulosus is an important zoonotic parasite globally causing cystic echinococcosis (CE) in humans and animals. In this study, prevalence of CE and variation of cox1 gene sequence were analyzed with isolates E. granulosus collected from different areas in northern Xinjiang, China. The survey showed that 3.5% of sheep and 4.1% of cattle were infected with CE. Fragment of cox1 was amplified from all the positive sheep and cattle samples by PCR. In addition, 26 positive samples across the 4 areas were included. The isolates were all E. granulosus sensu stricto (s.s.) containing 15 haplotypes (Hap1-15), and clustered into 2 genotypes, G1 (90.1%, 91/101) and G3 (9.9%, 10/101). Hap1 was the most common haplotype (48.5%, 49/101). Hap9 were found in humans samples, indicating that sheep and cattle reservoir human CE. It is indicate that E. granulosus may impact on control of CE in livestock and humans in the region.

Phylogenetic and phylogeographic analyses of Anisakis simplex sensu stricto (Nematoda: Anisakidae) from the common minke whale in Korean waters

  • Sunmin Kim;Bom Sok Lee;Seongjun Choe
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제61권3호
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    • pp.240-250
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    • 2023
  • The genus Anisakis is among the most significant parasites to public health, as it causes anisakiasis, a parasitic infection in humans resulting from consuming raw or undercooked seafood. Although the infection status of Anisakis in second intermediate hosts, such as marine fishes and cephalopods, and humans have been severally reported in Korea, no information about the definitive host in Korean waters is available. In 2014, 2 adult gastric nematodes were collected from a common minke whale (Balaenoptera acutorostrata) found in the East Sea, Korea. These worms were identified as A. simplex sensu stricto (s.s.) by comparing the mitochondrial COX2 marker with previously deposited sequences. Phylogenetic and phylogeographic analyses of A. simplex (s.s.) worldwide revealed 2 distinct populations: the Pacific population and the European waters population. This is the first report on adult Anisakis and its definitive host species in Korea. Further studies on Anisakis infection in other cetacean species and marine mammals in Korean seas are warranted.

국내에서 채집한 진드기에서 중합효소연쇄반응을 이용한 라임병균 및 Ehrlichiosis 원인체의 검출 (Detection of Borrelia burgdorferi and Ehrlichiosis Agent in Ticks Collected in Korea Using Polymerase Chain Reaction)

  • 김종배;송혜원;박성언;박상욱;안준환;엄용빈;김영미
    • 대한의생명과학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.113-120
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    • 1998
  • 국내에서 채집한 진드기의 라임병 및 ehrlichiosis 원인체 보균 상태를 조사하기 위하여 총 516마리 (Ixodes spp. 22마리 , Haemaphysalis spp. 494마리)의 ixodid 진드기를 봄과 가을에 걸쳐 강원도 고산지대 일원에서 채집하였다. 수집한 진드기에서 DNA를 추출·정제한 후 추출한 DNA를 template로 이용하여, Borrelia burgdorferi sensu lato 및 Ehrlichia spp.에 특이하게 반응하도록 제작한 primer를 이용한 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction, PCR)을 실시하였으며, 이 결과를 oligonucleotide probe를 사용한 southern blotting을 통하여 다시 확인하였다. 총 516마리의 진드기중 B. burgdorferi sensu lato DNA 양성인 진드기는 68 (13.2%)마리 (B. burgdorferi sensu stricto, 2; B. afzelii, 1; B. garinii, 33; B. tanukii, 8; B. turdae, 4)로 나타났으며 이 중 37 (7.2%)마리의 진드기는 southern blot analysis에서도 양성으로 확인되었다. 또한 101 (19.2%)마리의 진드기가 Ehrlichia spp.에 대한 PCR에서 양성이었으나, 이들 중 25 (4.8%)마리만이 southern blot analysis에서 양성으로 확인되었다. 그러나 사람의 병인체로 추정되는 human granulocytic ehrlichiosis (HGE) agent DNA를 보균한 진드기는 확인되지 않았다. 한편 라임병균과 ehrlichiosis원인체를 동시에 보균한 것으로 밝혀진 진드기가 3마리에서 (0.6%) 확인되어, 국내에서도 진드기 교상시 이들 두 가지 열성질환이 동시에 감염될 가능성이 있는 것으로 사료됨으로 진드기 매개성 열성질환에 대한 적절한 진단법 등을 보다 체계적으로 연구하여야 할 것으로 판단된다.

