The nucleotide sequence of Xbal-Mbol fragment of pKH7, a chloramphenicol-resistant($Cm^{r}$) plasmid isolated from multidrug-resistant S. aureus SA2, has been determined. Xbal-Mbol fragment of pKH7 was found to contain two ORFs. One ORF encoded Rap and the other encoded CAT protein. The deduced amino acid sequences of Rep and CAT of pKH7 were compared to those of pUB112 and pC221. Comparisons revealed that there was one amino acid difference in CAT between pKH7 and pUB112. CAT of pKH7 exhibited 98.6% amino acid identity to that of pC221. In case of Rep proteins, a slightly lower homology of 96.4% and 86.7% in amino acid sequences was observed between pKH7 and pUB112 and between pKH7 and pC221, respectively.
Tn5의 kanamycin 저항성 유전자를 가진 pBEL1 plasmid와 C.glutamicum cryptic plasmid인 pSR1으로 7.5kb의 새로운 plasmid를 만든 후, 이를 pCE1301이라 명명하였다. 이 pCE1301은 PEG1301은 PEG-protoplast법으로 C.glutamicum을 형질전환하였을 때 효율이 약 $3.0\times 10^3$형질전환제/$\mu g$이었으며 SalI과 EcoRI 제한효소 절단부위가 1개씩이었다. 또 Km이 없는 배지에서 25세대까지 안정하게 유지되었으며 B.flavum, E.coli에서 복제되었다. 이 pCE1301을 이용하여 C.glutamicum 의 homoserine dehydrogenase 유전자를 cloning하였다.
DNA subfragments, sopA, sopB, and sopC supporting stable maintenance of an oriC plasmid, were derived from mini-F plasmid DNA (EcoRI restriction fragment, f5) after digestion with restriction endonucleases, and cloned in vector plasmid pBR322. The recombinant plasmid obtained were introduced into E. coli KY7231 and E. coli CSR603, and proteins specified by the mini-F fragments were analysed by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Two proteins encoded by the F fragments were detected, having molecular weights of 41,000 and 37.000. The sopA protein (41K) encoded by a plasmid pXX288 was observed in the cytoplasm, whereas the sopB protein (37K) encoded by a plasmid pXX157 was in the membrane fraction. There was no novel protein band detected in the cell with a plasmid pXX300, which contained sopC fragment. Gene products of a plasmid pXX167, which is comprised of sopA, sopB, and sopC, were not detectable. Fluorography after one and two dimensional gel electrophoresis of the lysates showed that these two proteins were overproduced in the cells which were allowed to incorporate radioactive amino acid after plasmid amplification by chloramphenicol treatment. The isoelectric points of the sopA and sepB proteins were 6.6 and 7.0, respectively.
유전공학 기법으로 번형시킨 Km' plasmid 들의 전이를 30.deg.C 의 Luris-Bertani broth 에서 실시하였으며, 그 전이 빈도에 대한 donor 와 recipient 의 균주와 함께 pH 의 영향을 연구하였다. GEM 균주들과 NI 균주의 Km'plasmid 의 전이빈도는 recipient 가 MTI 일 경우 pH 7 에서 약 $10^{-5}$ 로 비슷하였으나 CS 균주인 DKC601 에서는 Km'plasmid 의 전이빈도가 $2.2 * 10^{-7}$ 로 훨씬 떨어졌다. 그리고 recipient 가 lab. strain (E. coli HB101) 인 경우에도 Km'plasmid 의 전이경향은 GEM 균주들과 NI 균주사이에 큰차이가 없었다. 또 어느 균주의 경우에나 pH 7 일 때의 전이 빈도가 $10^{-5}$ 정도로 가장 높게 나타났으며, pH 5 와 pH 9 에서는 그보다 조금 떨어졌다. 그러나 E. coli C600을 host 로 하여 제조한 CS 균주(DKC601)에서는 Km'plasmid 의 전이 빈도가 다른 GEM 균주들에 비하여 $10^{2}$$-10^{3}$ 배 낮았으며 pH 4와 9 에서 6 시간의 conjugation 후에도 전이가 전혀 일어나지 않았다. Conjugant 에서의 plasmid의 재배열은 lab, strain 을 recipient 로 했을 경우에는 별로 없었지만, NI 균주를 recipient 로 했을 경우에 많이 나타났으며, 특히 donor 가 NI 균주보다 GEM 균주인 경우에 더욱 다양하였다. 그러나 pH 에 따른 타이는 그렇게 크지 않았다.
Carboxydobacteria 의 일산화 탄소 산화에 대한 유전학적 연구를 위해 Pseudomonas caarboxydovorans 에 존재하는 pYK100 plasmid 와 pBR322 를 이용하여 pYK322 (7.2 kb, Ap, Tc) 와 pYK324 (7.2 kb, Ap, Tc) 등 두가지 재조합 plasmid shuttle 백테를 만들고, pYK100와 pACYC184를 이용하여 pYK210(5.2 kb, $CM^{r}$ ), pYK220 (5.2kb,$CM^{r}$ ), pYK230 (5.2 kb, $Cm^{r}$ ), pYK232 (5.2 kb, $CM^{r}$) 등 네가지 shuttle 벡터를 만들었다. 재조합된 벡터들은 보두 대장균에서 안정되게 복제되었다. pYK322 와 pYK220 을 이용한 carboxydobacteria 의 형질전환 실험에서 Bagdasarian 과 Timmis 의 방법 (Curr. Top. Microbiol. Immunol., 96 :47-67, 1982) 을 변형하여 0.2% succinate 가 포함된 무기염류배지에서 지수성장 중기까지 배댜ㄷ한 세균을 이용하고, 형질전환용액의 10 mM RbCI 을 100 mM KCI 로 대체하며, 형질전환용액 처리후 4.deg.C 에서의 방치시간을 12시간으로 하고, DNA첨가휴 45.deg.C 에서 3 분간 heat shock 을 준 경우에 높은 형질전환이 일어났다. 형질전환된 세균으로 부터 형질전환에 사용한 plasmid 를 발견할 수 없었는데, 이는 도입된 plasmid 가 염색체 DNA 에 결합되었기 때문인 것으로 추측된다.
