• 한국수산과학회지
• /
• 제47권5호
• /
• pp.522-526
• /
• 2014

Pyropia, economic red algae species, have been cultivated in Korea (referred to as 'gim'), Japan ('nori'), and China ('zicai') for over 300 years. Vegetable seaweed Pyropia species are sold in the public markets in various forms as commercial seafoods. In Korea, two kinds of Pyropia seafood made with species of Pyropia and Ulva (sea lettuce, referred to as 'parae') are also sold. These are referred to as 'parae-gim' (with Pyropia spp. and U. linza) and 'gamtaegim' (with Pyropia spp. and U. prolifera). There is currently no method for identifying the seaweed species that comprise Pyropia seafood products. Therefore, we developed novel molecular markers to identify Ulva species in commercial Pyropia seafoods. Based on rbcL molecular markers, we identified informative characteristics to discriminate U. linza and U. prolifera as seafood ingredients. Moreover, PCR with 3'-end mismatch primers successfully isolated the specific rbcL sequences of U. linza and U. prolifera from Pyropia seafoods. Therefore, our novel molecular markers will be useful for identifying the ingredient species of commercial seafoods.

• ALGAE
• /
• 제30권4호
• /
• pp.265-274
• /
• 2015

Thorea indica sp. nov. is described from the Sai River, Uttar Pradesh, India (26°39′00.7″ N, 80°47′38.3″ E). Its classification is based on molecular sequences of the plastid-encoded RuBisCO large-subunit gene, rbcL and the barcode region of the mitochondrial encoded cytochrome c oxidase subunit 1, cox1, and morphological data. The sequence analyses confirm a new species of Thorea. The cox1 barcode sequence had 90.4-90.8% identity with Thorea sp. from Australia and Thorea hispida from Hawaii and China. Based on rbcL sequences the Indian specimen was positioned in a major clade with high support (>95 bootstrap and 0.95 posterior probability) containing two other species: T. okadae from Japan and T. hispida from the continental USA, Hawaii, the UK, and China. The divergences among these sequences were T. indica vs. T. okadae (2.8%) and T. indica vs. T. hispida (2.9-3.4%). The comparison of morphological characters of Thorea from India was not conclusive due to the inadequate descriptions in previous reports: most specimens reported as T. hispida fit within the circumscription of T. indica as described here. The previous report of T. siamensis from the Sai River is incorrect and the specimens fit within our description of T. indica. Thorea indica and T. okadae can be distinguished by minor morphometric characters and sexuality (dioecious vs. monoecious).

• ALGAE
• /
• 제31권2호
• /
• pp.155-165
• /
• 2016

Green microalgae from the class Chlorophyceae represent a major biodiversity component of eukaryotic algae in continental water. Identification and classification of this group through morphology is a hard task, since it may present cryptic species and phenotypic plasticity. Despite the increasing use of molecular methods for identification of microorganisms, no single standard barcode marker is yet established for this important group of green microalgae. Some available studies present results with a limited number of chlorophycean genera or using markers that require many different primers for different groups within the class. Thus, we aimed to find a single marker easily amplified and with wide coverage within Chlorophyceae using only one pair of primers. Here, we tested the universality of primers for different genes (tufA, ITS, rbcL, and UCP4) in 22 strains, comprising 18 different species from different orders of Chlorophyceae. The ITS primers sequenced only 3 strains and the UCP primer failed to amplify any strain. We tested two pairs of primers for rbcL and the best pair provided sequences for 10 strains whereas the second one provided sequences for only 7 strains. The pair of primers for the tufA gene presented good results for Chlorophyceae, successfully sequencing 21 strains and recovering the expected phylogeny relationships within the class. Thus, the tufA marker stands out as a good choice to be used as molecular marker for the class.

