• Mycobiology
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• 제35권1호
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• pp.25-29
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• 2007

A newly synthesized Nickel (II) tyrosine complex was screened as potential antimicrobial agent against a number of medically important bacteria (Bacillus subtilis, Streptococcus ${\beta}$-haemolytica, Escherichia coli, Shigella dysenterae) and fungi (Aspergillus fumigatus, Candida albicans, Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Penicillium sp.) strains. were used for antifungal activity. The antimicrobial activity was evaluated using the Agar Disc method. Moreover, the minimum inhibitory concentration of the complexes was determined against the same pathogenic bacteria and the values were found between $4{\sim}64\;{\mu}g\;ml^{-1}$. Brine shrimp bioassay was carried out for cytotoxicity measurements of the complexes. The $LC_{50}$ values were calculated after probit transformation of the resulting mortality data and found to be 6 ${\mu}g\;ml^{-1}$.

• Molecules and Cells
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• 제19권3호
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• pp.365-374
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• 2005

To find potential targets of novel antimicrobial agents, we identified essential genes of Streptococcus pneumoniae using comparative genomics and allelic replacement mutagenesis. We compared the genome of S. pneumoniae R6 with those of Bacillus subtilis, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, and Staphylococcus aureus, and selected 693 candidate target genes with > 40% amino acid sequence identity to the corresponding genes in at least two of the other species. The 693 genes were disrupted and 133 were found to be essential for growth. Of these, 32 encoded proteins of unknown function, and we were able to identify orthologues of 22 of these genes by genomic comparisons. The experimental method used in this study is easy to perform, rapid and efficient for identifying essential genes of bacterial pathogens.

• Advances in Traditional Medicine
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• 제6권2호
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• pp.102-107
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• 2006

The methanol extract and residual methanol fraction of Excoecaria agallocha L. (Euphorbiaceae) stem bark was investigated in this study by wheat rootlet and shoot growth inhibition, and antimicrobial bioassay. The methanol extract and residual methanol fraction showed high inhibitory effect on both the wheat rootlet (82-89%) and shoot growth (85-90%) compared to control. The methanol extract showed a better and dose related inhibition on both the rootlet and shoot growth compared to residual methanol fraction. The $IC_{50}$ value of methanol extract for rootlet and shoot were $2.88\;{\mu}g/ml$ and $2.32\;{\mu}g/ml$, and of residual methanol fraction for rootlet and shoot were $7.91\;{\mu}g/ml$ and $4.45\;{\mu}g/ml$. The methanol extract and residual methanol fraction did not show any antibacterial activity against the tested microorganisms of clinical isolates Escherichia coli, Staphylococcus aureous, Pseudomonas aeruginosa, Proteus vulgaris and Bacillus subtilis. The plant has the potential to be a source of novel cytotoxic compound(s).

• 대한화학회지
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• 제56권3호
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• pp.334-340
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• 2012

A new series of ethyl 2-(4-substitutedbenzylidene)-5-(3'-(ethoxycarbonyl)biphenyl-4-yl)-7-methyl-3-oxo-3,5-dihydro-2H-thiazolo[3,2-a]pyrimidine-6-carboxylate derivatives ($\mathbf{8a-j}$) were synthesized. The newly synthesized compounds were characterized by $\mathbf{IR}$, $^1\mathbf{H}$ $\mathbf{NMR}$, $^{13}\mathbf{C}$ $\mathbf{NMR}$, $\mathbf{LCMS}$ $\mathbf{mass}$ and $\mathbf{C}$, $\mathbf{H}$, $\mathbf{N}$ analyses. All newly synthesized compounds were screened for their In vitro antioxidant activity (Scavenging of hydrogen peroxide, Scavenging of nitric oxide radical, and Lipid peroxidation inhibitory activity), antibacterial (Escheria coli, Pseudonmonas aeruginosa (gram-negative bacteria), Bacillus subtillis, Staphylococcus aureus (gram-positive bacteria)) and antifungal (Candida albicans Aspergillus niger) studies.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권4호
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• pp.623-632
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• 2006

