• 제목/요약/키워드: parent vector

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Streptomyces griseus IFO13350 유래 sprA 및 sprB 유전자를 이용한 Pretense 생산균주 개발 (Development of a Recombinant Streptomyces griseus with sprA and sprB Genes for Proteolytic Enzyme Production)

  • 황지환;이창권;이강무;조병기;박해룡;황용일
    • 미생물학회지
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    • 제41권1호
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    • pp.87-92
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    • 2005
  • 방선균 Streptomyces griseus에서 상업적 목적으로 생산되는 protease인 protease는 serine protease, alkaline protease, aminopeptidase및 carboxypeptidase로 구성되어 있는 복합체로서 의 약용 소염제로 널리 사용되어지고 있다. 본 연구에서는 기존에 개발되어 있는 방선균용 integration vector인 pSET152로부터 목적산물의 대량발현을 위해 방선균용 promoter ermE가 cloning된 새로운 integration vector인 pHJ101을 개발하였고, pretense의 생산량 증대에 사용하였다. 새로 개발된 integration vector에 S. griseus protease A를 코드하고 있는 유전자, sprA와 S. griseus pretense B유전자, sprB를 각각 cloning하여 plasmid pHJ201과 pHJ202를 구축하였다. 이들 plasmid들을 S. griseus IFO 13350에 형질전환하여 발현용plasmid가 chromosome에 integration된 재조합 균주 S. gliseus HA와 S. griseus HB를 얻었다. 이들 재조합균주로부터 전체 protease의 생산량을 확인한 결과, 모균주보다 각각 S. griseus HA는 약 5.3 배, S. griseus HB는 약 5 배 정도 생산량이 증대되었다. 이들 결과로부터 특정유전자의 고발현용 integration vector의 제작이 확인되었으며, 전체 protease의 생산량 증대의 가능성이 시사되었다.

동적 비트 할당을 통한 다차원 벡터 근사 트리 (Multi-Dimensional Vector Approximation Tree with Dynamic Bit Allocation)

  • 복경수;허정필;유재수
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제4권3호
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    • pp.81-90
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    • 2004
  • 최근 컴퓨팅 환경의 급속한 발전으로 다양한 응용에서 다차원 데이터에 대한 활용이 증가되고 있다. 본 논문에서는 내용 기반 다차원 데이터 검색을 위한 벡터 관사 트리를 제안한다 제안하는 색인 구조는 공간 분할 방식과 벡터 근사화 기법을 이용하여 영역 정보를 표현하기 때문에 하나의 노드 안에 많은 영역 정보를 저장하여 트리의 높이를 감소시킨다 또한 다차원의 데이터 공간에 동적인 비트로 할당하여 다차원색인 구조의 문제점인 '차원의 저주 현상'을 해결한다. 또한 군집화된 데이터에 대해서 효과적인 표현 기법을 제공한다. 자식 노드의 영역 정보는 부모 노드를 기준으로 상대적으로 표현함으로서 좀더 정확한 영역을 표현할 수 있다. 제안하는 색인 구조의 우수성을 보이기 위해 실험을 통해 기존에 제안된 색인구조와의 비교 분석을 수행한다.

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다해상도 움직임 예측을 이용한 동영상 물체탐지 알고리즘 (An algorithm for Video Object Detection using Multiresolution Motion Estimation)

  • 조철훈;박장한;이한우;남궁재찬
    • 대한전자공학회논문지SP
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    • 제40권1호
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    • pp.87-95
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    • 2003
  • This paper proposes an object detection algorithm using the Multiresolution Motion Estimation(MRME) in wavelet d야main. A existing motion estimation method has characteristics of motion estimation but it requires having computation. Motion estimation in higher resolution used the motion vector of the lower resolution with the MRME that has parent-child relationship on wavelet coefficients. This method reduces the search area of motion estimation in higher resolution and computational complexity. The computational complexity of the proposed method is about 40% of the existing method using 3-level Set Partitioning in Hierarchical Trees(SPIHT) wavelet transform. The experimental results with the proposed method showed about 11% decrease of Mean Absolute Difference(MAD) and gains able to precise tracking of object.

