• 제목/요약/키워드: narrow-sense heritability

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이면교잡에 의한 대맥형질의 유전분석 (Diallel Cross Analysis of Characters in Barley)

  • 정원복;정대수;무전화의;좌등화광
    • 생명과학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.59-65
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    • 1997
  • In this experiment, gene actions were analysized for seven barley parents in order to obtain basic information on their genetic improvement by diallel crosses. The results obtained were summarized as follows. In analysis of variance, additive, dominant, maternal and reciprocal effects were observed significantly for culm length, tiller number, number of spiked per plant, culm diameter, awn length, leaf width, number of grains per spike, and 1000 grain weight. Over-dominance was shown by Vr-Wr graphic analysis in five characters such as tiller number, number of spikes per plant, length of flag leaf, number of grains per spike, and 1000 grain weight, and partial dominance in four characters such as culm length, culm diameter, awn length, and leaf width. Component of genetic varience analyzed for four characters such as culm diameter, awn length, length of flag leaf, and leaf width showed that additive effects were higher than dominant effects. Culm length, tiller number, number of spikes per plant, number of grains per spike, and 1000 grain weight showed dominant effects higher than additive effects. The narrow-sense heritability for awn length, leaf width, and number of grains per spike showed high values as more than 0.62, while broad-sense heritability for culm length, number of spikes per plant, culm diameter, awn length, leaf width, number of grains per spike, and 1000 grain weight showed high values as more than 0.65.

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Diallel Analysis for Rice Allelopathic Potential against Barnyardgrass Assessed in Field Condition

  • Junaedi, Ahmad;Lee, Sang Bok;Chung, Ill Min;Kim, Kwang Ho
    • 한국육종학회지
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    • 제40권1호
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    • pp.8-14
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    • 2008
  • A complete diallel cross was performed to determine the inheritance of allelopathic potential and combining ability of six rice germplasm that showed different level of allelopathic potential against barnyardgrass. Parents and F1 of 30 crosses were assessed for allelophatic potential in field condition. Barnyardgrass (Echinochloa crus-galli (L.) Beauv. var. frumentaceae) was used for rice allelopathic potential indicator which was observed in height and shoot dry weight, then suppression percentage were calculated by comparing to barnyardgrass grown in control plot (no rice). It was found that general combining ability showed no significant effect, whereas specific combining ability and reciprocal effect were significant. Variance analysis confirmed that genetic control of allelopathic potential in rice against barnyardgrass was mostly directed by dominance gene effect. The dominant genes were associated with high allelopathic potential and recessive genes were associated with low allelopathic potential. Heritability in broad sense for barnyardgrass dry weight suppression was around 41%; whereas for barnyardgrass height suppression was 51%. However, heritability in narrow sense was very low. The finding suggests that accumulation of genes associated with allelopathic potential would be a strategy to develop promising varieties in reference with the specific combining ability of cross combinations.

목화의 F2잡종집단에 대한 유전분석 (Genetic Analysis of Quantitative Characters by Diallel Cross in Cotton)

  • 정원복
    • 생명과학회지
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    • 제12권2호
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    • pp.213-218
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    • 2002
  • 목화 특성을 고려한 4개 품종을 이면교배하여 얻은 F$_2$세대의 12개 조합을 재료로 각 형질에 대한 유전자의 분포상태 및 우성정도 등을 산출한 결과는 다음과 같다. 개서일수는 상가적 효과, 우성효과, 모본효과, 정역간의 효과에서 유의하였다. 주당삭수와 개화일수는 상가적 효과, 우성효과, 모본효과에서 유의하였고, 삭중, 삭당 실면중, 삭당 조면중, 종자수, 종자폭, 종자 100립중은 상가적 효과와 우성효과에서 유의하였으며, 종자장은 상가적 효과에서만 유의하였다. Vr-Wr graph에서 주당삭수, 삭중, 삭당 실면중, 삭당 조면중, 종자폭, 종자 100립중, 개화일수, 개서일수는 불완전 우성으로 유전되고, 삭당 종자수, 종자장은 초우성으로 유전되었다. 유전분산 성분에서 삭중, 삭당 실면중, 삭당 조면중, 삭당 종자수, 종자장, 개화일수는 상가적 효과가 우성효과보다 컸고, 주당삭수, 종자폭, 종자 100립중, 개서 일수는 우성효과가 상가적 효과보다 컸다. 협의의 유전력은 삭중, 삭당 실면중, 삭당 조면중, 개화일수, 개서일수가 43.19% 이상으로 높았고, 광의의 유전력은 주당삭수, 삭중, 삭당 실면중, 삭당 조면중, 종자장, 개화일수, 개서일수가 51.71% 이상으로 높았다.

