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한국산 둑중개속 어류 개체군들의 형태 변이 및 AFLP 분석을 통한 유전 변이 (Morphological Variations and Genetic Variations Inferred from AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) Analysis of Cottus Populations (Scorpaeniformes: Cottidae) in Korea)

  • 변화근;김근식;송하윤;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.67-75
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    • 2009
  • 한국의 Cottus 속 어류 9개체군들의 형태 및 유전 변이를 서로 비교하였다. 형태변이 분석은 계수, 계측 형질 및 수정난의 크기를 분석하였으며, 유전 변이 분석은 AFLP fingerprinting을 이용하였다. 조사결과 동해로 흐르는 하천의 둑중개 집단은 서해와 남해로 흐르는 강 또는 하천의 둑중개 집단과 계측형질에서 유의적인 차이를 보였으나, 계수형질과 수정난 크기의 차이는 없었다. 하지만 배봉천의 Cottus sp. 집단은 계수형질에 있어 한둑중개와 비슷하였고, 배지느러미의 계측형질과 수정난의 크기는 둑중개와 비슷하였다. AFLP를 이용한 유전적 거리를 추정한 결과 둑중개 집단간 0.110~0.221로 나타났다. 한둑중개 집단과 둑중개 집단간 0.542~0.621로 나타났고, 배봉천의 Cottus sp. 집단과 둑중개 집단 간 0.222~0.304로 나타났다. UPGMA dendrogram결과 Cottus sp. 집단은 다른 둑중개 집단과 분리되었다.

금강과 만경강에 서식하는 멸종위기 어류 감돌고기 Pseudopungtungia nigra의 AFLP에 의한 유전 다양성 및 집단구조 (Genetic Diversity and Population Structure of the Endangered Fish Pseudopungtungia nigra (Cyprinidae) from the Geum and Mankyung Rivers Assessed by Amplified Fragment Length Polymorphism)

  • 김근식;윤영은;강언종;양상근;방인철
    • 한국어류학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.76-80
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    • 2009
  • 금강과 만경강에 서식하는 멸종위기어류 감돌고기(Pseudopungtungia nigra)의 유전 다양성 및 집단 구조를 amplified fragment length polymorphism (AFLP)를 이용하여 분석하였다. AFLP분석은 5개의 primer 조합에서 447개의 유효밴드가 생성되었으며, 64.1%의 다양성을 보였다 (금강: 74.6%, 만경강: 53.6%). 집단 내 이형접합율은 금강 집단이 0.170, 만경강 집단이 0.104, 유전 다양성 수치는 금강 집단이 0.240, 만경강 집단이 0.147로 나타났다. 감돌고기 두 집단 간 분화도(Fst)는 0.150 수준에서 통계적으로 유의하여(P<0.05), 두 집단 사이에 유전적 분화를 나타내었다. 개체간의 UPGMA dendrogram을 분석한 결과 만경강 집단이 낮은 유전적 변이를 나타내었고, 지리적 지역에 대응하여 나뉘었으며, 두 집단 간 낮은 유전적 거리를 보였다(0.026). 따라서, 두 집단은 동일한 유전적 기원으로 추정되고, 감돌고기의 복원을 위한 친어 집단 선정을 위해서는 금강 집단이 적합하며, 만경강 집단은 유전적 및 서식지의 관리가 필요할 것으로 판단된다.

MYLK Polymorphism Associated with Blood Eosinophil Level among Asthmatic Patients in a Korean Population

  • Lee, Soo Ok;Cheong, Hyun Sub;Park, Byung Lae;Bae, Joon Seol;Sim, Won Chul;Chun, Ji-Yong;Isbat, Mohammad;Uh, Soo-Taek;Kim, Yong Hooun;Jang, An-Soo;Park, Choon-Sik;Shin, Hyoung Doo
    • Molecules and Cells
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    • 제27권2호
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    • pp.175-181
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    • 2009
  • The myosin light chain kinase (MYLK) gene encodes both smooth muscle and nonmuscle cell isoforms. Recently, polymorphisms in MYLK have been reported to be associated with several diseases. To examine the genetic effects of polymorphisms on the risk of asthma and related phenotypes, we scrutinized MYLK by re-sequencing/genotyping and statistical analysis in Korean population (n = 1,015). Seventeen common polymorphisms located in or near exons, having pairwise $r^2$ values less than 0.25, were genotyped. Our statistical analysis did not replicate the associations with the risk of asthma and log-transformed total IgE levels observed among African descendant populations. However, two SNPs in intron 16 (+89872C> G and +92263T> C), which were in tight LD (|D'| = 0.99), revealed significant association with log-transformed blood eosinophil level even after correction multiple testing ($P=0.002/P^{corr}=0.01$ and $P=0.002/P^{corr}=0.01$, respectively). The log-transformed blood eosinophil levels were higher in individuals bearing the minor alleles for +89872C> G and +92263T> C than in those bearing other allele. In additional subgroup analysis, the genetic effects of both SNPs were much more apparent among asthmatic patients and atopic asthma patients. Among atopic asthma patients, the log-transformed blood eosinophil levels were proportionally increased by gene-dose dependent manner of in both +89872C> G and +92263T> C(P = 0.0002 and P = 0.00007, respectively). These findings suggest that MYLK polymorphisms might be among the genetic factors underlying differential increases of blood eosinophil levels among asthmatic patients. Further biological and/or functional studies are needed to confirm our results.