Construction of a High-efficiency Shuttle Vector Containing the Minimal Replication Origin of Bacillus thuringiensis

  • Kang Joong Nam;Kim Yang-Su;Wang Yong;Choi Heekyu;Li Ming Shun;Shin Sang Chul;Jin Byung Rae;Roh Jong Yul;Choi Jae Young;Je Yeon Ho
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제11권2호
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    • pp.125-127
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    • 2005
  • In order to improve the transformation efficiency of the Bacillus thuringiensis (Bt)-Escherichia coli (E. coli) shuttle vector, pHT3101, we intended to minimize replication origin of Bt in pHT3101. For this, two modified shuttle vectors, pHT1K and pHT261, in which 2.9 kb of replication origin of Bt were shortened to 1 kb and 261 bp, respectively as previously reported. Whereas the pHT1K could efficiently transform Bt into the antibiotic resistant, no transformants were obtained with pHT261. Furthermore, pHT1K showed higher transformation efficiency compared to that of parent vector, pHT3101. Therefore, pHT1K might be a very useful Bt-E. coli shuttle vector carrying minimal replication origin of Bt.

무선 센서 네트워크에서 링크 상태 및 트래픽 분산 정보를 이용한 효과적인 라우팅 방법 (An Efficient Routing Scheme based on Link Quality and Load Balancing for Wireless Sensor Networks)

  • 김선명;양연모
    • 한국시뮬레이션학회논문지
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    • 제19권4호
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    • pp.11-19
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    • 2010
  • ZigBee는 WPAN(Wireless Personal Area Networks)을 위해 IEEE 802.15.4 표준에 근거하여 저비용, 저전력 소모를 위해 만들어진 표준이다. ZigBee 표준에서 라우팅을 위해 AODV(Ad-hoc On-Demand Distance Vector)와 트리 라우팅(Tree Routing) 두 가지 방법이 제시되었다. 트리 라우팅은 IEEE 802.15.4 MAC 계층의 토폴로지 형성 과정 동안에 만들어진 부모-자식 관계에 근거하여 센서 노드로부터 싱크 노드(Sink node)로 데이터를 전송한다. 이 방법에서 새로운 노드가 네트워크에 가입하기 위해 RSSI(Received signal strength indicator) 신호가 가장 강한 노드를 부모 노드로 선택한다. 그러므로 트래픽 분산이 이루어지지 않아 일부 노드는 많은 트래픽 양을 전달하게 되고 에너지는 빠르게 고갈된다. 본 논문에서는 트래픽 분산을 위해 링크 품질과 트래픽 양 정보를 이용하는 새로운 메트릭(Metric)을 제시한다. 제안되는 방법은 RSSI 신호 세기를 사용하는 대신에 새롭게 제안된 메트릭을 사용하여 부모 노드를 선택하여 네트워크에 가입한다. TinyOS TOSSIM(TinyOS mote SIMulator) 환경에서 시험을 통하여 제안한 방법이 기존 트리 라우팅 방법에 비해 우수한 성능을 가짐을 알 수 있다.

$ski^-$ 기주 세포에서 L-A dsRNA 바이러스의 defective interfering particle을 유도하는 효모 유전자 (A yeast Chromosomal Gene that Induces Defective Interfering Particles of L-A dsRNA Virus in $ski^-$ Host Cells)

  • 이현숙
    • 미생물학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.75-79
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    • 1991
  • The yeast L-A virus (4.6 kb dsRNA genome) encodes the major coat protein and a "gag-pol" fusion minor coat protein that separately encapsidate itself and $M_{1}$, a 1.8 kb dsRNA satellite virus encoding a secreted protein toxin (the killer toxin). The teast chromosomal SKI genes prevent viral cytopathology by lowering the virus copy number. Thus, $ski^{-}$ mutants are ts and cs for growth. We transformed a ski2-2 virus-infested mutant with a yeast bank in a high copy cloning vector and selected the rare healthy transformants for analysis. One type of transformant segregated M-O L-A-O cells with high frequency. Elimination of the DNA clone from the ski2-2 strain eliminated this phinotype and introduction of the DNA clone recovered from such transformants into the parent ski2-2 strain, or into ski3 or ski6 mutants gave the same phenotype. This killer-curing phenotype was due to the curing of the helper L-A dsRNA virus. The 6.5 kb insert only had this activity when carried on a high copy vector and in $ski^{-}$ cells (not in $SKI^{+}$ cells). This 6.5 kb insert acts as a mutagen on L-A dsRNA producing a high rate of deletion mutations.mutations.

