• 제목/요약/키워드: pel gene

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Glucosylated Polyethylenimine as a Tumor-Targeting Gene Carrier

  • Park In-Kyu;Cook Seung-Eun;Kim You-Kyoung;Kim Hyun-Woo;Cho Myung-Haing;Jeong Hwan-Jeong;Kim Eun-Mi;Nah Jae-Woon;Bom Hee-Seung;Cho Chong-Su
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제28권11호
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    • pp.1302-1310
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    • 2005
  • Glucosylated polyethylenimine (GPEI) was synthesized as a tumor-targeting gene carrier through facilitative glucose metabolism by tumor glucose transporter. Particle sizes of GPEI/DNA complex increased in proportion to glucose content of GPEI, whereas surface charge of the complex was not dependent on glucosylation, partially due to inefficient shielding of the short hydrophilic group introduced. GPEI with higher glucosylation (36 mol-$\%$) had no cytotoxic effect on cells even at polymer concentrations higher than 200 $\mu$g/mL. Compared to unglucosylated PEl. glucosylation induced less than one-order decrease of transfection efficiency. Transfection of GPEI/DNA complex into tumor cells possibly occurred through specific interaction between glucose-related cell receptors and glucose moiety of GPEI. Gamma imaging technique revealed GPEI/DNA complex was distributed in liver. spleen. and tumors.

제주지역에서 분리한 감자 줄기검은병균의 유전적 특성 (Genetic Characterization of Potato Blackleg Strains from Jeju Island)

  • 서상태;이승돈;이중섭;한경숙;장한익;임춘근
    • 식물병연구
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    • 제11권2호
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    • pp.140-145
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    • 2005
  • 제주지역의 감자 줄기검은병징으로부터 분리한 12균주의 유전적 특성을 분석하기 위해 Eca-specific PCR, PCR-RFLP, ERIC-PCR을 실시하여 그 결과를 E. carotovora대조균들과 비교하였다. Eca-specific PCR 결과 Eca 대조균들은 특이적 밴드를 형성한 반면, 줄기검은병균은 특이적 밴드를 형성하지 않았다. 또한, pel유전자의 RFLP분석 결과 줄기검은병균은 pattern 2를 나타내었으나, Eca 균주는 pattern 3을 나타내어 Eca와는 다른 특성을 보여주었다. 16S rDNA의 RFLP분석결과 이번 실험에 이용된 대부분의 균주가 pattern 1을 나타냈지만, 12개의 줄기검은병균 중 11개의 균이 pattern 2을 나타내어 Ecc와도 다른 특성을 보여주었다. 제주지역의 무름병징과 줄기검은병징을 나타내는 균주들의 유전적 관계를 분석하기 위해 ERIC-PCR을 실시한 결과 줄기검은병균들은 특이적 밴드를 형성하였으며, 서로 높은 유연관계를 보여주었다. 따라서 제주지역의 줄기검은병징으로부터 분리한 균주들은 Eca, Ecc균들과는 다른 특성을 가지고 있음을 알 수 있었다.

대장균에서 5-Enolpyruvylshikimate 3-Phosphate Synthase의 대량 발현 및 Periplasmic Space로의 Transport (Overexpression and Periplasmic Transport of 5-Enolpyruvylshikimate 3-Phosphate Synthase in E. coli)

  • 김남일;임재윤;조태주
    • 미생물학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.1-6
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    • 1997
  • 5-Enolpyruvylshikimate 3-phosphate(EPSP) synthase는 방향족 아미노산을 생합성하는 shikimate phathway의 6번째 효소로 광범위 제초제인 glyphosate의 target enzyme이다. 본 연구에서는, glyphosate에 저해를 받지 않는 EPSP synthase를 개발하고자 하는 연구의 한 단계로서, 우선, EPSP synthase를 대량 발현시킬수 있는 expression vector인 pET-25b를 사용하여 발현시킨 다음, 발현된 효소가 periplasmic space로 transport되는지 또 발현된 단백질이 효소 활성을 가지고 있는지 확인하고자 하였다. 그 결과, pelB leader를 앞에 붙여 발현시킨 EPSP synthase는 periplasmic space로 제대로 transport되며, 단백질 생산 및 periplasmic space로의 수송은 induction 온도에 의해 크게 좌우된다는 것을 관찰하였다. Periplasmic space로 수송되는 EPSP synthase의 양은 $34^{\circ}C$에서 induction시켰을 때 가장 많은 것으로 나타났다. 한편, pET-25b를 이용하여 발현시킨 EPSP synthase는 C-terminal 부위에 HSV-tag, His-tag등 26개 아미노산이 더 있는 상태로 만들어지는데, His-tag은 $Ni^{2+}$-affinity chromatography를 통한 정제에, HSV-tag은 Western blotting을 통한 detection에 각각 이용할 수 있다. 또한, 이와 같이 발현된 recombinant EPSP synthase는 phosphocellulose resin에 결합하였다가 기질인 shikimate 3-phosphate와 phosphoenolpyruvate에 의해 elution되며, glyphosate에 의해 저해되는등 wildtype효소와 같은 효소 특성을 보였다.

