• 제목/요약/키워드: restriction endonuclease map

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Agrobacterium tumefaciens KU-12 균주에서 분리한 플라스미드 pTi 12의 제한효소 지도 (Restriction endonuclease mapping of the plasmid pTi12 from agrobacterium tumefaciens)

  • 이용욱;손정훈;심웅섭
    • 미생물학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.173-179
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    • 1987
  • 한국산 A, tumefaciens의 3균주에서 분리한 Ti plasmid의 type과 분자량을 조사한 결과로 이들 모두는 octopine type 이었으며 각 plasmid의 분자량은 pTi12가 44Kb이었고, pTi14는 180Kb이었으며, pTi14는 172Kb이었다. 이중 pTi12를 Smal 및 HindIII로 가수분해한 결과 8개의 Smal digest fragment와 10개의 Hind III digest fragment를 얻었으며 Southern hybridization techniques을 이용하여 잠정적인 physical map을 작성하였다.

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황색포도상구균에서 테트라사이클린 내성을 나타내는 플라스미드의 동정 (Characterization of Tetracycline Resistant Plasmid in Staphylococcus aureus by Restriction Enzyme Mapping)

  • 김기현;김종명;문경호
    • 약학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.255-258
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    • 1992
  • The clinical isolate Staphylococcus aureus SA8 was resistant to tetracycline(Tc) and harboured a plasmid pKH1(24.82 kb). pKH1 was shown by curing and by transformation to specify resistance to Tc. The cleavage map of a pKH1 was determined by restricction enzyme mapping techniques. Cleavage map is given for BglII, EcoRI, HpaII, PvuII and SalI. Restriction endonuclease BamHI, BglI, BstEII, HpaI, PstI, and XhoI have no sites on this plasmid. HaeIII, XbaI, and HindIII have 5, 6, 14 sites, respectively.

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MLS계 항생물질 유도 내성 유전자의 크로닝과 유전자의 조절기전 -Streptococcus sp. TR-1에서 분리한 pMB 4 Plasmid의 MLS계 항생물질 유도내성- (Cloning of the MLS Antibiotics Inducible Resistance Gene and Its Control Mechanism -Inducible Resistance to MLS Antibiotics of pMB4 Plasmid Isolated from Streptococcus sp. TR-1-)

  • 정순학;곽진환;김희선;심미자;최응칠;김병각
    • 약학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.139-146
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    • 1990
  • Streptococcus sp. TR-1 which has inducible resistance to MLS antibiotics was isolated from soil samples in Korea. Streptococcus sp. TR-1 was cultured in Lysis broth, then a plasmid was isolated by modified Elliker method. Bacillus subtilis UOTO277 was transformed with that plasmid. This result showed that the plasmid has the gene relating with inducible resistance to MLS antibiotics. It was named pMB4 and its size was determined about 2.4 Kb by results of digestion with various restriction enzymes. Restriction endonuclease cleavage site map of pMB4 plasmid was made by double digestion of the plasmid. pMB4 plasmid has different restriction endonuclease site map from the other plasmids that have been discovered in Streptococcus sp. so far. And it could be identified that pMB4 plasmid does not have homology with ermK of Bacillus licheniformis EMR but has homology with ermC of Staphylococcus aureus from the results of Southern hybridization.

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Streptomyces diastatochromogenes로부터 분리된 SdiI의 특성에 관한 연구 (Characterization of a Restriction Endonuclease, SdiI from Streptomyces diastatochromogenes)

  • 배무;송은숙;황혜연;임정빈
    • 미생물학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.301-305
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    • 1994
  • 토양분리 방선균 Streptomyces diastatochromogenes로부터 분리된 제한효소 SdiI은 넓은 범위의 pH(7.0~12.5)와 온도 ($-60^{\circ}C$)에서 활성을 보였으며, 고농도 (-500mM) NaCl이 있어도 작용하였다. 또한, $20~60^{\circ}C$ 온도에서 안정하며, 활성을 갖기 위해서는 $MgCl_2$를 필요로 하였다. Lambda DNA에 대한 지도 작성으로부터 XhoI의 isoschizomer로 추정되었으며, DNa 염기서열 분석 결과, 인식, 절단 서열은 다음과 같이 결정되었다. 5‘-C${\downarrow}$TCGA G-3' 3'-G AGCT${\uparrow}$C-5'

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Cloning of Steroid $\Delta^1$-dehydrogenase Gene of Arthrobacter simplex IAM 1660

  • Bae, Moo;Bae, Song-Mee;Lee, Mi-Kyung;Lee, Jeong-Kug
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제6권2호
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    • pp.142-144
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    • 1996
  • To clone the gene coding for steroid $\Delta^1$-dehydrogenase of Arthrobacter simplex, its genomic library was constructed with a , $\lambda$gt11 expression vector and immunoscreened with antiserum against the enzyme. One positive clone was found to carry a 1.6-kb EcoR I restriction endonuclease fragment of A. simplex DNA. The restriction map of the 1.6-kb EcoR I fragment was determined after cloning of the DNA into pBS vector.