페튜니아 일대 잡종에서 덩굴성 관련형질의 상호관계 및 조합능력 (Correlation and Combining Ability of Plant Spreading Chracteristics in F1 Hybrids by Diallel Cross in Petunia hybrida)

  • 송천영
    • 화훼연구
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    • 제17권3호
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    • pp.179-184
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    • 2009
  • 페튜니아 5개 계통을 이면교배한 $F_1$ 10개 조합 및 양친에 대한 성 관련 형질인 초장, 초폭, 줄기길이, 줄기수, 절간장, 엽수 및 개회수 등의 형질에 대하여 상호관계 및 조합능력을 분석하였다. 초장은 초폭, 절간장 및 개회수 등의 형질들과, 엽수는 초폭, 줄기수 및 개회수의 형질들과 유의성이 인정되었으며, 특히 초폭과 절간장과의 사이에 고도로 유의한 정의 상관관계를 보였다. 일반조합능력(GCA)은 초장, 초폭, 줄기길이, 절간장, 줄기수, 엽수 및 개화수 등 모든 조사 형질에서 유의성이 인정되었고, 특수조합능력(SCA) 초폭, 줄기수, 엽수 및 개화수 등의 형질에서 유의성이 있었고, 일반조합능력효과가 특수조합능력효과보다 크게 작용하였다. 모본의 일반조합능력검정에서 D계통은 초 장, 초폭, 줄기길이, 줄기수, 엽수 및 개회수의 증가를 위해서, I계통은 초폭, 줄기길이 절간장에 대하여 일반 조합능력이 큰 것으로 나타났다. 특수조합능력 검정에서 초폭 증가에 뚜렷한 유의성을 보인 조합은 $D{\times}I$, $F{\times}I$$G{\times}I$조합이었고, 초폭, 절간장 및 개회수를 동시에 증가시키는데 유의성을 보인 조합은 $G{\times}I$조합이었다. 광의의 유전력은 7가지 형질 모두 크게 나타났고, 초폭과 줄기길이 및 절간장은 협의의 유전력도 높게 나타났다.

페튜니아 일대 잡종에서 생육관련 형질의 상호관계 및 조합능력 (Inter-Relationship and Combining Ability of Plant Growth in F1 Hybrids of Petunia hybrida)

  • 송천영;홍규현;강윤규
    • 현장농수산연구지
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    • 제3권1호
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    • pp.85-93
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    • 2001
  • 페튜니아 6개 계통을 이면교배한 F1 15개 조합 및 양친에 대한 엽장, 엽폭, 분지수, 엽수, 엽면적, 생체중 및 건물중 등의 형질에 대하여 상호관계 및 조합능력을 분석하였다. 엽면적과 생체중은 엽장, 엽폭, 분지수 및 엽수 등 모든 형질들과 유의성이 인정되는 정의 상관관계를 보였고 건물중은 엽장, 엽폭 및 생체중과 고도의 정의 상관관계를 보였으나 엽수와 엽장과는 상관관계가 없었다. 조합능력의 분산은 일반조합능력이나 특수조합능력 모두 7가지 형질에서 유의성이 인정되었으며 특수조합능력의 분산구성분이 일반조합능력의 분산구성분 보다 크게 작용하여 이들 형질의 유전에는 비상가적 유전자 작용이 큰 것으로 나타났다. 모본의 일반조합능력에서 D와 G계통은 엽장증가에 대한 효과가 컸으며, C와 D계통은 분지수, 엽수 및 엽면적증가에 대하여 일반조합능력이 컸고, 생체중 및 건물중 증가를 위해서는 C, D와 G계통들이 일반조합능력이 큰 것으로 나타났다. D×E조합, D×G조합 및 E×G조합은 엽장, 엽폭, 분지수, 엽수, 엽면적, 생체중 및 건물중 등의 모든 조사형질에서 특수조합능력 효과가 높았다. 유전력은 7가지 형질 모두 광의의 유전력이 크게 나타났고 엽폭 및 건물중은 광의와 협의의 유전력 모두가 높게 나타났다.