융합인재교육에서 핵심역량 기반 학습성과 구성요소의 상대적 가중치 연구 (A Study on the Relative Weights of the Components of Core Competence Based Learning Outcomes in STEAM (Science, Technology, Engineering Art, Mathematics))

  • 박기문
    • 대한공업교육학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.239-258
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    • 2015
  • 이 연구의 목적은 융합인재교육의 학습성과에 대한 합리적인 교육평가에 활용될 수 있는 기초자료를 제공하는 것으로, 융합인재교육에서 학습자가 함양해야 할 핵심 역량 준거의 상대적 가중치를 포함하는 학습성과 평가 방안을 제시하였다. 연구 방법은 융합인재교육 전문가를 대상으로 핵심역량에 대한 이원비교 설문조사를 실시하였고 핵심역량 요인의 우선순위를 분석하기 위하여 계층적 분석기법(AHP)을 적용하였다. 이에 따른 연구의 결론은 다음과 같다. 첫째, 핵심역량 1계층에서 융합수행능력과 융합인지능력의 중요도는 각각 39.4%, 36.8% 순으로 분석되었다. 융합인재교육의 교육평가에서 융합수행능력과 융합인지능력은 유사한 중요도 수준을 보였으며, 융합태도능력(23.8%)보다는 중요하게 고려해야 하는 요인으로 평가되었다. 둘째, 핵심역량 2계층에서 문제해결(20.0%)의 상대적 중요도가 가장 높게 나타났고, 다음으로는 창의적 사고력(18.3%), 책임감(15.3%), 융합지식 이해(11.0%) 순으로 분석되었다. 셋째, 핵심역량의 상대적 가중치 분석 결과는 융합인재 교육프로그램의 교육목표 달성 여부를 상대적 가중치에 따라 합리적으로 평가하는 역량평가 체제의 토대가 될 것이다. 더불어 융합인재교육의 교육평가뿐만 아니라 교수 학습 과정 개선과 학습효과를 높일 수 있는 교육프로그램 개발에 가이드 역할을 할 것으로 기대된다.

지리정보시스템(GIS)과 다기준 분석법(MCA)을 적용한 연안지역 평가 (An Assessment of Coastal Area Using Geographic Information Systems and Multi-Criteria Analysis)

  • 최희정;박정재;황철수
    • 한국지역지리학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.143-155
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    • 2007
  • 다양한 이해집단과 목적들이 상충하는 연안지역에 대해 공간정책을 결정하기 위해서는 물리적 자연조건, 사회 경제적 조건, 그리고 의사결정과정에서의 가치체계가 통합적으로 반영될 수 있어야 하고, 선호도가 반영된 요소를 효율적으로 분석할 수 있는 체계가 갖추어져야 한다. 본 연구에서는 지리정보시스템이라는 공통의 플랫폼에 다양한 유형의 연안지역 공간정보를 변환 통합하고, 다기준 분석법의 하나인 AHP를 이용해 의사결정에 영향을 미치는 기준들 사이에 가중치를 설정하여, 가중치를 적용한 개별 레이어를 지도대수와 중첩분석을 통해 최종 결과 레이어를 생성하였다. 이와 같이 지리정보시스템의 공간분석 기능을 다기준 분석법과 동적으로 통합함으로써 새롭게 변화된 정보들을 편리하게 분석과정에 포함시키거나 분석 결과가 단순하고 명확하게 설명되어 궁극적으로 정책결정자에게 유용한 정보를 제공할 수 있는 장점을 확인하였다. 특히 평가항목에 대한 가중치 할당 방식은 다양한 관전에 따른 정책결정과정을 모의할 수 있어 기존의 연구에 비해 유연성을 갖는다.