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알칼리내성 Bacillus sp. YA-14 유래의 Pectate Lyase 유전자를 함유한 재조합균주로부터 효소의 정제 및 특성 (Purification and Properties of Pectate Lyase Produced by Recombinant Strain -Containing pelK Gene from Alkalitolerant Bacillus sp. YA- 14)

  • 한혜정;김진만;박희경;배동훈;유주현
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권6호
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    • pp.655-662
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    • 1992
  • 알칼리내성 Bacillus sp. Ya-14 유래의 pectate lyase 유전자를 함유한 재조합균주로부터 affinity method, CM-cellose column chromatography와 gel filtration을 통해 효소를 정제하였으며 정제효소의 수율은 10.2, 정제도는 258배였다. 효소의 최적활성 pH는 10.0이었고 pH4.0-10.0까지의 범위에서 안정성이 있었으며, 최적활성온도는 $60^{\circ}C$이고 $50^{\circ}C$까지 열안정성이 있으며, SDS-PASGE에 의해 추정된 분자량은 43KDa 이었다. 아미노산 조정 분석 결과 polar, basic 아미노산의 함량이 높고 특히 Ser, Gly, Tyr의 함량이 높았으며, 정제효소의 N-terminal은 Ala-Asp-Leu-Gly-His-Gln-Thr의 아미노산 서열이었다.

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Chemical Composition and Quorum Sensing Inhibitory Effect of Nepeta curviflora Methanolic Extract against ESBL Pseudomonas aeruginosa

  • Haitham Qaralleh
    • 대한약침학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.307-318
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    • 2023
  • Objectives: Bacterial biofilm is regarded as a significant threat to the production of safe food and the arise of antibiotic-resistant bacteria. The objective of this investigation is to evaluate the quorum sensing inhibitory effect of Nepeta curviflora methanolic extract. Methods: The effectiveness of the leaves at sub-inhibitory concentrations of 2.5, 1.25, and 0.6 mg/mL on the virulence factors and biofilm formation of P. aeruginosa was evaluated. The effect of N. curviflora methanolic extract on the virulence factors of P. aeruginosa, including pyocyanin, rhamnolipid, protease, and chitinase, was evaluated. Other tests including the crystal violet assay, scanning electron microscopy (SEM), swarming motility, aggregation ability, hydrophobicity and exopolysaccharide production were conducted to assess the effect of the extract on the formation of biofilm. Insight into the mode of antiquorum sensing action was evaluated by examining the effect of the extract on the activity of N-Acyl homoserine lactone (AHL) and the expression of pslA and pelA genes. Results: The results showed a significant attenuation in the production of pyocyanin and rhamnolipid and in the activities of protease and chitinase enzymes at 2.5 and 1.25 mg/mL. In addition, N. curviflora methanolic extract significantly inhibited the formation of P. aeruginosa biofilm by decreasing aggregation, hydrophobicity, and swarming motility as well as the production of exopolysaccharide (EPS). A significant reduction in AHL secretion and pslA gene expression was observed, indicating that the extract inhibited quorum sensing by disrupting the quorum-sensing systems. The quorum-sensing inhibitory effect of N. curviflora extract appears to be attributed to the presence of kaempferol, quercetin, salicylic acid, rutin, and rosmarinic acid, as indicated by LCMS analysis. Conclusion: The results of the present study provide insight into the potential of developing anti-quorum sensing agents using the extract and the identified compounds to treat infections resulting from quorum sensing-mediated bacterial pathogenesis.

Streptavidin이 융합된 GFP항원 특이적인 VHH 항체의 기능적 발현 (Functional Expression of an Anti-GFP Camel Heavy Chain Antibody Fused to Streptavidin)

  • 한승희;김진규
    • 생명과학회지
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    • 제28권12호
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    • pp.1416-1423
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    • 2018
  • Biotin에 강한 결합 친화력($K_D=10^{-14}M$)과 함께 streptavidin의 tetramer 특징은 VHH 항체를 streptavidin에 융합시키게 하여 biotinylated horseradish peroxidase를 사용하는ELISA 와Western blot analysis 등의 면역분석법에서 VHH 항체의 항원결합력을 증가시키는데 응용 가능하다. 이를 응용하기 위해 우리는 Streptomyces avidinii 염색체 DNA로부터 PCR을 통해 streptavidin유전자를 증폭하고 이를 green fluorescent protein항원에 특이적으로 결합하는 8B9 VHH 항체유전자에 융합시켰다. 대장균에서 수용성 융합단백질로 발현시키기 위해 pUC119 플라스미드에 기초한 발현시스템을 사용하였다. 즉 lacZ promoter를 사용하여 IPTG에 의해 단백질발현을 유도하게 하였으며, 아미노말단에 pelB leader를 두어 발현된 단백질의 periplasmic space로 이동하게 하여 수용성 단백질형태의 분비를 촉진하였으며 카르복시말단에 6개의 polyhistidine tags를 두어 $Ni^+$-NTA-agarose column을 사용하여 발현된 단백질을 정제하였다. Streptavidin이 biotin에 강하게 결합함으로 대장균에 독성을 나타냄에도 불구하고 본 수용성 융합단백질은 성공적으로 발현되었다. SDS-PAGE에서 가열하는 경우 변성되어 30.6 kDa를, 가열하지 않는 경우에는 자연 상태의 122.4 kDa을 나타내었다. 이는 8B9 VHH항체에 융합된 streptavidin moiety에 의해 monomer subunit가 비공유결합으로 tetramerization됨을 제시해준다. 또한 본 융합단백질은 ELISA와 Westernblot analysis에서 보여진 것처럼 parental streptavidin과 유사한 biotin결합력과 green fluorescent protein항원 결합력을 모두 나타내었다. 결론적으로 streptavidin에 융합된 8B9 VHH 항체형태의 융합단백질은 대장균에서 수용성 tetramer로 성공적으로 발현 및 정제되었으며 biotin과 green fluorescent protein 항원에 동시에 결합함으로써 tetrameric and bifunctional VHH 항체제조의 가능성을 제시해주었다.