To find potential targets of novel antimicrobial agents, we identified essential genes of Staphylococcus aureus N315 by using comparative genomics and allele replacement mutagenesis. By comparing the genome of S. aureus N315 with those of Bacillus subtilis, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Streptococcus pneumoniae, a total of 481 candidate target genes with similar amino acid sequences with at least three other species by >40% sequence identity were selected. of 481 disrupted candidate genes, 122 genes were identified as essential genes for growth of S. aureus N315. Of these, 51 essential genes were those not identified in any bacterial species, and 24 genes encode proteins of unknown function. Seventeen genes were determined as non-essential although they were identified as essential genes in other strain of S. aureus and other species. We found no significant difference among essential genes between Streptococcus pneumoniae and S. aureus with regard to cellular function.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제6권4호
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• pp.342-348
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• 2005

본 연구에서는 음식물쓰레기 중의 단백질 분해활성을 갖는 대사산물을 생산하는 신규 바실러스 속 PNV-1 균주를 분리하였고, 분리된 균주를 이용하여 한국형 음식물쓰레기 환경인 고염분, 극한 pH, 고농도의 미생물 생육 저해물질 등에 대한 내성정도를 측정하였다. 실험 결과, 분리된 바실러스 속 균주는 약 0.68 unit/ml 이상의 높은 단백질분해효소 활성을 보유하고 있으며, 음식물쓰레기 중에 형성되는 pH 4 내지 9 범위에서 생육이 가능하고, 염분농도 최고 $8\%$와 살균작용을 하는 것으로 알려진 고춧가루 $5\%$에서도 생육에 거의 영향이 없었다. 또한, 미생물 생육 저해물질로 알려진 후추와 겨자에 대한 내성을 나타내었다.

• 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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• 제26권4호
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• pp.20-26
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• 2021

In this work, an indigenous microbial consortium was obtained by selectively cultivating microbes using a long-aged petroleum-contaminated soil (Kuwait) containing recalcitrant petroleum hydrocarbons. The obtained microbial consortium was able to grow on and degrade the remaining petroleum hydrocarbons which could not have been utilized by the indigenous microbes in the original Kuwait soil. The following microbial community analysis using 16S rRNA gene sequencing suggested that the enhanced degradation of the remaining recalcitrant petroleum hydrocarbons by the novel microbial consortium may have been attributed to the selected bacterial populations belonging to Bacillus, Burkholderia, Sphingobacterium, Lachnospiraceae, Prevotella, Haemophilus, Pseudomonas, and Neisseria.

• 생명과학회지
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• 제24권8호
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• pp.860-864
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• 2014

별불가사리(Asterina pectinifera)의 유문 맹낭 추출물로부터 새로운 항균활성 펩타이드를 정제하기 위해서 유문 맹낭 추출물을 역상 HPLC와 이온 HPLC column에 주입하였다. 강한 항균활성을 나타내는 2개의 새로운 펩타이드가 유문 맹낭 추출물로부터 정제되었다. 이러한 물질들은 Pyloric caeca Asterina pectinifera peptides (PAP-1와 PAP-2)라 명명하였다. 정제한 물질들의 특성을 알아보기 위해서, 분자량 및 아미노산 서열 분석은 MALDI-TOF 질량분석기와 에드만 분해법으로 조사하였다. PAP-1과 PAP-2의 분자량은 각각 약 2952 Da 및 2980 Da이었다. PAP-1과 PAP-2의 부분적인 N-말단 서열은 다음과 같다. PAP-1, AIQNAGES; PAP-2, AIQNAAES. PAP-2는 PAP-1의 6번째 위치(glycine or alanine)에서 한 잔기만 다른 isoform에 해당된다. 지금까지 밝혀진 항균활성 펩타이드와의 분자량 및 N-말단 아미노산 서열을 비교한 결과, 이들 물질들은 다른 물질들과 동일성을 나타내지 않았다. 이러한 발견은 PAP-1과 PAP-2가 별불가사리의 유문맹낭의 선천성 방어계에 중요한 역할을 담당하고 있는 것을 시사하고 있다.

