• 제목/요약/키워드: potato spindle tuber viroid

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RT-PCR 기법을 이용한 감자 걀쭉 바이로이드 (Potato Spindle Tuber Viroid)의 검정 (Detection of Potato Spindle Tuber Viroid Using RT-PCR Technique)

  • 정영희;전재홍;최경화;김현순;정혁
    • 한국식물병리학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.205-209
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    • 1997
  • PSTVd 를 접종시킨 감자의 Superior 품종으로부터 PSTVd RNA를 분리하여 역전사효소와 PSTVd genome 중 356 uncleotides를 증폭할 수 있는 PSTVd 특이적 primer 쌍을 사용하여 RT-PCR를 수행한 결과 356 nuclcotides의 DNA 절편이 증폭되었고 이 절편을 sequencing인 결과 PSTVd 의 유전자임을 확인하였다. 감염된 잎과 괴경에수 모두 RT-PCR 기법을 이용한 PSTVd 의 검정이 가능하였고 특히 RT 반응시 downstream primer만을 이용할 때보다 downstream과 upstream primer를 동시에 사용할 때가 PSTVd 의 검정에 더 효과적이었다.

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환상 및 선상감자 걀쪽바이로이드 RNA분자의 전기영동적 분리를 위한 효과적인 조건에 관한 연구 (Determining an Effective Electrophoretic Gel System for Separation of the Circular and Linear Potato Spindle Tuber Viroid RNA Molecules)

  • 이재열;김한집
    • 한국식물병리학회지
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    • 제3권4호
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    • pp.239-244
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    • 1987
  • 감자 걀쪽바이로이드(PSTV) RNA분자를 포함한 저분자량의 식물성 RNA분자에 대해서 0M부터 8M까지의 요소농도구배를 가진 폴리아크릴아마이드겔을 이용하여 1/40, 1/10로 희석한 완충액조건과 $17^{\circ}C,\;37^{\circ}C,\;57^{\circ}C$의 온도조건에서 전기영동을 실시하였다. 바이로이드의 RNA분자가 환상과 선상의 두가지 분자로 나뉘어지는 변성조건에서는 1/40로 희석한 TBE완충액을 포함하는 요소농도구배겔을 $57^{\circ}$에서 전기영동을 실시하는 것이 효과적이었다. 변성된 환상의 바이로이드분자에 대한 전기 영동적 이동성은 주로 요소의 농도에 따라 영향을 받는 것으로 보이는데, 이와 더불어 저 농도의 TBE완충액이 요소농도구배겔에서 환상과 선상바이로이드분자 사이에서 전기영동적 분리를 증가시켜 주었다.

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Resistance to Viruses of Potato and their Vectors

  • Palukaitis, Peter
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권3호
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    • pp.248-258
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    • 2012
  • Potato (Solanum tuberosum) is one of the most important food crops worldwide and yields of potato can be affected by virus infection. While more than 40 viruses have been found in potato, only nine viruses (potato leafroll virus, potato viruses A, M, S, V, X and Y, potato moptop virus and tobacco rattle virus) and one viroid (potato spindle tuber viroid) have a significant economic impact on potato, worldwide. This review describes the geographical distribution of the most important viruses infecting potato and the genes for resistance or tolerance that have been identified against these various infectious agents. In some cases such resistance genes have been found only in other Solanum species. Few genes for resistance to the vectors of these viruses have been obtained and even fewer have been deployed successfully. However, transgenic resistance in potato has been achieved against seven of these disease agents.

감자 걀쪽바이로드(PSTV) RNA 분자의 요소농도기울기겔에서 전기영동적 이동성에 관하여 (Electrophoretic Mobilities of the Potato Spindle Tuber Viroid RNA Molecules in the Urea-Gradient Gels)

  • 이재열
    • 미생물학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.23-27
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    • 1987
  • 바이로이드 RNA 분자를 포함한 저분자량의 식물성 RNA 분자에 대해서 0M부터 8M 까지의 요소구배를 가진 폴리아크릴아미드켈을 이용하여 전기영동적 이동성을 조사하였다. 막대모양의 바이로이드 RNA 분자는 요소구배 겔에서 전반적으로 다른 저분량의 식물성 RNA들과 마찬가지로 요소구배에 수직인 방향으로 비슷한 수준의 전기영동적 이동성을 보여주었다. 이와 달리 고리모양의 바이로이드 RNA 분자는 요소구배 겔에서 고농도의 요소구배 부분에서 보다도 저 농도의 요소구배 부분에서 더 빠르게 이동하였다. 따라서 고리모양의 바이로이드 RNA 분자는 요소구배 겔의 중간부분에서 막대모양의 바이로이드 분자의 밴드를 가로 지르는 기울기를 가진 특이한 전기영동적 이동을 나타내었다. 결과적으로 고리모양의 바이로이드 RNA 분자의 전기영동적 이동성은 0M 8M의 요소구배를 가지는 바이로이드 RNA 분자의 변성겔에서 주로 요소의 농도에 따라서 영향을 받는 것으로 보인다.

