• 제목/요약/키워드: non-specific binding

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돼지 동결정액의 배양에 따른 체외수정능력과 Glycosidase Activity의 변화 (Changes of Glycosidase Activity and Fertilizing Ability in Vitro by Incubation of Frozen-Thawed Spermatozoa in the Pig)

  • 황인선;정희태;양부근;김정익;박춘근
    • 한국가축번식학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.153-161
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    • 2003
  • 본 연구는 돼지 동결-융해 정자의 배양에 의한 체외수정능력과 glycosidase activity를 평가하기 위하여 chlortetracycfine fluorescence분석법을 이용하여, glycosidase가 체외수정능력과 정자침입에 미치는 영향에 대하여 검토하였다. 또한 돼지난자의 투명대내에서 발견된 당잔기에 대한 정자의 glyco-sidase 특이성을 확인하기 위하여 $\alpha$-L-fucosidase, $\alpha$-D-mannosidase, $\beta$-D-galactosidase 및 N-acetyl-$\beta$-D-glucosaminidase ($\beta$-GlcNAc'ase)의 activity를 분석하였다. 그 결과 glycosidase activity는 동결정자의 응해 후 배양하지 않았을 때보다 2시간 배양했을 때 더 높게 나타났다. $\beta$-GlcNAc'ase의 activity 는 정자 배양 유무에 관계없이 다른 glycosidase 처리시보다 최소한 2배 이상 높게 나타났다. 또한 첨체반응이 유기된 정자의 비율은 glycosidase ($\alpha$-D-mannosidase; P<0.05)에 의해 영향을 받았으며 자를 배양하지 않은 경우보다는 배양된 정자에서 높게 나타났다. 그러나 배양시간에 따른 정자의 존성에 대해 glycosidase의 종류에 따른 유의차는 인정되지 않았다. 한편 투명대내 정자의 접착과 입에 대한 또 다른 실험에서, 서로 다른 glyco-sidase가 첨가된 배양액내에서 수정된 정자가 배양시간이 길어짐에 따라 정자의 침입율은 낮아졌다 $\beta$-GlcNAc'ase; P<0.05). 투명대내의 정자접착정도는 glycosidase의 첨가시에 무첨가시보다 접착정도가 더 높았으며, 가장 높은 접착율은 $\beta$-GlcNAc'ase 첨가시 나타났다. 또한 모든 glycosidase 처리시 2시간 배양한 정자보다는 배양하지 않은 정자에서 투명대에 대한 접착정도가 높게 나타났으며, $\alpha$-D-mannosidase의 처리시 유의적인 차이를 보였다 (P<0.05). 본 연구의 결과, $\beta$-GlcNAc'ase가 주로 돼지정자의 원형질막내에 존재하는 것으로 추측되며, 배양된 정자에 의한 투명대 접착정도와 침입율이 낮았음에도 불구하고 glycosidase activity가 증가하는 것으로 나타났다.

Lactobacillus rhamnosus GG가 Streptococcus mutans의 부착능에 미치는 영향 (The influence of Lactobacillus rhamnosus GG on the binding ability of Streptococcus mutans)

  • 이수전;이성훈;최봉규;김정욱;김영재;김종철
    • 대한소아치과학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.155-160
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    • 2011
  • 최근 들어, 수복 치료 등을 이용한 질병의 직접적인 치료보다는 예방 치료에 대한 중요성이 강조되면서, 그 동안 사용되었던 화학적인 약물을 통한 예방 치료 이외에도 유산균등을 이용한 probiotics에 대한관심이 높아지고 있다. 여러 논문에서 Lactobacillus와 Bifidobateria들이 DMFS와 S. mutans를 감소한다고 보고하고 있다. 하지만, 이러한 미생물들의 접종 시기와 접종 농도에 대한 언급은 부족하다. 따라서 본 실험에서는 probiotics의 대표적인 균인, L. rhamnosus GG를 이용하여 예방 효과를 보기 위한 적정 농도를 재정립하고, 접종시기를 고찰하였다. S. mutans 배지에 $1{\times}10^6$ CFU이상 농도의 L. rhamnosus를 접종하였을 때 S. mutans count가 현저하게 감소하는 것을 볼 수 있었다. 접종 순서는 L. rhamnosus와 S. mutans를 동시에 접종하거나 L. rhamnosus를 S. mutans 보다 선행하여 접종하였을 때가, S. mutans를 L. rhamnosus 보다 선행하여 접종하였을 때에 비교하여 S. mutans count를 더 감소시켰다. 이 실험의 결과로 보아 probiotics의 접종 시기는 probiotics을 임상에 적용할 때 반드시 고려되어야 하겠다.

