Park, Hye-Seo;Kim, Eun-Hee;Kang, Mi-Ran;Chung, In-Kwon;Cheong, Chae-Joon;Lee, Weon-Tae
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제25권10호
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pp.1559-1563
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2004
The topoisomerase II poisoning effect of certain protoberberine alkaloids is associated with anti-cancer activity. Structure-activity relationships of protoberberine analogues substituted on the ring protons reveal that substitution at the C19 position is an important determinant of biological activity. In this study, the effects of substituent modification at the C19 position on the interaction of protoberberines with DNA are determined using UV and NMR spectroscopy. The line broadening effect on aliphatic resonances, chemical shift changes of the imino protons of HP14 upon berberine and berberrubine binding to HP14, and the rate of the exchange process between protoberberine analogs bound indicate that berberrubine binds HP14 more specifically than berberine. In addition, the free HP14 is altered by the substituent at the 19-position. UV spectra of berberrubine have shown a hypochromic effect together with a slight red shift, which are usually regarded as characteristics of DNA intercalation. These results are consistent with our previous report that the berberrubine is partially intercalated with HP14 with molar ratio 1 : 1, whereas a non-specific interaction is predominant between the berberine and HP14.
Micro-hole targets are studied to generate energetic protons from laser-thin foil targets by using 2-dimensional particle-in-cell simulations. By using a small hole, the maximum energy of the accelerated proton is increased to 4 times higher than that from a simple planar target. The main proton acceleration mechanism of the hole-targets is the electrostatic field created between the fast electrons accelerated by the laser pulse ponderomotive force combined with the vacuum heating and the target rear surface. But in this case, the proton angular distribution shows double-peak shape, which means poor collimation and low current density. By using a small cone-shaped hole, the maximum proton energy is increased 3 times higher than that from a simple planar target. Furthermore, the angular distribution of the accelerated protons shows good collimation.
Most high energy cosmic rays (CRs) are thought to be produced by diffusive shock acceleration (DSA) in supernova remnants (SNRs) within the Galaxy. Plasma and MHD simulations have shown that the self-excitation of MHD waves and amplification of magnetic fields via plasma instabilities are an integral part of DSA for strong collisionless shocks. In this study we explore how plasma processes such as plasma instabilities and wave-particle interactions can affect the energy spectra of CR protons and electrons, using time-dependent DSA simulations of SNR shocks. We demonstrate that the time-dependent evolution of the shock dynamics, the self-amplified magnetic fields and $Alfv{\acute{e}nic$ drift govern the highest energy end of the CR energy spectra. As a result, the spectral cutoffs in nonthermal X-ray and ${\gamma}$-ray radiation spectra are regulated by the evolution of the highest energy particles, which are injected at the early phase of SNRs. We also find that the maximum energy of CR protons can be boosted significantly only if the scale height of the magnetic field precursor is long enough to contain the diffusion lengths of the particles of interests. Thus, detailed understandings of nonlinear wave-particle interactions and time-dependent DSA simulations are crucial for understanding the nonthermal radiation from CR acceleration sources.
We obtained the chemical shifts of amide protons (NHs) in helical peptides at various temperatures and trifluoroethanol (TFE) concentrations using 2-dimensional NMR spectroscopy. These NH chemical shifts and their temperature dependence exhibited characteristic periodicity of 3-4 residues per cycle along the helix, where downfield shifted NHs showed larger temperature dependence. In an attempt to understand these observations, we focused on hydrogen bonding changes in the peptides and examined the validity of two possible explanations: (1) changes in intermolecular hydrogen bonding caused by differential solvation of backbone carbonyl groups by TFE, and (2) changes in intramolecular hydrogen bonding due to disproportionate variations in the hydrogen bonding within the peptide helix. Interestingly, the slowly exchanging NHs, which were on the hydrophobic side of the helix, showed consistently larger temperature dependences. This could not be explained by the differential solvation assumption, because the slowly exchanging NHs would become more labile if the preceding carbonyl groups were preferentially solvated by TFE. We suggest that the disproportionate changes in intramolecular hydrogen bonding better explain both the temperature dependence and the exchange behavior observed in this study.
Cosmic ray is composed of nuclear particles moving at a light speed. The cosmic ray affects the performance and the reliability of semiconductor devices by ionizing the semiconductor material. In this study, the radiation effects of protons, electrons, and photons, which compose the cosmic ray, on the GOS(Geostationary Orbit Satellite) were evaluated using the Monte-Carlo N-Particle code. The GOS was chosen due to the comparatively long exposure to the cosmic ray as it stays in the geostationary orbit more than 10 years. As the absorbed dose of semiconductor from electrons is much larger than those of protons, photons, and the secondary radiation, most of the radiation exposure of the semiconductors in the GOS results from that of electrons. When we compare the calculated absorbed dose with the radio-resistance of semiconductor, the Intel 486 of the Intel company is not suitable for the GOS applications due to its low radio-resistance. However RH3000-20 of MIPS and Motorola 602/603e can be applied to the Satellite when the aluminium shield is thicker than 3 mm.
