• 한국응용곤충학회지
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• 제55권4호
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• pp.523-528
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• 2016

풀무치(Locusta migratoria)는 벼과 작물(벼, 옥수수 등)에 큰 피해를 주는 세계적으로 유명한 메뚜기목 해충의 하나로서 밀도요인에 따라 형태와 행동적으로 구별되는 단독형(solitaria)과 군집형(gregaria)을 나타낸다. 풀무치는 전세계적으로 다양한 형태적인 변이가 알려져 있으나 최근의 분자생물학적 연구에 따르면 2가지 계통, 즉 남방계통(아프리카, 남유럽, 동남아시아, 호주)과 북방계통(동아시아, 유라시아)으로 나뉜다. 2014년 8월 전남 해남군 산이면에서 군집형 약충들이 대발생하여 주변 잡초 및 작물(벼, 기장)에 큰 피해를 주었다. 우리나라에서 군집형 풀무치의 발생에 대한 명확한 학술적 보고는 이번이 처음이다. 해남지역의 풀무치 대발생 지점에서 채집한 풀무치 12개체의 COI 염기서열을 분석한 결과, 0.0%-0.9%의 유전적 변이를 보였으며, 모두 북방계통에 속했다.

• Journal of Species Research
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• 제1권2호
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• pp.133-150
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• 2012

Amynthas tralfamadore sp. nov. is described from the Mt Halla, Jeju Island biosphere exhibition housed at NIBR Incheon. This species' taxonomy is problematical since it is similar to Amynthas masatakae (Beddard, 1892) from Japan, itself previously reported from Korea and at one time associated with Amynthas campestris (Goto & Hatai, 1898) and A. parvicystis (Goto & Hatai, 1899), all three variously implicated in prior A. robustus (Perrier, 1872) along with Amynthas aspergillum (Perrier, 1872). Based on reinspection of the London lectotype of A. masatakae-here designated and sketched for the first time-the current solution is for maintenance of all five taxa separately. A closely-related Japanese species-Metaphire ryunome sp. nov.-is comparable to Korean Metaphire reisuiensis (Kobayashi, 1938) comb. nov. Another specimen was identified as Amynthas micronarius (Goto & Hatai, 1898), a new record for Korea. It matches the newly-designated neotype (Tokyo NMST An446) and an annotated synonymy is provided; however, erstwhile synonyms, Amynthas shimaensis (Goto & Hatai, 1899) and A. yamizoyamensis (Ohfuchi, 1935) combs. novae, are briefly redescribed and provisionally restored to the Japanese list. mtDNA COI-5P barcode analyses support species identifications.

• 한국응용곤충학회지
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• 제39권4호
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• pp.211-226
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• 2000

본 연구는 파파리반딧불이 (Hotaria papcrinsis), 애반딧불이 (Luciola lateralis) 및 늦반딧 불이 (Pyrocoelia fufa)등 국내 주요 반딧불이 종의 유전적 분화 및 계통분류학적 관련을 파악하고자 하였다. 이를 위하여 mtDNA의 COI유전자 및 16S rRNA유전자 일부의 염기서열 (각 403bp 및 490bp~504bp)을 분석하였으며 아울러 GenBank에 등록된 일본 반딧불이 29종(반딧불이과 27종, 홍반딧과 1종 및 Rhagophthalmus과 1종)의 16S rRNA유전자의 동일부위 염기서열을 사용하였다. 국내 세 종간의 COI및 16S rRNA유전자의 염기서열 그리고 COI유전자의 아미노산 분화정도를 비교한 결과, 반딧불이아과(Lampyrinae)의 늦반딧불이는 애반딧불이아과(Luciolinae)에 공통적으로 속해있는 애반딧불이 및 파파리반딧불이와 다소 큰 유전적 차이를 나타냄으로 기존의 분류학적 위치를 확인하였다. 16S rRNA유전자의 염기서열을 이용, PAUP과 PHYLIP에 의한 계통분류학적 분석 결과, 우리 나라 애반딧불이는 일본 애반딧불이와 강력한 단일그룹을 형성하였으나 이들간 상당한 유전적 차이 (2.9%의 16S rRNA유전자 염기분화율)를 보였다. 국내 두 지역의 파파리반딧불이는 일본 대마도 고유종인 H. tsushimana와 같은 계통그룹을 형성하였으므로 Hotaria란 속명의 사용이 타당해 보이나 파파리반딧불이는 지역 개체간 자매분류군을 형성하지 않으므로 이에 대한 추가 연구가 요망되는 실정이다. 마지막으로, 국내 늦반딧불이 지역 개체가 일본 늦반딧불이와 강력한 단일 계통그룹을 형성한 점으로 미루어 Pyrocoelia란 속명의 사용은 타당해 보이나 다른 모든 늦반딧불이로부터 큰 유전적 거리론 보인 제주도 개체에 대한 추가적인 연구가 요망되는 실정이다. 결론적으로, 국내 반딧불이 종들은 일본에서 공통적으로 발생하는 반딧불이종 또는 속과 아주 강력한 계통그룹을 형성하였으므로 기존의 계통관련 연구를 지지하고 있는 실정이다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제16권2호
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• pp.75-86
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• 2008