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Genotypes of Echinococcus Species from Cattle in Tanzania

  • Bia, Mohammed Mebarek;Choe, Seongjun;Ndosi, Barakaeli Abdieli;Park, Hansol;Kang, Yeseul;Eamudomkarn, Chatanun;Nath, Tilak Chandra;Kim, Sunmin;Jeon, Hyeong-Kyu;Lee, Dongmin;Eom, Keeseon S.
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제59권5호
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    • pp.457-464
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    • 2021
  • Cystic echinococcosis is a zoonotic parasitic disease caused by Echinococcus species. Tanzania is one of the endemic countries with cystic echinococcosis. This study focussed on identifying genotypes of Echinococcus spp. in Tanzania. We collected 7 cysts from cattle in Mwanza municipal (n=4) and Loliondo district (n=3). The cysts from Mwanza were all E. ortleppi and fertile. In contrast, the cysts from Loliondo were all E. granulosus sensu stricto and sterile. Two from the 4 cysts were a new haplotype of E. ortleppi (G5). These results can improve the preventive and control programs for humans and livestock in Tanzania. To our knowledge, this study is considered the first to identify the genotype and haplotype of Echinococcus spp. in Tanzania.

Species diversity of the old genus Navicula Bory (Bacillariophyta) on intertidal sand-flats in the Nakdong River estuary, Korea

  • Joh, Gyeongje
    • Journal of Ecology and Environment
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    • 제36권4호
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    • pp.371-390
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    • 2013
  • Remarkable diversity of diatom taxa occurs in intertidal sand-flats of the Nakdong River estuary, one of the most dynamic and productive ecosystem in Korea. Benthic diatoms were collected from the sandy sediments to clarify the taxonomic accounts and distribution of the old genus Navicula, i.e., the naviculoid flora. Total 92 taxa belonging to Navicula sensu stricto and 22 genera separated from Navicula sensu lato are reported with brief descriptions and micrographs, and many species remain unidentified. The genera are ranked by the number of diatom species: Navicula of 33 species and varieties, Fallacia of 17 species, Placoneis of five species, Fogedia and Parlibellus of four species, Austariella, Hippodonta and Petroneis of three species, Cosmioneis, Diadesmis, Luticola, Moreneis and Sellaphora of two species and variety, Berkeleya, Chamaepinnularia, Cocconeiopsis, Diademoides, Dickieia, Eolimna, Geissleria, Haslea, Lyrella and Mayamaea of one species. Through 32 samplings of the 12 areas, the important species were identified Navicula perminuta, N. gregaria, N. torneensis, Fallacia cunoniae, F. litoricola, F. subforcipata, F. tenera. The naviculoid diatoms constitute an average of 27% (range: minimum to maximum, 5-75%), of the benthic diatom assemblages. The diatom assemblages are characterized by the colonizing of a few dominant or frequent species and many occasional or rare species. The dominant species were observed to fluctuate with sampling site and time. Among the reported naviculoid diatoms, 46 taxa are newly reported in Korea.

한국산 개미취속 및 근연 분류군의 열매 형태에 관한 분류학적 연구 (Taxonomic study on the achene morphology of Korean Aster L. and its allied taxa)

  • 정규영;정형진
    • 한국자원식물학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.179-187
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    • 2000
  • 광의의 한국산 개미취속의 16종류에 대하여 열매인 수과의 분류학적 가치를 평가하고자 본 연구를 수행하였다. 수과의 형태는 도피침상 장타원형, 도란형, 장타원형, 도란상 장타원형 의 4유형으로 구분되었으며, 수과에 존재하는 모용은 단열성 원추형, 사상형, 원주형, 두상형, 장축 두상형, 구형의 6유형으로 구분되었다. 이들의 수과 선단에서 분포양상은 무모형, 원추상 모용 소생형, 원추상 모용 밀집형, 원추상-두상 모용 혼생형의 4유형으로 구분되었다. 이러한 수과의 형태와 이에 존재하는 모용의 특징은 분류군내의 개체간에는 변이가 없으나 분류군간에는 뚜렷한 차이를 보여 종을 구분하는 좋은 형질로 여겨졌다. 특히 두상형의 모용의 존재여부와 수과선단의 두상형의 모용과 원추형의 모용이 혼생하는 형질은 광의의 Aster속을 Kalimeris, Heteropappus, Aster, Gymnaster속으로 세분할 때, Kalimeris속과 Heteropappus속 및 Aster속의 Pseudocalimeris절을 구분짓는 형질, 즉 절 이상을 구분하는 형질로서 가치를 지니는 것으로 판단되었다.

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