• 제목/요약/키워드: rRNA synthesis

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Strain Identification and Comparative Analysis of Toxigenic Cyanobacteria Determined by PCR

  • Jung Jong-Mun;Jung Eun-Young;LEE You-Jung;Park Hong-Ki;Jung Mi-Eun;Ji Ki-Won;Joo Gea-Jae
    • 한국환경과학회지
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    • 제14권7호
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    • pp.649-655
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    • 2005
  • Microcystis aeruginosa is common form of cyanobacteria (blue-green algae) capable of producing toxic heptapeptide (microcystin) that cause illness or death. The comparison of molecular genetic method with the morphological characteristics of cyanobacteria was conducted. We have designed PCR primers (JJM98F, JJM1141R) for cyanobacterial 16S rRNA and phycocyanin intergenic spacer (PC-IGS) gene domain. To confirm the production of microcystins, PCR primers for the N-methyltransferase (NMT) domain of microcystin synthetase gene mcyA were designed using 21 cyanobacteria strains Most of isolated strains from the Nakdong River was classified as Microcystis aeruginosa and the similarities were $99\%$ with M. aeruginosa AF 139292. $38.1\%$ of isolated strains contained microcystin synthesis gene. NMT (N-methyltransferase) were not detected in isolated strain in several strains, which means non-toxic. However, the NMTs of the strains were detected during the cultivation.

Genetic Analysis of a Structural Motif Within the Conserved 530 Stem-Loop of Escherichia coli 16S rRNA

  • Szatkiewicz Jin P.;Cho Hyun-Dae;Ryou Sang-Mi;Kim Jong-Myung;Cunningham Philip R.;Lee Kang-Seok
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권4호
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    • pp.569-575
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    • 2006
  • The 530 stem-loop is a 46 nucleotide stem-loop structure found in all small-subunit ribosomal RNAs. Phylogenetic and mutational studies by others suggest the requirement for Watson-Crick interactions between the nucleotides 505-507 and 524-526 (530 pseudoknot), which are highly conserved. To examine the nature and functional significance of these interactions, a random mutagenesis experiment was conducted in which the nucleotides in the proposed pseudoknot were simultaneously mutated and functional mutants were selected and analyzed. Genetic analysis revealed that the particular nucleotide present at each position except 524 was not exclusively critical to the selection of functional mutants. It also indicated that basepairing interactions between the positions 505-507 and 524-526 were required for ribosomal function, and much weaker base-pairing interactions than those of the wild-type also allowed high ribosomal function. Our results support the hypothesis that the 530 pseudoknot structure may undergo a 'conformational switch' between folded and unfolded states during certain stages of the protein synthesis process by interacting with other ligands present in its environment.

생쥐의 B 세포에서 면역글로블린 E의 분비와 사이토카인 생산에 대한 가미육군자탕의 효과 (Effects of Kamiyukgunja-tang on anti-CD40 and Recombinant Interleukin-4 induced Cytokine Production and Immunoglobulin E in Highly Purified Mouse B Cells)

  • 김운길;김동희;박양추
    • 동의생리병리학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.1065-1074
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    • 2003
  • In order to evaluate the antiallergic effects of Kamiyukgunja-tang (KYGJT), studies were done. We measured the cytotoxic activity for lung fibroblast cell, cytokines transcript expression, production of INF-γ, IL-10, IL-4, GM-CSF, IL-1 β, TNF-α. IL-5 proliferation of B cell in anti-CD40mAb plus r1L-4 stimulated murine splenic B cells. The results were obtained as follows : 1. KYGJT was not showed cytotoxicity in the fibroblast lung cell. 2. KYGJT increased the gene synthesis of INF-γ, IL-10, GM-CSF(m-RNA). 3. KYGJT decreased the gene synthesis of IL-1β, IL-4, TNF-α, IL-5(m-RNA). 4. KYGJT decreased the appearance of TNF-α significantly. 5. KYGJT decreased the appearance of IgE significantly. 6. KYGJT decreased the proliferation of B cell significantly. 7. KYGJT decreased the appearance of Histamin Release Production significantly. The facts above prove that KYGJT is effective against the allergy. Thus. I think that we should study on this continuously

2',4'-Dimethoxyflavone의 합성과 멜라닌 생성 저해 효과 (Synthesis of 2',4'-Dimethoxyflavone and Its Anti-pigmentation Effect)