In order to understand geographic genetic variation and relationship among populations of the mason bee (Osmia cornifrons Radoszkowsky), which is used as pollinator for apple tree, we sequenced a portion of mitochondrial (mt) COI gene, which corresponds to "DNA Barcode" region (658 bp) from 81 O. cornifrons individuals collected over eight localities in Korea. The sequence data revealed overall moderate to low genetic diversity within species, with a maximum sequence divergence of 0.76%. Geographically, two haplotypes (BAROC01 and BAROC02) were widespread with a frequency of 82.7%, whereas several haplotypes were found in a locality as a single individual, suggesting that haplotype distribution can be summarized as coexistence of a few widespread haplotypes and several regionally restricted haplotypes. Overall, high rate of per generation female migration (Nm=$1.1{\sim}$infinite) and low level of geographic subdivision ($F_{ST}=0{\sim}0.315$) among localities were characteristic. Although two populations (p < 0.026) were genetically subdivided from the remaining localities, no clear polarity was observed. Taken together, the nature of genetic divergence of the mason bee populations is characterized as one that possessing moderate to low genetic diversity, high gene flow, and wide spread haplotypes with ahigh frequency, concordant with the capability of dispersal in connection with the lack of historical biogeographic barriers.

• 한국응용곤충학회지
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• 제39권3호
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• pp.181-191
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• 2000

국내 늦반딧불이(Pyrocoelia rufa)이 미토콘드리아 DNA중 COI 유전자 일부(403 bp)의 염기서열을 결정, 집단내 유전적 다양도, 지역적 변이, 계통유전적 관련에 대한 분석을 실시하였다. 남해, 부산, 무주, 용인 등 우리나라 4개 지역으로부터 채집된 총 26개체로부터 7개의 mtDNA haplotype을 얻었으며 이들의 변이는 0.2~1.2%이었다. 도심인 부산에서 채집한 늦반딧불이는 다른 산림 및 농업의 채집지역과 달리 하나의 haplotype으로 고정되어 있어 도시화에 따른 집단의 병목현상과 서식처 파편화가 심각했음을 보여주었다. 그러나 우리나라 최대의 반딧불이 서식처이자 보호지역으로 지정된 무주로부터 4개의 haplotype을 얻었으며 이들의 최대염기 치환율은 1.0%로 가장 높은 집단내 유전적 다양도를 나타내었다. 근해의 섬인 남해의 늦반딧불이는 상대적으로 낮은 haplotype 다양도(H=0.25)와 계통유전적으로 이질적인 haplotype(PR7)의 존재로 요약되었는데 이는 비교적 가까운 과거의 한반도 생물지리 역사 및 유전자 이동에 의해 나타난 현상으로 설명하였다. 계층적 유전분석 결과 무주-용인과 부산-남해 그룹의 형성은 역사적으로 두 그룹사이에 유전자 이동에 반한 장벽의 존재 가능성을 제시한다고 설명하였다.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제18권3호
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• pp.311-316
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• 2015

Ten specimens of Brama dussumieri (family Bramidae) were collected from waters off Jeju Island, Busan, and Gangneung, Korea, during 2013-2014. The specimens were characterized by having 58-64 lateral line scales and 13-15 gill rakers. An analysis of 567 base pair sequences of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I showed that sequences in our ten specimens are concordant with those of B. dussumieri from the USA, India, and Japan, although with slight differences (genetic distance = 0.000-0.018). Brama dussumieri was distinguished from the most similar species, Brama japonica, by the number of lateral line scales (57-65 in B. dussumieri vs. 65-75 in B. japonica) and the number of gill rakers (13-15 in B. dussumieri vs. 17-20 in B. japonica). We propose the new Korean name "Wae-sae-da-rae" for B. dussumieri in Korea.