Desmin Binding Property of Nebulin Isoforms

  • Jeon Eun-Hee;Lee Yeong-Mi;Lee Min-A;Kim Ji-Hee;Choi Jae-Kyong;Park Eun-Ran;Kim Hyun-Suk;Ahn Seung-Ju;Min Byung-In;Joo Young-Mi;Kim Chong-Rak
    • 대한의생명과학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.73-79
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    • 2006
  • Nebulin is a giant ($600{\sim}900$ kDa), modular sarcomeric protein proposed to regulate the assembly, and to specify the precise lengths of actin filamints in vertebrate skeletal muscles. Recently, There is an evidence that the nebulin also expressed in non muscle tissue, brain and liver. We identified a new isoform of nebulin from adult brain library by PCR screening. It contains two simple-repeats exon 165, 166 and linker-repeats exon $154{\sim}161$ except exon 159. The nebulin modules M160 to M170 (exon 150 to exon 161) has been shown to bind desmin. In mature striated muscle, desmin intermediate filaments surround Z-discs and link individual myofibrils laterally at their Z-discs and to other intracellular structures, including the costameres and the intercalated discs of the sarcolemma, sarcoplasmic reticulum, mitochondria, T-tubules, and nuclei. Therefore, it is an interesting possibility that the differential splice pathways within the linker region of nebulin modify the affinity of nebulin's interaction with desmin. The specific interactions of nebulin and desmin were confirmed in vivo by yeast two hybrid experiments. To verify in the cellular level the interaction between nebulin isoform and desmin, we transfected COS-7 cell with EGFP-tagged nebulin and DsRed-tagged desmin. Based on evidence showing that despite exon 159 was deleted, the new isoform of nebulin was interact with desmin. This suggest that nebulin in brain may interact with another intermediate filament. The conservation of these ligand-binding capacity in brain and skeletal nebulins suggest that nebulins may have conserved roles in brain and skeletal muscle.

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인간 $\alpha$-fetoprotein에 대한 모노클로날 항체의 제조 및 모노클로날 항체를 이용한 효소면역분석법의 개발 (Production of a Monoclonal Antibody to Human $\alpha$-Fetopotein and Development of Monoclonal Antibody-Based Enzyme-Linked Immunosorbent Assays for Human $\alpha$-Fetoprotein)

  • Michung Yoon;Hyun-Hee Lee;Youngwon Lee
    • 대한의생명과학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.1-10
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    • 1999
  • 본 연구에서는 혈장이나 양수에 있는 $\alpha$-fetoprotein (AFP)을 인식 할 수 있는 모노클로날 항체를 제조하고, 모노클로날 항체를 이용한 효소면역분석법을 개발하고자 하였다. 양수로부터 얻은 AFP를 쥐에 주사한 후 비장을 분리하여 종양세포 (Sp2/O-Ag-14)와 융합하였고, 하이브리도마 기술을 이용하여 모노클로날 항체를 제조하였다. 모노클로날 항체를 클로닝하였으며, 생성된 항체를 MabF22로 명명하였고, IgG1 중사슬과 k 경사슬의 isotype을 나타냈다. 또한 immunoblotting 방법과 ELISA로 특이도를 조사한 결과 모노클로날 항체는 AFP와만 반응하였고, 결합 친화상수는 0.8$\times$$10^{-10}$M이었다. 두 종류의 효소면역분석법 -경쟁적 또는 비경쟁적 분석 -을 이용하여 항체의 효용성을 조사하였으며, 두 방법 모두 AFP와 농도에 비례하여 반응하였다. 따라서 본 연구에서 생산된 모노클로날 항체는 연구목적으로 뿐만 아니라 AFP 농도를 측정하기 위한 면역진단시약의 개발에도 유용할 것으로 생각된다.