  • 이범천;심관섭;김진화;김기호;이화정;표형배
    • 대한화장품학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.153-160
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    • 2006
  • 본 연구에서는 새로운 미백제를 개발하기 위하여 2',4'-dimethoxyflavone을 합성하였으며 멜라닌 형성 세포에서의 미백효과를 연구하였다 2',4'-Dimethoxyflavone은 프리 라디칼 소거활성(DPPH)이나 mushroom tyrosinase에 대한 직접적인 저해 효과는 없었다. 2',4'-Dimethoxyflavone을 48 h 처리한 B16 멜라노마 세포에서의 멜라닌 생합성 저해효과는 $5{\mu}g/mL$에서는 멜라닌생성이 27% 정도 감소되었다. 2',4'-Dimethoxyflavone은 농도에 비례해서 B16 멜라노마 세포내의 tyrosinase 활성을 저해하였으며, western blot을 이용하여 tyrosinase 단백질 발현도 감소시키는 것으로 확인되었다. 또한, RT-PCR을 이용하여 2',4'-dimethoxyflavone이 멜라닌 생성 과정에 관련하는 유전자 발현을 조사한 결과 tyrosinase와 tyrosinase 관련 단백질(TRP-1)의 mRNA발현을 억제 하였으며 TRP-2의 발현량에는 영향이 없었다. 이 결과로 2',4'-dimethoxyflavone은 멜라닌 형성세포에서 멜라닌 생성에 관여하는 타이로시나제와 TRP-1 유전자 발현 조절을 통하여 미백 효과를 나타내는 것으로 생각된다.

고콜레스테롤 식이 섭취 쥐에서 quercetin의 간 AMPK 및 microRNA-21 조절을 통한 지질대사 개선 효과 (Effects of quercetin on the improvement of lipid metabolism through regulating hepatic AMPK and microRNA-21 in high cholesterol diet-fed mice)

  • 이막순;김양하
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제55권1호
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    • pp.36-46
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    • 2022
  • Quercetin의 지질대사 개선 효과에 대한 작용기전을 확인하기 위해 C57BL/6J mouse를 사용하여 실험을 수행하였다. 고콜레스테롤혈증을 유도하기 위해 6주간 1% 콜레스테롤과 0.5% cholic acid를 함유하는 고콜레스테롤 식이를 급여하였으며, quercetin은 0.05%와 0.1%의 수준으로 고콜레스테롤 식이에 추가하여 같은 기간 동안 제공하였다. Quercetin은 혈청과 간의 중성지방 및 콜레스테롤 수준을 용량 의존적으로 감소하는 것으로 나타났다. 고콜레스테롤 식이를 섭취한 쥐의 간에서 지방 합성을 촉진하는 SREBP-1c, ACC1 및 FAS 유전자 발현이 quercetin 섭취에 의해 억제되는 것을 확인하였다. Quercetin은 간세포 내에서 에너지 대사를 조절하는 AMPK 활성을 증가시켰다. 이에 반해 암세포 증식을 촉진하고 지방간에서 높게 발현되는 miR-21 발현은 quercetin 섭취에 의해 감소되었다. 본 연구의 결과는 quercetin이 고콜레스테롤 식이 섭취 쥐에서 혈청과 간의 지질 수준을 낮추는 지질대사 개선 효과가 있으며, 이러한 효과의 일부는 간 내 지방합성 유전자 (SREBP-1c, ACC1 및 FAS) 발현, AMPK 활성 및 miR-21 조절을 통해 매개된다는 것을 시사한다.

프로테옴 분석에 의한 Bacillus subtilis PyrR 돌연변이체의 특성 (Characterization of a PyrR-deficient Mutant of Bacillus subtilis by a Proteomic Approach)

