I isolated the actinomycete strain KH223 from soil samples collected from the Kye Ryong mountain area. This strain is antagonistic to the multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. KH223 was confirmed as belonging to the genus Streptomyces based on the scanning electronmicroscopy(SEM) observations of the diaminopimelicacid(DAP) type and morphological and physiological characteristics. Comparison of the 16S rDNA nucleotide sequences revealed that KH223 has a relationship with Streptomyces galbus. Production of antibiotics by KH223 was most favorable when cultured on a glucose, polypeptone, and yeast extract(PY) medium for 6 days at 27$^{\circ}C$. The supernatant was found to exhibit an antimicrobial effect on various kinds of bacteria and fungi. Particularly, butanol and ethylacetate extracts of KH223 and cyclo(trp-trp) exhibited significant activity against A. baumannii at concentration ranges of 0.8-12.5 ${\mu}g$/mL, 5.0-25 ${\mu}g$/mL and 12.5${\rightarrow}$100 ${\mu}g$/mL, respectively. Moreover, in contrast to cyclo(trp-trp) had shown to activity against Micrococcus luteus JCM 1464 at the concentration of 12.5 ${\mu}g$/mL, the butanol extract of KH223 showed significant activity against Bacillus subtilis IAM 1069 and Micrococcus luteus JCM 1464 at the concentration of 0.4 and 0.8 ${\mu}g$/mL, respectively. These results suggest that KH223 may have a great potential in the production of new antibiotics to combat multidrug-resistant pathogens and further studies may be warranted for the same.
Purpose : Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii (A. baumannii) is recognized to be the most difficult pathogen to control and treat in pediatric burn centers. We analyzed the antibiotic susceptibility pattern of A. baumannii in our pediatric burn intensive care unit during the past 7 years. Methods : We retrospectively evaluated 56 patients (105 samples) under the age 15 years and who were infected with A. baumannii between January 1999 and December 2005. Results : Fot the 56 patients, the ratio of males to females was 1.15:1 and the median age was 48.3 months. The sites of 105 isolates were wounds (65%), sputum (20%), blood (6 %), cutdown tips (5%), endo-tip tubes (2%) and urine (2%). A. baumannii presented yearround. The annual antimicrobial resistance rate increased and the multidrug resistant rate for two or more antibiotics was 93.33%. For 3 patients in whom resistance emerged, the interval period between the susceptible and resistant strains after antibiotic use was a mean of 10 days. The A. baumannii isolated from blood were all multi-drug resistant pathogens. Conclusion : Multidrug resistance of A. baumannii is increasing. Strict infection control guidelines and active surveillance are needed for the prevention and treatment of A. baumannii in hospitals.
In this study, the antimicrobial activity of a bacteriocin produced by Enterococcus faecalis KT11, isolated from traditional Kargı Tulum cheese, was determined, and bacteriocin KT11 was partially characterized. The results showed that bacteriocin KT11 was antagonistically effective against various Gram-positive and Gram-negative test bacteria, including vancomycin- and/or methicillin-resistant bacteria. The activity of bacteriocin KT11 was completely abolished after treatment with proteolytic enzymes (proteinase K, ${\alpha}$-chymotrypsin, protease and trypsin), which demonstrates the proteinaceous nature of this bacteriocin. Additionally, bacteriocin KT11 remained stable at pH values ranging from 2 to 11 and after autoclaving at $121^{\circ}C$ for 30 min. In addition, the activity of bacteriocin KT11 was stable after treatment with several surfactants (EDTA, SDS, Triton X-100, Tween 80 and urea) and organic solvents (chloroform, propanol, methanol, ethyl alcohol, acetone, hexane and ethyl ether). Cell-free supernatant of E. faecalis KT11 was subjected to ammonium sulfate precipitation and then desalted by using a 3.5-kDa cut-off dialysis membrane. The bacteriocin activity was determined to be 711 AU/mL in the dialysate. After tricine-SDS-PAGE analysis, one peptide band, which had a molecular weight of ~3.5 kDa, exhibited antimicrobial activity. Because the bacteriocin KT11, isolated from E. faecalis KT11, exhibits a broad antimicrobial spectrum, heat stability and stability over a wide pH range, this bacteriocin can be used as a potential bio-preservative in foods. Additionally, bacteriocin KT11 alone or in combination with conventional antibiotics may provide a therapeutic option for the treatment of multidrug-resistant clinical pathogens after further in vivo studies.