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벡터 표현을 기반으로 한 XML 동적 레이블링 기법 (XML Dynamic Labeling Scheme Based On Vector Representation)

  • 홍석희
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제14권1호
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    • pp.14-23
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    • 2014
  • 인터넷 상에서 광범위한 데이터 교환 및 저장의 수단으로 XML에 대한 많은 연구가 진행되어왔다. 특히, XML 문서에 대한 구조 정보를 검색하기 위해서 XML 트리의 각 노드에 레이블을 부여하는 레이블링 기법에 대한 연구가 요구되었다. 레이블링 기법은 각 노드에 레이블을 할당하여 XML 트리 상에서 조상-후손 또는 부모-자식 등의 구조 정보를 검색 할 수 있게 한다. 또한, 레이블링 기법은 기존의 레이블들에 영향을 주지 않도록 동적인 XML 문서 환경을 효율적으로 지원해야 하는 요구 사항을 가진다. 본 논문에서 제안하는 레이블링 기법은 벡터 표현 방식을 기반으로 동적인 XML 문서의 변경을 효율적으로 지원하고 레이블의 길이를 줄임으로서 XML 문서의 레이블 크기를 작게 하여 저장 공간을 적게 요구할 뿐 아니라 검색시간을 향상시킨다. 성능 실험을 통하여 기존의 레이블링 기법보다 레이블 크기와 검색 시간 등에서 우수함을 보인다.

On the Heterogeneous Postal Delivery Model for Multicasting

  • Sekharan, Chandra N.;Banik, Shankar M.;Radhakrishnan, Sridhar
    • Journal of Communications and Networks
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    • 제13권5호
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    • pp.536-543
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    • 2011
  • The heterogeneous postal delivery model assumes that each intermediate node in the multicasting tree incurs a constant switching time for each message that is sent. We have proposed a new model where we assume a more generalized switching time at intermediate nodes. In our model, a child node v of a parent u has a switching delay vector, where the ith element of the vector indicates the switching delay incurred by u for sending the message to v after sending the message to i-1 other children of u. Given a multicast tree and switching delay vectors at each non-root node 5 in the tree, we provide an O(n$^{\frac{5}{2}}$) optimal algorithm that will decide the order in which the internal (non-leaf) nodes have to send the multicast message to its children in order to minimize the maximum end-to-end delay due to multicasting. We also show an important lower bound result that optimal multicast switching delay problem is as hard as min-max matching problem on weighted bipartite graphs and hence O(n$^{\frac{5}{2}}$) running time is tight.

Construction of a Shuttle Vector for Protein Secretory Expression in Bacillus subtilis and the Application of the Mannanase Functional Heterologous Expression

  • Guo, Su;Tang, Jia-Jie;Wei, Dong-Zhi;Wei, Wei
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권4호
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    • pp.431-439
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    • 2014
  • We report the construction of two Bacillus subtilis expression vectors, pBNS1/pBNS2. Both vectors are based on the strong promoter P43 and the ampicillin resistance gene expression cassette. Additionally, a fragment with the Shine-Dalgarno sequence and a multiple cloning site (BamHI, SalI, SacI, XhoI, PstI, SphI) were inserted. The coding region for the amyQ (encoding an amylase) signal peptide was fused to the promoter P43 of pBNS1 to construct the secreted expression vector pBNS2. The applicability of vectors was tested by first generating the expression vectors pBNS1-GFP/pBNS2-GFP and then detecting for green fluorescent protein gene expression. Next, the mannanase gene from B. pumilus Nsic-2 was fused to vector pBNS2 and we measured the mannanase activity in the supernatant. The mannanase total enzyme activity was 8.65 U/ml, which was 6 times higher than that of the parent strain. Our work provides a feasible way to achieve an effective transformation system for gene expression in B. subtilis and is the first report to achieve B. pumilus mannanase secretory expression in B. subtilis.

이중계층구조 파티클 샘플링을 사용한 다중객체 검출 및 추적 (Multi-Object Detection and Tracking Using Dual-Layer Particle Sampling)

  • 정경원;김나현;이승원;백준기
    • 전자공학회논문지
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    • 제51권9호
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    • pp.139-147
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    • 2014
  • 본 논문에서는 다중객체 검출과 동시에 추적을 수행하는 이중계층구조의 파티클 샘플링을 제안한다. 제안된 방법은 다중 객체 검출을 위한 상위 계층 파티클 샘플링과 검출된 객체의 추적을 위한 하위 계층 파티클 샘플링으로 구성된다. 상위 계층에서는 빠른 객체 검출을 위해 슬라이딩 윈도우 대신 움직임 추정 기반의 부모 파티클 (parent particles; PP) 윈도우를 사용하여, 이동 객체 주위로 리샘플링된 파티클을 통해 객체를 검출한다. 하위 계층에서는 상위 계층에서 검출한 객체의 객체영역에 자식 파티클 (child particles; CP)을 생성하여 해당 객체를 추적한다. 실험결과를 통해 비디오 시스템에서 기존 객체 검출 방법보다 빠른 검출이 가능하고, 다중 객체를 효과적으로 추적할 수 있음을 확인하였다.