Genome-wide Association Study (GWAS) and Its Application for Improving the Genomic Estimated Breeding Values (GEBV) of the Berkshire Pork Quality Traits

  • Lee, Young-Sup;Jeong, Hyeonsoo;Taye, Mengistie;Kim, Hyeon Jeong;Ka, Sojeong;Ryu, Youn-Chul;Cho, Seoae
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제28권11호
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    • pp.1551-1557
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    • 2015
  • The missing heritability has been a major problem in the analysis of best linear unbiased prediction (BLUP). We introduced the traditional genome-wide association study (GWAS) into the BLUP to improve the heritability estimation. We analyzed eight pork quality traits of the Berkshire breeds using GWAS and BLUP. GWAS detects the putative quantitative trait loci regions given traits. The single nucleotide polymorphisms (SNPs) were obtained using GWAS results with p value <0.01. BLUP analyzed with significant SNPs was much more accurate than that with total genotyped SNPs in terms of narrow-sense heritability. It implies that genomic estimated breeding values (GEBVs) of pork quality traits can be calculated by BLUP via GWAS. The GWAS model was the linear regression using PLINK and BLUP model was the G-BLUP and SNP-GBLUP. The SNP-GBLUP uses SNP-SNP relationship matrix. The BLUP analysis using preprocessing of GWAS can be one of the possible alternatives of solving the missing heritability problem and it can provide alternative BLUP method which can find more accurate GEBVs.

Heritability Estimated Using 50K SNPs Indicates Missing Heritability Problem in Holstein Breeding

  • Shin, Donghyun;Park, Kyoung-Do;Ka, Sojoeng;Kim, Heebal;Cho, Kwang-hyeon
    • Genomics & Informatics
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    • 제13권4호
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    • pp.146-151
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    • 2015
  • Previous studies in Holstein have shown 35% to 51.8% heritability in milk production traits, such as milk yield, fat, and protein, using pedigree data. Other studies in complex human traits could be captured by common single-nucleotide polymorphisms (SNPs), and their genetic variations, attributed to chromosomes, are in proportion to their length. Using genome-wide estimation and partitioning approaches, we analyzed three quantitative Holstein traits relevant to milk production in Korean Holstein data harvested from 462 individuals genotyped for 54,609 SNPs. For all three traits (milk yield, fat, and protein), we estimated a nominally significant (p = 0.1) proportion of variance explained by all SNPs on the Illumina BovineSNP50 Beadchip ($h^2_G$). These common SNPs explained approximately most of the narrow-sense heritability. Longer genomic regions tended to provide more phenotypic variation information, with a correlation of 0.46~0.53 between the estimate of variance explained by individual chromosomes and their physical length. These results suggested that polygenicity was ubiquitous for Holstein milk production traits. These results will expand our knowledge on recent animal breeding, such as genomic selection in Holstein.

페튜니아 일대 잡종에서 발아, 개화 및 종자 등숙소요일수 관련형질의 상호관계 및 조합능력 (Correlation and Combining Ability of Days to Germination, Flowering and Ripening in F1 Hybrids of Petunia hybrida)