  • 설경조;조현수;김사열
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.9-19
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    • 2011
  • Bacillus subtilis의 pyrimidine biosynthetic (pyr) operon은 UMP의 de nove 생합성에 관여하는 enzyme들을 encode할 뿐만 아니라, 조절단백질인 PyrR도 encode한다. PyrR은 pyr mRNA-binding 조절 기능과 uracil phosphoribosyltransferase activity를 동시에 가지는 bifunctional 단백질이다. 본 연구에서는 Proteomic analysis를 이용하여 Uracil - 환경에서 DB104${\Delta}$pyrR의 단백질 패턴을 분석하여 단백질 레벨에서 PyrR 단백질의 실질적인 조절 양상을 관찰하였다. 두 균주의 세포질 단백질은 다양한 발현의 차이를 보였으며, Silver 염색된 2D-gel의 pI 4~10 사이에서는 1,300여개의 단백질이 검출되었으며, 단백질 발현 차이를 보이는 172개의 spot 중에서 42개의 단백질이 identification 되었다. 그 결과 pyr operon의 단백질(PyrAa, PyrAb, PyrB, PyrC, PyrD, and PyrF)이 모두 Up regulation이 이루어지고 있음을 확인할 수 있었으며, 이것은 단백질 레벨에서 Pyrimidine 생합성 과정이 PyrR에 의해서 정확히 Regulation 되어짐을 확인할 수 있었다. 또한 Pyrimidine 생합성의 Up regulation과 Down regulation 상태의 단백질의 패턴 양상도 분석할 수 있게 되었다. Pyrimidine의 생합성 과정은 DNA를 구성하는 기본적인 구성 요소를 생산하는 과정으로서 여러가지 Metabolism 가운데 중요한 위치를 차지하고 있다. 만약 Pyrimidine의 생합성 과정이 Over- expression된다면 다른 Metabolism의 균형에도 변화가 올 것이다. Proteomics Analysis에 이용한 DB104${\Delta}$pyrR 균주는 Pyrimidine 생합성의 조절에 관여하는 PyrR knock out 균주로서 Uracil - 환경에서는 전체적인 Pyrimidine 생합성 조절이 Up regulation이 되어지므로 Up regulation 동안 어떤 Metabolism에 영향을 주는지 관찰을 할 수 있게 되었다. 특히 Amino Acid Metabolism에 관계있는 단백질의 Up regulation이 이루어짐을 관찰할 수 있었으며 이것은 현재 각광을 받고 있는 단백질 산업에 응용함으로써 산업적으로 많은 기대를 할 수 있을 것으로 예상되어진다.

생쥐의 B 세포에서 IgE의 분비와 Cytokine 생산에 대한 소청룡탕(小靑龍湯)의 효과(效果) (The Inhibitory Effects of SoCheongRyongTang(SCRT) on Cytokine Production and Secretion of IgE in Highly Purified Mouse B cells)

  • 이정은;한영주;박양춘;배한호
    • 대한한방내과학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.249-259
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    • 2003
  • Objective : We aimed to identify the inhibitory effects of SocheongRyoungTang on Cytokine Production and Secretion of IgE in Highly Purified Mouse B cells. This experiment was designed to investigate the effect of SoCheongRyongTang(SCRT) on Antiallergy. Materials and Methods : We measured the cytotoxic activity for cytokines transcript expression, production of $IL-1{\beta},\;IL-4,\;IL-6,\;IL-10,\;IFN-{\gamma},\;TNF-{\alpha},\;TGF-{\beta}$ proliferation of B cell in anti-CD40mAb plus rIL-4 plus HRF stimulated murine splenic B cells and histamine in anti-CD40mAb plus rIL-4 plus HRF stimulated mast cells. Results : 1. SCRT increased the gene synthesis of $IFN-{\gamma}(m-RNA)$, the appearance of IL-10, $IFN-{\gamma}$. 2. SCRT decreased the gene synthesis of $IL-l{\beta},\;IL-4,\;TGF-{\beta}(m-RNA)$ and the appearance of $IL-l{\beta},\;IL-4,\;TGF-{\beta},\;IgE$ significantly. Conclusion : SCRT decreased the proliferation of B cell significantly. According to the above results, it is suggested that SCRT extract might be usefully applied for prevention and treatment of Allergic disease.

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손바닥선인장 복합물이 Streptozotocin으로 유발된 당뇨 쥐의 지질대사에 미치는 효과 (Effects of Opuntia ficus-indica Complex on Lipid Metabolism in Streptozotocin-induced Diabetic Rats)

  • 윤진아
    • 한국식품영양학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.526-534
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    • 2013
  • This study was conducted to examine the effects of Opuntia ficus-indica complex (OF) on the lipid metabolism, bile acid in feces, alanine aminotransferase (ALT) activity, aspatate aminotransferase (AST) activity, composition of urine and expression of cholesterol related mRNA in streptozotocin (STZ)-induced diabetic rats. Thirty two male Sprague-Dawley rats were randomly divided into non-diabetic control (NC), diabetic control (DC), diabetic OF of 2% (OF-2) and diabetic OF of 5% (OF-5), then each group was fed for 3 weeks. Plasma total cholesterol, non-esterified fatty acids (NEFA), total cholesterol, low density lipoprotein (LDL), very low density lipoprotein (VLDL) were decreased significantly (p<0.05) in OF-5 group compared to DC, but high density lipoprotein (HDL) was not changed. AST and ALT were also reduced and bile acid excretion was improved. Composition of urine in OF-5 was almost same in NC. The expression of cholesterol $7{\alpha}$-hydroxylase (CYP7A1), 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase (HMG-CoA-R), Low density lipoprotein receptor (LDL-R) mRNA indicated that feeding OF have the effects of cholesterol decreation in plasma by synthesis of bile acid from cholesterol. These results provide experimental evidence about improved lipid metabolism of the OF feeding in the STZ-induced diabetic rats.