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DCT 맵 FSVQ와 단방향 분포 허프만 트리를 이용한 영상 압축 (Image Compression Using DCT Map FSVQ and Single - side Distribution Huffman Tree)

  • 조성환
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제4권10호
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    • pp.2615-2628
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    • 1997
  • 본 논문에서는 영상 전송을 위한 벡터 양자화기를 설계할 때 2차원 DCT에 근거한 DCT 맵과 유한상태 벡터 양자화를 이용하는 새로운 부호책(codebook) 설계 알고리듬을 제안한다. 영상을 윤곽선이 많은 부분과 적은 부분으로 나누어 맵을 만들고 이 맵에 따라 영상의 중요한 특징들을 2차원 DCT로 추출한다. 유한상태 벡터 양자화기의 마스터 부호책은 트리 구조에 근거한 2진 트리를 사용하여 두 영역을 따로 학습세트로 나눔으로서 만들어진다. 이와 같이 작성된 마스터 부호책으로부터 상태 부호책을 작성하여 입력 벡터에 대하여 마스터 부호책이 아닌 상태 부호책으로부터 부호단어를 찾는다. 또한 인덱스의 부호화는 고속 디지털 전송에 중요한 부분이기 때문에 고정길이의 부호를 엔트로피 부호화 법칙에 따라 가변 길이의 부호로 바꾸어 수행한다. 즉, 설계한 부호책에서 각 부호에 전송 부호 할당은 허프만 부호화를 수행하는데, 허프만 트리에서의 허프만 코드의 생성을 빠르게 하기 위해 본 논문에서는 트리의 단방향 분포 허프만 트리 알고리듬을 제안한다. Einstein과 Bridge 영상에 대하여 본 알고리듬으로 영상을 부호화했을 때 PNN 알고리듬보다는 각각 2.94 dB과 2.48 dB만큼, CVQ 알고리듬보다 각각 약 1.75 dB과 0.99dB만큼 더 좋은 영상의 화질을 얻을 수 있었다.

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정자의 형태학적 특성 분석에 관한 연구 (A Study on the Morphological Analysis of Sperm)

  • 백재승;전성수;김수웅;이원진;박광석
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제24권2호
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    • pp.153-165
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    • 1997
  • In male reproducible health, fertility and IVF (in-vitro fertilization), semen analysis has been most important. Semen analysis can be divided into concentration, motional and morphological analysis of sperm. The existing method which was developed earlier to analyze semen concentrated on the sperm motility analysis. To provide more useful and precise solutions for clinical problems such as infertility, semen analysis must include sperm morphological analysis. But the traditional tools for semen analysis are subjective, imprecise, inaccurate, difficult to standardize, and difficult to reproduce. Therefore, with the help of development of microcomputers and image processing techniques, we developed a new sperm morphology analyzer to overcome these problems. In this study the agreement on percent normal morphology was studied between different observers and a computerized sperm morphology analyzer on a slide-by-slide basis using strict criteria. Slides from 30 different patients from the SNUH andrology laboratory were selected randomly. Microscopic fields and sperm cells were chosen randomly and percent normal morphology was recorded. The ability of sperm morphology analyzer to repeat the same reading for normal and abnormal cells was studied. The results showed that there was no significant bias between two experienced observers. The limits of agreement were 4.1%${\sim}$-3.8%. The Pearson correlation coefficient between readers was 0.79. Between the manual and sperm morphology analyzer, the same findings were reported. In this experiments the slides were stained by two different methods, PAP and Diff-Quik staining methods. The limits of agreement were 7.2%${\sim}$-5.7% and 6.0%${\sim}$-6.3%, respectively. The Pearson correlation coefficients ware 0.76 and 0.91, respectively. The limits of agreement was tighter below 20% normal forms. In the experiments of repeatability, 52 cells stained by PAP and Diff-Quik staining methods were analyzed three times in succession. Estimating pairwise agreement, the kappa statistic for the pairs were 0.76, 0.81, 0.86, and 0.75, 0.88, 0.88 respectively. In this study it was shown that there was good agreement between manual and computerized assessment of normal and abnormal cells. The repeatability and agreement per slide of computerized sperm morphology analyzer was excellent. The computer's ability to classify normal morphology per slide is promising. Based on results obtained, this system can be of clinical value both in andrology laboratories and IVF units.

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Performances of Prognostic Models in Stratifying Patients with Advanced Gastric Cancer Receiving First-line Chemotherapy: a Validation Study in a Chinese Cohort

