Microbes within complex communities show quite different physiology from pure cultured microbes. However, historically the study of microbes has focused on single species in pure culture and most of microbes are unculturable in our labs, so understanding of complex communities lags behind understanding of pure cultured cells. Methodologies including stable isotope probing (SIP), a combination of fluorescence in situ hybridization (FISH) and microautoradiography (MAR), isotope micrarray, and metagenomics have given insights into the uncultivated majority to link phylogenetic and functional information. Here, we review some of the most recent literatures, with an emphasis on methodological improvements to the sensitivity and utilities of these methods to link phylogeny and function in complex microbial communities.
Kim, Jun Ho;Kim, Mi-Yeon;Kim, Jong-Hoon;Cho, Jae Youl
Biomolecules & Therapeutics
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v.23
no.5
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pp.414-420
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2015
Flavonoids, such as fisetin (3,7,3',4'-tetrahydroxyflavone), are plant secondary metabolites. It has been reported that fisetin is able to perform numerous pharmacological roles including anti-inflammatory, anti-microbial, and anti-cancer activities; however, the exact anti-inflammatory mechanism of fisetin is not understood. In this study, the pharmacological action modes of fisetin in lipopolysaccharide (LPS)-stimulated macrophage-like cells were elucidated by using immunoblotting analysis, kinase assays, and an overexpression strategy. Fisetin diminished the release of nitric oxide (NO) and reduced the mRNA levels of inducible NO synthase (iNOS), tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$, and cyclooxygenase (COX)-2 in LPS-stimulated RAW264.7 cells without displaying cytotoxicity. This compound also blocked the nuclear translocation of p65/nuclear factor (NF)-${\kappa}B$. In agreement, the upstream phosphorylation events for NF-${\kappa}B$ activation, composed of Src, Syk, and I${\kappa}B{\alpha}$, were also reduced by fisetin. The phospho-Src level, triggered by overexpression of wild-type Src, was also inhibited by fisetin. Therefore, these results strongly suggest that fisetin can be considered a bioactive immunomodulatory compound with anti-inflammatory properties through suppression of Src and Syk activities.
Three kinds of organic matter such as glucose, oxalic acid, and ethanol were added to the media(N-free or NO$\_$3/-riched) and their effects on the nitrogen fixation of Nostoc pruniforme were measured by manometric technique through the experiments in vivo. 1) The organic matters used in this experiments showed effective results as a role of substrate for the fixation of atmospheric nitrogen. 2) In the nitrogen-free medium treated with the both of flucose nad ethanol, the highest nitrogen uptakes were detected in the treated of low concentrations (glucose ; 0.1%, 0.5%, ethanol : 0.1%, 0.5%). On the contrary, the highest nitrogen uptakes in NO$\_$3/-riched medium were measured at the treated of high concentrations (glucose ; 2%, 1%, ethanol ; 1.5%, 1.0%). 3) The highest nitrogen uptakes in N-free medium treated with oxalic acid were measured at the concentration of 2% and 1%, respectively. In the medium of NO$\_$3/-riched, the nitrogen uptakes were in the opposite directions.
An enzyme-linked immnnosorbent assay (ELISA) has been performed for the detection of the prevailing toxinotypes of Clostridium perfringens obtained from conventional culturing of intestinal contents of goats which have died of suspected enterotoxaemia. The test was found effective to detect the toxins as well as types of the organism with less time and labor. The most prevailing type of C. perfringens causing enterotoxaemia in goat was C. perfringens type D (68.75%) and followed by C. perfringens type B (25%) and C (6.25%). No C. perfringens type A was detected. This study showed an intelligible picture of prevailing toxinotypes of C. perfringens in goats in Bangladesh. The use of the ELISA for the detection of clostridial types and toxins allows the differential diagnosis of C. perfringens types A, B, C and D enterotoxaemias from samples of intestinal contents and the typing of cultures of C. perfringens.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.26
no.6
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pp.922-928
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2012
Sulforaphane [1-isothiocyanato-4-(methylsulfinyl)-butane] is one of the most abundant isothiocyanates in some cruciferous vegetables, especially broccoli. Sulforaphaene has been shown to exhibit many pharmacological activities, including anti-oxidant, anti-inflammatory and anti-microbial activities. However, the anti-skin photoaging effects of sulforaphane have not yet been reported. In the present study, we investigated the inhibitory effects of sulforaphane on MMP-1 and -3 expressions of the human dermal fibroblasts via various in vitro experiments and elucidated the pathways of inhibition. Western blot analysis and real-time PCR revealed sulfiraphane inhibited UVB-induced MMP-1 and -3 expressions in a dose-dependent manner. UVB strongly activated nuclear factor-${\kappa}B$ (NF-${\kappa}B$) activity, which was determined by NF-${\kappa}B$ DNA binding activity. UVB-induced NF-${\kappa}B$ activation and MMP expression were completely blocked by sulforphane. These findings suggest that sulforaphane could prevent UVB-induced MMPs expressions through inhibition of NF-${\kappa}B$ activation.