Species that belong to the Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (Acb) complex are major causes of hospital-acquired infections. They are important opportunistic pathogens. These species are usually multidrug resistant (MDR), and the therapeutic options to treat the infections caused by these species are limited. In the present study, we investigated fluoroquinolone resistance mechanisms in 53 ciprofloxacin resistant Acinetobacter species isolates in Chungcheong, Korea. Antimicrobial susceptibilities were determined using the disk-diffusion method. Detections of genes and identification of mutations associated with fluoroquinolone resistance were carried out using PCR and DNA sequencing. In our study, 47 out of 53 ciprofloxacin resistant Acinetobacter isolates harbored sense mutations at the 83rd residue (serine to leucine) in the gyrA gene as well as at the 80th residue (serine to leucine) in the parC gene. Among the 47 isolates harboring sense mutations in gyrA and parC gene, 44 isolates were A. baumannii and 3 isolates were A. pittii. Plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) determinants were detected in isolates in our study. Among the 46 ciprofloxacin resistant A. baumannii isolates, 41 showed type A, B, or F banding patterns on their REP-PCR profiles. This result suggests that clonal relation and horizontal spreading of the bacterial isolates have been around hospitals in Chungcheong area. To prevent colonization and disseminations of fluoroquinolone resistance Acb complex isolates, continuous investigation and monitoring of antimicrobial resistant determinants of MDR isolates are needed.
Shin, Kyeong Seob;Son, Young Il;Kim, Yong Dae;Hong, Seung Bok;Park, Je-Seop;Kim, Sunghyun;Yu, Young-Bin;Kim, Young Kwon
Biomedical Science Letters
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v.20
no.2
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pp.77-84
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2014
Periodic analysis of local epidemiologic data of prevalent pathogens of blood culture can provide clinicians with relevant information to guide empirical antibiotic therapy. In this study, we analyzed a pattern of change of causative microorganisms and antimicrobial resistance at a tertiary medical center in Chungcheong province from 2003 to 2012, retrospectively. Of 70,258 blood specimens cultured, 6,063 (8.6%) were positive. Among the positive isolates, 95.9% were aerobic or facultative anaerobic bacteria, 0.1% were anaerobes, and 3.9% were fungi. Coagulase-negative Staphylococci (CoNS) (32.9%), Escherichia coli (16.7%), Staphylococcus aureus (9.1%), Klebsiella pneumoniae (6.4%), and ${\alpha}$-hemolytic Streptococcus (5.9%) were commonly isolated bacteria, and Candida albicans (1.4%) was the most commonly isolated fungi. Enterococcus faecium progressively increased but Streptococcus pneumoniae, Acinetobacter baumannii and Proteus species gradually decreased over a period of 10 years. The multidrug-resistant microorganisms such as methicillin-resistant S. aureus (MRSA), vancomycin-resistant enterococci (VRE), cefotaxime-resistant E. coli, imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa (IRPA) and imipenem-resistant A. baumannii (IRAB), were significantly increased. Therefore, there is a need for a more strict control of antibiotics and a more updated guideline for the treatment of bloodstream infection.
Yoo, Yeong Wol;Lee, Hyo Jeong;Kim, Seung;Bae, Min Suk;Lee, Mi Ja;Shim, Jung-Hyun;Cho, Seung Sik
Journal of Life Science
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v.24
no.3
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pp.266-273
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2014
In the present study, the chemical compositions and antimicrobial and antioxidant activities of commercially available essential oils in Korea were investigated. The essential oils were analyzed by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). The results demonstrated that they exhibit a broad spectrum of antimicrobial activities against gram positive, gram negative, and multidrug resistant (MDR) strains. The antimicrobial activity of five of the essential oils against 40 organisms was assessed using the minimum inhibitory concentration (MIC). The MIC values were in the ranges of 0.0625-0.5% (v/w) for lemongrass and manuka, 0.03125-1.0% (v/w) for tea tree, 0.0625-1.0% (v/w) for thyme, and 1-4% (v/w) for ravensara, depending on the pathogens studied. This study revealed that, among the essential oils tested, lemongrass and thyme oil showed broad antimicrobial activity against infectious bacteria. The antioxidant activities and the reducing power of the essential oils were determined with a 1, 1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH) assay. Thyme oil exhibited the strongest antioxidant activity comparing with ascorbic acid. This is the first report on the chemical compositions and antimicrobial activities of commercially available essential oils against infectious bacteria and MDR strains acquired from Korean hospitals.
Lee, Young-Seob;Kim, Hye-Sung;Lee, Jae Won;Lee, Dae-Young;Kim, Geum-Soog;Kim, Hyoun-Wook;Noh, Geon-Min;Lee, Seung Eun;Lee, Sun Ae;Song, Ok Hee;Kwon, Dong-Yeul
Korean Journal of Pharmacognosy
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v.47
no.2
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pp.122-127
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2016
Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus(MRSA) is a multidrug-resistant(MDR) strain. (+)-Usnic acid(UA) is uniquely found in lichens, and is especially abundant in genera such as Usnea and Cladonia. UA has antimicrobial activity against human and plant pathogens. Therefore, UA may be a good antibacterial drug candidate for clinical development. In search of a natural products capable of inhibiting this multidrug-resistant bacteria, we have investigated the antimicrobial activity of UA against 17 different strains of the bacterium. In this study, the effects of a combination of UA and permeable agents against MRSA were investigated. For the measurement of cell wall permeability, UA with concentration of Ethylenediaminetetraacetic acid(EDTA) was used. In the other hand, Sodium azide($NaN_3$) was used as inhibitors of ATPase. Against the 17 strains, the minimum inhibitory concentrations(MICs) of UA were in the range of $7.81-31.25{\mu}g/ml$. EDTA or $NaN_3$ cooperation against MRSA showed synergistic activity on cell wall. UA and in combination with EDTA and $NaN_3$ could lead to the development of new combination antibiotics against MRSA infection.