The studies were conducted to explore the dffects of growth or survival against various factors and plasmid profiles of 49 Y. enterocolitica isolated from springs water. In the presence of calcium hypochlorite, y. enterocolitica was entirely extinguished by exposure for 33 hours at 0.8 ppm concentration, and was grown up to 7% NaCl, but not at 95 NaCI. Y. enterocolitica was presented optimal growth at pH 7.0 anad 9.0, and not allowth the growth at pH3.0, 5.0 and 11.0. The optimal temperature for growth of Y. enterocolitica was 25$\circ$C and 35$\circ$C, and allowed the growth at refrigerant temperature, 5$\circ$C. Y. enterocolitica was remarkably decreased by exposure for 30 seconds under UV light, and entirely extinguished by exposure for 90 seconds. Therefore, UV light was effective for sterilization of Y. enterocolitica. Fourty-nine strains of Y. enterocolitica were harbor plasmid DNA of approximately 46 Kb molecular weight.
A well characterized naphthalene-degrading strain, Pseudomonas putida PpG7 was observed to utilize limonin, a highly-oxygenated triterpenoid compound as a sole source of carbon and energy. Limonin concentrations evidenced a 64% reduction over 48 h of growth in batch cultures. Attempts were made to acquire a plasmid-less derivative via various methods (viz. Ethidium Bromide, SDS, elevated temperature & mitomycin C), among which the method involving mitomycin C ($20{\mu}g/ml$) proved successful. Concomitant with the loss of plasmid in P. putida PpG7 strain, the cured derivative was identified as a $lim^-$ phenotype. The $lim^+$ phenotype could be conjugally transferred to the cured derivative. Based on the results of curing with mitomycin C, conjugation studies and presence of ndo gene encoding naphthalene 1,2 dioxygenase, it was demonstrated that genes for the limonin utilization were encoded on an 83 kb indigenous transmissible Inc. P9 NAH plasmid in Pseudomonas putida PpG7 strain.
Pnicillinase를 분필하는 Streptomyces bobili YS-40균주의 plasmid DNA를 phemol방법으로 유출하여 Bocillus subtilis IAM 12118균주에 형질 전환시켜서 penicillin 내성 plasmid DNA가 표현되게 하였다. 형질전환에 미치는 최적 pH와 온도는 각각 7.0, 3$0^{\circ}C$으로 나타났다. DNA와 Competent cell을 20분 이상 접촉시킴으로서 형질전환이 잘 일어났으며 DNA의 농도가 증가할수록 transformant의 수도 증가했다. DNA inhibitor 로 사용되는 lysine 의 첨가로 형질전환의 빈도가 약 6배정도 상승되었으며 chloramphenicol은 형질전환의 빈도에 별 영향을 미치지 않았다.
B. amyloliquefaciens의 $\alpha$-amylase 유전자가 S. cerevisiae 내에서 형질발현하는 가를 조사하기 위하여 본, 연구에서 YRp7 plasmid에 B. amyloliquefaciens amylase유전자를 cloning하여 만든 pEA24를 형질전환시켰다. 먼저 YRp7 plasmid를 이용하여 형질전환 최적 조건을 검토하여 본 바, PH 7과 8사이, 반응온도 3$0^{\circ}C$에서 40%의 polyethylene glycol(MW 4,000)을 처리한 후 2 %의 agar를 함유한 재생배지에 중층도말 하였을 때 형질전환율이 가장 높았다. 형질전환주로부터 생성된 amylase의 활성을 측정한 결과, S. cerevisiae에서 약간의 amylase활성을 나타내어 최고 B. amyloliquefaciens의 2% 정도였고, 세포외효소는 검출되지 않았다. 이들 형질전환 주가 가지고 있는 pEA24 plasmid의 안정성을 조사한 결과 YRp7보다 불안정하였으며, 추출한 DNA를 전기영동하여 그 band를 확인하였다.
A replication initiation gene was identified and its nucleotide sequence has been determined from a 3.8 kb, chloramphenicol acethyltransferase conferring R-plasmid pSBK203 of Staphylococcus aures. Location of the replication related region of pSBK 203 was determined by interuption with pUC 119 at XBaI and MspI sites which resulted in inactivation of replication in Bacilius subtilis. Base sequence of this region revealed on open reading frame of 942 base pairs, which encoded a 314 amino acid protein. Base sequence homology with other rep of pT181 family plasmids such as pT181, pC221, pC223, pS194, pU112, and pCW7 was ranged from 78% to 97% and the predicted amino acid sequence homology was from 72% to 95%.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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