Kim, Wan-Su;Choi, Woo Jin;Lee, Sunwoo;Kim, Woo Joong;Lee, Dong Chae;Sohn, Uy Dong;Shin, Hyoung-Shik;Kim, Wonyong
The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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v.19
no.1
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pp.21-27
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2015
The anti-inflammatory, antioxidant, and antimicrobial properties of artemisinin derived from water, methanol, ethanol, or acetone extracts of Artemisia annua L. were evaluated. All 4 artemisinin-containing extracts had anti-inflammatory effects. Of these, the acetone extract had the greatest inhibitory effect on lipopolysaccharide-induced nitric oxide (NO), prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$), and proinflammatory cytokine ($IL-1{\beta}$, IL-6, and IL-10) production. Antioxidant activity evaluations revealed that the ethanol extract had the highest free radical scavenging activity, ($91.0{\pm}3.2%$), similar to ${\alpha}$-tocopherol (99.9%). The extracts had antimicrobial activity against the periodontopathic microorganisms Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Fusobacterium nucleatum subsp. animalis, Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum, and Prevotella intermedia. This study shows that Artemisia annua L. extracts contain anti-inflammatory, antioxidant, and antimicrobial substances and should be considered for use in pharmaceutical products for the treatment of dental diseases.
Purpose: This study investigates the use intention of artificial intelligence (AI) food service stores for senior customers, which are becoming a trend in the service industry. Research design, data and methodology: For the study, the extended technology acceptance model (TAM) and motivated consumer innovativeness (MCI) variables, proven by existing researchers, were used. In addition to the effect of motivated consumer innovativeness on customer value, we investigated the effect of customer value on trust and use intention. For the study, 520 questionnaires were distributed online by an expert survey agency. Data was verified through validity and reliability. Results: The analysis results of the research hypothesis verified that functionally motivated consumer innovativeness (fMCI), hedonically motivated consumer innovativeness (hMCI), and socially motivated consumer innovativeness (sMCI) all had positive effects on usefulness and enjoyment. Furthermore, usefulness had a statistically significant positive effect on trust, but perceived enjoyment did not; trust was found to positively affect the intention to use. Conclusions: We compared the moderating effects of seniors' gender and age (at 60) between groups. Although there was no moderating effect of age, it was verified that regarding the effect of usefulness on trust, the male group showed a greater influence than the female group.
The gut is a complex organ that has played an important role in digestion, absorption, endocrine functions, and immunity. The gut mucosal barriers consist of the immunologic barrier and nonimmunologic barrier. During critical illnesses, the gut is susceptible to injury due to the induction of intestinal hyperpermeability. Gut hyperpermeability and barrier dysfunction may lead to systemic inflammatory response syndrome. Additionally, gut microbiota are altered during critical illnesses. The etiology of such microbiome alterations in critical illnesses is multifactorial. The interaction or systemic host defense modulation between distant organs and the gut microbiome is increasingly studied in disease research. No treatment modality exists to significantly enhance the gut epithelial integrity, permeability, or mucus layer in critically ill patients. However, multiple helpful approaches including clinical and preclinical strategies exist. Enteral nutrition is associated with an increased mucosal barrier in animal and human studies. The trophic effects of enteral nutrition might help to maintain the intestinal physiology, prevent atrophy of gut villi, reduce intestinal permeability, and protect against ischemia-reperfusion injury. The microbiome approach such as the use of probiotics, fecal microbial transplantation, and selective decontamination of the digestive tract has been suggested. However, its evidence does not have a high quality. To promote rapid hypertrophy of the small bowel, various factors have been reported, including the epidermal growth factor, membrane permeant inhibitor of myosin light chain kinase, mucus surrogate, pharmacologic vagus nerve agonist, immune-enhancing diet, and glucagon-like peptide-2 as preclinical strategies. However, the evidence remains unclear.
Purpose: This study aims to investigate the relationship between ESG activities (Environment, Social, Governance) of coffee shops and their brand image, purchase intention. Research design, data and methodology: To test the hypothesis, a survey was conducted for about one month from May to June, 2021, and a total of 311 people responded to the survey, and the responses from 311 copies were used for the analysis. Validity and reliability analysis were performed, and the relationship between latent variables was empirically analyzed using the structural equation modelling. Results: The results of the study are as follows. First, among the ESG activities of coffee shops, the environmental and social sectors had a significant positive (+) effect on the brand image, but the governance aspect showed no significant effect on the brand image. Second, it was found that the symbolic image and the empirical image had a significant positive (+) effect on the purchase intention, but the functional image did not have a significant effect on the purchase intention. Conclusions: The results of this study suggest that as the number of coffee shops and the heated competition are increasing, it is possible to build a differentiated brand image through ESG activities rather than relying on the functions and services of competing products.
Lactobacillus plantarum and Leuconostoc mesenteroides are crucial functional starters and predominant isolates in a wide range of fermented foods, particularly kimchi, whose constituents exhibit bioactive properties. We previously developed a methodology using anion exchange resins to purify peptidyl compounds from Lb. plantarum LBP-K10. Antibacterial cultures of Lb. plantarum LBP-K10 were obtained from the respective cultures' supernatants and filtrates. However, conclusive evidence of the efficacy of kimchi filtrates in eradicating pathogenic bacteria is lacking. We aimed to simulate the potential effects of antibacterial filtrates that contained antibacterial compounds which were derived from cultures of Lb. plantarum LBP-K10. We acquired the kimchi filtrates using a combination of centrifugation and filtration methodologies, without the requirement for inoculation. The filtered liquid from Chinese cabbage kimchi, inoculated with Lb. plantarum LBP-K10 as a starter culture, and the non-inoculated liquid from Chinese cabbage kimchi (referred to as CCK and CCKRef, respectively) were were examined. CCK demonstrated greater inhibitory activity and a more significant bactericidal effect against the bacterial indicator strains. The minimum inhibitory concentration demonstrated comparable outcomes in tests against both Gram-positive and Gram-negative bacteria. This research offers a groundbreaking examination that displays the effectiveness of profiling peptidyl compounds within kimchi filtrates for curing bacterial infections.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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