• 디지털융복합연구
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• 제18권12호
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• pp.425-434
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• 2020

바이러스감염으로 인한 설사는 전 세계적으로 공중 보건의 주요 문제이며 사망률의 큰 부분을 차지하고 있지만 기후데이터를 이용하여 분석한 연구는 많지 않다. 따라서 본 연구는 설사를 유발하는 바이러스인 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII의 감염과 기후와의 인과관계를 분석하여 조기진단과 치료를 용이하게 하고 계절성 질환을 더욱 관리하고 예방하는데 기여하고자 하였다. 2010년 6월부터 2019년 12월까지 단국대학교 병원에서 시행한 대변 시료 4,009개의 설사바이러스 6종의 멀티플렉스 역전사 PCR(mRT-PCR)검사결과와 다양한 기후 요인 중 체감온도, 상대습도, 일조율과의 상관관계를 후향적으로 분석하였다. 4,009 개의 대변 샘플 중 985 개는 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII 감염에 대해 양성이었다. 이 985 건 중 95.3 % (n = 939)는 10 세 미만으로 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII는 10 세 미만 환자에서 높은 감염률을 보였다. 우리는 기상 빅데이터와 연령, 시기별 감염분석 등에 기초하여 Rotavirus Gr.A의 감염이 상대 습도에 따라 유의한 상관 관계가 있음을 확인하였고 Norovirus G-II의 감염은 체감 온도와 유의한 상관 관계가 있음을 확인하였다. 본 연구는 기후요인에 따른 Rotavirus Gr.A, Norovirus G-I & GII 감염의 분포에 대한 이해도를 향상시킴으로써 바이러스성 설사질환과 관련된 보건정책의 설정이나 계절적 영향에 대한 새로운 통찰력을 제공하는데 유용한 자료가 될 것으로 기대한다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제18권5호
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• pp.1150-1154
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• 2009

Low levels of virus contamination and naturally occurring reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) inhibitors restrain virus detection in oysters. A rapid and efficient oyster-processing procedure that can be used for sensitive virus detection in oysters was developed. Poliovirus type 1 Sabin strain was used to evaluate the efficacy of virus recovery. The procedure included (a) acid-adsorption and elution with buffers (0.25M glycine-0.14 M NaCl, pH 7.5; 0.25M threonine-0.14M NaCl, pH 7.5); (b) polyethylene glycol (PEG) precipitation; (c) resuspension in Tween 80/Tris solution and chloroform extraction; (d) the second PEG precipitation; (e) viral RNA extraction with TRIzol and isopropanol precipitation; and (f) RT-PCR combined with semi-nested PCR. The overall recovery of elution/concentration was 19.5% with poliovirus. The whole procedure usually takes 19 hr. The overall detection sensitivity was 4 RT-PCR units of genogroup I norovirus (NoV) and 6.4 RT-PCR units of genogroup II Nov/25 g of oysters initially seeded. The virus-detecting method developed in this study should facilitate the detection of low levels of NoV in oysters.

• 한국수산과학회지
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• 제47권5호
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• pp.501-507
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• 2014

Norovirus (NoV) is a major cause of food poisoning outbreaks in Korea. Most NoV outbreaks originate from environmental contamination, but bivalves such as oysters are also important vectors. Oyster Crassostrea gigas contamination by NoV has been reported in Korea, but no quantitative analyses of NoV have been performed. We investigated the NoV concentration in 21 oyster samples from a Korean commercial oyster-growing area with confirmed fecal contamination from January to December 2012, using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction. Additionally, we assessed the NoV concentration after heating to investigate the effects of heat treatment on NoV-infected oysters. In NoV-positive samples, the cycle threshold (Ct) values were 37.43-39.41 and 36.77-39.30, while viral concentrations were $8.97{\times}10^2-2.24{\times}10^2$ and $3.05{\times}10^2-7.47{\times}10^1$ copies/g for genogroups I and II, respectively. After heat treatment, NoV genogroup I decreased by 83.4%, 88.0%, 89.4% and 100% at $60^{\circ}C$, $68^{\circ}C$, $70^{\circ}C$, and $100^{\circ}C$, respectively, for 15 min, while genogroup II respectively decreased by 67.3%, 76.3%, 80.1%, and 89.8% under the same conditions.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권4호
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• pp.556-562
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• 2014

The occurrence of human norovirus (NoV) genogroup I (GI) and genogroup II (GII) strains was investigated in Korea. Between 2007 and 2010, 265 samples were collected from 89 Korean water source locations. NoV GI was detected in 4.5% and NoV GII in 1.5%. Samples collected in winter had the highest occurrence; 9.4% for NoV GI and 6.3% for NoV GII. NoV GI detection was highest in groundwater, with the next highest in river water and the lowest in lake water (5.9%, 5.4%, and 1.6%, respectively), and NoV GII was found only in river water. When three representative Korean basin systems (Han (H)-, Geum/Seom (G/S)-, and Nakdong (N)-river basins) were compared, both NoV genogroups were high in the G/S-, but absent in the H- river basin. The most prevalent genotypes within the GI and GII groups were GI.5 and GII.4, respectively. The NoVs found in surface water were identical to those found in patients and those found in groundwater. The NoVs appeared to be transmitted from the patient to the surface water, and then to the groundwater, suggesting a fecal-oral route of transmission. This is the first nationwide surveillance of NoV in major Korean water sources.