  • 송천영;박상철;박노복
    • 현장농수산연구지
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    • 제3권1호
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    • pp.94-101
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    • 2001
  • 페튜니아 6개 계통을 이면교배한 F1 15개 조합 및 양친에 대한 발아율, 발아소요일수, 개화소요일수, 등숙소요일수 및 협당 종자수 등의 형질에 대하여 상호 관계 및 조합능력을 분석하였다. 개화소요일수와 발아소요일수 및 협당 종자수는 정의 상관관계를 보였고, 이들 형질과 발아율은 부의 상관관계를 나타냈으며, 종자 등숙소요일수와는 관계가 없었다. 협당 종자수는 발아율과 정의 상관관계를 나타냈다. 조합능력의 분산은 일반조합능력이나 특수조합능력 모두 5가지 형질에서 유의성이 인정되어 형질의 유전에는 상가적 유전 작용과 비상가적 유전 작용이 모두 중요하게 작용하는 것으로 나타났다. 모본의 일반 조합능력에서, 발아소요일수 및 개화소요일수 감소를 의해서는 A와 C계통에서, 발아율 증가 및 협당 종자수 증가를 위해서는 C와 G계통에서 각각 일반조합능력효과가 높게 나타났다. 개화소요일수 및 발아소요일수가 짧고, 발아율 및 협당 종자수의 특수조합능력효과가 높았던 조합은 D×G 및 E×F 조합이었고, 개화소요일수 및 발아소요일수가 길면서, 발아율 및 협당 종자수의 특수조합능력효과가 높았던 조합은 C×F로 나타났다. 유전력은 5가지 형질 모두 광의의 유전력이 크게 나타났고, 등숙소요일수 및 협당 종자수는 광의와 협의의 유전력 모두가 높게 나타났다.

황색종 연초 품종의 Gamma 선에 의한 돌연변이 유기 및 변이형질의 유전분석 III. 변이형질의 유전력과 형질 상호 관계 (Induced Mutant by Gamma Rays and Genetic Analysis for Mutant Characters in Flue-cured tobacco Variety (Nicotiana tabacum L) III. Heritability and Genobpic Correlation for Mutant Characters in Flue-cured Tobacco Variety)

  • 정석훈;이승철;김흥배
    • 한국연초학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.126-132
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    • 1992
  • This experiment was conducted to examine estimates of heterosis, degree of dominance, heritability and phenotypic and genotypic correlation for several mutant characters in flue-cured tobacco variety. Significant heterosis was noted, recording 2.73 and 6.16% for leaf width, -6.86 and -4.72 for leaf shape index, 19.8 and 23.4% for bacterial wilt disease index in Fl an4 F2 generation, respectively, and -1.44 for days to flower in F2 generation. And also leaf width was appeared partial dominance in Fl, and leaf shape index in Fl and F2, Leaf width in F2 was appeared overdominance. Estimated heritabilities in the broad sense ranged from 0.77 to 0.87 for plant and stalk height and days to flower, while those of leaf number, leaf length and width, leaf shape index and bacterial wilt disease index ranged from 0.50 to 0.65. And the heritabilities in the narrow sense were appeared 0.64 and 0.72 for stalk and plant height, respectively, and the others were ranged from 0.32 to 0.47 Positive genotpic correlations appeared among plant height, stalk height, leaf length and leaf width, and between leaf shape index ands day to flower. And negative genotypic correlations appeared between leaf shape index and plant height and stalk height and leaf width, and between bacterial wilt disease index and leaf length.

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누에의 숙잠체중과 산란성에 대한 유전분석 (Genetic Analysis for Weight of Matured Silkworm and Number of Eggs Laid in Hybrid Population of the Silkwom, Bombyx mori)

  • 정원복
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제35권2호
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    • pp.100-104
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    • 1993
  • 누에 7개 품종을 이면교배하여 F1세대의 숙잠체종과 F2 세대의 산란수에 대한 유전분석의 결과는 다음과 같다. 분산분석의 결과에서 유전적 효과인 상가적 효과, 우성 효과, 모체 효과 및 정역간의 효과는 숙잠체종과 산란수에서 모두 유의하였다. 숙잠체중과 산란수는 우성 효과가 상가적 효과보다 컸고, 광의의 유전력은 숙잠체중과 산란수에서 각각 0.986, 0.936으로 높았다. 협의의 유전력은 숙잠체중이 0.773으로 높았으나 산란수는 0.228로 낮았다. vr-Wr graph에서 숙잠체중은 불완전 우성이고, 산란수는 초우성의 유전현상을 보였다. 일반 조합능력의 효과에서 숙잠체중은 잠 107과 잠 124의 품종이, 산란수는 S1이 각각 그 효과가 정으로 컸다. 특정조합의 효과에서 숙잠체중은 S1XC51조합, S1X잠 124 조함, 잠 107X잠 108 조합이 각각 정으로 높은 효과를 보였다. 산란수는 잠107XN63 조합, S1XC51 조합, N74X잠 108 조합, 잠 107X잠 108 조합이 각각 정으로 높은 효과를 보였다.

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