Hong, Seung Bok;Yum, Jong Hwa;Kim, Yong Dae;Shin, Kyeong Seob
Biomedical Science Letters
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v.21
no.2
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pp.84-91
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2015
To provide guidelines for the empirical treatment of urinary tract infections, we observed annual changes in the occurrence frequency and antimicrobial susceptibility of urinary isolates in a university hospital in the Chungbuk province, South Korea, over a period of 10 years (2004~2013). Escherichia coli (38.2%), Enterococcus faecalis (11.7%), Klebsiella pneumoniae (7.3%), Pseudomonas aeruginosa (4.3%), E. faecium (4.3%), and Staphylococcus aureus (4.1%) were commonly isolated urinary pathogens. The prevalence of E. coli, E. faecium and Streptococcus agalactiae were significantly higher in females (P < 0.001), whereas E. faecalis, P. aeruginosa and S. aureus were significantly more common in male patients (P < 0.001). E. coli mostly frequently showed resistance to ampicillin (67.94%), followed by trimethoprim/sulfamethoxazole (36.06%) and ciprofloxacin (26.84%). Over the studied time period, resistance rates of E. coli to ciprofloxacin significantly increased (20.44% to 33.55%). Moreover, extended-spectrum $\beta$-lactamase (ESBL) producing isolates also significantly increased in E. coli (4.2% to 18.3%) and K. pneumoniae (9.6% to 26.9%). In addition, the proportion of vancomycin-resistant Enterococcus facium (VRE) also increased (15.7% to 25.0%). In conclusion, over the last 10 years, the proportions of ciprofloxacin resistant E. coli and multidrug-resistant bacteria, such as ESBL and VRE have significantly increased. This trend must be strictly controlled and demonstrates the need for more updated guidelines for the treatment of urinary tract infections.
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), Escherichia coli (E. coli) and Staphylococcus aureus (S. aureus) are typical opportunistic pathogens. Moreover, these bacteria are known to possess multidrug-resistant (MDR) properties. This study investigates the antimicrobial activity of six fermented products, which have varying efficacies against P. aeruginosa, E. coli, and S. aureus. To identify novel candidate genes, differential expression analysis was performed using an annealing control primer. In the disk diffusion method, Fig vinegar (FV) and Diospyros kaki Thunb vinegar (DTV) showed the greatest increase in inhibition compared to other fermented products, whereas fermented Korean traditional nature herb (FKTNH) had no antibacterial effect. This study identified down-regulation of Escherichia coli O157:H7 ompW gene for outer membrane protein W, whereas gene for synthetic construct Lao1 gene for L-amino acid oxidase were up-regulated in E. coli treated with 5% FV. Consuming fermented vinegar helps prevent bacterial infections. Especially, FV and DTV are potentially useful alternative natural products for multidrug resistance. Furthermore, both are expected to be used as effective natural antimicrobial agents, such as disinfectants.
Seong, Gil Myung;Kim, Miok;Lee, Jaechun;Lee, Jong Hoo;Jeong, Sun Young;Choi, Yunsuk;Kim, Woo Jeong
Tuberculosis and Respiratory Diseases
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v.76
no.2
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pp.66-74
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2014
Background: The increasing number of outpatients with multidrug-resistant (MDR) pathogens has led to a new category of pneumonia, termed healthcare-associated pneumonia (HCAP). We determined the differences in etiology and outcomes between patients with HCAP and those with community-acquired pneumonia (CAP) to clarify the risk factors for HCAP mortality. Methods: A retrospective study comparing patients with HCAP and CAP at Jeju National University Hospital. The primary outcome was 30-day mortality. Results: A total of 483 patients (208 patients HCAP, 275 patients with CAP) were evaluated. Patients with HCAP were older than those with CAP (median, 74 years; interquartile range [IQR], 65-81 vs. median, 69 years; IQR, 52-78; p<0.0001). Streptococcus pneumoniae was the major pathogen in both groups, and MDR pathogens were isolated more frequently from patients with HCAP than with CAP (18.8% vs. 4.9%, p<0.0001). Initial pneumonia severity was greater in patients with HCAP than with CAP. The total 30-day mortality rate was 9.9% and was higher in patients with HCAP based on univariate analysis (16.3% vs. 5.1%; odds ratio (OR), 3.64; 95% confidence interval (CI), 1.90-6.99; p<0.0001). After adjusting for age, sex, comorbidities, and initial severity, the association between HCAP and 30-day mortality became non-significant (OR, 1.98; 95% CI, 0.94-4.18; p=0.167). Conclusion: HCAP was a common cause of hospital admissions and was associated with a high mortality rate. This increased mortality was related primarily to age and initial clinical vital signs, rather than combination antibiotic therapy or type of pneumonia.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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