• ALGAE
• /
• 제36권3호
• /
• pp.165-174
• /
• 2021

Radicilingua Papenfuss and Calonitophyllum Aregood are two small genera of the family Delesseriaceae that consist of only three and one taxonomically accepted species, respectively. The type species of these genera, Radicilingua thysanorhizans from England and Calonitophyllum medium from the Americas, are morphologically very similar, with the only recognized differences being vein size and procarp development. To date, only other two species were recognized inside the genus Radicilingua: R. adriatica and R. reptans. In this study, we analysed specimens of Radicilingua collected in the Adriatic and Ionian Sea (Mediterranean), including a syntype locality of R. adriatica (Trieste, northern Adriatic Sea), alongside material from near the type locality of R. thysanorhizans (Torpoint, Cornwall, UK). The sequences of the rbcL-5P gene fragment here produced represent the first molecular data available for the genus Radicilingua. Phylogenetic reconstruction showed that the specimens from the Adriatic and Ionian Seas were genetically distinct from the Atlantic R. thysanorhizans, even if morphologically overlapping with this species. A detailed morphological description of the Mediterranean specimens, together with an accurate literature search, suggested that they were distinct also from R. adriatica and R. reptans. For these reasons, a new species was here described to encompass the Mediterranean specimens investigated in this study: R. mediterranea Wolf, Sciuto & Sfriso. Moreover, in the rbcL-5P tree, sequences of the genera Radicilingua and Calonitophyllum grouped in a well-supported clade, distinct from the other genera of the subfamily Nitophylloideae, leading us to propose that Calonitophyllum medium should be transferred to Radicilingua.

• 한국양식학회지
• /
• 제22권1호
• /
• pp.28-33
• /
• 2009

본 연구에서는 강도다리의 담수순화방법으로 급격한 염분변화(AD)와 단계적인 염분변화(SD II과 III)를 주었을 때 강도다리의 생리적 반응을 조사하였다. AD에서 Ht, RBC 및 Hb는 Exp. II에 비해 증가하는 값이 높게 나왔으며 회복하는 속도도 느렸다. 그러나 SD II는 Ht, RBC 및 Hb에서 실험개시시수준과 실험종료시의 값이 유의한 차이를 보이지 않았다. AD에서 cortisol의 농도는 실험개시시 $2.1{\pm}1.0{\mu}g/mL$로부터 실험개시 후 6시간째에 $13.7{\pm}0.2{\mu}g/mL$ 급격히 증가하였으나 10일째에 $3.10{\mu}g/mL$로 실험개시시 수준으로 회복되었다. SD I에서 cortisol의 농도는 실험개시시 $2.1{\pm}1.0{\mu}g/mL$로부터 6시간째에 $13.6{\pm}0.6{\mu}g/mL$로 증가하였고, 실험종료시인 10일째에 $3.1{\pm}0.4{\mu}g/mL$로 회복되었다. SD II에서 cortisol의 농도는 실험개시시 $2.1{\pm}1.0{\mu}g/mL$로부터 6시간째와 12시간째에 각각 $10.5{\pm}2.5$, $10.8{\pm}5.6{\mu}g/mL$로 증가하는 경향을 보였으나 48시간째부터 실험개시시 수준으로 회복되는 경향을 보였다. 글루코스 농도는 AD, SD I과 II에서 cortisol의 경향과 다르게 유의한 차이를 나타내지 않았다. 삼투질농도는 실험개시시 $286.8{\pm}3.3\;mOsm/kg$으로 나타났으며, AD와 단계적 염분변화 실험구인 SD I, II에서는 실험종료 시에 각각 $266.3{\pm}8.5$, $242.0{\pm}12.5$, $269.5{\pm}4.9\;mOsm/kg$으로 유의하게 감소하는 경향을 보였다. 혈장의 $Na^+$, $K^+$ 및 $Cl^-$ 농도는 AD의 경우, $Cl^-$(mEq/L)만이 실험개시시의 수준과 유의한 변화를 볼 수 없었고, $Na^+$(mEq/L)와 $K^+$(mEq/L)는 유의하게 감소하는 경향을 보였다. SD I에서도 $Cl^-$(mEq/L)만이 실험개시시의 수준과 유의한 변화를 볼 수 없었고, $Na^+$(mEq/L)와 $K^+$(mEq/L)는 유의하게 감소하는 경향을 보였다.