  • Xu, Hui;Zhang, Xiaopeng;Wu, Zhijun;Feng, Ying;Zhang, Cheng;Xie, Minmin;Yang, Yahui;Zhang, Yi;Feng, Chong;Ma, Tai
    • Journal of Gastric Cancer
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    • 제21권3호
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    • pp.268-278
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    • 2021
  • Purpose: While several prognostic models for the stratification of death risk have been developed for patients with advanced gastric cancer receiving first-line chemotherapy, they have seldom been tested in the Chinese population. This study investigated the performance of these models and identified the optimal tools for Chinese patients. Materials and Methods: Patients diagnosed with metastatic or recurrent gastric adenocarcinoma who received first-line chemotherapy were eligible for inclusion in the validation cohort. Their clinical data and survival outcomes were retrieved and documented. Time-dependent receiver operating characteristic (ROC) and calibration curves were used to evaluate the predictive ability of the models. Kaplan-Meier curves were plotted for patients in different risk groups divided by 7 published stratification tools. Log-rank tests with pairwise comparisons were used to compare survival differences. Results: The analysis included a total of 346 patients with metastatic or recurrent disease. The median overall survival time was 11.9 months. The patients were different into different risk groups according to the prognostic stratification models, which showed variability in distinguishing mortality risk in these patients. The model proposed by Kim et al. showed relative higher predicting abilities compared to the other models, with the highest χ2 (25.8) value in log-rank tests across subgroups, and areas under the curve values at 6, 12, and 24 months of 0.65 (95% confidence interval [CI]: 0.59-0.72), 0.60 (0.54-0.65), and 0.63 (0.56-0.69), respectively. Conclusions: Among existing prognostic tools, the models constructed by Kim et al., which incorporated performance status score, neutrophil-to-lymphocyte ratio, alkaline phosphatase, albumin, and tumor differentiation, were more effective in stratifying Chinese patients with gastric cancer receiving first-line chemotherapy.

약료서비스 R&D 고도화를 위한 우선순위 기반 전략과제 설정 (Development of Agenda for Pharmaceutical Care Service Research and Development using the Analytical Hierarchy Process)

  • 한나영;정채린;송윤경;윤정현;장선미;이의경;신현택;이영숙;손현순;지은희;서동철;김대경;오정미
    • 한국임상약학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.45-55
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    • 2019
  • Background: Although the importance of pharmaceutical care service has been growing to meet the needs of customers with the improvement of clinical and humanistic outcomes, there was not a systematic strategy to promote research in Korea. The aim of this study was to suggest the core agendas for pharmaceutical care services research and development (R&D) considering priorities. Methods: Based on desk researches, we developed R&D agendas for the needs of improving pharmaceutical care services in the area of institution, community, and public health. To determine the priority of agendas in developing pharmaceutical care service, analytic hierarchy process (AHP) analysis was performed by the 14 experts. Criteria and subcriteria were assessed for significance by pairwise comparisons. Then, agendas were evaluated for importance according to each subcriteria, and rank ordered considering the weight calculated by multiplying the importance scores of the criteria and the subcriteria. Results: We derived 25 agendas including 13 for institutional pharmaceutical care service, 8 for community pharmaceutical care service, and 4 for public-health related pharmaceutical care service. AHP model was constructed based on 4 criteria and 8 subcriteria by a hierarchical structure. From the AHP survey, the 'Development of pharmaceutical care service for metabolic and chronic disease' agenda accounted for the highest priority. Conclusion: We have developed the R&D agendas of the pharmaceutical care service which should be promoted. The results should be utilized by the government to nationally support the development of the standards and relevant regulations related to pharmaceutical care services in Korea.

계층분석법을 통한 지하차도 재해 예방 및 제어 시스템 개선 연구 (A Study on the Improvement of the Disaster Prevention and Control System for Underpasses by Analytic Hierarchy Process)

  • 김필도;김경수;문유미
    • 한국재난정보학회 논문집
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    • 제16권4호
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    • pp.734-746
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    • 2020
  • 연구목적: 지하차도의 설치 규모, 개수의 증가로 지하차도 내 화재, 침수 등의 재해가 증가하는 추세이다. 지하차도는 지하에 건설되어 재해 발생 시 일반도로 대비 피해가 크고 공용 중 재해 노출 가능성이 크다. 따라서 지하차도 내 재해를 예방·제어하기 위한 시스템 개선사항을 도출하는 데 목적이 있다. 연구방법:본 연구에서는 지하차도 내 재해 분석 및 영향요소에 관한 선행연구와 전문가 자문을 토대로 재해 영향요소 및 대안을 계층 구조화한 모형을 개발하였다. 개발된 모형은 전문가를 상대로 쌍대비교 형태의 설문에 활용하고, 개선순위 결정 등을 위해 AHP분석 기법을 사용 하였다. 연구결과: 설문조사는 일관성을 확보하였고, 재해(교통사고, 화재, 침수)와 대안(법, 제도/계획, 설계, 유지관리/인적/환경)을 상대로 가중치 등을 분석한 결과, 지하차도 재해 예방·제어를 위해 화재에 관한 법, 제도 분야 시스템개선이 최우선으로 필요한 것으로 확인되었다. 결론: 전문가 견지에서 볼 때 지하차도 내 화재 관련하여 물분무시설, 외부(지상)대피통로와 같은 방재시설과 관계된 법, 제도를 강화하는 것이 지하차도 재해예방 및 피해 최소화의 대안임을 보여 주었다.