• 한국응용곤충학회지
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• 제36권4호
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• pp.331-340
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• 1997

곤충 유전자를 이용한 항세균성 펩타이드 생산 및 응용에 관한 기초 연구로서 비병원성 세균(Escherichia coli K12)으로 면역 반응을 유도한 누에로부터 발현량이 증가하는 유전자 중 Hyalophora cecropia의 attacin과 cDNA 상동성을 나타내는 BmInc6 클론을 분리하고 그 특성을 조사하였다. BmInc6 cDNA의 전체염기서열을 분석한 결과 그 크기는 852 bp이고, 35번째 염기에서 변역이 개시되어 679 bp 위치에서 종결되는 open reading frame을 가지며 812번째 위치에 잠정 전사 종결 신호의 존재가 확인되었다(GenBank, AF005384). BmInc6에 의해 coding되는 아미노산은 214개이며, hydropathy 분석 결과 친수성을 나타내는 단백질이었다. 그리고 BmInc6 유전자에 의해 연역되는 펩타이드를 nuecin으로 명명하였다. Nuecin 유전자를 baculovirus 발현 백터계를 이용하여 곤충세포주에서 발현시킨 결과 전사체의 크기는 약 950 bp였고, 세포내 벌현 펩타이드의 분자량은 약 23 kDa이었다. 세포내에서 발현된 nuecin 전구체로 추정되는 23 kDa 펩타이드는 세포외로 분비되는 과정에서 약 3 kDa의 signal 펩타이드가 제거됨으로서 약 20 kDa의 성숙 nuecin으로 된다는 사실을 단백질 전기영동상으로 확인하였다. Nuecin 단백질의 항세균 활성을 수종의 그람 음성 및 양성 세균에 대해 검정한 결과, 특히 E. coli와 Bacillus subtilis에 높은 활성을 나타내었으며, attacin이 한정된 그람 음성 세균에만 항세균 활성을 나타내는데 비해 nuecin은 그람 음성은 물론 그람 양성에도 항세균 활성을 나타내어, 보다 넓은 항세균 스펙트럼을 가지는 것을 알 수 있었다.

• 생명과학회지
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• 제18권2호
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• pp.180-186
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• 2008

이상의 연구 결과에 의하면 U937 세포에서 FSB 및 TFS 모두 2 mg/ml의 농도에서 6시간까지는 세포증식에 아무런 영향을 미치지 못하였고 PMA 처리에 의해서도 세포증식에는 변화가 없었으며, 세포의 형태 및 핵의 형태도 PMA와 FSB 및 TFS의 처리에 의해서 아무런 변화가 나타나지 않았다. 그러나 COX-2의 발현의 정도는 PMA 처리에 의해서 증가하였고, 이렇게 증가한 COX-2는 FSB 및 TFS의 선처리에 의해서 효과적으로 억제되는 것으로 나타났다 또한 COX-2에 의해 생성되어 염증반응을 유발하며 세포분열이나 증식에 영향을 줌으로서 각종 질병의 유발과 진행에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있는 $PGE_2$의 경우도 PMA처리에 의하여 증가하였으며 FSB 및 TFS 처리에 의해서 강하게 억제되었다. 특히 FSB에 비하여 TFS를 선처리하였을 경우 PMA에 의하여 과발현된 COX-2 및 $PGE_2$ 생성의 억제정도가 더 강하게 나타났다. 이러한 결과는 FSB 및 TFS의 항염증기전 해석을 위한 이해와 향후 지속적인 연구를 위한 귀중한 자료가 될 것으로 사료된다.