• 대한수의학회지
• /
• 제30권2호
• /
• pp.157-162
• /
• 1990

The hematologic values were examined from 74 healthy mixed breed dogs in the area of Seoul. The results obtained are summarized as follows; 1. Mean${\pm}$SD values and ranges of red blood cell(RBC) count were $6.16{\pm}0.92{\times}10^6/{\mu}l$ and $4.40{\sim}8.62{\times}10^6/{\mu}l$, of hemoglobin(Hb) content $14.90{\pm}2.42g/100ml$ and 8.7~19.2g/100ml, of packed cell volume(PCV) $45.47{\pm}6.16ml/100ml$ and 30~57ml/100ml, of mean corpuscular volume (MCV) $74.80{\pm}6.83fl$ and 54.08~90.90fl, of mean corpuscular hemoglobin (MCH) $24.41{\pm}3.91pg$ and 14.19~32.97pg, of mean corpuscular hemoglobin concentration (MCHC) $32.07{\pm}3.24g/100ml$ and 22.23~39.76g/100ml, respectively. 2. The RBC count value in the age group of 3~4 years was higher (p<0.05) than the total RBC count value. The Hb content value in the age group of less than 6 months was lower (p<0.01) but in the age group of 1~2 years and the age group of 3~4 years were higher (p<0.05, p<0.01) than the total Hb content value. The PCV value in the age group of less than 6 months was lower (p<0.05) than the total PCV value. The MCHC values in the age group of 1~2 years and the age group of 3~4 years were higher (p<0.01, p<0.05) than the total MCHC value. 3. Mean${\pm}$SD values and ranges of white blood cell (WBC) count were $11.26{\pm}3.05{\times}10^3/{\mu}l$ and $6.30{\sim}18.4{\times}10^3/{\mu}l$, of band neutrophil $2.97{\pm}1.44%$ and 1~10%, of segmented neutrophil $62.81{\pm}4.92%$ and 42~70, of lymphocyte $30.55{\pm}5.69%$ and 17~50%, of monocyte $2.49{\pm}0.84%$ and 1~5%, of eosinophil $1.81{\pm}1.175$ and 1~8%, respectively. 4. The WBC count value in the age group of 7~12 months was lower (p<0.05) but in the age group of 3~4 years was higher (p<0.05) than the total WBC count value. The band neutrophil values in the age group of 1~2 years and the age group of 3~4 years were higher (p<0.05, p<0.01) than the total band neutrophil value.

• 식물분류학회지
• /
• 제39권3호
• /
• pp.135-142
• /
• 2009

엽록체 rbcL gene의 염기서열과 포자의 형태를 바탕으로 고사리삼과 식물의 계통과 제주고사리삼속의 계통학적 위치를 추정하였다. 엽록체 DNA rbcL 염기서열의 분석 결과 고사리삼과는 뚜렷하게 고사리삼계보 (Botrychioid lineage)와 나도고사리삼계보 (Ophioglossoid lineage)의 두 군으로 구분되었다. 고사리삼계보에 있어 제주고사리삼속(Mankyua)은 Helmintostachys속과 함께 분계의 기저에서 고사리삼속(Botrychium)의 자매분류군으로 분지하였으나, 이들 고사리삼속(Botrychium), 제주고사리삼속(Mankyua), 및 Helmintostachys속 사이의 계통적 유연관계는 결정되지 못했다. 고사리삼속의 경우 Sceptridium아속과 Botrychium아속이 뚜렷한 단계통을 형성하였으나, Botrypus아속에 속한 분류군들은 고사리삼속의 기저에서 다른 고사리삼속 분류군의 자매분류군으로 분지하면서 단계통이 아닌 것으로 밝혀졌다. 나도고사리삼계보를 형성하는 나도고사리삼속(Ophioglossum)의 경우, Ophioglossum아속은 단계통을 형성하였으며, Ophioglossum아속에 대해 Cheiroglossa아속 및 Ophioderma 아속이 차례로 자매분류군으로 분지하였다. 염기서열 계통수, 포자의 형태 및 외부형태의 고찰에 있어 제주고사리삼속은 Helminthostachys와 유사하지만, 계통수에서 patristic distance 뿐 아니라 포자소엽의 형태가 뚜렷이 구분되어 이들 2속은 독립된 속으로 판단된다.

• 해양환경안전학회지
• /
• 제24권7호
• /
• pp.967-972
• /
• 2018

최근 우리나라 연안에서 출현빈도가 점차 늘어나고 있는 침편모조류에 속하는 Chattonella는 대표적인 유해조류 중 하나로, 이들 종은 세포벽이 없어, 단순히 세포의 형태나 크기 등 광학현미경 관찰만으로는 정확하게 동정하는 것이 어렵다. 따라서 본 연구에서는 2017년 득량만에서 발생한 Chattonella 적조 시료를 대상으로 단일 세포를 분리하고, 이들 시료의 28s rDNA, rbcL, psaA 영역을 대상으로 single-cell PCR 기법을 이용하여 종 동정을 실시하였다. 현미경 관찰 결과 장축은 평균 $74.0{\pm}10.1{\mu}m$이고 단축은 평균 $33.1{\pm}3.6{\mu}m$로 일반적인 Chattonella의 형태적 특징을 보였다. 28s rDNA, rbcL, psaA 영역을 대상으로 한 염기서열 비교 결과에서는 세 영역 모두에서 하나의 종으로 명확히 구분되지는 않았다. 하지만 C. marina, C. marina var. antiqua, C. marina var. ovata 그룹과 99~100 % 높은 서열 유사성을 보였다.