• 대한의생명과학회지
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• 제17권3호
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• pp.191-196
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• 2011

Noroviruses (noroV) are the major cause of nonbacterial gastroenteritis in humans worldwide. Since noroV cannot yet be cultured in vitro and their diagnosis by electron microscopy requires at least $10^6$ viral particles/g of stool a variety of molecular detection techniques represent an important step towards the detection of noroV. In the present study, we have applied real-time nucleic acid sequence-based amplification (real-time NASBA) for simultaneous detection of NoroV genogroup I (GI) and genogroup II (GII) using standard viral RNA. For real-time NASBA assay which can detected noroV GI and GII, a selective region of the genes encoding the capsid protein was used to design primers and genotype-specific molecular beacon probes. The specificity of the real-time NASBA using newly designed primers and probes were confirmed using standard viral RNA of noroV GI and GII. To determine the sensitivity of this assay, serial 10-fold dilutions of standard viral RNA of noroV GI and GII were used for reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and real-time NASBA. The results showed that while agarose gel electrophoresis could detect RT-PCR products with 10 pg of standard viral RNA, the real-time NASBA assay could detect 100 fg of standard viral RNA. These results suggested that the real-time NASBA assay has much higher sensitivity than conventional RT-PCR assay. This assay was expected that might detect the viral RNA in the specimens which could have been false negative by RT-PCR. There were needed to perform real-time NASBA with clinical specimens for evaluating accurate sensitivity and specificity of this assay.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제48권7호
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• pp.753-759
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• 2005

목 적 : 소아에서 위장관염에 동반된 경련의 발생은 오래 전부터 알려져 왔으나 국내에서는 이에 관한 임상보고가 최근에 추가적으로 발표되고 있다. 저자들은 위장관염과 함께 무열성 경련을 보였던 환아들을 대상으로 하여 이의 임상적 특징 고찰과 발작간기 뇌파를 통해 이 질환의 전기 생리학적인 특징을 규명함으로서 향후 이 질환의 간질 증후군 분류와 진단, 치료 및 예후 예측에 도움이 되고자 하였다. 방 법 : 2001년 1월 1일부터 2004년 6월 30일까지 3년 6개월 동안 급성 위장관염으로 분당차병원 소아과에 입원하여 치료받은 환아 중 과거 신경질환이나 발달 이상의 병력이 없으면서 전해질 이상 및 저혈당에 의하지 않는 무열성 경련이 관찰되었던 67례를 연구대상으로 하였다. 결 과 : 급성 위장관염 입원 환아 2,887례 중 67례(2.3%)에서 무열성 경련이 관찰되었고 대상 환아의 연령은 1개월에서 42개월 사이($18.5{\pm}6.1$)이며 남아가 32례, 여아가 35례이었다. 경련 양상은 전신 강직-간대 발작은 51례(76.1%), 전신 강직 발작은 16례(23.9%) 형태였고 평균 경련시간은 2.8분(20초-40분), 입원 기간동안 평균 경련 횟수는 3.1회(1-13회)이었으나 경련 전후의 신경학적 이상 소견은 관찰되지 않았다. 항경련제는 42례(62.7%)에서 사용되었으며 이 중 23례에서는 2가지 이상의 항경련제 사용 후에 경련이 조절되었다. 뇌척수액 검사는 54례에서 시행되었으며 모두 정상이었고, 15례에서 시행된 뇌영상 검사는 모두 정상이었다. 49례에서 시행한 대변 배양 검사 상 세균은 자라지 않았으며, 로타바이러스는 62례 중 51례(82.3%), 노로바이러스는 18례 중 2례, 아스트로바이러스는 18례 중 1례에서 양성반응을 보였다. 대상 환아에서 시행한 총 73례의 발작간기 뇌파에서 49례(67.1%)는 정상 소견을 보였으나 24례(32.9%)에서는 두정위 일과성 예파(vertex sharp transient)와 구분되는 극파 또는 예파가 수면 I-II기에 중심부에서 관찰되었고 이 중 추적뇌파가 가능했던 6례에서 3례는 정상화가 되었으나 3례에서는 저진폭의 비정형적인 극파나 예파가 지속되었다. 퇴원 후 추적조사는 58례(86.6%)에서 시행되었고 최대 36개월까지 모두 신경학적 후유증없이 정상적인 발달을 보였다. 결 론 : 급성 위장관염과 동반된 양성 무열성 경련은 정상발달을 보이며 건강하던 영유아에서 일회성 또는 다발성으로 발생하며 전해질, 혈당, 뇌척수액 등의 검사가 정상이고, 일부에서는 일시적으로 중심부에서 극파 또는 예파를 보이지만 추적 검사 시에는 정상 또는 호전되는 소견을 나타내며 양성 경과를 취한다. 따라서 이 질환군은 간질 증후군 중 특별 증후군으로 분류될 것으로 예상된다. 또한 정상 발달을 보이는 영유아에서 급성 위장관염과 함께 무열성 경련이 발생하는 경우 반드시 이 질환군을 고려하여야 하며 보호자를 안심시키고, 장기간의 과다한 항경련제 투여와 불필요한 방사선 검사를 피하는 등 그 진단과 치료가 선택적으로 이루어져야 한다.