• 한국수산과학회지
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• 제47권1호
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• pp.79-83
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• 2014

Thirty five juveniles belonging to the genus Collichthys were collected using a bag net at Gang-wha-do, in the eastern Yellow Sea, between July and September, 2012, and identified using combined genetic and morphological methods. We sequenced 316 base pairs of mitochondrial DNA cytochrome c oxidase subunit I of 35 individuals, of which 22 individuals were identified as Collichthys niveatus (12.9-47.6 mm in SL) and 13 as Collichthys lucidus (13.4-40.3 mm SL). Morphologically, the number of occipital crests, an important taxonomic character during the adult stage, could not distinguish the two species during the juvenile stage, but the shape of the first anal fin spine clearly distinguished the two species even among juveniles.

• 한국패류학회지
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• 제26권4호
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• pp.275-283
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• 2010

Many freshwater snail taxa are difficult to identify using morphological traits due to phenotypic plasticity. However, using of molecular DNA marker in combination with morphological traits can provide a reliable means for discriminating among freshwater snail taxa including cryptic species. To discriminate among Korean freshwater snail taxa and resolve their systematic relationships, wesequenced a fragment of mtDNA cytochrome oxidase I (COI) gene from 82 specimens collected from ten different sites distributed along the Korean peninsula. We identified more than seven freshwater snail taxa including cryptic species in Korea. Whereas traditional shell morphology of freshwater snails offers only weak discriminatory power for recognizing 'good' taxa, DNA sequence data provided positive and reliable identification. In addition, a major Semisulcospira clade was clearly separated from the remaining lineages observed including cryptic species. However, a phylogenetic tree inferred from the COI gene data did not fully resolve systematic relationships among pleurocerid taxa in Korea. Establishing more robust shell characteristics for identifying taxa unambiguously and hence improving traditional key shell morphology characters for freshwater snail species is an urgent requirement and will require more rigorous examination of all nominal taxa. While molecular data generated here will be useful for species identification and for describing the systematic relationships among Korean freshwater snails, further analysis will be required.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제25권12호
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• pp.601-618
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• 2022

The genus Semisulcospira is an economically and ecologically valuable freshwater resource. Among the species, Semisulcospira coreana, Semisulcospira forticosta and Semisulcospira tegulata are endemic to the Korean peninsula and Semisulcospira gottschei is widespread in Asia. Therefore, maintenance and conservation of wild populations of these snails are important. We investigated the genetic diversity and population structure of Semisulcospira based on the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI), NADH dehydrogenase subunit 4 (ND4), and combined mitochondrial DNA (COI + ND4) sequences. All four species and various genetic makers showed a high level of haplotype diversity and a low level of nucleotide diversity. In addition, Fu's Fs and Tajima's D neutrality tests were performed to assess the variation in size among populations. Neutrality tests of the four species yielded negative Fu's Fs and Tajima's D values, except for populations with one haplotype. The minimum spanning network indicated a common haplotype for populations of S. coreana, S. tegulata and S. gottschei, whereas S. forticosta had a rare haplotype. Also, genetic differences and gene flows between populations were assessed by analysis of molecular variance and using the pairwise fixation index. Our findings provided insight into the degree of preservation of the species' genetic diversity and could be utilized to enhance the management of endemic species.

• 한국어류학회지
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• 제35권1호
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• pp.57-63
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• 2023

본 연구에서는 2018년 2~3월 제주도 남부해역에서 Bathylagidae에 속하는 Lipolagus ochotensis 자어 4개체(체장 13.4~21.3 mm)를 봉고네트로 채집하였다. L. ochotensis 자어는 몸이 길게 신장되었으며, 체고는 낮고, 눈이 돌출되며, 몸의 후반부에 흑색소포가 나 있고, 등지느러미가 몸 중앙에 위치하는 특징을 가진다. 미토콘드리아 DNA COI의 염기서열 625 bp를 분석한 결과, L. ochotensis 성어와 97.6%로 매우 가깝게 나타났다. 국내 처음 보고되는 본 종의 새로운 과명으로 "심해빙어과", 속명으로 "검은빙어속", 국명으로 "검은뺨빙어"를 각각 제안한다.