• Reproductive and Developmental Biology
• /
• 제39권1호
• /
• pp.13-21
• /
• 2015

본 연구에 사용된 공시축은 2013년 1월부터 2014년 12월까지 국립축산과학원 가축유전자원시험장 장내에서 사육 중인 모색을 기준으로 일반한우(황우), 백한우, 흑우 및 미니한우 등 총 75여 두(황우, 백우, 흑우 그리고 미니 한우)를 대상으로 연령별, 종별 그리고 성별로 각각 분류하고, 이들에 대한 혈액학적 수치를 확인하였다. 백한우와 흑우의 혈액학적 검사 결과에서 1년 이하에서 3년 이상으로 연령이 증가됨에 따라 RBC($11.6{\sim}9.4{\times}10^6/{\mu}L$, $12.3{\sim}9.9{\times}10^6/{\mu}L$로)와 PL치($645{\sim}510{\times}10^3$/, $673{\sim}425{\times}10^3/{\mu}L$로)에서 각각 유의성 있는 감소(p<0.05)가 인정되었다. 동일 연령(2~3년)의 대조군으로서 일반한우군과 희소한우군(백우, 흑우, 미니소) 간의 비교에서는 각각 RBC 수치가($10.0{\times}10^6/{\mu}L$, $9.6{\times}10^6/{\mu}L$, $10.5{\times}10^6/{\mu}L$, $10.1{\times}10^6/{\mu}L$)와 HCT (44.8%, 43.2%, 45.8%, 43.9%), MCV(53.5 fL, 52.1 fL, 54.9 fL, 53.7 fL) 및 MCHC(28.9 g/dL, 28.3 g/dL, 29.8 g/ dL, 29.0 g/dL)에서 일반한우와 희소한우 품종들 간의 차이점이 인정되었으며, MCV와 MCHC에서도 통계적 유의성이 인정되었다(p<0.05). 또한, 백한우와 흑우의 백혈구계 검사 결과에서도 1년 이하에서 3년 이상으로 연령이 증가함에 따라 WBC 수치($12.7{\sim}9.1{\times}10^3/{\mu}L$, $13.9{\sim}11.7{\times}10^3/{\mu}L$)가 감소하는 경향이 각각 인정되었으며, 동일 연령(2~3 년)의 희소한우의 백혈구 분포의 백분율에서는 전반적으로 림프구가 40.2~52.2%를, 분엽형 호중구가 27.2~33.9%로 나타났다. 일반한우군과 백한우군 간의 백혈구계의 림프구 수치의 비교에서는 백한우군(40.2%)로 일반한우(49.8%)에 비하여 유의적으로 낮음(p<0.05)을 확인하였다.

• ALGAE
• /
• 제30권1호
• /
• pp.1-13
• /
• 2015

A new macroscopic riverine red algal species, Lemanea manipurensis sp. nov. (Batrachospermales) is described from Manipur in northeast India. It has a sparsely branched, pseudoparenchymatous thallus with a single, central axial filament that lacks cortical filaments. Spermatangia occur generally in isolated, low and indistinct patches or form an almost continuous ring around the axis. Carposporophytes project into the hollow thallus cavity without an ostiole. The most striking morphological feature is the carposporophyte with very short gonimoblast filaments having cylindrical, narrow and sparsely branched sterile filaments, the terminal cell of each branch with a single, large, elongate carpospore. The widely distributed L. fluviatilis has spherical carpospores in long branched chains. Phylogenetic analysis of rbcL sequence data and comparison with other Batrachospermales clearly show that our specimens do not align with other species of Lemanea and Paralemanea investigated thus far. Five specific names attributed in previous literature (1973-2014) to Lemanea from Manipur, L. australis, L. catenata, L. fluviatilis, L. mamillosa, and L. torulosa are rejected until critical anatomical and molecular evidence is available for specimens from the Manipur river systems. Taxa referable to Paralemanea were not confirmed for India in this study. In view of the high demand for food and medical uses of L. manipurensis in northeast India, conservation measures are needed for its long term survival. The present paper constitutes the first combined morphological / molecular study on a freshwater red alga from India.