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한국에서의 감자 바이러스병 발생과 그 연구에 대한 고찰 (Review on the Occurrence and Studies of Potato Viral Diseases in Korea)

  • 함영일
    • 식물병연구
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    • 제9권1호
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    • pp.1-9
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    • 2003
  • The occurrence of potato(Sotanum tuberosum) viral diseases caused by Potato virus X(PVX), Potato virus Y (PVY), Potato leafroll virus(PLRV), Potato vims S(PVS), Potato virus M(PVM), Potato virus A(PVA), Potato virus T(PVT), Alfalfa mosic virus(AIMV), Tobacco mosic virus(TMV), Potato mop top virus(PMTV) Tobacco rattle virus(TRV) and Potato spindle tuber viroid(PSTVd), potato witches' broom phytoplasma, have been identified so far in Korea. Major viral diseases such as PVX, PVY and PLRV had been studied more deeply, however, the others are just identified and only partially characterized since the first study on the relation between PVX nucleic acid and virus protein by Kim in 1961. The most studies on potato viral diseases are mainly focused on the problems of seed potato production. The National Alpine Agricultural Experiment Station(NAAES), since it began its activities in 1961, has given special attention to this problem by doing studies to identify, characterize and control potato virus diseases. This effort resulted in the development of new potato virus detection methods as a basis for elaborating new method of control, such as the production of seed potato free of virus and the selection of new virus-resistant transgenic potatoes. The further studies of potato viral diseases required would be fallowings: the continuous monitoring for the occurrence of identified or not identified potato viruses in Korea, the isolation of resistant viral genes, the development of control method for the non-persistently transmitted viruses like PVY, special vectors such as nematode and fungus transmitted viruses, TRV and PMTV and the development of control methods against potato viral diseases by viral cross protection, therapy, transgenic plant, and the use of the agents or molecules, such as virus inhibitors and antiviral proteins, etc., blocking viral replication.

Solanum acaule 색소체 유전자형 선발을 위한 특이적 분자마커 개발 (PCR-based markers to select plastid genotypes of Solanum acaule)

  • 박태호
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제49권3호
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    • pp.178-186
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    • 2022
  • 볼리비아 유래의 4배체 감자 야생종 중 하나인 Solanum acaule는 서리, 감자역병, 감자바이러스X, 감자바이러스Y, 감자잎말림바이러스, 감자걀쭉병, 선충 등에 대한 저항성과 같이 감자의 신품종 육성에 매우 유용한 형질들을 가지고 있어 감자 육종에 많이 이용되고 있다. 그러나 이러한 유용 형질들을 재배종 감자에 전통적인 교잡에 의해 도입하는 것은 야생종과 재배종 간의 서로 다른 EBN에 따라 매우 제한적이다. 따라서, 이러한 생리적 장벽을 극복하기 위해서는 체세포융합을 이용할 수 있는데, 육종에 활용할 적절한 체세포융합체를 선발하기 위해서는 적절한 분자마커의 개발이 필수적이다. 이에, 본 연구에서는 앞서 차세대 유전체 기술에 의해 완성되어 보고된 S. acaule의 엽록체 전장 유전체 정보를 기반으로 이를 다른 8개의 Solanum 종의 엽록체 전장 유전체 정보와 비교를 통해 S. acaule 특이적인 분자마커를 개발하였다. S. acaule의 엽록체 전장 유전체 총 길이는 155,570 bp였으며, 총 158개의 유전자로 구성되어 있었다. 전체적인 구조와 유전자의 구성은 다른 Solanum 종들과 매우 유사하였고 12종의 다른 가지과에 속해 있는 종과의 계통수 분석에서 다른 Solanum 종과 매우 가까운 유연관계를 가지는 것을 확인하였다. S. acaule의 엽록체 전장 유전체와 다른 7개 Solanum 종의 엽록체 전장 유전체 다중 정렬의 결과로 각각 4개와 79개의 S. acaule 특이적인 InDel 및 SNP 영역이 확인되었으며, 이 정보를 이용하여 각각 1개씩의 InDel 및 SNP 영역 유래의 PCR 기반의 분자마커를 개발하였다. 본 연구의 결과는 S. acaule의 진화적 측면에서의 연구와 S. acaule를 이용한 감자품종 육성 연구에 기여를 할 수 있을 것이다.

2008년 우리나라 주요 작물 바이러스병 발생 상황 (Occurrence of Virus Diseases on Major Crops in 2008)

  • 김정수;이수헌;최홍수;김미경;곽해련;조점덕;최국선;김진영
    • 식물병연구
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    • 제15권1호
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    • pp.1-7
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    • 2009
  • Viruses diagnosed on crops including rice plants from farmers or agricultural extension agencies cover the country were 11 species including Broad bean wilt virus 2 (BBWV2) in 2008. Tomato spotted wilt virus (TSWV) was the most important virus having the detection rate of 22.9%. Two viruses of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) and Tobacco leaf curl virus (TLCV) inducing leaf yellow and curl diseases on tomatoes were occurred newly with the detection rate of 12.2% and 4.0%, respectively, in 2008. Rice stripe virus (RSV) was occurred on 869.5 ha mainly at Jindo and Haenam areas in Jeollanamdo province. At Jindo area, 12 plots were damaged severely with the infected hill rate of 83.8%. At the main production area of oriental melon at Seongju, almost all fruits from whole sale market at Seongju were infected with Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) as the detection rate of 87%. The areas occurred TSWV in Korea were 25 totally from 2003 including 7 areas newly reported in 2008 including Naju in Jeoallanamdo. TSWV could be reduced as 0.1 % from 5.3% by covering insect proof net in vinyl house after chemical soil sterilization. Tomato yellow leaf curl disease was occurred on April in 2008 at Tongyoung area in Kyeongsangnamdo, and detected continuously at 13 areas, 7 in Kyeongsangnamdo, 4 in Jeollabukdo and 2 in Jejudo. Potato spindle tuber viroid (PSTVd) was occurred abruptly in a confined space of a civil breeding greenhouse and a cultivar evaluation field followed by disuse 17.4 M/T of potato tubers. No PSTVd was detected at 17 fields cultivated the related potatoes to the bred company by RT-PCR.