인간유래각질형성세포에서 호장근 추출물이 피부장벽 보호능과 보습능에 미치는 영향 (The effects of the Reynoutria japonica on skin-barrier and moisturizing in HaCaT cells)

  • 강은정;박지아;최윤식
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.965-976
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    • 2023
  • 호장은 마디풀과에 속하는 다년초로 우리나라를 포함한 동아시아에서 잘 자생한다. 호장근은 호장의 뿌리로 항염증과 진경제로 사용되어 왔으며 유효성분으로 emodin을 포함하고 있다. 피부의 표피는 자극, 해로운 물질을 차단하고 수분 증발을 방지함으로써 체내를 보호하는 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 호장근과 그 유효성분인 emodin이 피부 장벽과 보습능에 미치는 영향에 대해 평가하고자 하였다. 먼저 호장근은 ABTS+ radicals을 우수하게 제거함으로써 항산화 효능이 뛰어남을 확인하였다. 다음으로, 실시간 중합연쇄효소반응을 통해 각질형성세포의 분화에 중요한 역할을 하는 filaggrin의 유전자 발현을 비교한 결과, 호장근과 emodin에 의해 농도-의존적으로 filaggrin mRNA 발현이 증가하였다. 또한, 호장근과 emodin은 히알루론산 합성에 중요한 역할을 하는 HAS-2 mRNA 발현을 유의하게 증가시키는 것으로 나타났다. 종합적으로, emodin을 유효성분으로 포함하는 호장근은 피부 장벽 강화와 보습능 증강을 위한 기능성 화장품 소재로서 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

Piper methysticum 의 뿌리로부터 추출한 Flavokawain B와 C가 Melan-a 세포에서 멜라닌 합성에 미치는 영향 (Flavokawain B and C, Isolated from the Root of Piper methysticum, Inhibit Melanogenesis in Melan-a Cells)

  • 류종혁;이정아;고재영;황재성
    • 대한화장품학회지
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    • 제48권1호
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    • pp.11-24
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    • 2022
  • Piper methysticum 뿌리의 에탄올 추출물은 멜라닌 세포 자극 호르몬 활성화 B16 흑색종 세포에서 멜라닌 생성을 억제하는 것으로 알려져 왔다. 이 추출물로부터 분리한 flavokawain B (FKB)와 flavokawain C (FKC)는 항멜라닌 생성 활성을 기반으로 멜라닌 생성을 억제하는 것으로 밝혀져 있다. 본 연구는 melan-a 세포에서의 멜라닌 합성에 대한 FKB 및 FKC의 억제 및 그 과정을 알아보고자 하였다. FKB와 FKC는 각각 10 μM, 5 μM 농도에서 melan-a 세포의 멜라닌 생성을 억제하였다. 그러나 FKB와 FKC 모두 세포 외 타이로시네이즈 활성은 억제하지 않았다. FKB는 타이로시네이즈 (tyrosinase, Tyr), 타이로시네이즈 연관 단백질 1 (tyrosinaserelated protein 1, TRP-1)과 2(tyrosinase-related protein 2, TRP-2), microphthalmia-associated transcription factor (MITF)의 단백질 발현량을 감소시켰으며 Tyr와 TRP-1의 mRNA 발현량을 감소시켰다. FKC는 TRP-2와 MITF의 단백질 발현량을 감소시켰으며 Tyr와 TRP-1의 mRNA 발현량을 감소시켰다. Tyr와 TRP-1의 감소된 발현은 주요 멜라닌 생성 단백질을 조절하는 MITF발현 감소로 인한 것임을 예상할 수 있었다. 다만 MITF의 mRNA 발현량은 FKB와 FKC 처리에 의해 변하지 않았기 때문에, MITF의 분해를 조절한다고 알려진 세포 외 신호 조절 키나아제(ERK)/AKT 인산화에 대한 FKB와 FKC의 영향을 확인하였다. FKB와 FKC는 AKT의 인산화를 증가시키지는 않았지만 ERK1/2의 인산화를 유의미하게 증가시켰다. 이러한 결과는 FKB와 FKC가 다양한 색소 침착 증상들에 대한 잠재적인 미백제로 도움이 될 수 있음을 말해준다.