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Annotation and Expression Profile Analysis of cDNAs from the Antarctic Diatom Chaetoceros neogracile

  • Jung, Gyeong-Seo;Lee, Choul-Gyun;Kang, Sung-Ho;Jin, Eon-Seon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권8호
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    • pp.1330-1337
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    • 2007
  • To better understand the gene expression of the cold-adapted polar diatom, we conducted a survey of the Chaetoceros neogracile transcriptome by cDNA sequencing and expression of interested cDNAs from the Antarctic diatom. A non-normalized cDNA library was constructed from the C. neogracile, and a total of 2,500 cDNAs were sequenced to generate 1,881 high-quality expressed sequence tags (ESTs) (accession numbers EL620615-EL622495). Based on their clustering, we identified 154 unique clusters comprising 342 ESTs. The remaining 1,540 ESTs did not cluster. The number of unique genes identified in the data set is thus estimated to be 1,694. Taking advantage of various tools and databases, putative functions were assigned to 939 (55.4%) of these genes. Of the remaining 540 (31.9%) unknown sequences, 215 (12.7%) appeared to be C. neogracile-specific since they lacked any significant sequence similarity to any sequence available in the public databases. C. neogracile consisted of a relatively high percentage of genes involved in metabolism, genetic information processing, cellular processes, defense or stress resistance, photosynthesis, structure, and signal transduction. From the ESTs, the expression of these putative C. neogracile genes was investigated: fucoxanthin chlorophyll (chl) a,c-binding protein (FCP), ascorbate peroxidase (ASP), and heat-shock protein 90 (HSP90). The abundance of ASP and HSP90 changed substantially in response to different culture conditions, indicating the possible regulation of these genes in C. neogracile.

Identification of Non-Muscle Nebulin Isoform in Human Brain Library

  • Joo, Young-Mi;Lee, Min-A;Choi, Pyung-Rak;Choi, Jae-Kyoung;Lee, Yeong-Mi;Choi, Su-Il;Kim, Myong-Shin;Jeon, Eun-Hee;Kim, So-Young;Kim, Chong-Rak
    • 대한의생명과학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.23-29
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    • 2004
  • Nebulin is a (Mr 600∼900 kDa) large actin-binding protein specific to skeletal muscle and thought to act as a molecular template that regulates the length of thin filaments. Cardiac muscles of higher vertebrates have been shown earlier to lack nebulin. Recently, full-length nebulin mRNA transcripts have been detected in heart muscle, but at lower levels than in skeletal muscle. Nebulin expression also was detected in the kidney, eye, and otic canal, suggesting that nebulin isoforms may also be expressed in these organs. We have searched for nebulin isoforms in brain of human using PCR and Northern blot. Here, we provide evidence that nebulin mRNA transcripts are expressed in brain. Seven nebulin isoforms (B, C, D, E, F, G and H form) are obtained in human skeletal muscle and four isoforms (B, C, G and H form) in human brain cDNA library. We cloned the 1.3 kb of nebulin fragment from human adult brain library by PCR. The identity of the PCR product was confirmed by sequence analysis. The partial brain nebulin sequence was 99% identical to the skeletal muscle cDNA as determined by Blast alignment. It contains two simple-repeats HR1, HR2 and linker-repeats exon l35∼143 except exon 140. It was different from skeletal muscle B form, which contain HR1 and HR8. These data suggest that nebulin isoform diversity occurs even more extensively than previously known, likely contributing to the distinct thin filament architecture of different striated muscles.

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Molecular Characterization of Chicken Toll-like Receptor 7

  • Chai, Han-Ha;Suk, Jae Eun;Lim, Dajeong;Lee, Kyung-Tai;Choe, Changyong;Cho, Yong-Min
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제39권4호
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    • pp.105-115
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    • 2015
  • Toll-like receptor 7 (TLR7) is critical for the triggering of innate immune response by recognizing the conserved molecular patterns of single-stranded RNA (ssRNA) viruses and mediated antigenic adaptive immunity. To understand how TLR7 distinguish pathogen-derived molecular patterns from the host self, it is essential to be able to identify TLR7 receptor interaction interfaces, such as active sites or R848-agonist binding sites. The functional interfaces of TLR7 can serve as targets for structure-based drug design in studying the TLR7 receptor's structure-function relationship. In contrast to mammalian TLR7, chicken TLR7 (chTLR7) is unknown for its important biological function. Therefore, it has been targeted to mediate contrasting evolutionary patterns of positive selection into non-synonymous SNPs across eleven species using TLR7 conservation patterns (evolutionary conserved and class-specific trace residues), where protein sequence differences to the TLR7 receptors of interest record mutation that have passed positive section across the species. In this study, we characterized the Lys609 residue on chTLR7-ECD homodimer interfaces to reflect the current tendency of evolving positive selection to be transfer into a stabilization direction of the R848-agonist/chTLR7-ECDs complex under the phylogenetically variable position across species and we suggest a potential indicator for contrasting evolutionary patterns of both the species TLR-ECDs.