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Aspartate계 아미노산 대사 효모 유전자 HOM6의 cloning 및 구조분석 (Molecular cloning and restriction endonuclease mapping of homoserine dehydrogenase gene (HOM6) in yeast saccharomyces cerevisiae)

  • 김응기;이호주
    • 미생물학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.357-363
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    • 1986
  • Synthesis of threonine and methionine in yeast, Saccharomyces cerevisiae shares a common pathway from aspartate via homoserine. HOM6 gene encodes homoserine dehydrogenase (HSDH) which catalyzes the inter-conversion of beta-aspartate semialdehyde and homoserine. The level of HSDH is under methionine specific control. A recombinant plasmid (pEK1: 13.3kb), containing HOM6 gene, has been isolated and cloned into E. coli by complenemtary transformation of a homoserine auxotrophic yeast strain M-20-20D (hom6, trp1, ura3) to a prototrophic M20-20D/pEK1, using a library of yeast genomic DNA fragments in a yeast centromeric plasmid, YCp50(8.0kb). Isolation of HOM6has been primarily confirmed by retransformation of the original yeast strain M20-20D, using the recombinant plasmid DNA which was extracted from M20-20D/pEK1 and subsequently amplified in E. coli. Eleven cleavage sites in the insery (5.3kb) have been localized through fragment analysis for 8 restriction endonucleases; Bgl II(2 site), Bgl II(1), Cla I(3), Eco RI(1), Hind III(2), Kpn I (1), Pvu II(1) and Xho I(1).

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대장균 내에서의 Bdi I Methylase 유전자의 클로닝과 발현 (Cloning and Expression of the Bdi Methylase Gene in E. coli)

  • 전희숙;김용석;최경래;노현모
    • 미생물학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.40-45
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    • 1987
  • B Brevibacterium divaricatum FERM 5948 균주로부터 Bdi I RIM 체계에 속하는 BdiI methylase 유천자를 클로닝하여 발현을 조사하였다. Bdi I methylase 유전자의 클로닝을 위해 pBR 322의 EcoRI, BamHl, Sal I 3 군데의 클로닝 site를 이 용했고 1 차 형질전환후 나온 플라스미드를 BdiI으로 자른 뒤 ligation 시키지 않고 형질전환시키는 방법을 이용하였다. 유전 자을 가지는 행질전환체의 선별은 Bdi I methylase에 의해 수정된 채조합 플라스미드는 BdiI 제한효소에 방호된다는 것에 기 초하여 선별하였는데 5.6kb의 EcoRI insert DNA를 가지는 pBDIM 116이 Bdil methylase 유전자플 가지는 것으로 판명 되었다. pBDIM 11&을 가지는 숙주셰포에서 추출한 추출용액에는 S-adenosylmethionine이 있으면 BdiI의 인지부위인 A ATCGAT에만 특정한 methylase 활성이 측정되였다. 11개의 제한효소를 이용하이 제한효소지도를 작성하였고, BdiI r restriction -modification 체계에 관해서 도 논의하였다.

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Lactobacillus plantarum Bacteriophage SC 921의 phage particle protein 및 genome의 특성 (Phage Particle Proteins and Genomic Characterization of the Lactobacillus plantarum Bacteriophage SC 921.)

  • 김재원;신영재;심영섭;유승구;윤성식
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.117-121
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    • 1998
  • 김치로부터 분리한 Lactobacillus plantarum bacteriophage SC 921은 M.O.I가 0.2일 경우 용균효과가 빠르게 진행됨을 알 수 있었고, SDS-PAGE를 실시하여 phage particle protein을 조사해 본 결과 4개의 major protein으로 구성되어 있는데 이들은 각각 48, 34, 32, 29 kDa으로 구성되어 있다. Exo III로 30분간 반응시킨 후 S1 nuclease를 처리하여 DNA의 형태를 조사해 본 결과 intact DNA는 linear form의 double strand를 유전전달 물질로 가지고 있었다. 제한효소에 대한 절단 효과를 조사한 결과, Sma I에 대해서 1개, Xba I, Cla I, Kpn I, EcoRI에 대해서 각각 2, 4, 5, 6개의 절단부위를 가지고 있으며, Hind III에 대해서는 절단부위가 매우 많은 것을 알 수 있었다. Hind III를 이용하여 intact DNA의 genome size를 측정해본 결과 약 66.5 kbp정도였다. 위의 실험결과와 restriction enzyme mapping을 통해 기존에 알려진 bacteriophage B2와 비교해본 결과 숙주 균주는 같으나 단백질적인 구조나 유전전달물질로 본 구조는 서로 다름을 알 수 있었다.

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효모에서 세포분열을 조절하는 KEM1 유전자에 관한 연구: kemi의 High Copy Suppressor (ROK1) 클로닝 (Studies on KEM1 Gene Controlling Mitotic Cell Division in Yeast: Molecular Cloning of a High Copy Suppressor (ROK1) of kem1)

  • Kim, Sang Hyeon;Kim, Jin Mi
    • 미생물학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.37-41
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    • 1992
  • Saccharomjyces cerevisiae에서 KEM1 유전자는 세포분열시 microtubules과 spindle pole body 구조체의 새로운 기능에 관여하는 것으로 알려져 있다. KEM1과 유사하거나 연관이 있는 기능을 갖는 새로운 유전자들을 찾는 목적으로 kem1 돌연변이의 high copy suppressor 유전자, ROK1, 를 찾아냈다. ROK1은 high copy 플라스미드에 클로닝되었을 때 kem1을 suppression 하고, low copy 플라스미드에서는 suppression 하지 않는다. kem1 돌연변이의 benomyl에 대한 민감성과 Kar enhancing 표현서을 동시에 suppression 하는 두 개의 클론을 분리하였으며, 제한요소로 분석했을 때 9.0kb의 insert 를 지닌 동일한 클론이었다. 이 suppressor 유전자 ROK1의 제한지도를 작성하였고, 그 결과 KEM1 이 아닌 다른 유전자인 것으로 나타났다. Suncloning 실험으로 ROK1은 적어도 3.0kb의 기능부위를 갖음을 확인했다.

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