A detection system was set up to measure the neutron generation rate of a recently developed D-D neutron generator. The system is composed of a Si detector, He-3 detector, and electronics for pulse height analysis. The neutron generation rate was measured by counting protons using the Si detector, and the data was crosschecked by counting neutrons with the He-3 detector. The efficiencies of the Si and He-3 detectors were calibrated independently by using a standard alpha particle source $^{241}Am$ and a bare isotopic neutron source $^{252}Cf$, respectively. The effect of the cross-sectional difference between the D(d,p)T and $D(d,n)^3He$ reactions was evaluated for the case of a thick target. The neutron generation rate was theoretically corrected for the anisotropic emission of protons and neutrons in the D-D reactions. The attenuations of neutron on the path to the He-3 detector by the target assembly and vacuum flange of the neutron generator were considered by the Monte Carlo method using the MCNP 4C2 code. As a result, the neutron generation rate based on the Si detector measurement was determined with a relative uncertainty of ${\pm}5%$, and the two rates measured by both detectors corroborated within 20%.
The interaction of reduced riboflavin 2', 3', 4', 5'-tetrabutyrate with salicylic acid, aspirin, and salicylamide has been spectroscopically investigated to determine the binding mechanism. Hydrogen-1 and carbon-13 unclear magnetic resonance, infrared, and absoption spectra were measured in chloform-d and chloroform. The association of the reduced riboflavin with salicylic acid derivatives is different from that osidizd one. Salicylic acid and the reduced riboflavin form a cyclic hydrogen bounded complex through the imino (3-N, 5-N) protons and the carbonyl (2-C, 4-C) oxygens of the isolloxazine ring of the latter, and the carboxylic hydroxyl proton and carbonyl oxygen of the former. Aspirin and the reduced riboflavin form a complex by the same mode as salicylic acid. Salicylamide forms a cyclic hydrogen bonded complex with the reduced riboflavin through the imino (3-N, 5-N) protons and the carbonyl (2-C, 4-C) oxygens of the isoalloxazine ring, and the amino proton and the carbonyl oxygen of salic aylmide. It appears that both the oxidized and reduced form of riboflavin are associated with salicylic acid derivatives.
Giant radio relics in the outskirts of galaxy clusters have been observed and they are interpreted as synchrotron emission from relativistic electrons accelerated via diffusive shock acceleration (DSA) in weak shocks of Ms < 3.0. In the DSA theory, the particle momentum should be greater than a few times the momentum of thermal protons to cross the shock transition and participate in the Fermi acceleration process. In the equilibrium, the momentum of thermal electrons is much smaller than the momentum of thermal protons, so electrons need to be pre-accelerated before they can go through DSA. To investigate such electron injection process, we study the electron pre-acceleration in weak quasi-perpendicular shocks (Ms = 2.0 - 3.0) in an ICM plasma (kT = 8.6 keV, beta = 100) through 2D particle-in-cell simulations. It is known that in quasi-perpendicular shocks, a substantial fraction of electrons could be reflected upstream, gain energy via shock drift acceleration (SDA), and generate oblique waves via the electron firehose instability (EFI), leading the energization of electrons through wave-particle interactions. We find that such kinetic processes are effective only in supercritical shocks above a critical Mach number, $Ms{\ast}{\sim}2.3$. In addition, even in shocks with Ms > 2.3, energized electrons may not reach high energies to be injected to DSA, because the oblique EFI alone fails to generate long-wavelength waves. Our results should have implications for the origin and nature of radio relics.
The prompt gamma imaging (PGI) technique is considered as one of the most promising approaches to estimate the range of proton beam in the patient and unlock the full potential of proton therapy. In the PGI technique, a dedicated algorithm is required to estimate the range of the proton beam from the prompt gamma (PG) distribution acquired by a PGI system. In the present study, a new range estimation algorithm was developed for a multi-slit prompt-gamma camera, one of PGI systems, to estimate the range of proton beam with high accuracy. The performance of the developed algorithm was evaluated by Monte Carlo simulations for various beam/phantom combinations. Our results generally show that the developed algorithm is very robust, showing very high accuracy and precision for all the cases considered in the present study. The range estimation accuracy of the developed algorithm was 0.5-1.7 mm, which is approximately 1% of beam range, for 1×109 protons. Even for the typical number of protons for a spot (1×108), the range estimation accuracy of the developed algorithm was 2.1-4.6 mm and smaller than the range uncertainties and typical safety margin, while that of the existing algorithm was 2.5-9.6 mm.
During the formation of large-scale structures in the universe, shocks with the sonic Mach number Ms <~ 5 are naturally induced by supersonic flow motions of baryonic matter in the intracluster medium (ICM). Cosmic rays (CRs) are expected to be accelerated via diffusive shock acceleration (DSA) at these ICM shocks, although the existence of CR protons in the ICM remains to be confirmed through gamma-ray observations. Based on the results obtained from kinetic plasma simulations, we build an analytic DSA model for weak, quasi-parallel shocks in the test-particle regime. With our DSA model, the CR acceleration efficiency ranges ~ 0.001 - 0.02 in supercritical quasi-parallel shocks with sonic Mach number Ms ~ 2.25 - 5, and the acceleration would be negligible in subcritical shocks wth Ms <~ 2.25. Adopting our DSA model, we estimate gamma-ray and neutrino emissions from clusters of galaxies by performing cosmological hydrodynamic simulations. The estimated gamma-ray flux is below the Fermi-LAT upper limit. In addition, the possible neutrino emission due to the decay of charged pions in galaxy clusters would be about <~ 1% of the atmospheric neutrino intensity in the energy range of <~ 100 GeV. In this talk, we will discuss the implication of our results.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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