Cimetidine의 Theophylline 약동학 및 대사과정에 미치는 효과에 관한 연구 (Effect of Cimetidine on Theophylline Disposition and Metabolic Pathways)

  • 장인진;이선희;신재국;신상구;박찬웅
    • 대한약리학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.83-90
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    • 1990
  • Cimetidine이 theophylline의 약동학적 특성과 대사과정에 미치는 효과를 검토코자 6마리의 개를 대상으로 일주일간 정맥내 cimetidine(30mg/kg/day)투여 전후에 단일 용량의 정맥투여에 따른 theophylline의 약동학적 parameter 및 뇨중 theophylline 대사물 배설의 변화를 교차 실험을 통하여 관찰하였다. 대조실험에 비해 cimetidine투여후 theophylline의 청소율은 평균 31%(P<0.05)감소하였고 혈장반감기는 29%(P<0.01)연장되었다. 그러나 steady-state의 분포용적 및 혈장 단백 결합의 변화는 관찰할 수 없었다. Theophylline의 주 대사물인 3-methylxanthine, 1-methyluric acid 및 1,3-dimethyluric acid의 24시간 뇨증 배설량은 cimetidine투여후 모두 감소 하였으나 통계적으로 유의한 변화는 아니었으며 개별대사물의 배설 분획은 변화가 없었다. 이상의 결과로 부터 cimetidine이 theophylline의 demethylation과 8-hydroxylation대사과정 모두를 비선택적으로 억제함으로써 청소율을 감소시키고 반감기를 증가시킬 것으로 추정되었다.

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Synergistic Effects of PectaSol-C Modified Citrus Pectin an Inhibitor of Galectin-3 and Paclitaxel on Apoptosis of Human SKOV-3 Ovarian Cancer Cells

  • Hossein, Ghamartaj;Keshavarz, Maryam;Ahmadi, Samira;Naderi, Nima
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권12호
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    • pp.7561-7568
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    • 2013
  • Galectin-3 (Gal-3) is a carbohydrate-binding protein which is thought to be involved in cancer progression but its contribution to epithelial ovarian cancer (EOC) remains unclear. The present study sought to determine the role of Gal-3 in chemoresistance of the human SKOV-3 ovarian cancer cell line to paclitaxel (PTX) using recombinant human Gal-3 (rhGal-3) and PectaSol-C modified citrus pectin (Pect-MCP) as a specific Gal-3 competitive inhibitor. Our results showed 41% increased cell proliferation, 36% decreased caspase-3 activity and 33.6% increased substrate-dependent adhesion in the presence of rhGal-3 compared to the control case (p<0.001). Treatment of cells with a non-effective dose of PTX (100nM) and 0.1% Pect-MCP in combination revealed synergistic cytotoxic effects with 75% reduced cell viability and subsequent 3.9-fold increase in caspase-3 activity. Moreover, there was 39% decrease in substrate-dependent adhesion compared to control (p<0.001). These results suggest that inhibition of Gal-3 could be a useful therapeutic tool for combination therapy of ovarian cancer.

화학수식제에 의한 Bacillus alcalophilus AX2000 유래 Xylanase의 활성에 관여하는 아미노산 잔기의 확인 (Identification of Amino Acid Residues Involved in Xylanase Activity from Bacillus alcalophilus AX2000 by Chemical Modifiers)

  • 박영서
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.121-128
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    • 2006
  • Bacillus alcalophilus AX2000으로부터 xylanase를 정제한 후 효소의 활성부위를 조사하기 위하여 여러 가지 화학수식제를 사용하여 효소활성의 저해도를 측정하였다. 여러 가지 화학 수식제 중에서 carbodiimide와 N-bromosuccinimide가 효소 활성을 완전히 저해시켜 glutamic acid또는 aspartic acid 잔기와 tryptophan 잔기가 효소의 활성부위에 관여하리라 추측되었다. 각각의 경우에 효소 실활은 수식제의 첨가농도에 따라 pseudo first-order kinetics 양식을 보여주었으며, carbodiimide와 N-bromosuccinimide는 각각 비경쟁적 저해와 경쟁적 저해방식을 나타내었다. 기질첨가에 의한 효소활성 보호실험을 통하여 tryptophan 잔기가 기질결합부위라 판단 되었다. 효소 실활속도의 분석에 의해 효소활성에는 2개의 glutamic acid 또는 aspartic acid 잔기와 1개의 tryptophan 잔기가 관여하는 것으로 나타났다.